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        基于最小描述長度和K2的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習算法

        2014-09-15 04:39:04李曉兵楊海東
        東北師大學報(自然科學版) 2014年3期
        關(guān)鍵詞:模擬退火結(jié)點網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)

        曾 安,李曉兵,楊海東,潘 丹

        (1.廣東工業(yè)大學計算機學院,廣東 廣州 510006;2.中油管道物資裝備總公司,河北 廊坊 065000;3.美國Batteries Plus公司,哈特蘭市 威斯康辛州 53029)

        貝葉斯網(wǎng)絡是以概率論和圖論為理論基礎(chǔ),用一個帶有條件概率的有向無環(huán)圖來表示隨機變量間依賴和獨立關(guān)系的網(wǎng)絡模型[1].由于貝葉斯網(wǎng)絡具有獨特的不確定性表達形式、易于綜合先驗知識以及直觀的推理結(jié)果等特性,貝葉斯網(wǎng)絡已逐漸成為在不確定情況下進行推理和決策的一種很受歡迎的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),并已在故障檢測、交通管理和金融投資與市場分析等領(lǐng)域取得了應用[2-4].實際上,貝葉斯網(wǎng)絡也常用在醫(yī)療領(lǐng)域之中.例如:CPCSBN遠程醫(yī)療系統(tǒng)[5],它是一個多層貝葉斯網(wǎng)絡,有448個結(jié)點和908條邊,是優(yōu)于世界上主要的遠程醫(yī)療診斷分析方法;Alarm網(wǎng)[6]具有37個結(jié)點和46條邊,描述了在醫(yī)院手術(shù)室中所存在的潛在細菌問題;Take HeartⅡ系統(tǒng)[7]是基于貝葉斯網(wǎng)的用于心血管并診斷的臨床支持決策系統(tǒng)(Clinical Decision Support System,CDSS)等.國內(nèi)使用貝葉斯網(wǎng)絡在冠脈支架臨床進行試驗[8],使用貝葉斯決策分類提高了藥物分類的準確性[9].通過貝葉斯網(wǎng)絡圖形化的特點,建立起疾病診斷、終點與癥狀、臨床檢驗的因果關(guān)系的模型,使醫(yī)療的診斷、處理更加科學和客觀.

        貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習是目前研究的熱點,其目的是獲取能較好吻合數(shù)據(jù)集并且盡可能簡單的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).同時,貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習也是一個NP難題.在實際中,人們主要是通過啟發(fā)式方法來獲取最優(yōu)的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)[10-11].它主要分為兩類:一類是基于條件獨立性測試的學習方法,這類方法過程比較復雜,學習效率比較低,需要假設(shè)一些限制條件來提高算法的學習效率[12];另一類是基于評分搜索的學習方法,該類方法對個體測試的錯誤并不敏感,可以在數(shù)據(jù)變量的依賴程度與添加邊的復雜度之間選擇一個折中的方法,如G.Cooper和E.Herskovits提出的K2算法[13].如今,已經(jīng)提出了很多貝葉斯結(jié)構(gòu)學習的算法[14-15],并且大多研究是基于評分搜索的學習方法.

        本文提出了一種新穎的基于KMBN算法.該算法在利用logistic回歸和互信息對數(shù)據(jù)集進行降維的基礎(chǔ)上,將MDL評分與K2算法結(jié)合,以構(gòu)建出一種較優(yōu)的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).實驗結(jié)果證實了該方法在效率和可靠性方面都明顯優(yōu)于傳統(tǒng)的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習算法.

        1 貝葉斯網(wǎng)絡簡述

        貝葉斯網(wǎng)絡又稱為信念網(wǎng)絡、因果概率網(wǎng)絡等.它可以將具體問題中復雜的變量關(guān)系體現(xiàn)在一個網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)中,并通過局部條件概率緊湊地表達出來.它描述了變量之間的依賴和因果關(guān)系,并使變量間的關(guān)系形成相對穩(wěn)定的狀態(tài).貝葉斯網(wǎng)絡分為有向無環(huán)圖(directed acyclic graph,DAG)和條件概率表(conditional probability table,CPT)兩部分.其中,有向無環(huán)圖包括結(jié)點集合與結(jié)點之間的有向邊,有向邊代表結(jié)點之間的依賴關(guān)系;條件概率表表示結(jié)點之間的關(guān)聯(lián)強度或置信度.學習貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)來解決問題,不僅需要考慮先驗知識的融合、評估函數(shù)的選擇,而且也要考慮不完備數(shù)據(jù)等因素的影響.

        眾所周知,K2算法是貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習領(lǐng)域的經(jīng)典算法[16],具有非常優(yōu)異的學習性能.K2算法有2個前提條件,就是要先給出結(jié)點的順序和每個結(jié)點的父結(jié)點個數(shù)的上限.它的目的是尋找結(jié)構(gòu)G的Cooper-Herskovis(CH)評分較高的模型,通過對數(shù)據(jù)集D的分析,找到與D吻合最好的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)G,即CH(G|D)最大的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).其中

        式中CH(〈Xi,πi〉|D)為Xi的家族CH評分.依據(jù)這一思想,在給出結(jié)點序ρ以及每個結(jié)點的父結(jié)點個數(shù)的上限u的情況下,K2利用貪婪搜索一次為每個結(jié)點找到其父結(jié)點集,從而最終構(gòu)建出完整的貝葉斯網(wǎng)絡.但在使用CH評分之前,首先需要選定先驗分布中的超參數(shù).通常這并非易事,因為理論上我們需要對每一個可能的結(jié)構(gòu)都提供參數(shù)先驗分布,而結(jié)構(gòu)數(shù)目眾多,無法一一羅列.MDL準則不需要計算其參數(shù)的先驗分布,計算較簡單,且由于明確地將結(jié)構(gòu)復雜性作為一個指標而傾向于選擇較簡單的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),計算結(jié)果更容易被接受.因此,基于MDL準則的算法可較好地實現(xiàn)目標網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)的拓撲簡單性與對實例數(shù)據(jù)集擬合度之間的權(quán)衡.

        MDL是Rissanen在研究通用編碼時提出的[17-18].它綜合考慮了似然函數(shù)和計算復雜度兩方面的因素.這個準則的基本原理是對于給定的實例數(shù)據(jù)進行壓縮,從而降低數(shù)據(jù)的編碼(描述)長度.一個MDL評分由以下2部分構(gòu)成:

        因此,貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)的MDL評分為

        2 基于KMBN算法

        基于KMBN算法主要包含3個步驟:(1)屬性(變量)降維,在對連續(xù)性變量進行離散化的基礎(chǔ)上,利用logistic多變量回歸分析找出相關(guān)性較為顯著的變量;(2)構(gòu)建無向圖,然后計算每一個屬性變量和決策變量間的互信息熵,互信息熵較小的變量之間連接邊;(3)構(gòu)建有向圖,運用MDL局部打分原理和K2算法來確定邊的方向.

        設(shè)一個數(shù)據(jù)集D 有M 個變量,記為X={X1,X2,…,XM},假設(shè){X1,X2,…,XM-1}是屬性變量,XM是決策變量.

        2.1 屬性降維

        利用logistic多變量回歸分析從結(jié)點變量X={X1,X2,…,XM}中找出用來構(gòu)建貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)所需的變量.記rij=p,對于屬性變量Xi和決策變量XM(i<M),用riM來表示它們之間的關(guān)系.如果riM≤0.05,則表示Xi和XM間為顯著關(guān)系,即該屬性變量對決策變量的影響顯著;如果riM>0.05,則表示Xi和XM間為非顯著關(guān)系,或者說與它們無關(guān).這樣就得出了構(gòu)建貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)的變量,記為{X1,X2,…,XN,其中XN=XM為決策變量.

        本研究對象選擇2016年12月~2017年12月在我院接受治療的120例初診2型糖尿病患者。將其按照就診時間先后分為觀察組與對照組,每組各60例患者。其中對照組男性32例,女性28例;年齡為37~70歲,平均年齡為(48.5±3.5)歲;病程1~7年,平均病程為(3.5±1.5)年;觀察組男性31例,女性29例;年齡為38~70歲,平均年齡為(49.0±3.2)歲;病程1~6年,平均病程為(3.2±1.0)年。兩組患者一般資料相比,無顯著差異(P>0.05),具有可比性。

        2.2 構(gòu)建無向圖

        依次對每一個屬性變量和決策變量〈Xi,XN〉,i=1,2,…,N-1計算,其互信息熵為

        其中xi為Xi的值,xN為XN的值.給定一個閾值e(e通常是一個很小的正數(shù)).當I<e時,連接邊Xi~XN.

        將I按大小進行排序,可得到初始結(jié)構(gòu)結(jié)點的先驗順序,記為ρ.

        2.3 構(gòu)建有向圖

        對于上述已經(jīng)存在的無向圖,運用MDL局部打分原理來確定邊的方向.MDL局部打分原理如下:

        設(shè)2個貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)分別為G1,G2,其中變量Xi的父結(jié)點集分別為Π1和Π2,如果Π1和Π2中只有π1和π2不同,那么ScoreMDL(G1|D)-ScoreMDL(G2|D)=ScoreMDL(X1∪π1|D)-ScoreMDL(X2∪π2|D),π1和π2分別為Π1和Π2中的父結(jié)點,ScoreMDL(Gi|D)表示結(jié)構(gòu)Gi在數(shù)據(jù)集D 上的最小描述長度,i=1,2.

        對變量Xj,假設(shè)它已經(jīng)有了一些父結(jié)點為πj.若|πj|<u,即變量Xj的父結(jié)點個數(shù)還沒達到u,則就要繼續(xù)找尋它的父結(jié)點.首先考慮那些在ρ中排在Xj之前、但卻還不是Xj的父結(jié)點的變量,從這些變量中選出Xi,計算新測度值MDL評分(記為ScoreNew).然后將其與舊測度(記為ScoreOld)做比較,如果ScoreNew<ScoreOld,則記Xi為Xj的父結(jié)點,否則停止尋找Xj的父結(jié)點.

        2.4 算法的偽代碼

        輸入:n個變量的集合X={X1,X2,…,Xn};變量父結(jié)點的上限個數(shù)為u;變量的順序ρ;一個包含N個樣本的完整數(shù)據(jù)集D.

        輸出:一個貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).

        3 實驗結(jié)果分析

        3.1 可靠性分析

        為了驗證本文提出的基于KMBN算法的有效性,采用廣東省某醫(yī)院MICU病房提供的數(shù)據(jù)集對KMBN算法、基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法和基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法進行仿真實驗.該數(shù)據(jù)集包括209個病歷,每個病歷有44個屬性,其中6個屬性是系統(tǒng)疾病,可將它們合并成一個屬性.則屬性有Balance,Speak和Platelet等38屬性變量和1個決策變量Event.該決策變量記錄了病人出MICU后是否存活了300d以上.38個屬性中,21個為連續(xù)型,17個為離散型的.為了簡化,僅選擇了其中一部分數(shù)據(jù)進行說明,相關(guān)信息見表1.對于連續(xù)型屬性,主要是根據(jù)專家經(jīng)驗知識設(shè)置斷點進行離散化,例如:對于屬性Platelet(100~300)×109個/L的為正常,低于100×109個/L或高于300×109個/L的為異常;屬性Procalcitonin小于0.5μg/L的為正常,大于或等于0.5μg/L的為異常;屬性Lactic Acid在0.5~2mmol/L之間為正常,小于0.5mmol/L或者大于2mmol/L的為異常.

        表1 部分數(shù)據(jù)信息

        對上述39個屬性采用回歸分析方法降維后,其中的12個屬性被保留了下來,它們包括11個屬性變量和1個決策變量(為了作圖方便,將它們用字母代替):

        我們對余下的12個屬性采用本文中提出的KMBN算法來構(gòu)建貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).取結(jié)點變量的父結(jié)點的最大個數(shù)u=4,結(jié)果如圖1所示.

        圖1 KMBN算法的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習結(jié)果

        為了驗證提出算法的性能,將結(jié)果分別與文獻[13]中的基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法,文獻[19]中的K2與模擬退火相結(jié)合的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法進行了比較.依然取結(jié)點變量的父結(jié)點的最大個數(shù)u=4,基于K2算法的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習結(jié)果如圖2所示.

        文獻[19]中的K2與模擬退火相結(jié)合的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法的結(jié)果如圖3所示.

        圖2 基于K2算法的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習結(jié)果

        圖3 基于K2與模擬退火的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習結(jié)果

        醫(yī)學診斷,特別是在臨床,需要簡潔、快速的診斷模型,冗長而耗費時間的診斷模型難以在臨床中推廣.ApacheⅡ評分模型[20]、GCS評分模型[21]就是臨床中快速的診斷模型.本文通過回歸分析方法來降維,在原本39個屬性中保留12個屬性,結(jié)點的減少簡化了決策變量的分析.通過KMBN算法得出的貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)提示結(jié)果受Survival Desire和FAST評分[22]的直接影響,兩屬性使診斷快速而有效,文獻[13]方法顯示結(jié)果受到多個因素(H,K,G和A)影響,本文方法明顯提高了效率.而圖3方法顯示,結(jié)果受屬性(Eyesight,Temperature)影響,對照醫(yī)學領(lǐng)域,不符合實際.圖2中,顯示B,C,D,E,F(xiàn),I,J之間沒有依賴關(guān)系.實際上,隨著疾病的進展和臟器功能衰竭,這些屬性是相互影響的,因此使用圖1解釋疾病發(fā)展更加合理.

        本文算法、文獻[13]和文獻[19]的學習結(jié)果數(shù)據(jù)如表2所示.從表2中可以看出,KMBN算法、基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法和基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法得出的邊數(shù)分別為19條,37條,20條.明顯基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習方法得出的關(guān)系更為復雜,而KMBN方法和基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習方法的關(guān)系復雜度相似.它們精確度的檢驗有待驗證.但由模型中邊的情況觀察,通過醫(yī)學理解可知,圖1中FAST功能評級的下降提示患者存在老年癡呆,因此影響患者語言能力,語言能力的下降直接導致社交功能受損,然后將伴隨生存欲望的下降,最終導致結(jié)果的發(fā)生.而氧合指數(shù)的下降往往伴隨著呼吸機輔助呼吸,因此其語言及生存欲望下降,同時,乳酸的上升導致臟器灌注的下降,將影響視覺和腎臟血流(尿素氮上升),其他的結(jié)果也有類似的聯(lián)系.總體來說,圖1對于結(jié)果的解釋較為合理,反觀圖3中生存欲望對于體溫、膽紅素的影響在醫(yī)學中難以解釋.同時,體溫和視覺對于結(jié)果的直接影響也無法通過醫(yī)學理論解釋.實際上,在該方法中多個邊所確定的關(guān)系均無法在醫(yī)學領(lǐng)域中解釋,因此極大影響結(jié)果的可信度判斷.

        表2 幾種算法學習結(jié)果的對比

        3.2 計算復雜度分析

        K2算法的時間復雜度為O(mk2n2r),其中:m表示實例樣本個數(shù),k表示父結(jié)點個數(shù),r表示每一個結(jié)點的取值個數(shù).在基于K2與模擬退火算法中,計算的復雜度與K2算法不同的就是多了等溫搜索次數(shù)t和最大迭代次數(shù)s,所以基于K2與模擬退火算法的時間復雜度是O(mk2n2rts).對于文中改進的KMBN算法,在得出先驗結(jié)點順序后不再依賴實例樣本個數(shù),因此其時間復雜度為O(k2n2r).

        由此可看出,基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法的計算時間比較復雜,基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法和本文算法接近,但基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法得出的結(jié)果受到多個因素影響,效率明顯較低.再者,基于K2的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法得出的結(jié)構(gòu)圖中的邊數(shù)比其他2個多很多,這在搜索診斷治療結(jié)果時需要花費更多的時間.雖然基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法得出的結(jié)構(gòu)圖邊數(shù)與本文算法很接近,但前者確定的很多關(guān)系無法在醫(yī)學領(lǐng)域中證實,缺乏準確性.

        4 結(jié)論

        貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習是數(shù)據(jù)挖掘的重要研究方向,它提供了不確定性環(huán)境下的知識表示、推理、學習手段,可以解決診斷、預測、分類等問題.本文充分考慮了條件變量與決策變量的數(shù)據(jù)分布關(guān)系,通過logistic回歸分析和條件互信息熵對案例數(shù)據(jù)進行了預處理,接著用提出的打分——搜索算法即KMBN算法對數(shù)據(jù)集進行了貝葉斯網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)學習.實驗結(jié)果表明,本文算法與傳統(tǒng)的基于K2算法的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習比較,前者明顯簡化了網(wǎng)絡結(jié)構(gòu).本文算法與基于K2與模擬退火的貝葉斯結(jié)構(gòu)學習算法比較,可以看出,本文算法具有較好的可靠性.同時,本文算法在時間復雜度上面也有改善,為貝葉斯網(wǎng)絡廣泛應用于解決實際問題又提供了一種新的有效方法.

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