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        軟骨發(fā)育不全患者FGFR3突變基因分析

        2014-11-21 07:10:04王堯崔亞洲周小燕韓金祥
        罕少疾病雜志 2014年1期
        關(guān)鍵詞:堿基核苷酸外顯子

        王堯 崔亞洲 周小燕 韓金祥

        1.山東中醫(yī)藥大學(xué) 2011級(jí) 博士研究生 山東 濟(jì)南 250355

        2.山東省醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心 國(guó)家衛(wèi)生部醫(yī)藥生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 山東省罕見病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 濟(jì)南 250062

        軟骨發(fā)育不全(achondroplasia,ACH,MIM:100800),又稱為胎兒型軟骨營(yíng)養(yǎng)障礙(chondrodystrophia fetalis),或稱軟骨營(yíng)養(yǎng)障礙性侏儒(chondrodystrophic dwarfism),是一種常染色體顯性遺傳病,外顯率為100%。這種疾病是由于軟骨內(nèi)成骨缺陷而膜性化骨正常造成的,國(guó)內(nèi)外都非常罕見,據(jù)國(guó)外研究機(jī)構(gòu)統(tǒng)計(jì),全球發(fā)病率大概為1/77000~1/15000[1]。在這些患者中80%~90%的新生兒為散發(fā)病例,由基因突變產(chǎn)生,10%~20%則是家系遺傳導(dǎo)致。軟骨發(fā)育不全患者的臨床表現(xiàn)具有共同的特征[2-4]:四肢短小,頭大、前額突出、塌鼻梁,肘關(guān)節(jié)不能伸直,雙腿呈“O”型,伴有鴨步,隨著年齡增長(zhǎng)變得越來越明顯;軀干部位發(fā)育正常,肋骨短,胸骨短而寬,空廓扁平,一般智力及其體力發(fā)育正常,并且性功能良好;手指方面短而粗大,呈現(xiàn)“三叉戟”狀態(tài),大拇指一組,食指跟中指為一組,無名指與小拇指為一組;脊柱主要表現(xiàn)為胸腰段后凸和椎管狹窄畸形。

        成纖維生長(zhǎng)因子受體3(fibroblast growth factor receptor 3,FGFR3)是一種發(fā)育調(diào)節(jié)的單次跨膜受體,參與和調(diào)控軟骨和長(zhǎng)骨發(fā)育的多個(gè)階段,如軟骨細(xì)胞的增生及軟骨基質(zhì)的鈣化,是目前世界公認(rèn)引起軟骨發(fā)育不全的最主要的致病基因,其熱點(diǎn)區(qū)域位于第10外顯子。97%以上突變位點(diǎn)又集中在1138位核苷酸,其中95%為G>A的堿基轉(zhuǎn)換,其余為G>C的顛換。兩種突變都導(dǎo)致FGFR3第380位甘氨酸由精氨酸取代(G380R),從而引起FGFR3蛋白功能表達(dá)異常,影響了軟骨細(xì)胞的增生和鈣化,使軟骨發(fā)育生長(zhǎng)受到阻礙停滯從而導(dǎo)致軟骨發(fā)育不全疾病的產(chǎn)生[5-9]。本研究主要通過毛細(xì)管測(cè)序方法對(duì)軟骨發(fā)育不全患者進(jìn)行基因篩查,以確定患者是否為軟骨發(fā)育不全。

        1 材料與方法

        1.1 研究對(duì)象 本實(shí)驗(yàn)中以9例初步診斷為軟骨發(fā)育不全的患者及其他們的父母為研究對(duì)象,共27人。其中9例患者的年齡大多在2~5歲,身高大約在60~80cm,臨床癥狀較為典型,例如四肢短小,頭大、前額突出、塌鼻梁,肘關(guān)節(jié)不能伸直,雙腿呈“O”型,并且具有典型的“三叉手”。患者的父母均為正常人,沒有發(fā)病癥狀。上述參與實(shí)驗(yàn)的人員均獲得并簽署了知情同意書,提供自己的DNA為研究樣本。

        1.2 研究方法

        1.2.1 血液DNA提?。何覀兂槿∩鲜龌颊呒捌涓改傅耐庵莒o脈血液2~3ml(EDTA抗凝混勻),采用OMEGA公司Blood DNA Midi Kit從血液中提取DNA,用紫外分光光度計(jì)對(duì)DNA進(jìn)行檢測(cè),A260/A280約為1.82。

        1.2.2 引物序列設(shè)計(jì):本實(shí)驗(yàn)依據(jù)NCBI提供的FGFR3基因序列,使用primer premier 5.0設(shè)計(jì)外顯子10的PCR擴(kuò)增所需要的引物,引物序列及退火溫度如表1所示

        1.2.3 PCR擴(kuò)增:本實(shí)驗(yàn)使用的PCR擴(kuò)增試劑盒是TAKALA公司的PCR Amplification Kit。每個(gè)反應(yīng)的總體積為25μl,其中反應(yīng)體系內(nèi)包括DNA模板50~200 ng,上游引物與下游引物各1μmol/L,dNTP各200μmol/L,MgCl2 1.5 mmol/L,10×PCR緩沖液2.5μl,Taq DNA聚合酶1U,其余用水補(bǔ)齊。熱循環(huán)儀使用的是PTC-200常規(guī)PCR儀,反應(yīng)條件如下:95℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,循環(huán)35個(gè)周期,最后72℃延伸10min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,將擴(kuò)增產(chǎn)物放入1%的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳跑膠,觀察PCR擴(kuò)增結(jié)果。擴(kuò)增片段大小為341bp。電泳結(jié)果如圖1所示。

        圖1 9例軟骨發(fā)育不全患者PCR擴(kuò)增電泳圖

        圖2 上述序列為反向引物測(cè)序峰圖。箭頭所示位點(diǎn)為患者FGFR3外顯子10的c.1138位點(diǎn)G>A。

        圖3 上述序列為反向引物測(cè)序峰圖。箭頭所示位點(diǎn)為患者FGFR3外顯子10的c.1138位點(diǎn)G>A。

        圖4 上述序列為反向引物測(cè)序峰圖。箭頭所示位點(diǎn)為正常家屬FGFR3外顯子10的c.1138位點(diǎn)。

        1.2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化及其測(cè)序:將擴(kuò)增好的PCR產(chǎn)物用純化試劑盒進(jìn)行純化,去除產(chǎn)物中的非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物及其引物二聚體等雜質(zhì),本實(shí)驗(yàn)使用的試劑盒是QIAGEN公司QIAquick PCR Purification Kit。將純化好的產(chǎn)物送去華大基因測(cè)序部,使用ABI公司的3730XL測(cè)序儀對(duì)純化產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。

        3 結(jié) 果

        對(duì)FGFR3外顯子10測(cè)序分析 通過對(duì)9例患者及其父母進(jìn)行FGFR3外顯子10測(cè)序,我們重點(diǎn)分析了1138位點(diǎn)核苷酸及1123位點(diǎn)核苷酸突變情況。其中9例初步診斷為軟骨發(fā)育不全患者的測(cè)序圖譜中,在1138位點(diǎn)處均出現(xiàn)了雜合峰圖(c.1138 G>A),而1123位點(diǎn)沒有雜合峰圖,表明這些病人確實(shí)是軟骨發(fā)育不全患者。而在患者的父母測(cè)序峰圖中,1138位點(diǎn)核苷酸及1123位點(diǎn)核苷酸均沒有發(fā)現(xiàn)雜合峰圖,表明患者父母均為正常。這結(jié)果提示在中國(guó)的人群中FGFR3外顯子10的1138位點(diǎn)核苷酸突變也是導(dǎo)致軟骨發(fā)育不全疾病產(chǎn)生的原因[10]。在這9對(duì)家庭中,患者都屬于散發(fā)病例,沒有出現(xiàn)家族遺傳性,這與先前文獻(xiàn)報(bào)道的70%~80%軟骨發(fā)育不全患者屬于散發(fā)病例基本一致[11-12]。此外,這些病例中都為c.1138 G>A,沒有出現(xiàn)c.1138 G>C,這也與國(guó)外報(bào)道基本一致[11-12]。圖2和圖3是其中兩個(gè)患者的基因測(cè)序峰圖,圖4為其中一個(gè)患者家屬的測(cè)序峰圖。

        4 討 論

        軟骨發(fā)育不全是一種罕見的常染色體顯性遺傳疾病,外顯率為100%,發(fā)病率為1/77000~1/15000[1],由基因突變產(chǎn)生。成纖維生長(zhǎng)因子受體3(FGFR3)是引起軟骨發(fā)育不全的最重要的致病基因,其本質(zhì)是酪氨酸激酶受體,由細(xì)胞外糖基化配體結(jié)合區(qū)、疏水跨膜區(qū)和細(xì)胞內(nèi)酪氨酸激酶催化區(qū)3部分組成[13]。Shiang等[14]1994年通過聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)結(jié)合單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)和限制性內(nèi)切酶酶解的方法對(duì)軟骨發(fā)育不全患者進(jìn)行基因篩查發(fā)現(xiàn)患者FGFR3基因都有突變,而且突變位置都位于FGFR3疏水跨膜區(qū),提示疏水跨膜區(qū)可能是影響軟骨發(fā)育的熱點(diǎn)區(qū)域。Perez-Custro等[15]進(jìn)一步對(duì)FGFR3基因進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)該基因長(zhǎng)約15Kb,共有19個(gè)外顯子以及18個(gè)內(nèi)含子,其中引起軟骨發(fā)育不全的突變位點(diǎn)在第10號(hào)外顯子上,恰巧此外顯子編碼FGFR3基因的疏水跨膜區(qū),進(jìn)一步明確該基因突變位點(diǎn)與疏水跨膜區(qū)有密切聯(lián)系。

        FGFR3基因主要由兩處堿基位點(diǎn)突變來引起軟骨發(fā)育不全,分別是:c.1138 G>A和c.1138 G>C,屬于單堿基突變。這兩種堿基突變的結(jié)果導(dǎo)致編碼的第380位氨基酸由甘氨酸(Gly)轉(zhuǎn)變成精氨酸(Arg),使蛋白質(zhì)功能發(fā)生改變,從而引起軟骨發(fā)育不全。其中97%軟骨發(fā)育不全患者都是由這兩種堿基突變?cè)斐?,又以c.1138 G>A為主要突變方式,所占比例達(dá)到95%以上。本研究中,我們?cè)?例散發(fā)的軟骨發(fā)育不全患者上檢測(cè)到FGFR3基因第10外顯子G380R突變,結(jié)果支持G380R是ACH最常見的突變這一結(jié)論,并且證明這種高度一致性的突變?cè)谥袊?guó)ACH患者中也存在[10]。9名患者的G380R突變都是由于FGFR3基因1138位核苷酸G>A轉(zhuǎn)換所致,未檢測(cè)到G>C顛換,與西方國(guó)家、日本報(bào)道的研究結(jié)果相似[16-17]。除此之外,1995年瑞典和日本的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了第三處堿基突變位點(diǎn),他們?cè)谝焕l(fā)和一例家系中分別發(fā)現(xiàn)了c.1123 G>T,導(dǎo)致編碼的第375位氨基酸由甘氨酸(Gly)轉(zhuǎn)變成半胱氨酸(Cys),但此類突變發(fā)生的概率很低,占所有突變比例的1%~2%[18-19],在本實(shí)驗(yàn)中所有患者及其父母在這個(gè)位點(diǎn)均沒有發(fā)現(xiàn)此類型突變。

        本實(shí)驗(yàn)采用毛細(xì)管測(cè)序方法檢測(cè)患者FGFR3基因突變,這種方法是目前最直接,最有效的檢測(cè)基因突變方法之一。由于引起此疾病的熱點(diǎn)突變都集中在FGFR3的外顯子10中,因而可以通過這種方法對(duì)患者及其疑似患者做基因水平診斷,從而可以準(zhǔn)確的判定患者是否如軟骨發(fā)育不全,加以針對(duì)性救治。除此之外,毛細(xì)管測(cè)序還可以應(yīng)用于產(chǎn)前診斷及胎兒檢查,以判定胎兒是否為軟骨發(fā)育不全患者。在未來,通過對(duì)基因測(cè)序的方式來診斷軟骨發(fā)育不全必定有著較為廣泛的應(yīng)用前景。

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