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        利用案件樣本對法醫(yī)DNA電泳試劑耗材的性能測試研究

        2014-12-17 00:36:14趙興春季安全李萬水李瑞云龐曉東
        中國測試 2014年1期
        關(guān)鍵詞:檢測

        孫 敬, 趙興春, 葉 健, 季安全, 胡 蘭, 李萬水, 劉 冰,孫 輝,李瑞云,龐曉東,張 濤

        (1.公安部物證鑒定中心,北京 100038;2.公安部第一研究所,北京 100048)

        0 引 言

        在日常法醫(yī)DNA檢驗分析中,檢測平臺一般由測序儀和配套試劑耗材兩大部分構(gòu)成。前者主要是從美國AB公司進口的各種型號的遺傳分析儀,后者主要包括甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠等試劑消耗品。這些試劑耗材有機整合對DNA分子變性、片段大小篩分以及電泳環(huán)境的穩(wěn)定形成起到至關(guān)重要的作用[1-2]。

        目前,在我國開展的各項法醫(yī)檢驗工作中,案件樣本DNA檢驗是一項重要的常規(guī)工作,對于有效打擊犯罪、維護社會治安穩(wěn)定發(fā)揮著不可替代的作用。由于近年來社會環(huán)境日趨復(fù)雜,案件的種類和數(shù)量呈逐年遞增的趨勢,同時犯罪手段更加多樣化,客觀存在的嚴(yán)峻形勢對我國法醫(yī)DNA檢驗工作提出了新的挑戰(zhàn)和需求。對法醫(yī)DNA檢驗具體而言,除了對擴增檢測試劑大規(guī)模需求外,檢測用的試劑耗材也面臨著巨大的需求壓力。正是在這一背景下,我中心成功研發(fā)出了甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠等試劑耗材,取得了相應(yīng)的科研成果。本文在此成果基礎(chǔ)上,利用我中心承擔(dān)的案件檢驗工作中收集的各類檢材為實驗對象,系統(tǒng)研究了上述成果在案件DNA檢測中的適用性,并在研究過程中與國外同類試劑耗材進行了平行對比,取得的研究結(jié)果將為試劑耗材進一步應(yīng)用到實際案件檢驗提供實驗基礎(chǔ)和參考依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 研究對象

        研究對象為甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠等法醫(yī)DNA檢驗試劑耗材樣品,均由公安部物證鑒定中心提供。

        1.2 案件樣本

        所有案件樣本均來自物證鑒定中心日常案件,主要包括血液(斑)15份、唾液(斑)5份、精液(斑)8份、骨骼8份、牙齒6份、脫落細(xì)胞7份,總計各類檢材49份。

        1.3 主要儀器與試劑

        生物安全柜(Heal Force公司);臺式離心機(賀利氏公司);9700型熱循環(huán)儀、3130xl遺傳分析儀、電泳毛細(xì)管 (Applied Biosystems公司);超純水儀(Millipore公司)。主要試劑見表1。

        1.4 方法

        1.4.1 檢測平臺的構(gòu)建

        本研究的檢測平臺包括2個:平臺1為對比平臺,由美國Applied Biosystems公司進口的3130xl遺傳分析儀與進口的甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠構(gòu)成;平臺2以我中心研發(fā)的甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠等成果作為研究對象,與美國Applied Biosystems公司進口的3130xl遺傳分析儀組成檢測平臺2。

        1.4.2 實驗方法

        按照DNATyperTM15說明書對各類生物檢材DNA進行PCR擴增,將擴增產(chǎn)物分別在平臺1和平臺2上進行平行電泳檢測,電泳結(jié)果用GeneMapper ID v3.2軟件進行分析,將平臺1和平臺2上的分型結(jié)果進行平行比對,對STR分型結(jié)果一致性進行分析。

        表1 主要試劑

        2 結(jié)果與討論

        2.1 檢材STR分型

        選取部分檢材電泳結(jié)果作為代表,其分型圖譜如圖1~圖12所示(X代表血斑、T代表唾液斑、J代表精斑、G代表骨骼、Y代表牙齒、C代表脫落細(xì)胞,數(shù)字代表相應(yīng)檢材編號)。

        圖1 X4經(jīng)DNATyperTM15擴增在平臺1,2上的分型結(jié)果

        圖2 T1經(jīng)DNATyperTM15擴增后在平臺1,2上的分型結(jié)果

        圖3 J2經(jīng)DNATyperTM15擴增在平臺1,2上的分型結(jié)果

        圖4 G6經(jīng)DNATyperTM15擴增后在平臺1,2上的分型結(jié)果

        圖1~圖6分別代表各種類型檢材經(jīng)DNATyperTM15試劑盒擴增后在平臺1和平臺2上的分型結(jié)果。

        對比分析圖1~圖6的分型圖譜可以看出:各類檢材DNA經(jīng)DNATyperTM15試劑盒擴增后在平臺1和平臺2上的檢測結(jié)果一致。

        對比分析圖7~圖12的分型圖譜可以看出:各類檢材DNA經(jīng)Identifiler試劑盒擴增后在平臺1和平臺2上的檢測結(jié)果一致。

        2.2 分型一致性比較

        將全部檢材DNA擴增后檢測得到的分型結(jié)果進行對比分析,比較結(jié)果分別見表2(DNATyperTM15)和表3(Identifiler)。在選取的全部案件生物檢材中,檢出全部位點及部分位點分型的STR分型結(jié)果在平臺1和平臺2上的檢測結(jié)果一致。

        表2 DNATyperTM15在平臺1和平臺2上的STR分型一致性結(jié)果1)

        表3 Identifiler 在平臺1和平臺2上的STR分型一致性結(jié)果

        表3 Identifiler 在平臺1和平臺2上的STR分型一致性結(jié)果

        檢測平臺 X1 X2 X3 X4 X5 X6 X7 X9 X10 X11 X12 X13 X14 X15平臺1 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ -■ ■ ■ ■平臺2 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ -■ ■ ■ ■分型是否一致 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是檢測平臺 脫落細(xì)胞J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7平臺1 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ -■ -■平臺2 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ -■ ■ ■分型是否一致 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是檢測平臺 骨骼 牙齒G1 G2 G3 G4 G5 G6 G7 Y1 Y2 Y3 Y4 Y5 Y6平臺1 ■ -■ ■ -■ - ■ ■ ■ -■ ×平臺2 ■ -■ ■ -■ - ■ ■ ■ -■ ×分型是否一致 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是 是檢測平臺 唾液(斑)T1 T2 T3 T4 T5平臺1 ■ ■ - × ■平臺2 ■ - - × ■分型是否一致 是 是 是 是血液(斑)X8精液(斑)■■是 J 8■■是 G 8■■是

        圖6 C2經(jīng)DNATyperTM15擴增后在平臺1、2上的分型結(jié)果

        圖7 X1在平臺 1、2上的 Identifiler 分型結(jié)果

        圖8 T5在平臺1、2上的Identifiler 分型結(jié)果

        圖9 J7在平臺1、2上的Identifiler 分型結(jié)果

        圖10 G4在平臺1、2上的Identifiler 分型結(jié)果

        圖11 Y1在平臺 1、2上的 Identifiler 分型結(jié)果

        圖 12 C2在平臺 1、2上的Identifiler 分型結(jié)果

        3 結(jié)束語

        我中心自主研發(fā)的甲酰胺、電泳緩沖液、凝膠等法醫(yī)DNA電泳檢測試劑耗材可用于日常案件樣本檢驗,其技術(shù)性能達到國外同類進口產(chǎn)品水平。

        [1] Heller C.Principles of DNA separation with capillary electrophoresis[J].Electrophoresis,2001,22(4):629-643.

        [2] Slater G W,Kenward M,McCormick L C,et al.The theory of DNA separation by capillary electrophoresis[J].Curr Opin Biotechnol,2003,14(1):58-64.

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