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        利用GS技術(shù)選育耐高溫高糖葡萄糖酸鹽生產(chǎn)菌

        2014-10-24 10:16:36沈玉平張祖姣

        沈玉平 張祖姣

        (湖南科技學(xué)院 生命科學(xué)與化學(xué)工程系,湖南 永州 425199)

        葡萄糖酸鹽主要用于人體微量元素補(bǔ)充[1]和建筑添加劑,在食品、建筑行業(yè)有著廣泛的應(yīng)用。

        葡萄糖酸鹽主要通過微生物發(fā)酵法生產(chǎn)。我國(guó)大部分地區(qū)夏季溫度高、時(shí)間跨度長(zhǎng)。因此,夏季生產(chǎn)必然導(dǎo)致能卻能耗的增加。此外,在葡萄糖酸發(fā)酵過程中,采用高濃度葡萄糖發(fā)酵,葡萄糖的分解產(chǎn)生高濃度的葡萄糖分解代謝物如葡萄糖酸、丙酮酸等阻遏物,阻遏葡萄糖氧化酶的合成[2],延長(zhǎng)發(fā)酵時(shí)間。因此,選育具有耐高溫、高糖性狀的葡糖糖酸鹽生產(chǎn)菌株具有重要的意義。

        基因組改組(GS, Genome Shuffling)技術(shù)是分子定向進(jìn)化在全基因組水平上的延伸,它以整個(gè)基因組為操作對(duì)象,模擬生物進(jìn)化過程,將具有不同正突變的多個(gè)全基因組進(jìn)行隨機(jī)重組,從而快速選育出高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)菌株或目的性狀得到較大改進(jìn)的菌株。Zhang Ying-Xing[3]等通過基因組改組快速提高了弗氏鏈霉菌生產(chǎn)泰樂星的能力。Ranjan Patnaik[4]等通過基因組改組提高了乳酸菌的耐酸能力,大大提高了乳酸的合成能力。Genome Shuffling技術(shù)最大的優(yōu)點(diǎn)就是可以在基因型和表型的相關(guān)機(jī)制不是很清楚的情況下可以迅速將決定某一理想表型的多個(gè)甚至十幾個(gè)突變基因組合在一起從而達(dá)到改進(jìn)的目的。因此,對(duì)于提高微生物的環(huán)境耐受性等基因編碼機(jī)制尚不清楚的性狀,Genome Shuffling技術(shù)有著獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。本文在理化誘變的基礎(chǔ)上,利用Genome Shuffling技術(shù)選育耐高溫和高初始葡萄糖糖性能優(yōu)良的改組菌株,并通過搖瓶實(shí)驗(yàn)5 L發(fā)酵罐實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其耐受高溫和初始葡萄糖糖性能。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株

        黑曲霉ZBY-7(Aspergillus.niger ZBY-7)[5],本實(shí)驗(yàn)室保存。菌種保藏于4 ℃的斜面培養(yǎng)基中,每?jī)蓚€(gè)月轉(zhuǎn)種一次。

        1.1.2 試劑

        蝸牛酶、 纖維素酶、溶菌酶購(gòu)于上海勵(lì)瑞生物科技有限公司;亞硝基胍(NTG)為FLUKA公司產(chǎn)品,其他化學(xué)試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?/p>

        1.1.3 培養(yǎng)基

        斜面培養(yǎng)基:葡萄糖 300 g、KH2PO40.15 g、KCl 0.2 g、MgSO4.7H2O 0.12 g 、(NH4)2HPO40.6 g、瓊脂 20 g,蒸餾水1000mL,自然pH。

        初篩培養(yǎng)基:參閱文獻(xiàn)[6]。

        發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖 300 g、MgSO4.7H2O 0.15 g 、KH2PO40.35 g、CaCO335 g、尿素 0.55 g,蒸餾水1000 mL,自然pH。

        原生質(zhì)體再生培養(yǎng)基[6,7]:初篩培養(yǎng)基中加入 0.6M 的MgSO4滲透壓穩(wěn)定劑即可。

        1.2 方法

        1.2.1 亞硝基胍-紫外誘變

        挑取新鮮斜面上孢子將濃度調(diào)整到 1×106個(gè)/ml,制成孢子懸液。準(zhǔn)確稱取5mg 亞硝基胍加入到6 cm無(wú)菌培養(yǎng)皿中,用1滴丙酮助溶,加入5 ml孢子懸液,在功率為15 W,距離為30 cm的紫外燈下分別照射0.5、1、1.5、2、2.5、3、3.5、4 min,在紅光下取處理后的孢子懸液0.1ml涂布于平板上,培養(yǎng)后菌落計(jì)數(shù),繪制致死曲線。

        1.2.2 正突變基因庫(kù)的獲得

        出發(fā)菌株經(jīng)亞硝基胍-紫外誘變,37 ℃、30 % 初始葡萄糖濃度條件下耗糖速率大于出發(fā)菌株30 ℃、10 % 初始糖濃度條件下耗糖速率的突變株為正突變株。

        1.2.3 基因組改組

        1.2.3.1 原生質(zhì)體的制備 參閱文獻(xiàn)[7]。

        1.2.3.2 原生質(zhì)體的滅活 將原生質(zhì)體于 50 ℃水浴處理1、2、3、4、5 min,計(jì)算原生質(zhì)體的致死率。

        1.2.2.3 基因組改組 將各正突變株原生質(zhì)體按1:1比例混合,在25 %聚乙二醇(PEG)6000、0.01 mol/L CaCl2溶液促融下對(duì)個(gè)正突變株的整個(gè)基因組進(jìn)行隨機(jī)重組,并通過定向篩選技術(shù)篩選出耐受高溫、高初始葡萄糖性狀得到提高的改組菌株。

        1.2.4 篩選方法

        1.2.4.1 初篩 根據(jù)初篩平板上透明圈的大小進(jìn)行初篩。

        1.2.4.2 復(fù)篩 黑曲霉發(fā)酵生產(chǎn)的葡萄糖酸導(dǎo)致發(fā)酵液pH,從而抑制菌株繼續(xù)產(chǎn)酸,因此搖瓶發(fā)酵時(shí)采用 CaCO3中和產(chǎn)生的葡萄糖酸,以達(dá)到調(diào)節(jié)pH的目的。葡萄糖酸鈣的溶解度很低(40 g.L-1),未溶解的葡萄糖酸鈣以晶體的形式吸附在菌體上。因此,檢測(cè)發(fā)酵液中的葡萄糖酸鈣的含量不能真實(shí)的反應(yīng)發(fā)酵所產(chǎn)生的葡萄糖酸。劉建忠[8]經(jīng)多年研究發(fā)現(xiàn),黑曲霉 ZBY-7發(fā)酵消耗的葡萄糖幾乎完全被用來(lái)產(chǎn)酸,葡萄糖的消耗量能夠真實(shí)的反應(yīng)菌株在發(fā)酵過程中葡萄糖酸的產(chǎn)生量。因此,本文通過檢測(cè)發(fā)酵液中殘?zhí)呛浚云咸烟堑南乃俾剩╩g.h-1.mL-1)表征菌株的產(chǎn)酸能力。

        1.2.5 葡萄糖的測(cè)定

        葡萄糖的測(cè)定采用氧化還原滴定法[8]。

        1.2.6 5 L發(fā)酵罐水平實(shí)驗(yàn)

        在搖瓶實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,在5 L發(fā)酵罐水平上考察高濃度初始糖、高溫條件下改組菌株發(fā)酵狀況。發(fā)酵條件為pH 6.0,溫度37℃,初始葡萄糖濃度為30%,轉(zhuǎn)速 950 rpm 通氣量前2 h 為2 vvm,以后均為8 vvm,采用40% NaOH作為 pH調(diào)節(jié)劑,依據(jù)流加NaOH的體積計(jì)算發(fā)酵過程中產(chǎn)生的酸。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 亞硝基胍-紫外線誘變

        通過紫外線、亞硝基胍處理,其處理時(shí)間和致死率關(guān)系如圖1。

        研究表明,致死率85%左右比較容易獲得正突變株,因此我們選擇3.0 min的處理時(shí)間。

        圖1.亞硝基胍-紫外線誘變會(huì)致死曲線

        2.2 正突變基因庫(kù)的獲得

        本文通過經(jīng)典的亞硝基胍-紫外線誘變獲取基因組改組所需的正突變基因組庫(kù)。以黑曲霉 ZBY-7為出發(fā)菌株度,亞硝基胍、紫外線處理3 min,獲得正突變株9株,其耗糖速率如表1。

        表1 突變株耗糖速率

        從表1我們可以看出,在初始葡萄糖濃度提高到30 %,發(fā)酵溫度提高到37 ℃情況下,突變耗糖速率較出發(fā)菌株有較大幅度的提高,其中最高的一株 A.niger-NU-3 較出發(fā)菌株提高12.48 %。這證明,通過誘變,各正突變株初步具有了耐高溫高糖的性能。

        2.3 原生質(zhì)體滅活

        原生質(zhì)體分別處理 1、2、3、4、5min,其致死情況見圖2。

        圖2.黑曲霉原生質(zhì)體滅活致死曲線

        從圖2我們可以看出,熱滅活能夠完全滅活黑曲霉原生質(zhì)體。因此,為排除基因組改組過程中親本的干擾,我們采用的50 ℃,水浴5 min的滅活方式進(jìn)行親本滅活。

        2.4 基因組改組

        以亞硝基胍-紫外線誘變所獲得的 9株正突變株為出發(fā)菌株進(jìn)行基因組改組,獲得8株正融合株,結(jié)果如表2所示。其中耗糖速率最高的一株為 3.00mg.h-1.mL-1,命名為A.niger-GS-30,其耗糖速率較出發(fā)菌株提高28.21%。

        表2融合子的耗糖速率

        A.niger-GS-30 3.00 A.niger-GS-34 2.98 A.niger-GS-42 2.93 A.niger-GS-58 2.94 A.niger-GS-62 2.96

        在此次基因組改組中,菌株的耗糖速率未得大幅度提高,這可能是菌株的耗糖能力已接近極限,很難再提高;也有可能是由于遺傳背景差異較小造成的,在今后的改組中,可以采用不同的誘變劑誘變獲得遺傳背景差異較大的菌株,可能會(huì)取得更好的效果。

        2.5 5 L發(fā)酵罐水平發(fā)酵實(shí)驗(yàn)

        為驗(yàn)證耐高糖高溫菌株A.niger-GS-30在發(fā)酵罐水平上是否具有可信性和可重復(fù)性,本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了5L發(fā)酵罐的葡萄糖酸鈉的發(fā)酵實(shí)驗(yàn)。發(fā)酵過程中,對(duì)殘?zhí)牵≧G)和葡萄糖酸鈉的產(chǎn)量(以葡萄糖酸鈉的濃度表示,g.L-1)作了檢測(cè),并將與出發(fā)菌株作了比較,結(jié)果如圖3。

        圖3.A.niger-GS-30在 5 L發(fā)酵罐水平上殘?zhí)菨舛茸兓?葡萄糖酸鈉產(chǎn)量關(guān)系圖

        圖中“◆”為出發(fā)菌株殘?zhí)茿.niger-ZBY-7含量,“◇”為出發(fā)菌株 A.niger-ZBY-7葡萄糖酸鈉含量;“▼”為改組菌株 A.niger-GS-30殘?zhí)呛浚啊蟆睘楦慕M菌株A.niger-GS-30葡萄糖酸鈉含量。

        從圖3中我們可以看出,在高初始糖濃度高溫條件下,隨著葡萄糖濃度的下降,葡萄糖酸鈉濃度持續(xù)升高。A.niger-GS-30發(fā)酵2小時(shí)時(shí)已經(jīng)流加開始NaOH,說明菌體已經(jīng)開始產(chǎn)酸,而出發(fā)菌株直到發(fā)酵 4小時(shí)后才開始流加NaOH。比起出發(fā)菌株,A.niger-GS-30的適應(yīng)期縮短2h。發(fā)酵時(shí)間上,在同為30%的初始糖濃度下,出發(fā)菌株的發(fā)酵時(shí)間為36h,而A.niger-GS-30的發(fā)酵時(shí)間為33h,發(fā)酵時(shí)間縮短3h。

        從發(fā)酵的效果看,A.niger-GS-30產(chǎn)率為40.82 g.h-1,比出發(fā)菌株37.12 g.h-1的產(chǎn)率提高9.97 %;A.niger-GS-30的轉(zhuǎn)化率與出發(fā)菌株相當(dāng),分別為113.03%和111.96%。無(wú)論是發(fā)酵的產(chǎn)率還是轉(zhuǎn)化率,A.niger-GS-30都比出發(fā)菌株有一定的提高。

        3 結(jié)論

        3.1 通過亞硝基胍-紫外線復(fù)合誘變,初步獲得具有耐受高溫高糖性能的突變株,作為正突變株基因庫(kù)。

        3.2 熱滅活5 min 可完全滅活黑曲霉原生質(zhì)體,可有效的排除基因組改組后改組菌株篩選的干擾。

        3.3 通過基因組改組,獲得一株能耐受37 ℃高溫,30 %初始葡萄糖的改組菌株,其耗糖速率較出發(fā)菌株提高28.2 %,發(fā)酵溫度提高7 ℃,初始葡萄糖耐受濃度由10 %提高到30 %。

        4 討論

        本文通過基因組改組成功獲得一株耐高溫高糖的葡萄糖酸鹽生產(chǎn)菌,無(wú)論耗糖速率還是發(fā)酵溫度及初始糖耐受濃度均得到較大提高。這說明,在現(xiàn)今環(huán)境耐受性能的機(jī)制及基因編碼控制尚未完全弄清楚的情況下,使用 Genome shuffling技術(shù)提高菌株的環(huán)境耐受性仍不失為一種快速便捷的方法。但是,如果不采用多元化來(lái)源的正突變基因庫(kù),其性能提高幅度將大大降低。在本文中,基因組改組的出發(fā)菌株均為亞硝基胍-紫外線復(fù)合誘變后的正突變株,其遺傳背景差異較小,因此,本次改組雖然耐高溫高糖的性能得到較大提高,但葡萄糖的耗糖速率卻提高有限。此外,如果不采用合理的方法定向篩選改組菌株,也將大大增加篩選的工作量。在本文中,采用熱滅活的方法排除親本的干擾,并通過透明圈的方法進(jìn)行初篩,這樣就大大減少了定向篩選的工作量。

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