林 榮 王 彬 劉燕飛
浙江省溫州市中心血站,浙江溫州 325000
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是黃病毒科肝炎病毒,為RNA正鏈病毒[1]。鑒于HCV基因組的變異性較大,故HCV存在不同的基因型。目前,根據(jù)Simmonds分型系統(tǒng)共有6個基因型,68個亞型。我國主要以 1a、1b、2a、2b、3a 基因型為主,且均有相關(guān)報道文獻(xiàn)[2]。我國HCV感染率較高,平均為3.2%,該類感染可導(dǎo)致慢性肝炎、肝硬化、肝癌等病癥,其臨床癥狀的輕重程度與感染基因型相關(guān),一般1b型較非1b型肝功能損害病情嚴(yán)重,易惡化[3-5]。因此,對HCV感染區(qū)分基因分型對于丙型肝炎的個體化治療作用明顯。本研究采用PCR技術(shù)對溫州地區(qū)HCV感染者進(jìn)行基因型研究,了解本地區(qū)患者主要基因型,以探討HCV基因型的分布特征,并分析基因型與病情的關(guān)系,現(xiàn)報道如下:
收集 2010年 1月~2012年 12月溫州市中心血站(以下簡稱“我站”)自愿獻(xiàn)血者244例,經(jīng)ELISA方法證實HCV抗體陽性者122例,年齡23~56歲,其中男 68例,女 54例;健康者 122例,年齡 20~58歲,其中男70例,女52例。收集同期溫州某醫(yī)院門診患者122例,其中,輸血后丙肝 14例,男 4例,女 10例,年齡15~64歲;散發(fā)性丙肝 25例,男 15例,女 10例,年齡 17~60歲;肝硬化 40例,男 27例,女 13例,年齡11~69歲;原發(fā)性肝癌 43例,男 21倒,女 22例,年齡23~68歲。采集靜脈血,全部血清標(biāo)本均來自我站檢驗科及醫(yī)院門診患者。所有患者診斷均符合2000年9月西安第10次全國傳染病與寄生蟲病和肝病學(xué)術(shù)會議修訂的《病毒性肝炎防治方案》的標(biāo)準(zhǔn):血清抗-HCV陽性、HCV RNA>80 copies/mL,伴或不伴肝功能異常,均伴有不同程度的肝硬化。兩組研究對象年齡、性別比例等一般資料比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。且研究對象均知情同意,已經(jīng)我站業(yè)務(wù)科通過。
全血RNA提取試劑盒(北京艾比根生物技術(shù)有限公司);HCV抗體診斷試劑盒(北京科美東雅生物技術(shù)有限公司);Taq酶、引物、RNA酶抑制劑(上海玉博生物科技有限公司);M-MuLV逆轉(zhuǎn)錄酶(Simga公司)。
1.3.1 PCR引物設(shè)計 自Genebank中查找HCV 1a、1b、2b、3a型全序列,查找各型 5′UTR 區(qū)共同序列,并以此自行設(shè)計引物。 外引物:S1 (nt34~54):5′-ATCACTCCCCTGTGAGGAAC-3′;S2(nt279~299):5′-CCCTATCAGGCAGTACCACA-3′;內(nèi)引物:S3(nt39~59):5′-TCCCCTGTGAGGAACTACTG-3′;S4 (nt274~294):5′-TCAGGCAGTACCACAAGGCC-3′。
1.3.2 HCV RNA提取及AMV反轉(zhuǎn)錄 所收集的血清,12 000 r/min離心10 min,取上清,-70℃冰箱保存?zhèn)溆?。利用Trizol法提取備用血清中的病毒RNA,具體操作方法為:于 30 μL血清中加入 Trizol溶液、氯仿及異丙醇,預(yù)冷振蕩并洗滌,所得RNA于-70℃超低溫冰箱中保存?zhèn)溆?。另外在EP管中依次加入模板RNA、oligo(dT)16、dNTPmixture、RNase Inhibitor、AMV及 DEPC水,混勻均勻,42℃保溫 1 h,95℃保溫 5 min后冰上冷卻后,行反轉(zhuǎn)錄。
1.3.3 巢式PCR擴增和酶切反應(yīng) 于EP管中分別加入 cDNA 模板,Taq DNA 聚合酶,10×PCR buffer,上游引物(25 mmol/L)、下游引物 1μL,dNTP,滅菌去離子水,行擴增,并于 95℃預(yù)變性 4 min,95℃變性 30 s,55℃退火 30 s,70℃延伸 30 s,70℃延伸 5 min,進(jìn)行35個循環(huán)后得到第1輪擴增產(chǎn)物。以其為模板,等同條件下行第2輪擴增。取第2輪PCR產(chǎn)物,分別加入19.5 μL Hae Ⅲ和 Bsh 1236Ⅰ及 buffer溶液,37℃水浴2 h,2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定結(jié)果。
所有數(shù)據(jù)采用SPSS 15.0統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗,等級資料采用秩和檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
1b 陽性(144 bp)、2a陰性表達(dá);1b 陰性、2a陽性(174 bp)表達(dá);1b 陽性(144 bp)、2a 陽性(174 bp)表達(dá),見圖1。
圖1 溫州地區(qū)HCV分型凝膠電泳圖
結(jié)果顯示,所有研究對象中,門診肝病患者1b總陽性率為100.0%,HCV抗體陽性者1b總陽性率為95.9%,健康者1b總陽性率為0.0%,三者比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=10.28,P <0.05),提示該地區(qū) 1b基因型所占比例較大。見表1。
以門診患者不同病變程度占比進(jìn)行統(tǒng)計,結(jié)果顯示,122例患者中1b型所占比例最高,且主要分布在重度病變及肝硬化患者中(P<0.05),不同程度間比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。提示1b型感染所致疾病病情較為嚴(yán)重。見表2。
表1 HCV-RNA基因分型結(jié)果[n(%)]
表2 基因型與患者病情的關(guān)系
HCV基因組變異明顯,分型較多,平均每個位點的核苷酸變異頻率每年可達(dá)0.001[6-7]。HCV不同基因型可影響患者的病情及其進(jìn)展。本研究利用較為保守的5′UTR區(qū)進(jìn)行RFLP法分型,對1a~6a不同基因型的cDNA擴增效果較為明顯。不同地區(qū)的HCV基因分布不同,歐美國家主要為1a型,亞洲國家主要為1b型[8]。文獻(xiàn)顯示,1b基因型對疾病的影響較為嚴(yán)重,可導(dǎo)致肝壞死及纖維化,且該類病毒的復(fù)制能力較強,危險系數(shù)較大[9]。
HCV基因型分布存在地區(qū)差異。研究報道我國南方沿海城市1b型占90%以上,北方城市2a型占62%左右[10-11]。HCV包括多種基因型,將Okamoto和Simmonds提出的兩種分類方法結(jié)合起來可以把HCV基因型分為Ⅰ/1a、Ⅱ/1b、Ⅲ/2a、Ⅳ/2b、Ⅴ/3a、4a、4b、4c、4d、5a和Ⅵ/6a,其中Ⅱ/1b和Ⅲ/2a是我國主要流行的基因型。人感染HCV后機體不產(chǎn)生保護(hù)性抗體,另外針對HCV感染也缺少有效的治療藥物。雖然干擾素是目前公認(rèn)的抗HCV的有效藥物,但是,國內(nèi)外的研究資料表明,HCV基因型對干擾素有明顯影響[7-8]。因此,在干擾素治療前,提前測定患者所感染HCV的基因型對于治療非常重要。另外,人感染HCV以后,肝臟疾病的嚴(yán)重程度也各異,這與所感染的HCV基因型也有關(guān),所以研究HCV不同血清型在人群中分布情況可以為HCV的診斷和治療等方面提供重要的科學(xué)依據(jù)。我國其他地區(qū)雖然進(jìn)行了HCV基因型分布的探討,但是在溫州地區(qū)還未開展。關(guān)于浙江溫州地區(qū)HCV不同基因型分布情況相關(guān)的研究不多。本研究結(jié)果顯示,所有研究對象中,門診肝病患者1b型總陽性率為100.0%,HCV抗體陽性者1b型總陽性率為95.9%,健康者1b型總陽性率為0.0%,三者比較,差異顯著(P<0.05),提示該地區(qū) 1b型所占比例較大。122例肝病患者中1b型所占比例最高,且主要分布在重度病變及肝硬化患者中(P<0.05),不同程度間比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。提示,1b型有較高的復(fù)制能力和血清反應(yīng)性,較強的肝細(xì)胞損害作用及較低的IFN治療反應(yīng)性等,由其感染所致疾病病情較為嚴(yán)重,HCV基因型與特定的組織病理學(xué)程度、肝臟炎癥程度相關(guān)。
綜上所述,本研究在一定程度上反映了溫州地區(qū)HCV基因型分布情況,對當(dāng)?shù)乇透窝谆颊叩闹委熀皖A(yù)后判斷有一定的指導(dǎo)意義。但由于本研究對象例數(shù)不多,還不能完全反映溫州地區(qū)HCV不同基因型具體分布情況,且研究對象以慢性肝病為主,缺乏無癥狀患者,有必要擴大樣本量,選擇人群資料進(jìn)一步研究。
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