夏循禮
(江西中醫(yī)藥大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,南昌 330004)
糖類(lèi)是生物體的主要能源物質(zhì),葡萄糖有氧氧化過(guò)程是其供能的主要方式。當(dāng)前主要的《生物化學(xué)》教材[1-4]對(duì)該過(guò)程基本描述為:在生物體內(nèi),葡萄糖(C6H12O6)經(jīng)過(guò)一系列酶促反應(yīng),其H原子經(jīng)過(guò)呼吸鏈傳遞,最終與O反應(yīng)生成H2O,同時(shí)伴隨著氧化還原電勢(shì)轉(zhuǎn)化為自由能,并以化學(xué)能形式儲(chǔ)存在ATP(ADP磷酸化生成ATP)中,生成30~32ATP(或者36~38ATP);其C原子以有機(jī)酸脫羧的形式生成CO2釋放出來(lái);其中1分子葡萄糖有氧氧化共產(chǎn)生12對(duì)H原子,氧化磷酸化生成12分子H2O,有機(jī)酸脫酸生成6分子CO2。
綜觀(guān)這些教材的葡萄糖有氧氧化過(guò)程,有兩個(gè)主要問(wèn)題并沒(méi)有闡釋清楚:一是經(jīng)過(guò)呼吸鏈傳遞并與ATP生成量直接相關(guān)的12對(duì)(24個(gè))H原子的來(lái)源問(wèn)題,因?yàn)?分子葡萄糖只有6對(duì)(12個(gè))H原子;二是有機(jī)酸脫羧生成6個(gè)CO2的O原子的來(lái)源問(wèn)題,因?yàn)槠咸烟欠肿又挥?個(gè)O原子,而6個(gè)CO2共需要12個(gè)O原子,以及其它來(lái)源O原子形成有機(jī)酸羧基的機(jī)制如何。檢索近年來(lái)的生物學(xué)科期刊發(fā)表的關(guān)于生物氧化和三羧酸循環(huán)教學(xué)研究的論文[5-8],對(duì)這兩個(gè)問(wèn)題或者語(yǔ)焉不詳,或者涉及不深,沒(méi)有能夠全面地解析這兩個(gè)問(wèn)題。鑒于此,筆者在《基于H原子和O原子代謝的葡萄糖有氧氧化解析》[9]一文中已經(jīng)嘗試對(duì)第一個(gè)問(wèn)題作答;本文試就第二個(gè)問(wèn)題概要闡釋。
葡萄糖有氧氧化過(guò)程中共有3次有機(jī)酸脫羧反應(yīng),發(fā)生在糖酵解途徑之后,分別為丙酮酸氧化脫羧、異檸檬酸氧化脫羧和α-酮戊二酸氧化脫羧。
1)葡萄糖酵解途徑總反應(yīng):
2)丙酮酸氧化脫羧反應(yīng):
3)異檸檬酸氧化脫羧反應(yīng):
4)α-酮戊二酸氧化脫羧反應(yīng):
從上述反應(yīng)可以看出,1分子葡萄糖通過(guò)糖酵解途徑,分解為2分子丙酮酸和2分子(NADH+H+):通過(guò)丙酮酸氧化脫羧、異檸檬酸氧化脫羧和α-酮戊二酸氧化脫羧分別各生成1分子CO2,因此1分子葡萄糖共生成6分子CO2,具體為:丙酮酸氧化脫羧生成C0O2的C原子來(lái)源于葡萄糖,O原子來(lái)源于葡萄糖;異檸檬酸氧化脫羧生成CcO2的C原子來(lái)源于(與乙酰輔酶A 和H2O生成檸檬酸的)草酰乙酸,O原子同樣來(lái)源于(與乙酰輔酶A 和H2O生成檸檬酸的)草酰乙酸;α-酮戊二酸氧化脫羧生成CfO2的C原子來(lái)源于(與乙酰輔酶A 和H2O生成檸檬酸的)草酰乙酸,O原子同樣來(lái)源于(與乙酰輔酶A 和H2O生成檸檬酸的)草酰乙酸。
其中丙酮酸氧化脫羧發(fā)生在丙酮酸的C0位羧基上(CbH3-CaO-C0OOH),異檸檬酸氧化脫羧發(fā)生在異檸檬酸的Cc位羧基上(CfOOH-CeHOH-CdHCcOOH-CbH2-CaOOH),α-酮戊二酸氧化脫羧發(fā)生在α-酮戊二酸的Cf位羧基上(CfOOH-CeO-CdH2-CbH2-CaOOH)。丙酮酸的C0位羧基來(lái)源于葡萄糖分子,異檸檬酸的Cc位羧基和α-酮戊二酸的Cf位羧基都來(lái)源于三羧酸循環(huán)起始反應(yīng)加入的草酰乙酸(C1(c)OOH-C2(d)O-C3(e)H2-C4(f)OOH)的2個(gè)羧基,分別為其Cc位羧基和Cf位羧基(-C1(c)OOH和-C4(f)OOH)。
葡萄糖氧化脫羧過(guò)程需要解讀的是:與乙酰輔酶A 和H2O反應(yīng)生成檸檬酸(CaOOH-CbH2-CdOHCcOOH-CeH2-CfOOH)的草酰乙酸的2個(gè)羧基(-CcOOH和-CfOOH)分別通過(guò)異檸檬酸氧化脫羧和α-酮戊二酸氧化脫羧形式生成CO2釋放,而三羧酸循環(huán)結(jié)束時(shí)草酰乙酸得到還原;該“還原”的草酰乙酸(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH)的C原子來(lái)源及其羧基形成機(jī)制,即可解析外源O原子的來(lái)源問(wèn)題。
上述三羧酸循環(huán)“還原”的草酰乙酸(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH)的4個(gè)C原子來(lái)源分別為乙酰輔酶A (CbH3-CaO-SCoA)的2個(gè)C原子,以及(與乙酰輔酶A 和H2O生成檸檬酸的)草酰乙酸脫羧后“余下”的Cd和Ce位的2個(gè)C原子(C1(c)OOH-C2(d)O-C3(e)H2-C4(f)OOH);其羧基的形成機(jī)制與3次加H2O反應(yīng)緊密相關(guān):
5)檸檬酸生成過(guò)程中的加H2O形成羧基
該過(guò)程中H2O分子的-OH加在Ca位形成羧基(-CaOOH),H加在Cd位形成-OH。
6)琥珀酰輔酶A生成琥珀酸過(guò)程中的加H2O形成羧基
該過(guò)程中H2O分子來(lái)源于:H3PO4+GDP → GTP+H2O,其-OH加在Ce位形成羧基(-CeOOH)。
7)延胡索酸生成蘋(píng)果酸過(guò)程中的加H2O形成羥基,在生成草酰乙酸時(shí)再形成?;?/p>
CaOOH-CbH=CdH-CeOOH(延胡索酸)+H2O → CaOOH-CbHOH-CdH2-CeOOH(蘋(píng)果酸)
該過(guò)程中H2O分子的-OH加在Cb位形成羥基(-CbHOH),再氧化脫氫形成?;?-Cb=O)。
從上述反應(yīng)(5)、(6)和(7)可以看出,葡萄糖通過(guò)糖酵解途徑和丙酮酸氧化脫羧生成乙酰輔酶A,加H2O和草酰乙酸生成檸檬酸,H2O以-OH形式加到乙酰輔酶A的?;?Ca=O的C原子上形成羧基-CaOOH;H3PO4和GDP生成GTP和H2O,H2O以-OH形式加到琥珀酰輔酶A的?;?Ce=O的C原子上形成羧基-CeOOH;延胡索酸加H2O生成蘋(píng)果酸,H2O以-OH形式加到延胡索酸的不飽和烯?;?Cb=Cd-的C原子上形成羥基(-CbHOH),然后氧化脫氫生成草酰乙酸的酰基(-Cb=O),該草酰乙酸的?;?-Cb=O)再進(jìn)入三羧酸循環(huán)生成檸檬酸時(shí)即加H2O中的H形成-CdOH-(-CdOH-CcOOH-),在檸檬酸轉(zhuǎn)化為異檸檬酸后形成-CeOH-(-OHCeH-HCdCcOOH-),在異檸檬酸氧化脫羧過(guò)程中形成α-酮戊二酸的-Ce=O-CfOOH,在α-酮戊二酸氧化脫羧過(guò)程中形成琥珀酰輔酶A的-Ce=O-SCoA,最終加H2O轉(zhuǎn)化為琥珀酸的羧基-CeOOH(CaOOH-CbH2-CdH2-CeOOH)。
以上3次加H2O反應(yīng),共加入6個(gè)O原子(2×3H2O=6H2O)到葡萄糖有氧氧化過(guò)程中,2個(gè)O原子參與形成乙酰輔酶A的?;?C=O的C原子來(lái)源的羧基-COOH,此羧基即檸檬酸循環(huán)“還原”的草酰乙酸的Ca位羧基(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH);2個(gè)O原子參與形成2分子琥珀酰輔酶A的?;?Ce=O的C原子來(lái)源的羧基-CeOOH(CaOOH-CbH2-CdH2-CeOOH),即琥珀酸的羧基-CeOOH,此羧基即三羧酸循環(huán)“還原”的草酰乙酸的Ce位羧基(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH);2個(gè)O原子參與形成三羧酸循環(huán)“還原”的草酰乙酸的?;?C=O,而檸檬酸循環(huán)起始加入的草酰乙酸的酰基-C=O的O原子通過(guò)一系列酶促反應(yīng)進(jìn)入琥珀酰輔酶A的?;?C=O,即三羧酸循環(huán)“還原”的草酰乙酸的Ce位羧基(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH)中的另一個(gè)O原子。
綜上所析,葡萄糖有氧氧化過(guò)程中3次有機(jī)酸脫羧:丙酮酸氧化脫羧生成CO2的C原子和O原子都來(lái)源于葡萄糖;異檸檬酸氧化脫羧生成CO2的C原子和O原子都來(lái)源于草酰乙酸的C1(c)位羧基;α-酮戊二酸氧化脫羧生成CO2的C原子和O原子都來(lái)源于草酰乙酸的C4(f)位羧基。檸檬酸循環(huán)最終“還原”的草酰乙酸(C1(a)OOH-C2(b)O-C3(d)H2-C4(e)OOH)的C1(a)和C2(b)位C原子來(lái)源于丙酮酸氧化脫羧生成的乙酰輔酶A,C3(d)和C4(e)位C原子來(lái)源于三羧酸循環(huán)起始草酰乙酸的C2(d)和C3(e)位C原子,其C1(a)位羧基的2個(gè)O原子分別來(lái)源于葡萄糖和H2O;C2(b)位?;?C=O的O原子來(lái)源于H2O;C4(e)位羧基的2個(gè)O原子分別來(lái)源于H2O和三羧酸循環(huán)起始反應(yīng)加入草酰乙酸的?;?C=O的O原子。
所以,葡萄糖有氧氧化過(guò)程中CO2生成的有機(jī)酸脫羧機(jī)制為:葡萄糖通過(guò)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸,丙酮酸氧化脫羧生成CO2;異檸檬酸氧化脫羧生成CO2,“借用”的草酰乙酸的C1(c)位有機(jī)酸羧基通過(guò)乙酰輔酶A的酰基-C=O加H2O生成羧基“歸還”;α-酮戊二酸氧化脫羧生成CO2,“借用”的草酰乙酸的C4(f)位有機(jī)酸羧基通過(guò)琥珀酰輔酶A的?;?C=O加H2O生成羧基“歸還”。葡萄糖有氧氧化過(guò)程中加H2O成為有機(jī)酸脫羧反應(yīng)的羧基來(lái)源的關(guān)鍵。
關(guān)于葡萄糖有氧氧化通過(guò)有機(jī)酸脫羧生成CO2的機(jī)制,朱欽士[10]、吳劍侯認(rèn)為[11]:葡萄糖的C原子不能直接與O2中的O原子結(jié)合。為了解決這個(gè)難題,線(xiàn)粒體采用了一個(gè)非常聰明的“以H換C”的迂回方式,先在“燃料”分子中的C原子上加上H2O(在C=C雙鍵處)。H2O是由一個(gè)O原子和兩個(gè)H原子組成的(H2O, 即H-O-H)。在被加到食物分子中的C原子上以后,原來(lái)H2O上的H被脫掉(由脫氫酶催化),留下O原子與食物分子中的C原子結(jié)合。然后C原子再帶著兩個(gè)O原子從食物分子中被分離出來(lái)(由脫羧酶催化),成為CO2。機(jī)體呼出的CO2就是這樣形成的(所以機(jī)體呼出的二氧化碳里面的O,并不來(lái)自機(jī)體吸進(jìn)的O,而是來(lái)自H2O)。這樣,C原子作為“燃料”的價(jià)值,就被“轉(zhuǎn)移”到了H原子上。同樣,這些H “燃料”也是來(lái)自H2O分子。
從本文的解析來(lái)看,線(xiàn)粒體“以H換C”的方式成立,即以H2O的H原子,換取葡萄糖的C原子,H原子被脫氫酶脫下來(lái),由輔助因子(NAD+和FAD)傳遞到呼吸鏈,伴隨氧化磷酸化過(guò)程合成ATP,C原子結(jié)合H2O的O原子形成有機(jī)酸羧基,以氧化脫羧方式生成CO2釋放出來(lái),結(jié)果是葡萄糖的C原子作為“燃料”的價(jià)值,被“轉(zhuǎn)移”到了加入的H2O的H原子上。但是,“以H換C”的方式不是在C=C雙鍵處加上H2O,而是在各中間產(chǎn)物(如乙酰輔酶A和琥珀酰輔酶A)的酰基-C=O上加上H2O的-OH,形成羧基-COOH,最終以有機(jī)酸脫羧生成CO2。
1個(gè)葡萄糖分子徹底氧化生成CO2和H2O,共產(chǎn)生6個(gè)CO2和12對(duì)脫氫酶輔助因子結(jié)合的H原子(以NADH+H+和FADH2形式存在):細(xì)胞液中糖酵解途徑產(chǎn)生2對(duì)H原子(NADH+H+形式),線(xiàn)粒體中產(chǎn)生10對(duì)H原子(8對(duì)NADH+H+形式,2對(duì)FADH2形式)。
1個(gè)葡萄糖分子共有6對(duì)H原子(12個(gè)),全部轉(zhuǎn)化為脫氫酶輔助因子結(jié)合的H原子,另外的6對(duì)H原子(12個(gè))則來(lái)源于上述加H2O反應(yīng)過(guò)程中加入的6個(gè)H2O。來(lái)源于6個(gè)H2O的6對(duì)H原子由相應(yīng)的脫氫酶從底物分子上脫下,通過(guò)呼吸鏈-氧化磷酸化與機(jī)體吸進(jìn)的O反應(yīng)生成H2O,釋放的自由能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能儲(chǔ)存在ATP中。
葡萄糖有氧氧化過(guò)程中加入的6分子H2O提供的6對(duì)H原子產(chǎn)生了多少ATP呢?
有機(jī)酸脫羧生成CO2發(fā)生在丙酮酸氧化脫羧和三羧酸循環(huán)兩個(gè)階段,3次加H2O反應(yīng)都發(fā)生在三羧酸循環(huán),在這兩個(gè)階段共發(fā)生5次脫氫酶催化的反應(yīng),產(chǎn)生2×4(NADH+H+),2×1FADH2,只要確認(rèn)產(chǎn)生的FADH2的H原子是否來(lái)自加入的H2O,就可以計(jì)算出加入的H2O“以H換C”產(chǎn)生了多少ATP。
FADH2的2個(gè)H原子分別來(lái)源于琥珀酸(CaOOH-CbH2-CdH2-CeOOH)的Cb位和Cd位上的H原子,其中Cb位的H原子來(lái)源于乙酰輔酶A的甲基-CH3上的H原子,源頭上其來(lái)自于葡萄糖的H原子;Cd位的H原子來(lái)源于草酰乙酸的非羧基C原子(C3(e)位)上的H原子,所以,F(xiàn)ADH2的2個(gè)H原子不是來(lái)源于加H2O“以H換C”的H2O中的H原子。
加H2O“以H換C”的6個(gè)H2O中的12個(gè)H原子全部以6個(gè)NADH+H+形式傳遞到呼吸鏈,通過(guò)氧化磷酸化與O反應(yīng)生成H2O,釋放的自由能中一部分轉(zhuǎn)化為化學(xué)能儲(chǔ)存在15ATP中:
1分子NADH+H+經(jīng)過(guò)呼吸鏈-氧化磷酸化產(chǎn)生2.5分子ATP;
6分子NADH+H+經(jīng)過(guò)呼吸鏈-氧化磷酸化產(chǎn)生6×2.5分子ATP=15ATP。
綜合以上分別針對(duì)葡萄糖有氧氧化的有機(jī)酸脫羧過(guò)程、加H2O“以H換C”形成有機(jī)酸羧基機(jī)制、以及加H2O“以H換C”與氧化磷酸化產(chǎn)生ATP 3個(gè)部分的解析,我們可以得出如下結(jié)論:
1)葡萄糖有氧氧化過(guò)程產(chǎn)生12對(duì)以NADH+H+和FADH2形式存在的H原子,其中6對(duì)H原子來(lái)源于“以H換C”的加H2O反應(yīng),由脫氫酶脫下以NADH+H+形式傳遞到呼吸鏈,與O反應(yīng)生成H2O,同時(shí)釋放能量生成15個(gè)ATP。加H2O反應(yīng)的H2O有兩種來(lái)源:一是直接加入基質(zhì)中的H2O;二是H3PO4和GDP反應(yīng)生成GTP時(shí)產(chǎn)生的H2O。
2)葡萄糖有氧氧化的C原子通過(guò)有機(jī)酸脫羧方式生成CO2釋放出來(lái),葡萄糖分子的6個(gè)C原子以有機(jī)酸脫羧方式生成CO2需要12個(gè)O原子,葡萄糖提供6個(gè)O原子,另外6個(gè)O原子由“以H換C”加入的6個(gè)H2O提供。H2O的-OH加到中間產(chǎn)物的?;?C=O上形成羧基-COOH,再以有機(jī)酸脫羧生成CO2完成葡萄糖C原子的徹底代謝。
3)葡萄糖有氧氧化的有機(jī)酸脫羧有兩種方式:一是葡萄糖經(jīng)過(guò)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸,丙酮酸進(jìn)行有機(jī)酸脫羧生成CO2;二是丙酮酸通過(guò)乙酰輔酶A進(jìn)入三羧酸循環(huán),“借用”草酰乙酸(生成檸檬酸)執(zhí)行有機(jī)酸脫羧,完成葡萄糖全部C原子生成CO2的代謝,而“借用”的草酰乙酸在一系列脫氫和加H2O的酶促反應(yīng)后得到“歸還”。
4)葡萄糖有氧氧化過(guò)程中的有些加H2O反應(yīng),并不參與“以H換C” 形成有機(jī)酸羧基機(jī)制,如檸檬酸經(jīng)過(guò)順烏頭酸生成異檸檬酸的加H2O和脫H2O反應(yīng),這種性質(zhì)的加H2O和脫H2O反應(yīng)只是為了底物分子的-OH和H的位置置換、分子內(nèi)部重組而進(jìn)行氧化脫羧反應(yīng);有些反應(yīng)發(fā)生的脫H2O反應(yīng),如2-磷酸甘油酸脫H2O生成磷酸烯醇式丙酮酸,并不減少葡萄糖分子的O原子和H原子數(shù)量,它們只是把葡萄糖代謝途徑“暫時(shí)”引入的O原子和H原子“清除”掉。這些加H2O和脫H2O反應(yīng)當(dāng)然也不會(huì)影響到葡萄糖徹底氧化通過(guò)呼吸鏈-氧化磷酸化生成ATP的數(shù)量。
5)三羧酸循環(huán)途徑通過(guò)“借用”草酰乙酸還有一個(gè)重要生理作用。食物來(lái)源的葡萄糖經(jīng)過(guò)有氧氧化途徑徹底氧化,其6個(gè)C原子只有2個(gè)以CO2形式釋放出來(lái)(丙酮酸氧化脫羧反應(yīng)),另外4個(gè)C原子則進(jìn)入三羧酸循環(huán)(以2個(gè)乙酰輔酶A形式)參與合成2個(gè)檸檬酸分子,最終交換至三羧酸循環(huán)結(jié)束時(shí)“歸還”的2個(gè)草酰乙酸分子上;而三羧酸循環(huán)起點(diǎn)的(參與合成2個(gè)檸檬酸分子的)機(jī)體內(nèi)的2個(gè)草酰乙酸分子上的羧基以有機(jī)酸脫羧方式生成4個(gè)CO2釋放出來(lái),表觀(guān)上體現(xiàn)為葡萄糖分子的6個(gè)C原子全部轉(zhuǎn)化為CO2。事實(shí)上,通過(guò)三羧酸循環(huán)途徑,食物來(lái)源的葡萄糖(以乙酰輔酶A形式)與機(jī)體內(nèi)的草酰乙酸進(jìn)行了C原子的交換:葡萄糖的C原子有三分之一(2/6)通過(guò)丙酮酸氧化脫羧以CO2形式釋放出來(lái),三分之二(4/6)通過(guò)三羧酸循環(huán)進(jìn)入機(jī)體內(nèi)的草酰乙酸;同時(shí),機(jī)體內(nèi)的2個(gè)草酰乙酸分子通過(guò)三羧酸循環(huán)對(duì)其C原子進(jìn)行了二分之一(4/8)的更新。該過(guò)程(或生理功能)可以通過(guò)三羧酸循環(huán)連續(xù)不斷地進(jìn)行,從而實(shí)現(xiàn)機(jī)體內(nèi)外生物分子中C原子的“更新”。認(rèn)識(shí)到三羧酸循環(huán)是葡萄糖、脂類(lèi)和蛋白質(zhì)等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)氧化供能的共同途徑,則對(duì)這種機(jī)體內(nèi)外生物分子中C原子“更新”機(jī)制的意義應(yīng)引起更大的重視。
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