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        著色性干皮病基因D和X線(xiàn)交叉互補(bǔ)修復(fù)基因1的多態(tài)性與肺癌的相關(guān)性分析

        2014-10-02 02:01:16都勇揭志軍何燕超錢(qián)凌
        中國(guó)臨床醫(yī)學(xué) 2014年3期
        關(guān)鍵詞:肺癌研究

        都勇 揭志軍 何燕超 錢(qián)凌

        (復(fù)旦大學(xué)附屬上海市第五人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科,上海 200240)

        肺癌的發(fā)生發(fā)展是多基因變異和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果[1]。DNA修復(fù)基因的序列中因單個(gè)堿基突變而造成的單核苷酸多態(tài)性(single nueleotide polymorphism,SNP),可導(dǎo)致編碼氨基酸的異常,影響蛋白的功能,最終影響個(gè)體DNA修復(fù)能力(DNA repair capacity,DRC),使個(gè)體對(duì)腫瘤的易感性增加[2]。本研究采用聚合酶鏈反應(yīng)–限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技術(shù)檢測(cè)著色性干皮病基因D(Xeroderma pigmentosum gene D,XPD)和X線(xiàn)交叉互補(bǔ)修復(fù)基因1(X-ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)在肺癌患者和健康志愿者中的SNP,探討其與肺癌的關(guān)系以及易感基因和吸煙的交互作用,旨在為肺癌的早期篩查及病因研究提供依據(jù)。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選擇2012年1月—2013年9月在我院住院的肺癌患者150例,所有患者均經(jīng)支氣管鏡或肺穿刺活檢病理檢查診斷為肺癌,且均未接受化療及放療。150例肺癌患者中,小細(xì)胞肺癌30例,非小細(xì)胞肺癌120例;120例非小細(xì)胞肺癌患者中,鱗癌52例,腺癌48例,其他類(lèi)型(如大細(xì)胞癌、肉瘤樣癌及類(lèi)癌)20例。對(duì)照組選取我院同期健康體檢者150例(對(duì)照組),胸部CT檢查及血清腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)未見(jiàn)異常。兩組均無(wú)高血壓、糖尿病及冠心病等慢性疾病病史,無(wú)呼吸系統(tǒng)其他疾病史。所有研究對(duì)象入組前均簽署知情同意書(shū)。

        1.2 研究方法 清晨空腹抽取外周靜脈血2~4 mL,用EDTA抗凝劑抗凝,貯存于-20℃。采用DNA提取試劑盒提取基因組 DNA,貯存于-80℃。設(shè)計(jì)目的基因相關(guān)引物,引物序列及PCR擴(kuò)增條件見(jiàn)表1,擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳觀察。購(gòu)置目的基因相應(yīng)限制性核酸內(nèi)切酶,將限制性核酸內(nèi)切酶與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加入相應(yīng)酶切體系,酶切反應(yīng)后將酶切產(chǎn)物進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳,觀察各電泳條帶,判斷各標(biāo)本的基因型,見(jiàn)表2。

        表1 XPD-751、XRCC1-399基因PCR擴(kuò)增體系

        表2 XPD-751、XRCC1-399基因酶切體系

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,所有等位基因分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律,計(jì)量資料比較采用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料比較采用χ2檢驗(yàn),交互作用分析采用Logistic回歸法,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 2組研究對(duì)象的一般資料比較 2組研究對(duì)象的性別及年齡差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);2組研究對(duì)象的吸煙史及吸煙指數(shù)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05)。見(jiàn)表3。

        表3 2組的一般資料比較

        2.2 2組研究對(duì)象的XPD-751和XRCC1-399基因型頻率及等位基因頻率分布 2組研究對(duì)象XPD-751基因型頻率及突變等位基因頻率比較差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說(shuō)明XPD-751多態(tài)性與肺癌發(fā)生相關(guān);2組研究對(duì)象的XRCC1-399基因型頻率及突變等位基因頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說(shuō)明XRCC1-399多態(tài)性與肺癌發(fā)生無(wú)相關(guān)。見(jiàn)表4~5。

        2.3 非小細(xì)胞肺癌及小細(xì)胞肺癌患者XPD-751等位基因頻率分布 XPD-751等位基因Gln的頻率在非小細(xì)胞肺癌及小細(xì)胞肺癌患者中分別為31.33%、20.67%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.012),說(shuō)明 XPD-751多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌相關(guān)。見(jiàn)表6。

        2.4 不同病理類(lèi)型非小細(xì)胞肺癌的XPD-751等位基因頻率分布 XPD-751等位基因Gln的頻率在鱗癌、腺癌及其他類(lèi)型非小細(xì)胞肺癌患者中分別為31.73%、15.62% 和 20.00%,3 組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.023),說(shuō)明XPD-751多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌中的鱗癌密切相關(guān)。見(jiàn)表7。

        表4 肺癌組與對(duì)照組XPD-751、XRCC1-399基因型頻率分析 (n,%)

        表5 肺癌組與對(duì)照組XPD-751、XRCC1-399突變等位基因頻率分析 (n,%)

        表6 非小細(xì)胞肺癌、小細(xì)胞肺癌患者XPD-751突變等位基因頻率分析 (n,%)

        表7 不同病理類(lèi)型非小細(xì)胞肺癌患者XPD-751突變等位基因頻率分析 (n,%)

        2.5 吸煙和XPD-751多態(tài)性對(duì)肺癌的交互作用分析 與對(duì)照組比較,以無(wú)吸煙及無(wú)XPD-751多態(tài)性時(shí)的相對(duì)危險(xiǎn)度為1.000,吸煙及無(wú)XPD-751多態(tài)性時(shí)罹患肺癌的相對(duì)危險(xiǎn)度為1.523,有XPD-751多態(tài)性及無(wú)吸煙時(shí)罹患肺癌的相對(duì)危險(xiǎn)度為1.342,吸煙與XPD-751多態(tài)性共同存在時(shí)罹患肺癌的相對(duì)危險(xiǎn)度為2.812(P=0.336),說(shuō)明吸煙與 XPD-751多態(tài)性?xún)煞N危險(xiǎn)因素在肺癌的發(fā)生中并無(wú)交互作用。見(jiàn)表8。

        表8 吸煙與XPD-751多態(tài)性對(duì)肺癌的交互作用分析

        3 討 論

        XPD定位于人類(lèi)染色體19q13.2-13.3,由23個(gè)外顯子組成,是參與核苷酸修復(fù)的重要基因。XPD表達(dá)的蛋白產(chǎn)物具有解開(kāi)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的功能,并可移除或切除損傷DNA。目前研究[3]發(fā)現(xiàn),XPD有7個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn),而對(duì)位于密碼子312、751處的基因變異最為常見(jiàn)。

        本研究發(fā)現(xiàn),XPD-751等位基因頻率在肺癌組和對(duì)照組之間以及在非小細(xì)胞肺癌患者和小細(xì)胞肺癌患者之間的差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;在非小細(xì)胞肺癌中,XPD-751等位基因頻率在鱗癌患者中明顯高于腺癌及其他類(lèi)型非小細(xì)胞肺癌患者,差異亦有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;說(shuō)明XPD-751多態(tài)性與肺癌相關(guān),尤其與非小細(xì)胞肺癌中的鱗癌密切相關(guān)。上述結(jié)果與邢德印等[4]的結(jié)論相符;Ouyang等[5]發(fā)現(xiàn) XPD-751 多態(tài)性與肺腺癌相關(guān);然而,López-Cima 等[6]在研究西班牙人群的肺癌易感基因時(shí),發(fā)現(xiàn)XPD-751多態(tài)性與肺癌無(wú)明顯相關(guān)性。

        XRCC1定位于人類(lèi)染色體 19q13.2-19q13.3,包含17個(gè)外顯子。XRCC1的編碼產(chǎn)物為腳手架蛋白,可直接與DNA聚合酶β、DNA連接酶Ⅲ和多聚ADP核糖聚合酶形成復(fù)合物,在損傷引起的堿基切除修復(fù)和單鏈斷裂修復(fù)中起著重要的作用?,F(xiàn)已證實(shí),XRCC1有多種 SNP,其中第 6外顯子Arg194Trp、第9外顯子 Arg280His和第10外顯子Arg399Gln 較為常見(jiàn)[7]。

        本研究發(fā)現(xiàn),肺癌組和對(duì)照組XRCC1-399等位基因頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說(shuō)明XRCC1-399多態(tài)性與肺癌無(wú)相關(guān)性,與 Wang 等[8]、Schneider等[9]的研究結(jié)果一致。但是,余紅平等[10]研究發(fā)現(xiàn),攜帶XRCC1-Gln399Gln突變純合子基因型的個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)明顯升高。

        綜上所述,本研究表明,XPD-751基因多態(tài)性與肺癌(尤其是與鱗癌)的發(fā)生相關(guān),但與吸煙之間無(wú)交互作用;XRCC1-399多態(tài)性與肺癌無(wú)相關(guān)性。對(duì)這些DNA修復(fù)基因的研究有助于肺癌的早期診斷與預(yù)防,并有助于進(jìn)一步探索肺癌的發(fā)病機(jī)制。

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        [4]邢得印,齊軍,譚文,等.北京地區(qū)漢族人群DNA修復(fù)基因XPD單核苷酸多態(tài)性與肺癌及食管癌風(fēng)險(xiǎn)的研究[J].中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志,2003,20(1):35-38.

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        [10]余紅平,曾小云,仇小強(qiáng),等.DNA修復(fù)基因XRCC1單核苷酸多態(tài)性與肺癌易感性[J].廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2006,23(3):355-358.

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