劉義慶,田文君,渠 滕,劉春梅,許 麗,王盛華,朱之煒,張炳昌△(.山東大學附屬省立醫(yī)院檢驗科,濟南 500 ;.山東大學第二醫(yī)院肝病科,濟南 500 ;.山東省濟南市體外診斷試劑工程技術(shù)研究中心 500)
丙型肝炎病毒(HCV)感染是一個世界性的傳染病,全球大約有1.7億人被感染,我國 HCV感染者約4 200 萬人[1]。HCV慢性感染可導(dǎo)致肝臟慢性炎癥壞死和纖維化,部分患者可發(fā)展為肝硬化、肝癌等終末期肝臟疾病,嚴重威脅人類健康。HCV是單股正鏈RNA病毒,極易發(fā)生基因變異,根據(jù)其核苷酸序列的差異,可分為6種HCV基因型及不同亞型,根據(jù)2005年新的HCV基因型命名規(guī)則,以阿拉伯數(shù)字表示HCV基因型,以小寫英文字母表示基因亞型。HCV基因分型方法主要包括直接測序法、限制性片段長度多態(tài)性分析法(RFLP)、特異性引物聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)法、特異性探針熒光PCR法、基因芯片法等[2]。HCV基因組的E1、NS5b、C區(qū)直接測序和樹分析是最準確、最經(jīng)典的檢測方法,為HCV基因分型的“金標準”[3]。為了解近年來山東地區(qū)漢族丙型肝炎患者HCV基因型分布情況,本研究通過焦磷酸測序法對153例山東地區(qū)漢族丙型肝炎患者進行HCV基因分型,以期為山東地區(qū)漢族人群丙型肝炎的診治提供理論依據(jù)。
1.1 一般資料 選擇2013年5月至2013年10月山東省立醫(yī)院門診及住院的153例丙型肝炎患者,均為山東地區(qū)漢族且均未接受過抗病毒治療。其中男71例,女82例,年齡16~93歲,平均年齡(46.17±18.37)歲。
1.2 方法 無菌采集外周靜脈血5mL,乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-K2)抗凝,在收集后2h內(nèi),室溫下3 000 r/min離心8 min,將血漿轉(zhuǎn)移到無菌離心管中,-70℃保存留做 HCVRNA檢測。RNA檢測結(jié)果大于103IU/mL的標本進一步做焦磷酸測序并做HCV基因分型。
1.2.1 HCV-RNA檢測 采用實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄PCR(FQ-RT-PCR)技術(shù),HCV核酸定量檢測試劑盒由羅氏診斷產(chǎn)品有限公司(上海)提供,儀器為COBAS AmpliPrep-COBAS TaqMan48。由基因擴增實驗室工作人員嚴格按照說明書操作,每次實驗中均設(shè)置臨界陽性、強陽性對照和質(zhì)控,HCVRNA檢測的線性反應(yīng)范圍為43~6.9×107IU/mL,檢測下限為15IU/mL。
1.2.2 HCV基因測序和分型 采用德國Qiagen公司Pyro-Mark Q24型焦磷酸測序-遺傳分析系統(tǒng)對RNA檢測結(jié)果大于103IU/mL的標本進行基因測序和分型,該系統(tǒng)包括序列分析儀PyroMark Q24、用于制備單鏈DNA的PyroMark Q24真空工作站、分析用的PyroMark Q24軟件以及相關(guān)試劑,嚴格按照說明書進行操作。
1.3 統(tǒng)計學處理 首先對HCV-RNA病毒載量數(shù)據(jù)進行對數(shù)轉(zhuǎn)換(log10),再用SPSS21.0軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析處理,運用單因素方差分析比較HCV各亞型之間病毒載量是否有統(tǒng)計學差異;以α=0.05為檢驗水準,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 HCV基因分型結(jié)果 本次研究共檢出5種HCV基因亞型,分別為 1a、1b、2a、3a、3b,所占比例依次為3.92%(6/153)、65.36%(100/153)、28.76%(44/153)、1.31%(2/153)、0.65%(1/153)。以1b為主,其次為2a,1a、3a、3b少見,未檢出其他基因亞型。
2.2 HCV基因亞型病毒載量分析 運用單因素方差分析,對HCV基因亞型之間病毒載量是否存在差異進行統(tǒng)計學分析,結(jié)果F=4.376,P=0.006,即各 HCV基因亞型之間病毒載量不全相同。多重比較(LSD方法)表明1b亞型病毒載量明顯高于2a亞型,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。而1a與1b、2a、3a之間,1b與3a之間,2a與3a之間病毒載量比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),詳見表1。
表1 各HCV基因亞型病毒載量水平()
表1 各HCV基因亞型病毒載量水平()
注:-表示無數(shù)據(jù);與2a亞型比較,aP<0.05。
分型HCV-RNA單因素方差分析(IU/mL,×106) LSD法(log10)1a 2.54±3.06 5.91±0.86 1 b 3.08±4.79 5.91±0.98a 2a 7.48±9.54 5.28±0.96 3 a 2.05±2.69 5.89±1.00 3 b--
HCV感染主要通過輸血或血液制品傳播,目前HCV在全世界的感染率約為2%,我國約為3.2%。對于HCV感染目前還無有效的疫苗和治療方法,不同的HCV基因型生物活性不同,病情進展和抗病毒治療時間和療效也不盡相同。HCV基因分型檢測有助于了解地域分布,探討其傳播途徑和發(fā)展。
由于人群遺傳背景、人員流動性等不同,HCV基因型分布呈明顯的國籍和地域差異[4]。美國、巴西和歐洲西北部以1a型占絕大多數(shù);亞洲、遠東、歐洲東西部以1b型為主;2a和2b型多分布于亞洲和歐洲;新加坡、泰國3a型多見;4a多見于中東和北非;5a局限于南非;6a常見于香港、越南等亞洲南部。中國大陸大部分地區(qū)HCV基因型以1b和2a型為主,其中1b型占70%~80%,在部分南方城市甚至高達90%,自南向北2a型所占的比例逐漸增多。本研究表明,近年來山東地區(qū)漢族丙型肝炎患者HCV基因分型以1b為主,2a型次之,與吉林、上海、福建等中國大部分地區(qū)報道相似[5-7],與甘肅地區(qū)2a型較1b型更常見不同[8],也與廣東地區(qū)6a型高于2a型成為僅次于1b型的常見亞型不同[9-10],說明中國大陸地區(qū)的HCV基因型存在區(qū)域性分布。
現(xiàn)有研究表明HCV基因型與疾病進展、干擾素治療效果密切相關(guān)[11]。本文研究發(fā)現(xiàn)1b亞型組病毒載量明顯高于2a組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),這與前期研究結(jié)論一致。1b型病毒復(fù)制能力較強,對干擾素的持續(xù)病毒學應(yīng)答(SVR)較低,僅為20%左右,更易發(fā)展為慢性肝炎、肝硬化和肝細胞癌。干擾素對2a型治療效果要明顯好于1b型,其SVR率可達67%[5]。可以看出,HCV基因分型有利于臨床醫(yī)師針對患者感染的基因型制定個體化治療方案,提高治療效果。本研究中其他亞型之間病毒載量未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學差異,可能與其他亞型例數(shù)較少有關(guān)。
本文采用焦磷酸測序法對山東地區(qū)153例漢族丙型肝炎患者進行HCV基因分型,并對不同基因型之間的病毒載量進行了分析,發(fā)現(xiàn)山東地區(qū)漢族丙型肝炎患者基因型以1b和2a為主,且病毒載量1b明顯高于2a,這為山東地區(qū)漢族人群丙型肝炎的預(yù)防、診斷和治療提供理論依據(jù)和幫助。
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