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        小鼠CDC26基因短發(fā)夾RNA重組腺病毒載體的構(gòu)建與表達(dá)分析

        2014-10-27 09:04:52程然然閆永紅弓蒙蒙曹培麗賀福初王曉暉
        生物技術(shù)通訊 2014年5期
        關(guān)鍵詞:腺病毒滴度載體

        程然然,閆永紅,弓蒙蒙,曹培麗,賀福初,,王曉暉

        1.北京工業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)與生物工程學(xué)院,北京 100124;2.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所,北京蛋白質(zhì)組研究中心 蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 102206

        細(xì)胞分裂周期蛋白26(cell division cycle 26,CDC26)是細(xì)胞周期后期促進(jìn)復(fù)合物(cell cycle anaphase-promotingcomplex,APC)家 族 成 員 。CDC26基因是編碼泛素連接酶的基因之一,通過編碼細(xì)胞中泛素連接酶來調(diào)控細(xì)胞周期蛋白的合成與分解,以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞周期性的分裂與增殖分化[1-2]。CDC26和APC6連接后,可以對細(xì)胞周期蛋白的降解產(chǎn)生作用[3]。

        目前對CDC26基因的研究報道不多,大多都是對CDC25和CDC42基因所控制的其蛋白家族的研究[4-6]。RNA干擾(RNA interfering,RNAi)是近年發(fā)展迅速的一項(xiàng)生物技術(shù),已成為基因功能研究和基因治療的強(qiáng)有力工具[7]。我們以短發(fā)夾RNA(short hair RNA,shRNA)腺病毒為介導(dǎo),構(gòu)建靶向干擾CDC26基因的表達(dá)載體,為CDC26基因功能的研究提供相關(guān)技術(shù)手段和積累資料。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        人293A細(xì)胞株、HeLa細(xì)胞株、小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(mouse embryonic fibroblast,MEF)、大腸桿菌Top10菌株、穿梭載體pENTRY-EF1a-EGFP-Mir30、腺病毒載體pAd/pl-DEST均來自北京蛋白質(zhì)組研究中心分子遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室;DNA限制性內(nèi)切酶、T4DNA連接酶購自NEB公司;Gateway體外重組系統(tǒng)、PEI轉(zhuǎn)染試劑、TRIzol購自Invitrogen公司;DNA快速純化回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購自Promega公司;其他常規(guī)試劑均為進(jìn)口或國產(chǎn)分析純級產(chǎn)品。

        1.2 穿梭載體pENTRY-CDC26-shRNA的構(gòu)建和鑒定

        參考小鼠CDC基因(GenBank:NM_139291.3)設(shè)計CDC26基因的靶向shRNA序列(TGCTGTTGACA GTGAGCGCAGCTCAAGCTCGACGACATTGTAGTGAAGCCACAGA TGTACAATGTCGTCGAGCTTGAGCTTTGCCTACTGCCTCGGA)及對照組shRNA序列(為GFP的靶向序列,命名為S000)(TGCTGTTGACAGTGAGCGAAACGTCTATATCATGGCCG ACTAGTGAAGCCACAGATGTAGTCGGCCATGATATAGACGTTGT GCCTACTGCCTCGGA)。

        本研究避開了傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增靶向shRNA序列,而是依據(jù)DNA雙鏈互補(bǔ)性質(zhì)將目的序列分割合成,而后以退火連接的方式構(gòu)建其載體。CDC26序列拆分如下:

        A:tcgagaaggtatattgctgttgacagtgagcgCAGCTCAAGCTCGACG ACATTG;B:ttcactaCAATGTCGTCGAGCTTGAGCTGcgctcactgtca acagcaatataccttc;C:tagtgaagccacagatgtaCAATGTCGTCGA GCTTGAGCTTtgcctactgcctcgg;D:aattccgaggcagtaggcaAAG CTCAAGCTCGACGACATTGtacatctgtggc。

        S000對照組以同樣的方法拆分,由華大基因有限公司(北京)合成。A和B退火,C和D退火,退火產(chǎn)物直接暴露有XhoⅠ和EcoRⅠ酶切位點(diǎn),無須再次酶切。將2段退火產(chǎn)物與pENTRY-EF1a-EGFPMir30(XhoⅠ和EcoRⅠ酶切回收)載體用T4DNA連接酶連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10感受態(tài)細(xì)胞,卡那霉素(Kan)抗性選擇陽性克隆,提質(zhì)粒,送華大基因有限公司進(jìn)行測序鑒定。

        1.3 重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA的構(gòu)建

        將測序鑒定正確的pENTRY-CDC26-shRNA載體用Gateway體外重組系統(tǒng)重組到pAd/pl-DEST。Gateway反應(yīng)體系(10 μL)包括6 μL TE(pH8.0)、1 μL pENTRY-CDC26-shRNA(100 ng)、1 μL pAd-DEST(150 ng)、2 μL LRⅡ重組酶。室溫反應(yīng)1 h,轉(zhuǎn)化大腸桿菌TOP10感受態(tài)細(xì)胞,氨芐西林(Amp)抗性選擇陽性克隆,提取質(zhì)粒用EcoRⅠ酶切鑒定。

        1.4 重組腺病毒的包裝與擴(kuò)增

        將正確的重組子用PacⅠ酶切線性化,乙醇沉淀法回收,用PEI轉(zhuǎn)染293A細(xì)胞,24 h后觀察GFP的表達(dá),培養(yǎng)7~10 d后在顯微鏡下觀察細(xì)胞空斑病變,當(dāng)細(xì)胞中出現(xiàn)病變且視野中局部或全部為綠色熒光時,表明重組腺病毒在293A細(xì)胞中包裝成功。當(dāng)部分細(xì)胞開始變圓并脫落時,收集細(xì)胞及其培養(yǎng)液,于-80℃與37℃反復(fù)凍融3次裂解細(xì)胞以釋放病毒顆粒,4000 r/min離心10 min,取上清于-80℃保存,將回收到的病毒原液感染新的293A細(xì)胞,擴(kuò)增病毒,回收備用。

        1.5 病毒滴度的測定

        準(zhǔn)備生長良好的HeLa細(xì)胞,消化計數(shù)稀釋至1×105/mL,加入6孔板,1 mL/孔;將3個稀釋度(10-2、10-3、10-4)的病毒加入6孔板,24 h后觀察病毒感染細(xì)胞的熒光數(shù)量[8],利用流式細(xì)胞儀檢測病毒滴度。

        1.6 CDC26 shRNA重組腺病毒在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)及干擾效果鑒定

        基礎(chǔ)細(xì)胞培養(yǎng)液加10%胎牛血清(FBS)培養(yǎng)MEF,其密度達(dá)90%時用已知滴度的病毒液感染細(xì)胞,24 h后觀察GFP的表達(dá)情況,以確定重組腺病毒是否感染MEF。收集感染的實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞與對照組(S000)細(xì)胞,TRIzol法提取總RNA,并反轉(zhuǎn)錄形成cDNA。采用實(shí)時熒光定量PCR(qPCR)檢測CDC26基因mRNA的表達(dá)情況[9-10]。以β-actin為內(nèi)參,用NCBI Primer Blast設(shè)計各組的定量檢測引物CDC26-F(5'-TGCAGAGGCCTGAAAAGAGATTT-3')、CDC26-R(5'-ACTCCTCAATGTCGTCGAGC-3')、 β-ac?tin-F(5'-AACAGTCCGCCTAGAAGCAC-3')和 β-actin-R(5'-CGTTGACATCCGTAAAGACC-3')。用 2-ΔΔCt法進(jìn)行相對定量分析,檢測CDC26基因mRNA的表達(dá)情況。

        2 結(jié)果

        2.1 穿梭質(zhì)粒pENTRY-CDC26-shRNA的克隆

        將克隆好的CDC26與對照組S000入門質(zhì)粒進(jìn)行測序鑒定,證實(shí)所設(shè)計的shRNA序列已正確插入pENTRY-EF1α-EGFP-Mir30載體。

        2.2 重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA的構(gòu)建

        pAd-CDC26-shRNA載體經(jīng)EcoRⅠ酶切,結(jié)果與理論預(yù)期相符(圖1),表明成功構(gòu)建了腺病毒重組載體pAd-CDC26-shRNA。

        2.3 重組腺病毒的包裝

        帶有GFP標(biāo)記的線性化pAd-CDC26-shRNA及對照組pAd-S000-shRNA載體轉(zhuǎn)染293A細(xì)胞8 d后,在顯微鏡下觀察到細(xì)胞病變,且GFP充滿視野中的絕大多數(shù)細(xì)胞,表明腺病毒包裝成功(圖2)。

        2.4 病毒滴度測定結(jié)果

        用流式細(xì)胞儀檢測3個濃度梯度的細(xì)胞熒光產(chǎn)生情況,結(jié)果見圖3,陰性對照組無熒光產(chǎn)生,其余3組(10-2、10-3、10-4)都產(chǎn)生了不同層次的熒光數(shù)目。假定每一個細(xì)胞內(nèi)只有一個病毒進(jìn)入,則根據(jù)公式及10-2管的病毒感染率可計算出病毒初液的滴度(UT/mL)=0.835×1.18×106×100/0.9=1.09×1010。

        2.5 CDC26 shRNA重組腺病毒在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)及干擾效果

        用已知滴度的病毒感染3代以內(nèi)的MEF,24 h后在熒光顯微鏡下觀察,可見視野中有大量綠色熒光(圖4),說明重組腺病毒成功感染了MEF。收集各組細(xì)胞進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR檢測,結(jié)果表明熒光定量PCR引物具有很好的溶解曲線(圖5),表明PCR引物特異性良好。被感染了病毒的細(xì)胞其相應(yīng)的基因擴(kuò)增率僅為26.85%,可計算出設(shè)計和構(gòu)建的shRNA對細(xì)胞中CDC26基因的抑制率為73.14%(圖6),表明成功構(gòu)建了具有較高敲低效果的shRNA腺病毒載體。

        2.6 CDC26 shRNA重組腺病毒在小鼠肝臟內(nèi)的干擾效果研究

        用已知病毒滴度的腺病毒,尾靜脈注射6~8周雄性C57/BL6小鼠,1010/只,對照組和實(shí)驗(yàn)組各5只,注射1周后測量小鼠空腹血糖。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與對照小鼠相比,注射CDC26 shRNA的小鼠的血糖值明顯降低(圖7),表明CDC26在小鼠體內(nèi)血糖的維持中起重要作用,同時暗示了CDC26在糖代謝過程中的重要作用。

        3 討論

        CDC26是APC家族中的一員,由位于小鼠4號染色體上的CDC26基因編碼,對調(diào)控細(xì)胞周期具有重要作用。目前有關(guān)APC家族的研究主要集中在CDC25和CDC42上[11],對CDC26的研究報道較少。

        圖1 pAd-CDC26-shRNA重組質(zhì)粒的酶切鑒定

        圖2 重組腺病毒包裝過程中的細(xì)胞病變效應(yīng)及GFP表達(dá)(×40)

        圖3 流式細(xì)胞術(shù)檢測pAd-CDC26-shRNA重組腺病毒滴度

        圖4 重組腺病毒感染MEF(×40)

        圖5 實(shí)時熒光PCR引物特異性的溶解曲線

        圖6 構(gòu)建的shRNA敲低CDC26 mRNA的RT-qPCR檢測結(jié)果

        圖7 病毒注射7 d后C57/BL6小鼠的空腹血糖值

        為了進(jìn)一步研究CDC26在細(xì)胞中可能發(fā)揮的作用,我們設(shè)計了CDC26基因的shRNA。鑒于腺病毒具有感染效率高、宿主廣泛、容易制備表達(dá)、不整合入染色體、表達(dá)效率高等優(yōu)點(diǎn),我們選擇構(gòu)建CDC26基因的shRNA腺病毒載體。通過限制性內(nèi)切酶分析及堿基序列測定,證明構(gòu)建了重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA。我們在293A細(xì)胞中包裝了重組腺病毒。RT-qPCR檢測結(jié)果顯示,感染pAd-CDC26-shRNA腺病毒的MEF中CDC26基因的mRNA表達(dá)明顯減少,證明靶向shRNA表達(dá)成功。我們還發(fā)現(xiàn)CDC26敲低后小鼠的血糖值會明顯降低。以上結(jié)果為下一步機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ)。

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