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        以oprI為靶基因?qū)崟r熒光PCR法檢測化妝品中綠膿桿菌

        2014-11-03 10:13:48蘇建暉許如蘇周廣彪曾梅錦
        質(zhì)量安全與檢驗檢測 2014年4期
        關(guān)鍵詞:檢測方法

        蘇建暉 蔡 穎 許如蘇 周廣彪 曾梅錦

        (汕頭出入境檢驗檢疫局 廣東汕頭 515031)

        1 前言

        綠膿桿菌也稱銅綠假單胞菌,在自然界分布廣泛,空氣、水、土壤中均有存在,易引起人皮膚化膿感染,特別是燒傷、燙傷、眼部疾病患者被感染后,常使病情惡化,并可引起敗血癥。因此,日本、歐盟、中國、美國等各國和地區(qū)均把它定為化妝品中的重要檢測指標,規(guī)定在化妝品中不得檢出。

        在現(xiàn)行國家標準[1]中,化妝品中綠膿桿菌的檢驗采用傳統(tǒng)方法,即選擇性增菌、平板分離培養(yǎng)、顯微鏡檢與生化鑒定。由于這種方法所需周期較長,工作量大,消耗試劑多,操作者需要有較豐富的實踐經(jīng)驗,并且靈敏度較低,因此,已不能滿足現(xiàn)代快、準、靈的要求。

        PCR技術(shù)在微生物檢測中已有很多研究報道[2-5],也被其他許多國家標準或行業(yè)標準采用[6-8],本項目對以oprI為靶基因?qū)崟r熒光PCR法檢測化妝品中的綠膿桿菌進行了研究,包括增菌液中DNA的提取方法、引物探針的設(shè)計及篩選、PCR反應條件及參數(shù)的優(yōu)化、特異性及標準曲線的建立以及靈敏度、重復性、穩(wěn)定性試驗等,以期建立更快、更好、更節(jié)約的新檢測方法或初篩方法,應用于化妝品生產(chǎn)企業(yè)對原材料、半成品、成品的質(zhì)量控制把關(guān)。

        2 材料與方法

        2.1 材料

        2.1.1 試驗樣品

        粉餅、沐浴露、發(fā)油、睫毛膏、洗發(fā)香波、護發(fā)素、發(fā)膠、唇彩、眼影、指甲油、口紅、啫喱密、面霜、香水:來源于汕頭櫻姬化妝品廠、汕頭市深特寶潔實業(yè)有限公司、汕頭市奇?zhèn)崢I(yè)有限公司、汕頭市金奇日化有限公司、汕頭市艾迪絲化妝品有限公司、廣東拉芳日化有限公司等單位。

        2.1.2 儀器

        Lightcycler480熒光定量PCR儀:瑞士Roche;低溫高速離心機:12000r/min以上,德國貝克曼公司;生物安全柜:美國FORMA;電子天平:精度至0.01g,梅特勒公司;恒溫生化培養(yǎng)箱:上海一恒;FTA卡:美國Whatman公司;打孔機:美國Whatman公司;脈沖均質(zhì)器:英國PUL100E。

        2.1.3 試劑

        Takara 2×PCR反應液:包括Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTP、TE液,寶生物工程大連有限公司;TE緩沖液:購自寶生物工程大連有限公司;超純水:Milli-Q純水器制得;SCDLP液體培養(yǎng)基:北京陸橋技術(shù)有限公司。

        2.1.4 試驗菌株

        15株冷凍干粉標準菌種:購自中國普通微生物菌株保藏中心(CGMCC)、 工業(yè)微生物菌種保藏管理中心(CICC)、中國醫(yī)學細菌保藏管理中心(CMCC )、美國菌種保藏中心(ATCC)、廣東省微生物研究所微生物菌種保藏中心(GIM);21株陽性工作菌株:來自CNAS能力驗證、本單位實驗室、汕頭市食品藥品監(jiān)督管理局、汕頭市金奇日化有限公司、汕頭市奇?zhèn)崢I(yè)有限公司、汕頭市中心醫(yī)院等單位;51株陰性菌株:來自中國菌種保藏中心、廣東省微生物研究所微生物菌種保藏中心等單位。詳見表1、表2、表3。

        表2 試驗陽性菌株的來源

        表3 試驗陰性菌株的來源

        2.2 方法

        2.2.1 引物和探針的設(shè)計與合成

        從GenBank中找到綠膿桿菌有高度保守性的編碼外膜蛋白(oprI)基因,并以此為目的基因設(shè)計引物、探針。引物和探針由大連寶生物技術(shù)有限公司合成。

        使用時,引物探針從冷凍冰箱取出后先回溫,需彈擊振勻,離心聚集后使用效果較佳。

        2.2.2 樣品制備

        參照化妝品衛(wèi)生規(guī)范(2007版)[1],取樣品10mL(g),其中水溶性樣品加到90mL滅菌生理鹽水中,疏水性樣品加5mL石蠟、10mL吐溫80、75mL滅菌生理鹽水,脈沖均質(zhì)器均質(zhì)15s,制成取1:10樣品稀釋液。

        2.2.3 增菌培養(yǎng)

        取1:10樣品稀釋液10mL加到90mLSCDLP液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)6h。如有綠膿桿菌生長,培養(yǎng)液常呈黃綠色或藍綠色,表面多有一層薄菌膜。

        2.2.4 模板DNA提取

        取1mL樣品增菌液于1.5mL離心管中,14000r/min離心3min,棄去上清液;加TE緩沖液洗滌沉淀1次,重復離心,棄去上清液;沉淀加100μL去離子水懸浮,于沸水浴中煮沸10min,冰浴5min,14000r/min離心3min,取上清液為模板。提取DNA時,由于1.5mL離心管存在內(nèi)外氣壓差,偶爾會出現(xiàn)沖蓋現(xiàn)象,因此在檢樣在上機擴增前最好先在干熱孵育器上以90℃預熱后,蓋緊,加貼封口膜,這樣能防止溢出。

        取1mL樣品增菌液于1.5mL離心管中,14000r/min離心3min,棄去上清液,加TE緩沖液洗滌沉淀1次,重復離心,棄去上清液,沉淀加100μL去離子水懸浮,于沸水浴中煮沸10min,冰浴5min,14000r/min離心3min,取上清液為模板。

        2.2.5 實時熒光PCR試驗

        反應總體積為20μL,其中Takara 2×PCR反應液10μL,20μmol/L上下游引物混合液1.0μL,20μmol/L探針0.1μL,模板2.0μL,超純水8.9μL。反應參數(shù)為:95℃ 50s,95℃ 5s,60℃ 40s(檢測熒光信號),40個循環(huán)。

        熒光信號采集波長:Hex(523nm-568nm)。

        2.2.6 結(jié)果判定

        反應結(jié)束后,取出PCR反應板。常規(guī)按照默認的二階求導法計算CP值數(shù)值,查看樣品、陽性和陰性對照擴增情況。陽性對照CP值<30,陰性對照無CP值,實驗成立,可進行實驗樣品的結(jié)果判定:CP值<35為試驗陽性;檢測不到CP值為試驗陰性;如CP值≥35,且擴增曲線明顯呈對數(shù)增長,判為可疑,應延長增菌培養(yǎng)時間至少2h,甚至培養(yǎng)過夜后重新試驗,若CP值明顯變小,則判為陽性,否則判為陰性。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 引物和探針序列

        引物和探針的序列見表4。

        表4 引物和探針的序列

        3.2 DNA提取方法

        3.2.1 不同方法比較

        本研究采用了兩種D N A提取方法進行比較。方法1:參照許如蘇[5]沸騰方法(見2.2.3、2.2.4),將上清液轉(zhuǎn)移至新管備用(不能及時檢驗,則放置于-20 ℃保存)。每20μL PCR反應體系中加入2μL模板。方法2:化妝品樣品經(jīng)SCDLP培養(yǎng)后,滴加200μL增菌液于FTA卡片圓圈中,風干1h后備用,以直徑0.5mm打孔器在FTA卡片上取1孔加入20μL PCR反應體系中。

        15株標準菌株、21株參考菌株、51株非綠膿桿菌菌株的檢測結(jié)果顯示兩種方法在特異性方面沒有明顯區(qū)別,均為100%。但卡片法在靈敏度上比沸騰法低一個量級,因為在滴加入SCDLP增菌液時,是以若干個點為中心進行擴散,菌濃度在卡片上的分布不甚均勻,故在低濃度時效果欠佳,不易檢出,而且FAT卡片法成本相對高,所以本研究采用沸騰法。靈敏度試驗結(jié)果詳見表6。

        3.2.2 洗滌步驟比較

        對沸騰法提取DNA是否一定要經(jīng)過兩次洗滌離心步驟進行了比較。比較對象為添加大約2000CFU/mL綠膿桿菌的各種化妝品SCDLP培養(yǎng)基,分經(jīng)洗滌與不經(jīng)洗滌進行測定,其余步驟均相同。

        結(jié)果顯示,不經(jīng)洗滌的樣品,除發(fā)膠外,其余如潤膚露、洗發(fā)水、淋浴露、粉餅、眼影等一般化妝品,提取效果良好,說明可不經(jīng)離心洗滌,直接沸騰10min,冰冷后離心取上清液測定。采用這種方式具有:①減少污染環(huán)境,更加符合生物安全操作;②實驗證明由于減少了洗滌步驟,從而可以減少DNA損失;③減少操作步驟,能提高工作效率。但未經(jīng)洗滌,個別樣品的擴增曲線較平,波形欠佳。此外,發(fā)膠可能含有抑制熒光的物質(zhì),故檢測不出綠膿桿菌。而經(jīng)過洗滌的測試樣品均可檢出綠膿桿菌,但CP值稍大些。具體結(jié)果見表5。

        表5 樣品前處理經(jīng)TE液洗滌效果比較

        綜合考慮,所有化妝品統(tǒng)一采用經(jīng)過洗滌的步驟,雖然降低一點靈敏度,但在準確度與擴增曲線線形上能取得較好效果。

        3.3 儀器條件的優(yōu)化

        反應退火溫度為60℃時,靈敏度較高,但一些非綠膿桿菌的假單胞菌,如惡臭假單胞菌、親水假單胞菌、洋蔥假單胞菌等的CP值在33-35之間,易造成可疑性干擾;而退火溫度為59℃時,既有較高的靈敏度,非綠膿桿菌的假單胞菌CP值均>35,不會干擾目標菌檢測。

        儀器檢測器采用523-568nm(Hex)通道采集熒光信號。

        3.4 特異性試驗

        以表1-表3的87株標準和參考菌株提取的DNA為模板,對綠膿桿菌進行實時熒光PCR試驗,同時檢測10份污染大量雜菌(無綠膿桿菌)的樣品,以驗證本方法對綠膿桿菌和自然界其他微生物的特異性。

        試驗結(jié)果顯示,只有相對應的菌株出現(xiàn)陽性反應,其他非對應菌株和污染雜菌的樣品全部均為陰性反應,說明針對綠膿桿菌建立的實時熒光PCR方法具有高度特異性。

        陰性反應中的惡臭假單胞菌、洋蔥假單胞菌、親水假單胞菌等均有擴增,但CP值處于≥35、<40之間,延長增菌培養(yǎng)時間至16h后重新試驗,CP值無明顯變小,仍處于≥35、<40之間;陰性反應中金黃色葡萄球菌、大腸埃希氏菌、黑曲霉、白色念珠球菌等檢測不到CP值。陽性反應的CP值均<30;當綠膿桿菌菌濃度<1CFU/反應體系時,CP值有時會處于≥35、<40之間,但延長增菌培養(yǎng)時間至16h后重新試驗,CP值明顯變小至<30。

        3.5 靈敏度試驗

        綠膿桿菌標準菌株經(jīng)營養(yǎng)肉湯復壯、十六烷甲基溴化銨培養(yǎng)基分純培養(yǎng)后,劃血平板,以接種環(huán)挑取新鮮菌苔若干環(huán)配成一定麥氏度的菌懸液;取1.0mL該菌液加入90mLSCDLP液中,再添加1.0g模擬潤膚露作化妝品本底后,振蕩均勻;將該SCDLP液依次進行10倍稀釋,配成10-1-10-9濃度的系列標準菌株稀釋樣液;各取1.0mL該系列標準菌株稀釋樣液,以營養(yǎng)瓊脂平板培養(yǎng),計數(shù)菌含量,同時按化妝品中實時熒光PCR方法對該系列標準菌株稀釋樣液提取DNA后測定綠膿桿菌,結(jié)果見表6。

        表6 靈敏度試驗結(jié)果

        結(jié)果顯示,沸騰法實時熒光PCR試驗的靈敏度均能達到低于2CFU/反應體系,非常靈敏。

        3.6 線性關(guān)系

        按照與3.5同樣的步驟進行試驗,結(jié)果見圖1、圖2。

        圖1 引物1綠膿桿菌靈敏度擴增曲線

        圖2 引物1綠膿桿菌標準曲線

        結(jié)果顯示,當綠膿桿菌濃度處于103-107CFU/mL,初始菌濃度對數(shù)值與CP值呈良好的線性關(guān)系。

        3.7 重復性試驗

        配制含綠膿桿菌高、中、低不同菌濃度的模擬潤膚露SCDLP培養(yǎng)液,每個濃度各測定5次,計算變異系數(shù),結(jié)果見表7、圖3。

        表7 重復性試驗結(jié)果

        圖3 重復試驗擴增曲線

        結(jié)果顯示,其批內(nèi)CP值的變異系數(shù)小于2%??梢娫搶崟r熒光PCR方法具有良好的可重復性,滿足實驗統(tǒng)計學要求。

        3.8 熒光PCR試劑的穩(wěn)定性檢測結(jié)果

        試劑組成如下:TE緩沖液、Takara 2×PCR反應液、引物探針反應液1套、陽性對照模板、陰性對照模板、去離子水。

        穩(wěn)定性檢測已進行12次,延續(xù)12個月,檢測結(jié)果仍保持穩(wěn)定。因此,試劑組成的有效期至少12個月。

        3.9 與GB方法的比較

        綠膿桿菌實時熒光PCR方法與GB標準傳統(tǒng)方法比較,方法特異性吻合率達100%,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。

        當染菌量>50CFU/g時,實時熒光PCR方法的檢測結(jié)果與GB標準傳統(tǒng)方法檢測結(jié)果一致,但檢測速度快10倍以上;當染菌量<50CFU/g時,兩者的檢測結(jié)果出現(xiàn)波動,即有的樣品為陽性,有的樣品為陰性,且不完全一致,但實時熒光PCR方法的檢出率較GB標準傳統(tǒng)方法稍高,原因是實時熒光PCR方法的提取DNA后有一個濃縮10倍的操作,如果進一步縮小定容體積,擴大濃縮倍數(shù),也可以再提高檢出限附近的陽性率。

        4 結(jié)論

        (1)以oprI為靶基因的實時熒光PCR檢測化妝品中綠膿桿菌的方法,具有準確、靈敏、快速、操作簡便與高通量檢測等特點,可在食藥局、技監(jiān)局、檢驗檢疫局、化妝品企業(yè)中推廣應用。

        (2)由于化妝品中綠膿桿菌檢測尚無有關(guān)PCR技術(shù)的標準方法,因此建議將此方法上升為標準方法。

        (3)據(jù)查ATCC綠膿桿菌標準菌株有近300株,由于資金不足等條件限制,本研究只對現(xiàn)有的15株標準菌株與21株陽性工作菌株進行了試驗,效果均滿意,但未能進行更多試驗,因此普遍性適用研究還有待更深入的驗證。

        [1]化妝品衛(wèi)生規(guī)范(2007版)[S].

        [2]劉芳. 環(huán)介導等溫擴增快速檢測銅綠假單胞菌的研究[J]. 檢驗檢疫學刊,2013,4:4-6.

        [3]徐德順. 大腸桿菌O157:H7實時熒光PCR快速檢測方法的建立[J].上海預防醫(yī)學雜志,2009,21(4):7-9.

        [4]徐璇. 熒光實時定量PCR檢測銅綠假單胞菌方法建立及價值[J].中國醫(yī)師雜志,2006,8(12):1614-1617.

        [5]許如蘇. 沙門氏菌和大腸桿菌O157:H7雙重熒光PCR檢測方法的研究[J]. 中國動物檢疫,2008,25(3):36-40.

        [6]SN/T 1869-2007 食品中多種致病菌快速檢測方法PCR法[S].

        [7]SN/T 2358-2009 國境口岸炭疽芽孢桿菌熒光定量PCR檢測方法[S].

        [8]SN/T 2425-2010 進出口食品中霍亂弧菌快速及鑒定監(jiān)測方法實時熒光PCR方法[S].

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