摘要:目的 探尋導(dǎo)致豚鼠自身免疫性梅尼埃病(autoimmune Meniere's disease,AIMD)模型的內(nèi)耳組織抗原成分中相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的蛋白質(zhì)成分。方法 雙向凝膠電泳方法分離豚鼠內(nèi)耳組織抗原成分,用ImageMaster圖像分析軟件選擇相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的蛋白質(zhì)點(diǎn),對(duì)這些蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過Mascot軟件查詢Swiss-prot數(shù)據(jù)庫,利用PathwayStudio軟件對(duì)查詢到的蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白。結(jié)果 獲得重復(fù)性和分辨率都較好的雙向電泳圖譜,軟件分析相對(duì)分子質(zhì)量58 000蛋白共獲得20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn);質(zhì)譜分析后查詢數(shù)據(jù)庫鑒定得到11個(gè)蛋白質(zhì)。這些蛋白分別與免疫、凋亡和分化等功能相關(guān),其中凝血因子C從相對(duì)分子質(zhì)量、Mascot評(píng)分和蛋白功能等方面綜合評(píng)估結(jié)果提示其可能作為相對(duì)分子質(zhì)量58000蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白抗原。結(jié)論 成功獲得豚鼠自身免疫性梅尼埃病模型主要內(nèi)耳抗原成分中相對(duì)分子質(zhì)量58 000蛋白的雙向凝膠電泳圖譜,并應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)鑒定蛋白質(zhì)點(diǎn)。綜合分析提示凝血因子C可能為相對(duì)分子質(zhì)量58 000蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白。
關(guān)鍵詞:梅尼埃??;自身免疫;內(nèi)耳抗原
自身免疫性內(nèi)耳疾?。╝utoimmune inner ear disease,AIED)是臨床上極少數(shù)治療效果較好一類內(nèi)耳疾病,自身免疫性梅尼埃病(autoimmune Meniere's disease,AIMD)屬于自身免疫性內(nèi)耳疾病(autoimmune inner ear disease,AIED)的一種。本項(xiàng)目組前期實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果顯示,相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的內(nèi)耳組織抗原為導(dǎo)致豚鼠AIMD的主要抗原成分之一[1,2]。本研究擬對(duì)豚鼠內(nèi)耳組織中相對(duì)分子量58 000的抗原采用蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù),進(jìn)行分離鑒定,為AIMD在特異性抗原方面的進(jìn)一步研究打下基礎(chǔ)。
1資料與方法
1.1實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 健康、白色、紅目豚鼠3只,3月齡,雌雄不限,體重250~300g,由南京市江寧青龍山動(dòng)物繁殖場提供,豚鼠耳廓反射正常,耳鏡檢查排除中耳疾患。
1.2試劑與儀器
1.2.1蛋白質(zhì)提取、雙向電泳 固相pH梯度膠條(24cm,pH3~10NL)、丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺、TEMED、APS、Tris、超純尿素、DTT、硫脲、CHAPS、載體兩性電解質(zhì)(Pharmalytes pH3~10)、膠槽清洗液、凝膠覆蓋液、碘乙酰胺、低熔點(diǎn)瓊脂糖、溴酚蘭;BCA試劑盒;十二烷基磺酸鈉;蛋白酶抑制劑cocktail、37%甲醛;分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)(130、95、72、55、43、34、26kD);甘油、無水乙醇、冰醋酸、無水乙酸鈉、碳酸鈉、硫代硫酸鈉、硝酸銀、乙二胺四乙酸二鈉(EDTA.Na2)、磷酸、蔗糖、濃鹽酸均為國產(chǎn)分析純;所有溶液均用去離子水配制。
1.2.2質(zhì)譜分析 乙晴,碳酸氫胺,三氟乙酸,序列修飾后胰蛋白酶。MALDI-MS質(zhì)譜儀BIFLEXⅣ。
1.2.3免疫印跡法試驗(yàn) PVDF膜(Millipore Corporation);化學(xué)發(fā)光試劑盒(Cell Signaling Technology,Inc)。CS-15R臺(tái)式高速冷凍離心機(jī);Bio-Rad ModeL 680垂直電泳槽、電轉(zhuǎn)移槽;
1.3方法
1.3.1抗原制備 制備豚鼠內(nèi)耳組織抗原[3],方法:清醒狀態(tài)下斷頭,取聽泡,分離膜迷路(主要包括螺旋韌帶、基底膜、膜半規(guī)管、橢圓囊和球囊),置于150μl裂解液(7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,40mmol/L Tris,65mmol/L DTT,2%IPG緩沖液,1%Cocktail,去離子水),經(jīng)剪切、超聲粉碎及均漿,12000 r/min 4℃離心5min,取上清貯于-80℃?zhèn)溆谩S肂CA法測蛋白質(zhì)濃度。
1.3.2雙向凝膠電泳 第一相固相pH梯度(immobilized pH gradient,IPG)等電聚焦主要參照G?紫rg等[4]的方法進(jìn)行,簡述:采用pH3~10NL,24cm干膠條,每份以120μg內(nèi)耳抗原總蛋白質(zhì)與水化液(8mol/L尿素、20mmol/LDTT、2%CHAPS、0.5%IPG緩沖液以及0.001%溴酚蘭)充分混合,總體積450μl。用IPGphor等電聚焦儀,進(jìn)行第一向等電聚焦,在20℃下自動(dòng)運(yùn)行。
1.3.3凝膠染色和掃描及圖像分析 雙向電泳后的2-DE膠,為了制備蛋白用于質(zhì)譜分析而采用硝酸銀染色。染色后的雙向電泳凝膠用ImageScannerTM掃描儀進(jìn)行透射掃描,數(shù)字化圖象文件運(yùn)用Amersham Pharmacia公司的ImageMasterR 2D Elite(Version 2.00)軟件分析。比較3次重復(fù)結(jié)果圖譜,獲得標(biāo)準(zhǔn)圖譜。選擇相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
1.3.4質(zhì)譜分析及數(shù)據(jù)庫查詢 選取2-DE凝膠上相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)在圖像上做好標(biāo)記,編號(hào)為1~20。20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)在經(jīng)過切膠、脫色、干膠后進(jìn)行酶切、點(diǎn)樣。得到的肽質(zhì)量指紋圖譜利用Mascot搜索引擎(http://www.matrixscience.com//mascot/cgi/search_form.pl?FORMVER=2SEARCH=PMF)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫檢索,其中蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫選擇SwissProt庫。結(jié)合雙向電泳圖譜上相應(yīng)點(diǎn)的等電點(diǎn)、分子量綜合分析。
2結(jié)果
2.1二維電泳及凝膠分析結(jié)果:電泳后的凝膠圖譜呈現(xiàn)良好的重復(fù)性和穩(wěn)定性,經(jīng)圖像軟件分析相對(duì)分子質(zhì)量為58 000的共有20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)(圖1)。將這20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)從1~20依次編號(hào),并對(duì)其進(jìn)行質(zhì)譜分析。
圖1 豚鼠內(nèi)耳組織抗原雙向凝膠電泳圖譜
1~20分別為相對(duì)分子質(zhì)量為58kD的20個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)。
2.2質(zhì)譜結(jié)果及生物信息學(xué)分析 將這20個(gè)蛋白點(diǎn)進(jìn)行MALDI-TOF-MS分析,以基質(zhì)峰和酶自動(dòng)降解峰進(jìn)行校正,獲得各蛋白點(diǎn)的肽片斷質(zhì)量指紋圖譜。用Mascot搜索引擎在SwissProt數(shù)據(jù)庫進(jìn)行查詢,結(jié)合雙向電泳圖譜上相應(yīng)點(diǎn)的表觀等電點(diǎn)、分子量綜合分析,前17個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)被成功鑒定,部分蛋白質(zhì)點(diǎn)得到同一種蛋白,總共獲得11個(gè)蛋白(圖2)。第一個(gè)蛋白點(diǎn)得到兩個(gè)蛋白,其余各點(diǎn)都為一個(gè)蛋白;1、7、9、10、15和17六個(gè)點(diǎn)都得到凝血因子C,從相對(duì)分子質(zhì)量、Mascot評(píng)分和蛋白功能等方面綜合評(píng)估,凝血因子C可能為58kD蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白。
圖2 質(zhì)譜分析后在SwissProt數(shù)據(jù)庫搜索到的蛋白質(zhì)
蛋白質(zhì)點(diǎn)1~17經(jīng)分析得到結(jié)果,第一個(gè)蛋白點(diǎn)為混合點(diǎn),分別得到兩個(gè)蛋白,其余各點(diǎn)為一個(gè)蛋白。
3討論
內(nèi)耳自身免疫性病理損傷在感音神經(jīng)性聾(sensorineural hearing loss,SNHL)、梅尼埃病(Meniere's disease,MD)等內(nèi)耳疾病的發(fā)生及其病理機(jī)制中可能起著重要作用[5,6]。實(shí)驗(yàn)研究證實(shí)多種內(nèi)耳抗原在AIED的發(fā)病中起重要作用,對(duì)這些內(nèi)耳抗原的研究將有助于找到敏感而特異的血清學(xué)檢測方法,作為臨床診斷的重要依據(jù)。
之前的研究初步篩選出分子量為68KD、58KD、42KD、28KD的蛋白質(zhì)可能是致內(nèi)耳自身免疫病理損傷的主要抗原成分[1],發(fā)現(xiàn)68kD蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白為波形蛋白[7]。本研究擬對(duì)豚鼠內(nèi)耳組織中相對(duì)分子量58KD的抗原采用蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù),進(jìn)行分離鑒定,為AIMD在特異性抗原方面的進(jìn)一步研究打下基礎(chǔ)。我們用雙向凝膠電泳方法分離豚鼠內(nèi)耳組織抗原成分,用ImageMaster圖像分析軟件選擇獲得20個(gè)相對(duì)分子質(zhì)量為58kD的蛋白質(zhì)點(diǎn),對(duì)這些蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過Mascot軟件查詢Swiss-prot數(shù)據(jù)庫,最后得到11個(gè)蛋白,其中六個(gè)點(diǎn)都得到凝血因子C。
58kD蛋白在自身免疫性內(nèi)耳疾病的研究中非常重要,而其成分究竟為何仍存在爭議,Boulassel[8]等發(fā)現(xiàn)多種內(nèi)耳疾病患者血清可以與58kD內(nèi)耳蛋白反應(yīng)進(jìn)而通過實(shí)驗(yàn)推斷58kD蛋白是COCH5B2蛋白。凝血因子C同源物(coagulation factor C homology,COCH)基因是人類發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)伴前庭功能障礙的常染色體顯性遺傳非綜合征性耳聾基因,在耳蝸和前庭組織中有高度表達(dá),COCH基因突變可致患者出現(xiàn)漸進(jìn)性感音神經(jīng)性耳聾、前庭功能障礙癥狀[9]。
過去研究表明自身免疫因素是內(nèi)耳疾病的病因之一,但這些免疫介導(dǎo)的聽力損失尚缺乏明確的診斷標(biāo)準(zhǔn),主要依賴聽力學(xué)損害、免疫試驗(yàn)陽性及應(yīng)用激素治療有效來判斷。我們項(xiàng)目組將對(duì)這些內(nèi)耳抗原繼續(xù)研究,進(jìn)而找到敏感而特異的血清學(xué)檢測方法。
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編輯/申磊