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        金銀花HQT基因變異類型與其綠原酸含量相關(guān)性

        2014-12-02 05:30:20吳敏琳孫小琳朱莎莎李衛(wèi)東白根本
        吉林中醫(yī)藥 2014年7期
        關(guān)鍵詞:綠原金銀花變異

        吳敏琳,孫小琳,朱莎莎,李衛(wèi)東,白根本

        (北京中醫(yī)藥大學(xué),北京100102)

        金銀花(Lonicera japonica Thunb)又名忍冬,為忍冬科忍冬屬植物[1],具有清熱解毒、涼散風(fēng)熱、廣譜抗菌及抗病毒等功效,臨床上治療濕病發(fā)熱、風(fēng)熱感冒、咽喉腫痛、肺炎等多種疾病,有“中藥之中的青霉素”之稱[2-3]?!侗静菥V目》記載“忍冬,莖葉及花,功用皆同”。金銀花在其道地產(chǎn)區(qū)山東已有300余年的栽培歷史,長(zhǎng)期的自然選擇與人工選擇,金銀花的種質(zhì)發(fā)生了明顯的變異與分化,形成的種質(zhì)形態(tài)、產(chǎn)量及質(zhì)量均存在較大差異[4-5]。有機(jī)酸類被認(rèn)為是金銀花清熱解毒的藥理基礎(chǔ),其中常以綠原酸(chlorogenic acid,CGA)作為金銀花的質(zhì)量控制指標(biāo)[6]。而目前公認(rèn)的綠原酸合成途徑有3條,經(jīng)研究表明,通過HQT(hydroxycinnamoyl CoA quinate hydroxycinnamoyl transferase)合成綠原酸的途徑為其主要合成途徑[7]。HQT功能基因的變異可通過改變其蛋白活性來調(diào)控綠原酸的生物合成效率。本文擬從不同金銀花品種中克隆HQT基因編碼區(qū)序列,通過多重序列比對(duì),揭示金銀花HQT基因變異并按其編碼氨基酸的差異進(jìn)行分類,再結(jié)合其綠原酸含量的變化,闡明金銀花HQT基因的與綠原酸生物合成的關(guān)系。

        1 實(shí)驗(yàn)材料

        1.1 植物材料 研究所用的12個(gè)忍冬品種(見表1),分別來自山東、河北、河南等金銀花主要栽培區(qū)。試驗(yàn)材料均采自山東平邑九間棚公司金銀花種質(zhì)資源收集圃。

        表1 金銀花樣品

        1.2 試劑 RNeasy Plus Mini Kit(Qiagen-Sample&Assay Technologies),SuperScript?VILOTMcDNA Synthesis Kit、AccuPrimeTMPfx Super Mix(Lifetechologies),100 bp Plus II DNA Ladder(北京全式金生物技術(shù)有限公司),綠原酸對(duì)照品(中國(guó)藥品生物制品檢定所,生產(chǎn)批號(hào)為11075-200413)。

        1.3 儀器 SIGMA 3K-15低溫高速離心機(jī)(Sigma);凝膠成像分析儀(BIO-RAD),DYY-6C電泳儀、水平電泳槽(北京市六一儀器廠),SANYO-80℃超低溫冰箱、制冰機(jī)(SANYO),GeneAmp9600 PCR儀(Applied Biosystems),DHG-9053A電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(上海一恒科技有限公司),KQ-300VDE數(shù)控超聲波清洗器(昆山市超聲儀器有限公司),BP211S電子天平(Sartorius),高效液相色譜儀(Waters)。

        2 實(shí)驗(yàn)方法

        2.1 總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄 采用Qiagen公司的RNA提取試劑盒提取各樣品的總RNA,1.2%瓊脂糖變性膠電泳檢測(cè)。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系步驟如下:在微量離心管中配制20 μL混合液,包含模板RNA 2.5 μg,5X VILO[TM]Reaction Mix 4 μL,10X SuperScript?Enzyme Mix 2 μL,DEPC-treated water up to 20 μL。25℃保溫10 min,42 ℃保溫60 min,85 ℃保溫5 min,產(chǎn)物于-20℃保存。

        2.2 PCR擴(kuò)增HQT基因編碼區(qū)序列 根據(jù)金銀花HQT基因編碼區(qū)的 cDNA序列[8],用 Primer Primer 5.0軟件在cDNA末端設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增金銀花HQT基因編碼區(qū),引物序列如下,上游引物HQT-F:CATGCCATGGCTATGGGAAGTGAAGGAAGTGTGAA;下游引物 HQT-R:TCCCCCGGGTCAGAACTCGTACAAACACTTCTCAAA。PCR 反應(yīng)體系(25 μL):AccuPrime PfxSuper Mix 22.5 μL,F(xiàn)orward and reverse primers(10 μmol)1 μL,Template DNA solution(10 pg – 200 ng)0.5 μL。PCR 反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min,95℃變性15 s,58℃退火30 s,68℃延伸30 s,共進(jìn)行35個(gè)循環(huán),4℃保存。

        2.4 HQT基因編碼區(qū)序列的生物信息學(xué)分析 各樣本的測(cè)序結(jié)果用MEGA 5.0軟件分析,并輔以人工校對(duì)。利用NCBI的Blast功能進(jìn)行序列相似相比較,利用MEGA 5.0軟件對(duì)HQT基因序列進(jìn)行聚類進(jìn)化分析。

        2.5 綠原酸含量測(cè)定及方法學(xué)驗(yàn)證

        2.5.1 色譜條件 色譜柱為Agilent C18色譜柱(250 mm ×4.6 mm,5 μm),流動(dòng)相為乙腈-0.4% 磷酸(13∶87),進(jìn)樣量為5 μL,流速 1 mL/min,柱溫25℃,檢測(cè)波長(zhǎng)327 nm。

        2.5.2 對(duì)照品溶液及供試品溶液制備[9]對(duì)照品溶液制備:精密稱取綠原酸標(biāo)準(zhǔn)品2.55 mg,加入50%甲醇配制終濃度為0.051 mg/mL的對(duì)照品溶液。供試品溶液制備:精密稱取金銀花樣品粉末0.1 g(過藥典4號(hào)篩),置50 mL具塞錐形瓶中,精密加50%的甲醇20 mL,超聲(270 W,45 kHz)30 min,放冷后稱定補(bǔ)重,搖勻后過濾,精密量取續(xù)濾液10 mL,置25 mL量瓶中,加50%甲醇定容。

        2.5.3 線性試驗(yàn) 按照2.5.1項(xiàng)下的色譜條件,將2.5.2項(xiàng)下配制的綠原酸標(biāo)準(zhǔn)品分別進(jìn)樣2,4,6,8,10 μL,記錄峰面積。

        2.5.4 樣品含量測(cè)定 取不同樣品按供試液制備方法制樣并測(cè)定,按外標(biāo)法計(jì)算綠原酸的含量。

        2.5.5 精密度試驗(yàn) 取同一份對(duì)照品溶液,按照設(shè)定的色譜條件,重復(fù)進(jìn)樣6次測(cè)定。

        2.5.6 重復(fù)性試驗(yàn) 取同批樣品(九豐一號(hào))6份,按供試液制備方法制樣并測(cè)定。

        2.5.7 穩(wěn)定性試驗(yàn) 取同一份供試品溶液(九綠一號(hào)),分別在 0,1,2,4,8,12,24 h 時(shí)測(cè)定含量。

        催化燃燒熱空氣脫附法是采用催化燃燒反應(yīng)后的熱氣體(控制溫度)加熱吸附床,脫附出來的有機(jī)氣體進(jìn)入催化燃燒階段凈化處理,從而脫附凈化。催化燃燒脫附法所需催化劑的費(fèi)用較高,并且具有一定的安全隱患。

        2.5.8 回收率試驗(yàn) 精密稱取已知含量的供試品(九綠一號(hào))6份,分別加入6組不同量的綠原酸對(duì)照品,按供試液制備方法制樣并測(cè)定,每一水平測(cè)定3次。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 HQT基因的測(cè)序 從12種金銀花樣品中PCR得到了7條HQT基因cDNA編碼序列,長(zhǎng)度約1 300 bp。按樣品編號(hào)分別將這12條序列編號(hào)為1~12,12條序列一致度為98.3% ~100%。利用NCBI的BLAST進(jìn)行序列相似性比較,與金銀花HQT基因序列[7](GenBank accession:GQ847546)相 似 性 大 于98%,確定了獲得的cDNA片段為金銀花HQT基因的cDNA片段。

        3.2 HQT基因編碼區(qū)序列的變異分析 對(duì)12條HQT基因的編碼區(qū)序列進(jìn)行分析,變異情況見表2。

        表2 金銀花HQT基因編碼序列變異

        對(duì)表2進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)HQT基因序列中主要存在以下2種情況的突變,1)單核苷酸多態(tài)性(SNPs):進(jìn)行比對(duì)的12條HQT基因,其編碼區(qū)共有24處SNPs,如在360 bp處的T-A轉(zhuǎn)換,410 bp處的A-C顛換。2)插入/缺失突變:在1~6 bp的位點(diǎn)上,3號(hào)樣本存在ATGGCT 6個(gè)堿基的插入,但是未引起移碼突變,開放閱讀框完整,為1 326 bp,比其它序列開放閱讀框長(zhǎng)度增加6 bp。

        3.3 HQT氨基酸序列多態(tài)性分析 利用MEGA 5.0軟件將12條核酸序列翻譯成對(duì)應(yīng)的氨基酸,得到長(zhǎng)439~441的HQT蛋白氨基酸序列,變異情況見表3。對(duì)表3進(jìn)行分析,共發(fā)現(xiàn)在4個(gè)位點(diǎn)氨基酸發(fā)生了突變,其中3號(hào)樣品存在一處由2個(gè)氨基酸插入引起的突變,這一突變使得3號(hào)樣品的起始密碼子提前,比其他樣品氨基酸序列多了2個(gè)氨基酸殘基。

        表3 金銀花HQT蛋白的氨基酸序列變異

        3.4 綠原酸含量測(cè)定與方法學(xué)驗(yàn)證

        3.4.1 線性 以進(jìn)樣量為縱坐標(biāo)Y,峰面積為橫坐標(biāo)X,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,得回歸方程Y=0.000 000 3 X+0.013 1,R2=0.999 7。表明綠原酸在0.102 ~0.510 μg范圍內(nèi)線性關(guān)系良好。

        3.4.2 樣品含量 每份樣品重復(fù)測(cè)定3次,取平均值,結(jié)果見表4。

        表4 樣品綠原酸含量測(cè)定結(jié)果

        3.4.3 精密度、重現(xiàn)性、穩(wěn)定性、回收率 儀器精密度RSD=0.18%,說明儀器精密度良好。供試品溶液制備方法重現(xiàn)性RSD=1.76%,說明制備方法重現(xiàn)性高。樣品穩(wěn)定性RSD=0.84%,表明供試液中的待測(cè)組分在24 h內(nèi)是穩(wěn)定的。平均回收率=100.28%,RSD=0.11%(n=6),以上驗(yàn)證結(jié)果說明實(shí)驗(yàn)方法和數(shù)據(jù)科學(xué)有效。

        4 討論

        目前公認(rèn)的綠原酸合成途徑有3條,其中通過HQT催化咖啡酰-CoA與奎尼酸生成綠原酸[10]的途徑是植物體內(nèi)合成綠原酸的主要途徑,本文在對(duì)金銀花HQT基因編碼區(qū)序列進(jìn)行研究時(shí)發(fā)現(xiàn)其具有多態(tài)性。

        按照表3中4個(gè)位點(diǎn)可將HQT基因的突變分為3個(gè)類型:類型Ⅰ,在第137、324位點(diǎn)分別是丙氨酸和纈氨酸;類型Ⅱ(3號(hào)樣品),在第1、2位點(diǎn)分別是甲硫氨酸和丙氨酸;類型Ⅲ(4號(hào)樣品),在第137、324位點(diǎn)分別是天冬氨酸和丙氨酸。結(jié)合表4的結(jié)果分析:類型Ⅱ綠原酸含量為1.20%,是所有實(shí)驗(yàn)樣品中含量最少的;類型Ⅲ綠原酸含量為1.89%,相對(duì)大多數(shù)品種其含量也較少;類型Ⅰ中各實(shí)驗(yàn)品種綠原酸含量均大于2%。綜合兩項(xiàng)結(jié)果發(fā)現(xiàn),HQT基因變異在一定程度上影響了其表達(dá)產(chǎn)物綠原酸的含量,證明了二者之間具有一定的相關(guān)性。

        其中4號(hào)樣品的眾多突變證實(shí)了不同種類忍冬的HQT蛋白在基因水平上存在有明顯的差異;5號(hào)樣品為金銀花的變種(紅白忍冬),其綠原酸含量明顯高于其他二倍體品種。以上兩點(diǎn)從不同層面上證明了忍冬分類的準(zhǔn)確性。

        綠原酸含量之所以存在明顯的差異,除了基因變異造成的影響,還可能有多種因素的共同作用:如外部環(huán)境的影響,生長(zhǎng)在陽(yáng)坡的金銀花不同器官中綠原酸的含量均高于陰坡的同類樣品[11];干旱、低溫以及病害感染,都可促使磷酸戊糖途徑的比重增大,使綠原酸含量增多[12]等。另外,實(shí)驗(yàn)結(jié)果中5號(hào)樣品是四倍體,其綠原酸含量約為其他普通二倍體品種的2倍左右。由此可見綠原酸的積累有其復(fù)雜的生理學(xué)機(jī)制,還有待進(jìn)一步的具體研究。

        本文對(duì)金銀花功能蛋白HQT進(jìn)行基因編碼區(qū)多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)HQT基因具有豐富的變異,其錯(cuò)義突變導(dǎo)致了HQT蛋白的改變,進(jìn)而導(dǎo)致了不同品種的樣品中綠原酸含量產(chǎn)生差異。本文發(fā)現(xiàn)了金銀花HQT基因編碼區(qū)和綠原酸含量及種間分類具有一定的相關(guān)性。為科學(xué)的利用和開發(fā)金銀花資源奠定理論基礎(chǔ)和提供科學(xué)手段,為以后的研究工作提供有價(jià)值的參考。

        [1]黃麗瑛,呂植禎,李繼彪,等.中藥金銀花的化學(xué)成分研究[J].中草藥,1996,27(11):195-196.

        [2]劉恩荔.金銀花的研究進(jìn)展[J].山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2006,37(3):331-334.

        [3]劉丹.金銀花的研究進(jìn)展[J].武警醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào),2005,14(1):78-80.

        [4]張永清.山東金銀花生產(chǎn)情況調(diào)查[J].山東中醫(yī)雜志,2000,19(10):621-624.

        [5]周鳳琴,張永清,張芳,等.山東金銀花種質(zhì)資源的調(diào)查研究[J].山東中醫(yī)雜志,2006,25(4):268-271.

        [6]張守平,辛寧,柳萍.金銀花化學(xué)成分及質(zhì)量控制研究進(jìn)展[J].中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志,2007,14(3):84-86.

        [7]Niggeweg R,Michael A J,Martin C.Engineering plants with increased levels of the antioxidant chlorogenic acid[J].Nat Biotechnol,2004,22:746-754.

        [8]彭小?。疸y花的基因鑒定及其HQT基因的克隆與功能研究[D].北京:北京中醫(yī)藥大學(xué),2010:80.

        [9]國(guó)家藥典委員會(huì).中華人民共和國(guó)藥典[M].北京:中國(guó)醫(yī)藥科技出版社,2010:205.

        [10]Rhodes M J C,Wooltorton L S C.The enzymatic conversion of hydroxycinnamic acids to p-coumaroyl quinic and chlorogenic acids in tomato[J].Phytochem,1976,15:947-951.

        [11]T.W.古德溫,E.I.默塞爾.植物生物化學(xué)導(dǎo)論[M].楊陵:天則出版社,1988.

        [12]鄭師章,倪德祥,周紀(jì)倫,等.若干金銀花中綠原酸含量的比較研究[J].復(fù)旦學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,1978(1):111-115.

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