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        基于語義網(wǎng)的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理方法研究思路

        2014-11-10 01:57:00于彤李敬華張竹綠于琦劉靜楊碩賈李蓉朱玲董燕
        中國醫(yī)學(xué)創(chuàng)新 2014年30期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)處理中醫(yī)藥大數(shù)據(jù)

        于彤 李敬華 張竹綠 于琦 劉靜 楊碩 賈李蓉 朱玲 董燕

        【摘要】 “大數(shù)據(jù)”時代的來臨,為中醫(yī)藥工作者重新思考中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的本質(zhì),革新中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理方法,提供了寶貴的契機。中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的核心是“知識密集性”數(shù)據(jù)?!按髷?shù)據(jù)”時代的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理方法,應(yīng)側(cè)重于解決知識建模、知識融合、知識服務(wù)等一系列與“知識”相關(guān)的問題。語義網(wǎng)技術(shù)發(fā)端于知識表示和推理領(lǐng)域的研究成果,又能解決數(shù)據(jù)集成與互聯(lián)問題。它為構(gòu)建中醫(yī)藥“大數(shù)據(jù)”并從中發(fā)現(xiàn)新穎知識,提供了理想的技術(shù)手段。

        【關(guān)鍵詞】 大數(shù)據(jù); 中醫(yī)藥; 語義網(wǎng); 數(shù)據(jù)處理

        中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)庫的建設(shè)和利用,是中醫(yī)藥信息處理過程中的核心環(huán)節(jié)。經(jīng)過30多年的努力,中醫(yī)藥工作者已建成了大量的中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)庫,內(nèi)容涉及中醫(yī)、中藥、古籍、方劑、針灸等諸多領(lǐng)域[1]。這些數(shù)據(jù)資源中蘊含著豐富的中醫(yī)藥知識遺產(chǎn),為知識百科、知識檢索、知識地圖等知識服務(wù)提供數(shù)據(jù)支持,為中醫(yī)藥知識傳承、臨床實踐和科學(xué)研究做出了重要貢獻[2]。然而,中醫(yī)團體近十年來仍在沿用傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理技術(shù),數(shù)據(jù)處理水平?jīng)]有明顯提高。該領(lǐng)域仍存在著數(shù)據(jù)庫模式不合理、數(shù)據(jù)質(zhì)量缺陷、數(shù)據(jù)管理手段相對落后等諸多問題。特別是數(shù)據(jù)資源無法在組織、地區(qū)及國際間的充分共享,形成所謂的“數(shù)據(jù)孤島”現(xiàn)象,這已成為困擾中醫(yī)藥工作者多年的老大難問題。數(shù)據(jù)資源建設(shè)仍滯后于臨床、科研發(fā)展的需要,制約中醫(yī)藥信息化事業(yè)的整體發(fā)展。

        “大數(shù)據(jù)”時代的來臨,為中醫(yī)藥工作者重新思考中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的本質(zhì),革新中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理方法,提供了寶貴的契機?!按髷?shù)據(jù)”的理念在于將各種相關(guān)的數(shù)據(jù)集關(guān)聯(lián)起來,構(gòu)成大型、全面的數(shù)據(jù)集合,從中發(fā)現(xiàn)新穎的知識。為建立一套既符合“大數(shù)據(jù)”理念,又適合中醫(yī)藥領(lǐng)域特點的信息處理方法,首先要從本質(zhì)上理解中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容。中醫(yī)典籍汗牛充棟。但與天文、地理、生物等以“大數(shù)據(jù)(Big Data)”為特征的學(xué)科相比,中醫(yī)藥領(lǐng)域產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量仍然是“小巫見大巫”。中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)量不是很大,但數(shù)據(jù)本身所包含的知識量很大,因此常被稱為“知識密集型”的數(shù)據(jù)資源[3]。中醫(yī)藥領(lǐng)域的數(shù)據(jù)不是單純的觀測數(shù)據(jù),而是觀測與體驗相互融合的數(shù)據(jù)。中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的生成模式與獲取手段,決定其無法成為傳統(tǒng)意義上的“大數(shù)據(jù)”,而必然是“知識密集型”數(shù)據(jù)。

        為處理中醫(yī)藥知識密集型數(shù)據(jù),需要建立適合中醫(yī)藥領(lǐng)域特點的方法學(xué)體系。所謂中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的“知識量很大”,主要體現(xiàn)在其中蘊含著豐富的語義關(guān)系。若將這些語義關(guān)系抽取并融合起來,則構(gòu)成了復(fù)雜語義網(wǎng)絡(luò),其節(jié)點數(shù)量相對而言不是很大,但具有復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。語義網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,反映了數(shù)據(jù)中的知識含量。若能通過基于本體的方法來處理中醫(yī)藥數(shù)據(jù),深度挖掘其中蘊含的語義關(guān)系,并基于語義網(wǎng)(Semantic Web)實現(xiàn)“知識密集型”數(shù)據(jù)資源的合理組織,則可在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)資源利用中取得突破[4-5]。

        1 語義網(wǎng)在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理中的應(yīng)用

        語義網(wǎng)(Semantic Web)是萬維網(wǎng)聯(lián)盟(World Wide Web Consortium,簡稱W3C)提出并倡導(dǎo)使用的一項創(chuàng)新的萬維網(wǎng)(Web)技術(shù),其核心思想是在萬維網(wǎng)上構(gòu)建一個全球性的數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò),用以實現(xiàn)更為智能的應(yīng)用[5]。近年來,語義網(wǎng)技術(shù)在歐、美等地取得迅速發(fā)展,得到IBM、Oracle等著名IT企業(yè)的鼎力支持,在生命科學(xué)、醫(yī)療保健和新藥研發(fā)等領(lǐng)域取得廣泛應(yīng)用。

        中醫(yī)藥工作者已經(jīng)認(rèn)識到語義網(wǎng)的價值,并開展了將語義網(wǎng)應(yīng)用于中醫(yī)藥領(lǐng)域的若干嘗試,構(gòu)建了中醫(yī)藥本體平臺、中醫(yī)藥語義查詢平臺和中醫(yī)藥語義搜索平臺等系統(tǒng),在文化傳承和醫(yī)療保健等方面產(chǎn)生了社會效益,取得了良好的示范性效果,并積累了寶貴的經(jīng)驗[5]?,F(xiàn)有工作表明語義網(wǎng)能夠為中醫(yī)藥領(lǐng)域問題提供適宜的解決方案,但尚未充分發(fā)揮語義網(wǎng)的全部潛能。這就需要建立一套基于語義網(wǎng)的數(shù)據(jù)處理方法學(xué),消除語義網(wǎng)技術(shù)和中醫(yī)藥領(lǐng)域?qū)嶋H應(yīng)用之間的隔閡,從而實現(xiàn)中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的充分共享和深度利用。

        這套方法學(xué)的處理對象是中醫(yī)藥數(shù)據(jù),但其最終目的則是對數(shù)據(jù)中蘊含的知識進行合理組織、系統(tǒng)保護和深度挖掘。中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)是中醫(yī)藥知識的密集型載體,中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理在本質(zhì)上是對中醫(yī)藥知識的創(chuàng)造、維護、共享、融合和利用的持續(xù)過程,其中涉及知識建模、知識融合、知識服務(wù)等一系列與“知識”相關(guān)的方法。下面分別進行闡述。

        1.1 基于本體的中醫(yī)藥知識建模方法 中醫(yī)藥知識體系與中華傳統(tǒng)文化息息相關(guān),具有鮮明的思想和語言特色,這決定了中醫(yī)藥知識建模的獨特性。歷代中醫(yī)普遍采用“取向比類”等形象思維方法,導(dǎo)致中醫(yī)藥知識難以精確描述和定量刻畫。中醫(yī)藥領(lǐng)域知識的復(fù)雜性、模糊性和爭議性,向現(xiàn)有的知識表達與推理技術(shù)提出了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。作為語義網(wǎng)的基石,本體是針對某個領(lǐng)域的概念體系的精確規(guī)范,用以明確概念的定義以及概念之間的語義關(guān)系[4]。可以基于國際最新的本體表達框架,提出符合中醫(yī)藥特色的知識建模方法,對中醫(yī)藥的思維模式和知識體系進行分析與建模,研發(fā)面向中醫(yī)藥領(lǐng)域的示范性本體、知識庫以及相應(yīng)的推理方法,從而系統(tǒng)梳理中醫(yī)藥知識體系,保護中醫(yī)藥知識遺產(chǎn)。

        1.2 基于語義網(wǎng)的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)集成與知識融合方法 中醫(yī)藥領(lǐng)域的數(shù)據(jù)整合工作長期停滯不前,形成了所謂的“數(shù)據(jù)孤島”現(xiàn)象,造成中醫(yī)藥知識無法在組織和實踐者之間充分共享。語義網(wǎng)的核心優(yōu)勢在于將數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和存儲方式各異的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一格式并重新發(fā)表,從而實現(xiàn)數(shù)據(jù)資源整合,構(gòu)建全球數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)。在語義網(wǎng)的框架下,不僅能夠?qū)崿F(xiàn)中醫(yī)疾病、中藥、針灸、醫(yī)案等中醫(yī)藥各門類數(shù)據(jù)資源的集成,而且能夠進一步建立中西醫(yī)之間的知識關(guān)聯(lián)??赏ㄟ^語義關(guān)系表達中醫(yī)藥和西醫(yī)之間的結(jié)合點,從而實現(xiàn)這兩個領(lǐng)域的知識資源的關(guān)聯(lián)和融合,支持各種面向結(jié)合醫(yī)學(xué)的知識共享、決策支持和知識發(fā)現(xiàn)應(yīng)用。這套方法能使中醫(yī)藥知識接入全球互聯(lián)的知識網(wǎng)絡(luò)之中,在中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)學(xué)中發(fā)揮更大的作用和影響力。

        1.3 基于語義網(wǎng)的中醫(yī)藥知識服務(wù)方法 語義網(wǎng)不僅支持?jǐn)?shù)據(jù)集成,而且為基于數(shù)據(jù)的知識服務(wù)提供了新方法。例如,“語義搜索”基于領(lǐng)域知識庫實現(xiàn)智能的搜索功能,向用戶提供準(zhǔn)確的信息搜索結(jié)果;“語義查詢”向用戶提供簡易、友好的查詢構(gòu)造界面,引導(dǎo)用戶以交互的方式進行知識問答;“語義維基”向用戶提供百科全書式的知識服務(wù),支持知識資源的有序組織、有效管理和協(xié)作式加工?;谥嗅t(yī)藥數(shù)據(jù)的語義網(wǎng)應(yīng)用系統(tǒng)能夠面向臨床決策、新藥研發(fā)和電子教學(xué)提供知識服務(wù),解決中醫(yī)藥知識共享與傳播的問題,為中醫(yī)藥知識服務(wù)模式創(chuàng)新提供了有力的技術(shù)支持。

        2 小結(jié)

        近年來,中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)事業(yè)取得長足發(fā)展,積累了為數(shù)眾多的數(shù)據(jù)資源。如何管理如此龐大的數(shù)據(jù)資源,如何解決“數(shù)據(jù)孤島”問題實現(xiàn)數(shù)據(jù)整合,如何從海里數(shù)據(jù)中挖掘新穎的知識,如何實現(xiàn)基于數(shù)據(jù)的知識服務(wù)以滿足中醫(yī)專家和百姓的需求,都是中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)事業(yè)中需要考慮并解決的問題?!按髷?shù)據(jù)”時代的來臨,有望帶來中醫(yī)藥數(shù)據(jù)處理方法的大變革,從根本上解決上述問題,推動中醫(yī)藥信息化事業(yè)的整體發(fā)展。需要針對中醫(yī)藥“知識密集性”數(shù)據(jù)的特點,建立一套基于語義網(wǎng)的數(shù)據(jù)處理方法學(xué)。其中包括:(1)采用基于本體的知識建模方法,構(gòu)建中醫(yī)藥領(lǐng)域本體和知識庫,系統(tǒng)梳理中醫(yī)藥知識體系;(2)采用語義集成方法實現(xiàn)大量中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫的有效整合,解決中醫(yī)藥“數(shù)據(jù)孤島”問題;(3)采用語義搜索、語義查詢、語義維基等方法提供知識服務(wù),解決中醫(yī)藥知識傳播問題。通過這套方法學(xué),將能匯集中醫(yī)藥及相關(guān)學(xué)科的數(shù)據(jù)資源,挖掘數(shù)據(jù)中蘊含的潛在規(guī)律及知識點,發(fā)揮多學(xué)科研究成果對中醫(yī)藥發(fā)展的支撐作用。

        參考文獻

        [1]崔蒙,尹愛寧,范為宇,等.中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)研究進展[J].中國中醫(yī)藥信息雜志,2006,13(11):104-105.

        [2]高博,崔蒙,楊碩,等.基于數(shù)據(jù)的中醫(yī)藥知識服務(wù)研究[J].圖書情報工作,2012,56(9):5-9.

        [3]崔蒙,李海燕,雷蕾,等.“大數(shù)據(jù)”時代與中醫(yī)藥“知識密集型”數(shù)據(jù)[J].中國中醫(yī)藥圖書情報雜志,2013,37(3):1-3.

        [4]于彤,崔蒙,李敬華,等.中醫(yī)藥本體工程研究現(xiàn)狀[J].中國中醫(yī)藥信息雜志,2013,20(7):110-112.

        [5]于彤,崔蒙,李敬華.語義Web在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用研究綜述[J].世界中醫(yī)藥,2013,8(1):107-109.

        (收稿日期:2014-03-04) (本文編輯:蔡元元)endprint

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