易克賢 鄭金龍 習(xí)金根等
摘 要 利用AFLP分子標(biāo)記技術(shù)對181個(gè)中國柱花草膠孢炭疽菌菌株進(jìn)行了基因組DNA分析。分析結(jié)果表明柱花草膠孢炭疽菌株DNA存在顯著的多態(tài)性。聚類分析結(jié)果表明181個(gè)中國柱花草膠孢炭疽菌株可劃分成4大組,但大多數(shù)聚于第Ⅰ和Ⅱ組,而第Ⅰ、Ⅱ組下又分別分為4個(gè)亞組,表明中國柱花草膠孢炭疽菌正在出現(xiàn)種內(nèi)遺傳分化。同時(shí)實(shí)驗(yàn)結(jié)果還表明中國菌株存在著廣泛的生物多樣性和遺傳變異性,海南菌株與廣東、廣西的菌株相比多樣性較豐富,致病力更強(qiáng);而海南菌株又以東方、昌江、中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院儋州所部(簡稱“兩院”)3個(gè)地區(qū)的菌株多樣性最為豐富,毒性譜最廣泛,這可能與海南種植柱花草歷史相對較長、引種活動(dòng)和生產(chǎn)活動(dòng)更為頻繁等有關(guān)。
關(guān)鍵詞 柱花草;炭疽病;遺傳多態(tài)性;AFLP;分子標(biāo)記
中圖分類號(hào) S541+.9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A
柱花草(Stylosanthes spp.)又名筆花豆(penciflower),天然分布在中南美洲、熱帶北美洲、非洲及東南亞[1]。是全球熱帶地區(qū)栽培面積最大應(yīng)用最廣泛的優(yōu)良豆科牧草,它具有產(chǎn)量高、耐旱、耐酸、耐貧瘠等優(yōu)良特性,適于在熱帶、南亞熱帶地區(qū)種植,具有很大的發(fā)展?jié)摿2]。
影響柱花草生產(chǎn)的主要病害是柱花草炭疽?。⊿tylo anthracnose)。柱花草炭疽病主要由半知菌類炭疽菌屬的膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)引起,有時(shí)亦可由該屬的平頭炭疽菌(C.truncatum)和菜豆炭疽菌(C. lindemuthianum)引起[3]。我國1962年從馬來西亞引入柱花草[4]。自推廣種植以來,由于受到柱花草炭疽病的危害,其產(chǎn)量受到嚴(yán)重影響[3]。柱花草炭疽病病原菌存在高度的生物多樣性和遺傳變異性[5]。各國的生產(chǎn)實(shí)踐均證明一個(gè)抗病的柱花草品種使用10年后就會(huì)變成感病品種。而同一品種的柱花草在不同地點(diǎn)的感染程度有差異。炭疽菌分離菌的地理分布與柱花草宿主的自然分布相關(guān)。
AFLP技術(shù)因具有靈敏度高、快速、多態(tài)性強(qiáng)、DNA的用量少、重復(fù)性高等諸多優(yōu)點(diǎn),已被廣泛用于真菌分類鑒定和遺傳多樣性的研究[6-7]。因此該技術(shù)可以檢測到傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法無法區(qū)分的相似菌株種間和種內(nèi)差別,它能快速偵測到新的侵染力強(qiáng)的菌株的出現(xiàn)及其種群的消長和遷移動(dòng)態(tài),便于及時(shí)采取相應(yīng)的措施。
本文是在對我國柱花草炭疽病害調(diào)查和病原收集的基礎(chǔ)上,進(jìn)行病原菌基因組DNA的AFLP多態(tài)性分析,以進(jìn)一步確定我國柱花草炭疽菌的遺傳多態(tài)性和病原遺傳分化類型,為我國柱花草炭疽病抗病育種、病害預(yù)測及防治等提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
1997年至2004年本研究團(tuán)隊(duì)對我國柱花草炭疽病進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)查并分離獲得病原菌703份,從中選取有代表性的181個(gè)菌株進(jìn)行AFLP分析,菌株明細(xì)見表1。
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
用8對引物對181個(gè)中國柱花草膠孢炭疽菌株進(jìn)行分析,每對引物都產(chǎn)生了清晰的AFLP指紋,形成的AFLP圖譜效果如圖1、2、3、4。應(yīng)用UPGMA法進(jìn)行聚類,獲得的聚類樹狀圖如圖5、6、7、8。結(jié)果表明,中國柱花草膠孢炭疽菌具有豐富的多樣性。181個(gè)炭疽菌株之間的相似系數(shù)在0.24~0.57之間,同時(shí)在相似系數(shù)約0.24處聚成4大組。第Ⅰ組共73個(gè)菌株,又在相似系數(shù)約0.25處分化成4個(gè)亞組;第Ⅱ組共60個(gè)菌株,又在相似系數(shù)約0.30處分化成4個(gè)亞組;第Ⅲ、Ⅳ組分別僅有12、20個(gè)菌株。以上結(jié)果表明中國柱花草炭疽菌正在出現(xiàn)種內(nèi)遺傳分化。
結(jié)合聚類圖5、6、7、8和表2可以看出,Ⅰ-1亞組、Ⅱ-1亞組、Ⅲ組菌株主要來自海南;Ⅰ-2亞組的菌株主要來自廣東;Ⅱ-2亞組、Ⅱ-3亞組菌株主要來自廣西;而Ⅰ-3、Ⅰ-4、Ⅱ-4、Ⅳ組菌株主要來自廣東和海南,結(jié)果表明菌株間出現(xiàn)不同程度的地域分布規(guī)律。
從表3、4、5還可看出,第Ⅰ組菌株侵染圭亞那、有鉤、粗糙、西布拉等所有的10個(gè)柱花草寄主品種,而第Ⅱ、Ⅳ組只侵染其中的5個(gè)寄主品種,第Ⅲ組僅侵染其中的4個(gè)寄主品種,說明第Ⅰ組菌株的毒力較強(qiáng),毒性譜非常廣泛,而第Ⅱ、Ⅳ、Ⅳ組菌株的毒性譜較窄。從各省區(qū)的菌株組型分布情況看,海南東方、昌江、兩院的菌株多樣性豐富,覆蓋了所有的4個(gè)組型,而廣西和廣東菌株則相對簡單。這可能與海南種植柱花草歷史較長、大量從國外引種有關(guān)。
3 討論與結(jié)論
3.1 柱花草膠孢炭疽菌株DNA存在顯著的多態(tài)性
本文采用8對不同的引物對181個(gè)來自海南、廣東和廣西的柱花草膠孢炭疽菌株進(jìn)行了較為全面和系統(tǒng)的AFLP分析,結(jié)果表明供試柱花草膠孢炭疽菌株DNA存在顯著的多態(tài)性。
181個(gè)炭疽菌株之間的相似系數(shù)為0.24~0.57,同時(shí)在相似系數(shù)約0.24處聚成4大組,但大多數(shù)菌株聚于第Ⅰ和Ⅱ組。而第Ⅰ組又在相似系數(shù)約0.25處分化成4個(gè)亞組;第Ⅱ組又在相似系數(shù)約0.30處分化成4個(gè)亞組;表明中國柱花草膠孢炭疽菌正在出現(xiàn)種內(nèi)遺傳分化,這與易克賢等人的研究相一致[10]。
3.2 柱花草膠孢炭疽菌株遺傳多態(tài)性具有地域性差異
本文的研究結(jié)果表明海南、廣東和廣西3省區(qū)柱花草膠孢炭疽菌株DNA遺傳多態(tài)性豐富程度海南菌株大于兩廣的菌株,而且同一省區(qū)內(nèi)不同地方的菌株其遺傳多態(tài)性亦表現(xiàn)出地域性差異。其中海南菌株又以東方、昌江、儋州兩院三地的菌株多樣性最為豐富,毒性譜最廣泛,這可能與各地柱花草的引種活動(dòng)、推廣種植的時(shí)間、規(guī)模程度和生態(tài)條件差異有關(guān),引種和種植時(shí)間越長,病原菌為適應(yīng)當(dāng)?shù)丨h(huán)境,遺傳變異和進(jìn)化必然更加活躍[11]。
3.3 柱花草膠孢炭疽菌株表現(xiàn)出一定程度的?;纳?/p>
本研究結(jié)果表明,第Ⅰ組菌株侵染圭亞那、有鉤、粗糙、西布拉等所有的10個(gè)柱花草寄主品種,而第Ⅱ、第Ⅳ組只侵染其中的5個(gè)寄主品種,第Ⅲ組僅侵染其中的4個(gè)寄主品種,說明第Ⅰ組菌株的毒力較強(qiáng),毒性譜非常廣泛,而第Ⅱ、Ⅳ、Ⅳ組菌株的毒性譜較窄。
3.4 AFLP可用于柱花草膠孢炭疽菌株種群遺傳變異的監(jiān)測和抗病育種
國外許多報(bào)道[12-14]均表明在柱花草的起源中心-南美和長期種植區(qū)其炭疽病菌存在著廣泛的生物多樣性和遺傳變異性,而在新種植區(qū)則相對簡單。本文研究表明,與國外研究結(jié)果相比,中國柱花草炭疽病菌遺傳多樣性要簡單得多,因此今后從其它國家進(jìn)行柱花草引種和推廣過程中,應(yīng)特別注意病原菌的檢疫和病害監(jiān)測,以防止新的侵染力強(qiáng)的病原菌株或小種從國外或老種植區(qū)帶入新區(qū),影響中國柱花草的生產(chǎn)。此外本文研究結(jié)果表明中國柱花草炭疽病菌正出現(xiàn)一些新的種內(nèi)遺傳分化,因此有必要不斷加強(qiáng)綜合抗病品種的選育。
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