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        牡荊素與DNA相互作用的機(jī)理研究

        2014-03-28 05:11:12煒,劉
        關(guān)鍵詞:牡荊小檗吸收光譜

        劉 煒,劉 紅

        (海南師范大學(xué)化學(xué)與化工學(xué)院,???71158)

        DNA與藥物分子相互作用的研究有助于了解藥物的作用機(jī)理,并更有效地指導(dǎo)新藥設(shè)計(jì),以DNA作為藥物作用靶是有效的新興的藥物篩選和新藥設(shè)計(jì)手段[1-3].

        牡荊素屬于黃酮苷類化合物,存在于山楂、牡荊、竹葉等植物中,主要用于治療心血管疾病,也是防癌抗腫瘤的天然藥物成分,具有較強(qiáng)的抗氧化、抗癌、抗病毒的藥理活性,生物活性測定中對人類癌細(xì)胞顯示了廣泛的細(xì)胞毒作用.本論文主要通過紫外吸收光譜法、熒光光譜法和黏度法研究牡荊素與DNA的相互作用,該研究將有助于揭示牡荊素的抗癌機(jī)理.

        圖1 牡荊素結(jié)構(gòu)式Fig.1 The structure of vitexin

        1 實(shí)驗(yàn)部分

        1.1 儀器與試劑

        TU-1901紫外可見分光光度計(jì)(普析通用,北京),PHS-25型p H計(jì)(上海雷磁),日立F-4500熒光分光光度儀(日本).

        DNA貯備液:稱取0.1 g的鯡魚精DNA(Sigma公司)以二次蒸餾水定容于100 m L的容量瓶中,由在260 nm處的吸光度(ε=6600 L·mol-1·cm-1)確定其濃度,冰箱中冷藏.

        牡荊素(中檢所,純度≥99.8%)貯備液:稱取一定量的牡荊素,以乙醇定容至100 mL的容量瓶中配制成濃度為10-3mol/L,置于0至4℃下保存.

        緩沖溶液:用鹽酸滴加到0.1 mol/L的Tris(三羥甲基氨基甲烷)中,在p H計(jì)上調(diào)成p H7.4的緩沖溶液.

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        在10 m L的比色管中依次加入1 m L p H7.4的緩沖溶液、小檗堿、DNA溶液,以及不同量的牡荊素工作溶液,定容、搖勻,進(jìn)行熒光光譜的測定.熒光激發(fā)波長定為358 nm,熒光發(fā)射峰位為532 nm,狹縫寬均為5 nm.

        在10 m L的比色管中依次加入1 m L p H7.4的緩沖溶液、牡荊素工作溶液和不同量的DNA溶液,定容、搖勻,以試劑空白為參比,進(jìn)行紫外吸收光譜的測定.

        2 結(jié)果與討論

        2.1 牡荊素對DNA紫外吸收光譜的影響

        圖2為牡荊素對DNA紫外吸收光譜的影響.

        圖2 牡荊素對DNA紫外吸收光譜的影響Fig.2 The UV absorption spectra of DNA in the presence of vitexin

        從圖2中可以看出,DNA在257 nm處有一最大紫外吸收峰,連續(xù)加入牡荊素后,其吸收度持續(xù)增強(qiáng),表明牡荊素與DNA發(fā)生了反應(yīng).由于DNA在257 nm處的吸收峰來自于其堿基對,因此表明牡荊素與DNA的堿基對發(fā)生了結(jié)合.

        2.2 DNA對牡荊素紫外吸收光譜的影響

        圖3為DNA對牡荊素紫外吸收光譜的影響,由圖3可以看出,牡荊素在220 nm及274 nm處各有一紫外吸收峰,DNA的加入導(dǎo)致兩處吸收峰的吸光度明顯降低,同時(shí)紫外吸收峰明顯紅移(274 nm→279 nm).由于藥物與DNA大致有3種結(jié)合模式:靜電式、嵌入式和溝槽式,其中靜電式結(jié)合不會(huì)發(fā)生藥物吸收峰的紅移或藍(lán)移;如果小分子與DNA是通過嵌入式鍵合,DNA的加入會(huì)引起藥物分子的紫外吸收峰發(fā)生紅移,溝槽式則發(fā)生藍(lán)移[4-6].因此,可判斷葒草苷與DNA為嵌入式結(jié)合.

        圖3 DNA對牡荊素紫外吸收光譜的影響Fig.3 The UV absorption spectra of vitexin in the presence of DNA

        2.3 牡荊素對BR-DNA體系熒光光譜的影響

        鹽酸小檗堿(BR)可作為熒光探針研究小分子化合物與DNA的相互作用,當(dāng)藥物小分子插入到DNA雙螺旋中時(shí),可與小檗堿發(fā)生競爭結(jié)合DNA的反應(yīng),將小檗堿從雙螺旋中擠出,從而熒光強(qiáng)度降低[4-5].連續(xù)向小檗堿-DNA體系中加入不同量的牡荊素,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示.小檗堿-DNA體系在532 nm處有一顯著熒光發(fā)射峰,隨著牡荊素的連續(xù)加入,其熒光強(qiáng)度持續(xù)下降,說明牡荊素對小檗堿-DNA體系發(fā)生了熒光猝滅作用.

        圖4 牡荊素對小檗堿-DNA體系熒光發(fā)射光譜的影響Fig.4 The fluorescence emission spectra of BR-DNA in the presence of vitexin

        2.4 熒光猝滅方式的判斷

        由動(dòng)態(tài)猝滅Stern-Volmer 方程:F0/F=1+Kqτ0c=1+Ksvc(1)[7],根據(jù)牡荊素對BRDNA的猝滅光譜所得熒光強(qiáng)度計(jì)算得F0/F-1,按式(1)對c作線性回歸(圖5),求得在298 K時(shí),牡荊素對BR-DNA的Stern-Volmer猝滅常數(shù)Ksv為5.785×103L/mol(相關(guān)系數(shù)為0.9647),則其雙分子速率常數(shù)Kq為5.785×1011L·mol-1·s-1,遠(yuǎn)大于各猝滅劑對生物大分子最大擴(kuò)散控制的碰撞猝滅常數(shù)2.0×1010L·mol-1·s-1[8],因此牡荊素對BR-DNA的熒光猝滅不是動(dòng)態(tài)猝滅所引起,而是因?yàn)樾纬蓮?fù)合物所產(chǎn)生的靜態(tài)猝滅.實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,牡荊素與DNA是以嵌入方式結(jié)合,導(dǎo)致小檗堿被擠出DNA雙螺旋,從而發(fā)生熒光猝滅.

        圖5 牡荊素與BR-DNA反應(yīng)的stern-volmer方程Fig.5 Stern-Volmer curves for the binding of vitexin to BR-DNA at 298 K

        2.5 牡荊素與DNA的結(jié)合常數(shù)和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)由靜態(tài)猝滅公式

        由式(2)分別作出不同溫度下牡荊素-DNA體系的關(guān)系圖.結(jié)果如圖6,通過外推截距和斜率可求出25℃和40℃牡荊素與DNA之間的結(jié)合常數(shù)分別為1.156×105L·mol-1和1.885×104L·mol-1,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)分別為1.336 3和1.061 5.

        2.6 牡荊素與DNA結(jié)合反應(yīng)的熱力學(xué)性質(zhì)及作用力的影響

        根據(jù)熱力學(xué)公式可以計(jì)算藥物小分子與生物大分子作用間的有關(guān)熱力學(xué)參數(shù)[10-11]:

        根據(jù)熱力學(xué)參數(shù)可以簡單判斷其相互作用類型:ΔH>0及ΔS>0為疏水作用,ΔH<0及ΔS>0為靜電作用,ΔH<0及ΔS<0為氫鍵或者范德華作用[12-15].

        根據(jù)牡荊素與DNA的結(jié)合常數(shù)K1(298 K)=1.156×105L·mol-1,K2(313 K)=1.885×104L·mol-1,按式(3)~(5)可以求得二者結(jié)合過程的熱力學(xué)參數(shù):

        由此可初步判斷牡荊素與DNA主要是以氫鍵或者范德華作用力結(jié)合.

        圖6 牡荊素與DNA反應(yīng)的lg[(F 0-F)/F]~lg c關(guān)系圖Fig.6 The plot of lg[(F 0-F)/F]vs lg c of the reaction between vitexin and DNA

        圖7 牡荊素對DNA相對黏度的影響Fig.7 The effect of vitexin on the relative viscosity

        2.7 牡荊素與DNA反應(yīng)的黏度研究

        當(dāng)藥物分子以嵌入的方式與DNA結(jié)合,DNA雙螺旋變長,粘度增加[12,16].向固定濃度的DNA溶液中加入不同量的牡荊素,由實(shí)驗(yàn)結(jié)果,按下式計(jì)算相對粘度:η=(t-t0)/t0.式中t0為空白溶液流經(jīng)毛細(xì)管所需時(shí)間,t為含不同量牡荊素的DNA溶液流經(jīng)毛細(xì)管所需時(shí)間,以(η/η0)1/3對結(jié)合比率r(cvitexin/cDNA)作圖,η0為未加入牡荊素時(shí)DNA的粘度[12],如圖7所示.隨著牡荊素濃度的增大,DNA相對粘度逐漸增大,由此可知牡荊素與DNA以嵌入方式結(jié)合,結(jié)果與熒光、紫外光譜結(jié)果相吻合.

        3 結(jié)論

        本文利用熒光光譜法和紫外吸收光譜法研究了牡荊素與DNA相互作用的機(jī)理,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,牡荊素與DNA主要通過氫鍵或者范德華作用力以嵌入模式結(jié)合,從而阻止了細(xì)胞中DNA的復(fù)制,這可能是牡荊素具有較強(qiáng)抗癌活性的原因之一.25℃和40℃兩個(gè)不同溫度下下牡荊素與DNA之間的結(jié)合常數(shù)分別為1.156×105和1.885×104L·mol-1,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)分別為1.3363和1.0615.

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