譚 廣 毅,叢 麗 娜,姜 啟 晨,盧 冬
(大連工業(yè)大學(xué) 生物工程學(xué)院,遼寧 大連 116034)
溶菌酶(又稱胞壁質(zhì)酶)是一種專門作用于微生物細胞壁的水解酶,屬于α-乳白蛋白家族,廣泛存在于動物、植物、細菌、噬菌體中[1]。目前,根據(jù)溶菌酶空間結(jié)構(gòu)、免疫學(xué)特性和催化活性的差異通??煞譃?類:雞型溶菌酶、無脊椎動物溶菌酶、鵝型溶菌酶、植物溶菌酶、細菌溶菌酶、T4噬菌體溶菌酶[2]。其中,c型溶菌酶分布最為廣泛,脊椎動物、無脊椎動物和原索動物中均有發(fā)現(xiàn),其中禹紹國等[3-4]從奧里亞羅非魚中克隆出了3種c型溶菌酶基因。
目前國內(nèi)外重組溶菌酶的研究主要集中在c型人溶菌酶以及c型和i型水產(chǎn)動物溶菌酶[5]。而c型水產(chǎn)動物溶菌酶對于水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)尤其是蝦類的養(yǎng)殖意義非凡。但是迄今為止,產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)重組水產(chǎn)動物溶菌酶尚未見報道。重組中國明對蝦溶菌酶的生產(chǎn)目前主要存在的問題:首先是重組對蝦溶菌酶基因在大腸桿菌原核表達系統(tǒng)中表達,其溶菌酶蛋白多以包涵體形式存在,后續(xù)對其變性和復(fù)性操作繁瑣,獲得的酶產(chǎn)量低、活性不穩(wěn)定;其次是重組對蝦溶菌酶在畢赤酵母真核表達系統(tǒng)蛋白表達量很低[6]。這些問題嚴重阻礙了中國明對蝦溶菌酶研究向產(chǎn)業(yè)化試驗的進程。通過對中國明對蝦溶菌酶基因結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),中國明對蝦溶菌酶成熟肽(140個氨基酸)具有一個完整的結(jié)構(gòu)域,包括c型溶菌酶的活性中心(Glu33和Asp50),以及8個保守Cys殘基;同時,中國明對蝦溶菌酶成熟肽疏水性較高,且N端和C端含多個疏水性氨基酸[7-10]。因此,本研究將中國明對蝦溶菌酶成熟肽N端和C端個別疏水性氨基酸經(jīng)點突變[11]改為親水性氨基酸,以誘導(dǎo)其溶菌酶蛋白的可溶性表達。
1.1.1 酶類及主要試劑
T4DNA連接酶、TaqDNA聚合酶、限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和XhoⅠ、DNA Marker,購自TaKaRa Biotechnology公司(大連);質(zhì)粒提取試劑盒、瓊脂糖凝膠電泳DNA回收試劑盒,購自天根生物技術(shù)公司;其他SDS-PAGE電泳試劑、細菌培養(yǎng)試劑等為國產(chǎn)或進口分析純試劑。
1.1.2 菌株與載體
大腸桿菌表達系統(tǒng)Rosetta(DE3)、表達載體pET-39b(+)購自 Novagen公司;重組克隆質(zhì)粒pMD18-T-FcLys、基因工程菌pET-39b(+ )-FcLys/Rosetta(DE3)由本實驗室構(gòu)建保存。
1.2.1 點突變設(shè)計方案
通過對中國明對蝦溶菌酶成熟肽(140個氨基酸)氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn),其疏水性偏大且疏水性氨基酸多分布于兩端。在不改變活性中心、不影響二硫鍵形成等前提下,首先挑選該序列兩端個別疏水性氨基酸突變?yōu)橛H水性氨基酸,即將該成熟肽氨基酸序列N端的第2號位的纈氨酸(GTC)突變?yōu)楦拾彼?GGC),第3號位的苯丙氨酸(TTC)突變?yōu)榻z氨酸(TCC);再將成熟肽C端第137號位異亮氨酸(ATA)突變?yōu)榫彼?AGA),第138號位苯丙氨酸(TTC)突變?yōu)槔野彼?TAC),最后一位的苯丙氨酸(TTC)突變?yōu)榻z氨酸(TCC)。通過以下設(shè)計特異性引物,經(jīng)PCR擴增,預(yù)期得到中國明對蝦溶菌酶點突變(FcLysM)基因片段,最終目標為表達可溶性重組突變對蝦溶菌酶蛋白,以期解決對蝦溶菌酶高效表達中存在表達產(chǎn)物不溶性的瓶頸問題。
1.2.2 引物設(shè)計
以實驗室保存重組克隆質(zhì)粒pMD18-TFcLys為模板,根據(jù)表達載體pET-39b(+)特性及“1.2.1”討論的原則等,進行引物設(shè)計。上游引物引入酶切位點NcoⅠ,下游引物引入酶切位點XhoⅠ。(下劃線表示引入的酶切位點、小寫字母表示點突變基因)
表1 FcLysM特異性引物Tab.1 Specific primer of FclysM
1.2.3 FcLysM基因的擴增
以重組克隆質(zhì)粒pMD18-T-FcLys為模板進行PCR反應(yīng),反應(yīng)條件為(50μL反應(yīng)體系):94℃30s、60℃30s、72℃1min共30個循環(huán);72℃10min。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增產(chǎn)物。擴增得到的PCR產(chǎn)物用低熔點瓊脂糖凝膠電泳割膠回收,保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.4 重組表達系統(tǒng)pET-39b(+)-FcLysM/Rosetta(DE3)的構(gòu)建
將回收純化的PCR擴增產(chǎn)物與克隆載體pMD18-T連接,構(gòu)建pMD18-T-FcLysM 質(zhì)粒,轉(zhuǎn)入E.coliDH5α中,經(jīng)篩選鑒定得到陽性克隆菌株。液體培養(yǎng)提取重組質(zhì)粒pMD18-T-FcLysM,使用NcoⅠ和XhoⅠ雙酶切,將回收的目的片段與使用相同酶酶切處理的原核表達載體pET-39b(+)定向連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET-39b(+)-FcLysM,轉(zhuǎn)入E.coliDH5α中。再提取重組質(zhì)粒,經(jīng)菌落PCR和酶切驗證后,篩選得到的陽性克隆菌株通過DNA測序鑒定其正確性。最后,將重組質(zhì)粒與空白質(zhì)粒pET-39b(+)分別轉(zhuǎn)入E.coli感受態(tài)細胞Rosetta(DE3),涂布于含有100μg/mL卡那霉素(Kan)的LB固體培養(yǎng)基上,37℃過夜培養(yǎng)。
1.2.5 重組蛋白FcLysM的誘導(dǎo)表達
將測序鑒定正確的陽性單克隆表達菌株和陰性對照菌株接種于LB/Kan液體培養(yǎng)基中,37℃、160r/min過夜振蕩培養(yǎng)。再以1∶100的比例將種子液接種于200mL LB/Kan液體培養(yǎng)基中,37℃、160r/min 培養(yǎng)約2.5h,OD600值達到0.5~0.6。取出1mL菌液作為誘導(dǎo)前對照樣品,再加入終濃度為1.0mmol/L的IPTG,25℃、150r/min誘導(dǎo)培養(yǎng)4h,取出1mL菌液作為誘導(dǎo)后樣品,其余發(fā)酵誘導(dǎo)菌液經(jīng)10 000r/min離心15min,收集菌體細胞。將收集的菌體重懸于20mL預(yù)冷的含20mmol/L的Tris-HCl緩沖液中(pH 8.0),加入終質(zhì)量分數(shù)1%的 Triton X-100,冰浴中進行超聲破碎細胞(破碎時間1s,間歇時間3s,總時間20min)。超聲破碎后離心菌液(4℃、12 000r/min、15min),分別收集上清液和沉淀。用12%的SDS-PAGE電泳檢測。
1.2.6 重組蛋白FcLysM與FcLys可溶性表達量對比
發(fā)酵、誘導(dǎo)表達、細胞破碎條件同“1.2.4”。分別取FcLysM與FcLys超聲破碎菌體上清液樣品,用12%的SDS-PAGE電泳檢測。
以提取的重組質(zhì)粒pMD18-T-FcLys為模板,由特異性引物Fc-1和Fc-2進行PCR擴增,經(jīng)檢測分析擴增出的FcLysM成熟肽基因,在440bp左右有清晰亮帶,與預(yù)測大小一致。經(jīng)序列測定,該擴增的FcLysM成熟肽基因片段為420bp。將已得到的pMD18-T-FcLysM 質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和XhoⅠ雙酶切,結(jié)果出現(xiàn)與預(yù)測目的片段和載體大小一致的條帶(圖1),測序后驗證了該重組表達質(zhì)粒中目的基因序列的正確性,這表明重組表達質(zhì)粒pET-39b(+)-FcLysM構(gòu)建成功。
圖1 成熟肽點突變基因(FcLysM)的擴增和酶切驗證Fig.1 Amplification and identification of FcLysM
將已構(gòu)建的重組基因工程菌pET-39b(+)-FcLysM/Rosetta(DE3)和陰性對照菌株 pET-39b(+)/Rosetta(DE3),使用IPTG作為誘導(dǎo)劑進行誘導(dǎo)表達。經(jīng)12%的SDS-PAGE電泳檢測,陰性對照菌株誘導(dǎo)后樣品與誘導(dǎo)前樣品比較,前者在25.0ku處產(chǎn)生一條特異性亮帶,而FcLysM工程菌誘導(dǎo)培養(yǎng)后的樣品則在43.0ku處明顯出現(xiàn)了一條特異性電泳亮帶(圖2)。經(jīng)預(yù)測軟件Bandscan掃描分析,該融合蛋白表達量達到菌體總蛋白含量的90%以上,這表明FcLysM在此基因工程菌體系中得到了高效表達。另外,F(xiàn)cLysM基因編碼140個氨基酸,經(jīng)ExPASy預(yù)測分子質(zhì)量為15.3ku,而pET-39b(+)載體上融合 表 達 的 幾 個 標 簽 蛋 白,His-Tag、DsbA、S-Tag等序列分子質(zhì)量為28.1ku左右,因此,計算該重組蛋白FcLysM的分子質(zhì)量應(yīng)為43.0ku左右,電泳圖上的實驗結(jié)果與理論計算相符合。
圖2 FcLysM重組菌株誘導(dǎo)表達Fig.2 Expression of pET-39b(+)-FcLysM/Rosetta(DE3)
將已構(gòu)建的重組基因工程菌pET-39b(+)-FcLysM/Rosetta(DE3)(重組點突變對蝦溶菌酶基因工程菌)和實驗室保存的基因工程菌pET-39b(+)-FcLys/Rosetta(DE3)(重 組 對 蝦溶菌酶基因工程菌),使用IPTG作為誘導(dǎo)劑進行誘導(dǎo)表達。分別取超聲破碎菌體的上清液樣品,經(jīng)12%的SDS-PAGE電泳檢測,兩樣品均在43.0ku處出現(xiàn)明顯條帶(圖3)。經(jīng)預(yù)測軟件Bandscan掃描分析,點突變重組蛋白FcLysM可溶性表達量約占上清液總蛋白量的51.9%,非重組蛋白FcLys可溶性表達量約占上清液總蛋白量的23.2%,突變后可溶性表達量增加一倍,基本達到實驗?zāi)康摹?/p>
圖3 重組蛋白FcLysM與FcLys可溶性比較Fig.3 Comparative FcLysM and FcLys
本研究成功擴增出中國明對蝦溶菌酶的成熟肽點突變基因,并構(gòu)建了重組中國明對蝦溶菌酶原核表達質(zhì)粒pET-39b(+)-FcLysM。
誘導(dǎo)表達中國明對蝦溶菌酶點突變基因的重組工程菌株pET-39b(+ )FcLysM/Rosetta(DE3),得到重組的FcLysM 蛋白,經(jīng)預(yù)測軟件Bandscan掃描分析,表達量達到菌體總蛋白的90%左右,實現(xiàn)了中國明對蝦重組點突變?nèi)芫傅母咝П磉_。
中國明對蝦溶菌酶點突變重組蛋白FcLysM可溶性表達量高出非點突變重組蛋白FcLys可溶性表達量一倍,這個結(jié)果將大大簡化了重組蛋白的后續(xù)純化工藝。同時,對中國明對蝦溶菌酶點突變重組蛋白FcLysM的抑菌活性進行了初步探究,其抑菌活性與非點突變重組蛋白FcLys的抑菌活性幾乎相同。這個結(jié)論為利用基因點突變技術(shù)研究可溶性蛋白表達提供了有意義的探索。
[1]劉梅,張士璀.溶菌酶c及其生物學(xué)功能[J].生命的化學(xué),2006,26(5):465-467.
[2]高鳳英,葉星,白俊杰,等.兩種沼蝦溶菌酶cDNA基因的克隆和表達[J].水生生物學(xué)報,2005,29(6):615-620.
[3]禹紹國,葉星,張莉莉,等.奧里亞羅非魚3種c型溶菌酶基因的克隆及其序列分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,2010,18(1):66-74.
[4]SOUSHI F,IZUMI TT,KEIKO K,et al.Protein purification,cDNA cloning and gene expression of lysozyme from erisilkworm,Samiacynthiaricini[J].Comparative Biochemistry and Physiology,2001,128:709-718.
[5]GROSS P S,BARTLETT T C,BROWDY C L,et al.Immune gene discovery by expressed sequence tag analysis of hemocytes and hepatopancreas in the pacific white shrimp,Litopennaeusvannamei,and the atlantic white shrimp,L.setiferus[J].Developmental and Comparative Immunology,2001,25(7):565-577.
[6]KUHELJ R,DOLINAR M,PUNGERCAR J,et al.The preparation of catalytically active human cathepsin B from its precursor expressed inEscherichiacoliin the form of inclusion bodies[J].European Journal of Biochemistry,1995,299(2):533-539.
[7]張海波,譚洪新,王興強,等.凡納濱對蝦溶菌酶基因在大腸桿菌中的表達和活性檢測[J].海洋科學(xué),2009,33(1):48-53.
[8]FUNAHASHI J,TAKANO K,YAMAGATE Y,et al.Positive contribution of hydration structure on the surface of human lysozyme to the conformational stability[J].Journal of Biological Chemistry,2002,277(24):21792-21880.
[9]卜興江,杜欣軍,周文杰,等.中國對蝦溶菌酶基因克隆、重組表達與性質(zhì)分析[J].生物工程學(xué)報,2008,25(5):723-732.
[10]楊杰,叢麗娜,夏濤,等.日本對蝦c型溶菌酶的高效重組表達及產(chǎn)物分析[J].生物技術(shù)通報,2012,239(6):99-105.
[11]常藝海,叢麗娜,盧冬,等.重組海參溶菌酶C端基因(Sjlys-C)的可溶性表達和抑菌活性分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,2012,20(4):443-450.