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        1例有汗性外胚層發(fā)育不良患者的基因突變分析

        2014-03-22 02:39:49蔣樹娟黃丹何蓉
        關(guān)鍵詞:基因突變結(jié)構(gòu)分析

        蔣樹娟,黃丹,何蓉

        (中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院臨床遺傳科,沈陽110004)

        1例有汗性外胚層發(fā)育不良患者的基因突變分析

        蔣樹娟,黃丹,何蓉

        (中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院臨床遺傳科,沈陽110004)

        Mutation Analysisin Patientwith Hidrotic EctodermalDysplasia:ACase Report

        利用DNA測序技術(shù)對1例中國漢族有汗性外胚層發(fā)育不良患者進(jìn)行GJB6基因突變檢測,并利用生物信息學(xué)軟件對檢測到的突變進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,明確有汗性外胚層發(fā)育不良的致病原因。結(jié)果發(fā)現(xiàn),GJB6基因c.31G>A(p.G11R)突變是該有汗型外胚層發(fā)育不良患者的致病原因之一。

        有汗型外胚層發(fā)育不良;基因突變;GJB6;DNA測序;結(jié)構(gòu)分析

        有汗型外胚層發(fā)育不良(hidrotic ectodermal dysplasia,HED),又稱Clouston綜合征,人類孟德爾遺傳在線編號(hào)為129500,是一種罕見的常染色體顯性遺傳性皮膚疾病,發(fā)病率約為1/10萬。臨床主要特點(diǎn)為甲發(fā)育不良、掌跖角化、毛發(fā)稀疏或完全缺如,患者汗腺和皮脂腺功能正常,部分患者可有白內(nèi)障、斜視、骨骼改變、聽力減退、智力障礙及指(趾)畸形,臨床表現(xiàn)具有多樣性[1]。本病是由編碼連接蛋白30(connexin 30,Cx30)的GJB6基因突變所致[2]。我們利用DNA測序技術(shù)對來門診進(jìn)行遺傳咨詢的1例中國漢族有汗型外胚層發(fā)育不良患者及其父親進(jìn)行了致病基因突變分析,報(bào)道如下:

        1 材料與方法

        1.1 臨床資料

        患者男,28歲,自出生就發(fā)現(xiàn)頭發(fā)、指甲、趾甲發(fā)育不良。查體:無頭發(fā),頭皮僅見少量毫毛;眉毛、睫毛、陰毛、腋毛等體毛缺如,甲板短小,指甲、趾甲發(fā)育不良、短縮、變薄,有深的縱紋(圖1A和1B),牙齒發(fā)育正常,汗腺分泌正常,視力、聽力無異常,智力發(fā)育正常,腋窩皮膚病理示表皮基本正常,真皮散在毛囊、皮脂腺結(jié)構(gòu),汗腺豐富(圖2A)?;颊吒赣H,50歲,臨床表現(xiàn)比患者輕,頭發(fā)、眉毛及睫毛正常,陰毛、腋毛稀少,指甲、趾甲增厚呈灰黃色(圖1C和1D),右上肢及前胸可見散在紅斑,牙齒發(fā)育正常,汗腺分泌正常,視力及聽力正常,智力發(fā)育正常,腋窩皮膚病理顯示表皮基本正常,真皮內(nèi)未見毛囊、皮脂腺結(jié)構(gòu),真皮下部汗腺豐富(圖2B)。

        圖1 患者及其父親甲表現(xiàn)

        1.2 方法

        1.2.1 基因組DNA提取:經(jīng)患者及家屬知情同意,采集患者及其父親的外周血,并獲得了他們簽署的知情同意書。采用上海華舜生物技術(shù)有限公司的外周血DNA抽提試劑盒提取基因組DNA。另外以同樣的方法提取160例無親緣關(guān)系的健康對照個(gè)體基因組DNA作為對照。

        1.2.2 突變檢測:GJB6含有一個(gè)外顯子,我們參照文獻(xiàn)[3]合成引物,對GJB6整個(gè)編碼區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,產(chǎn)物長度990 bp。PCR反應(yīng)體系為25 μL,含有基因組DNA 100 ng,引物0.5 μmol/L,1×PCR緩沖液,1 μmol/L dNTPs,1.5 μmol/L MgCl2,1U Taq DNA聚合酶(大連TaKaRa公司)。PCR反應(yīng)條件:95℃變性5 min,95℃45 s,62℃45 s,72℃1 min進(jìn)行35個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min。4 μL PCR產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。PCR擴(kuò)增的目的片段純化回收后用ABI3730測序儀(美國Applied Biosystems by Life Technologies)進(jìn)行雙向測序,測序引物同前。測序結(jié)果用DNAStar 5.0和BioEdit軟件與人類基因組GJB6序列(NG_008323.1)進(jìn)行比對。

        圖2 患者及其父親右腋下皮膚病理

        1.2.3 Cx30結(jié)構(gòu)分析:從NCBI數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm. nih.gov/)下載不同種屬的Cx30序列,利用BioEdit軟件對下載的氨基酸序列進(jìn)行比對,比較Cx30突變位點(diǎn)區(qū)域的種屬差異。瑞士生物信息學(xué)研究所創(chuàng)建的蛋白質(zhì)分析專家系統(tǒng)包含了蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測的SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy.org/)數(shù)據(jù)庫,利用該網(wǎng)站的在線預(yù)測功能,以Cx26(PDB編碼:2ZW3)為模板對野生型和突變后的Cx30進(jìn)行蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測,并進(jìn)一步利用生物信息學(xué)軟件Py-MOL(http://www.pymol.org)對突變前后的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較[4]。

        2 結(jié)果

        2.1 GJB6基因突變分析

        測序結(jié)果表明,患者及其父親攜帶GJB6基因雜合錯(cuò)義突變c.31G>A(p.G11R),該突變導(dǎo)致Cx30第11位氨基酸由甘氨酸(Gly)變成精氨酸(Arg),160例無親緣關(guān)系的正常人均未見此改變(圖3)。

        2.2 Cx30結(jié)構(gòu)分析

        通過氨基酸序列比對可以看出Cx30的第11個(gè)氨基酸位置(p.G11)在各個(gè)種屬(如人、猩猩、狗、鼠、牛、雞)中高度保守(圖4A)。三級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示,突變之前甘氨酸(Gly11)可以與Cx30氨基端的組氨酸(His7)和纈氨酸(Val13)形成氫鍵,從而維持Cx30正常的三級(jí)結(jié)構(gòu);突變成精氨酸(Arg11)之后,增加的側(cè)鏈還可以與氨基端的蘇氨酸(Thr8)和第一跨膜區(qū)的蘇氨酸(Thr26)形成氫鍵(圖4B、C),這可能會(huì)影響Cx30的正常折疊,從而影響其正常的空間構(gòu)象。另外,突變?yōu)榫彼嶂驝x30氨基末端的局部區(qū)域還增加了正電荷,這可能會(huì)對Cx30正常結(jié)構(gòu)的形成產(chǎn)生影響,或?qū)π纬傻倪B接蛋白通道的通透性產(chǎn)生影響。

        圖3 GJB6基因測序圖

        3 討論

        有汗型外胚層發(fā)育不良是一種罕見的常染色體顯性遺傳性疾病,多見于法籍加拿大人。1996年Kibar等[5]利用基因連鎖分析確定了HED2的染色體定位,2000年Lamartine等[6]進(jìn)一步證實(shí)GJB6基因突變是該綜合征的致病原因。迄今為止,在HED患者中已發(fā)現(xiàn)該基因的4種突變:(1)大多數(shù)HED患者發(fā)病的原因是c.31G>A(p.G11R)突變,該突變導(dǎo)致Cx30的氨基末端引入了一個(gè)正電荷的精氨酸。Lamartine等[6]研究了來自不同地理區(qū)域(蘇格蘭、非洲、西班牙、法裔加拿大人、法國、印度、馬來群島及威爾士)的12個(gè)患病家系,發(fā)現(xiàn)除了印度、馬來群島和威爾士的患者攜帶c.263C>T突變外,幾乎所有的患者為c.31G>A突變,這一突變還在黎巴嫩和德國患者中被發(fā)現(xiàn)[7],中國也相繼在5個(gè)家系中發(fā)現(xiàn)這個(gè)突變[8~12],本研究也在先證者和其父親中檢測到c.31G>A(p.G11R)突變的存在,進(jìn)一步支持此突變是導(dǎo)致HED發(fā)病的主要原因。(2)錯(cuò)義突變c.263C>T(p.A88V)[2],該突變在Cx30的第2個(gè)跨膜區(qū)引入了1個(gè)高疏水性的氨基酸殘基。李汶等[13]也在一中國家系中發(fā)現(xiàn)此突變,并在基因診斷基礎(chǔ)上對該家系中一孕婦孕5個(gè)多月的胎兒進(jìn)行了產(chǎn)前診斷。(3)第3種突變c.110T>A(p.V37E),該突變是Smith等[14]在研究一個(gè)散發(fā)的來自蘇格蘭的病例時(shí)發(fā)現(xiàn)的,它直接導(dǎo)致了Cx30第1個(gè)跨膜區(qū)域的氨基酸的改變,引入了一個(gè)帶負(fù)電荷的谷氨酸。(4)第4種突變c.148G>A(p.D50N),該突變發(fā)生在Cx30的第一個(gè)胞外區(qū),是Baris等[15]在患有HED的北歐猶太人中發(fā)現(xiàn)的,后兩種突變尚未在中國患者中發(fā)現(xiàn)。

        圖4 Cx30氨基末端氨基酸序列比對及三級(jí)結(jié)構(gòu)分析

        GJB6基因編碼Cx30蛋白,屬于縫隙連接蛋白基因家族,與相鄰細(xì)胞膜上的半通道或稱連接子組成一個(gè)完整的縫隙連接通道,使相鄰細(xì)胞間離子、代謝物質(zhì)和小的信使分子直接轉(zhuǎn)運(yùn),對細(xì)胞增殖、分化及機(jī)體的生長發(fā)育具有意義[16]。據(jù)報(bào)道,Cx30在特定的組織優(yōu)先表達(dá),在小鼠中,Cx30在成鼠的大腦和皮膚中高度表達(dá)[17]。Fujimoto等[7]利用免疫染色的方法證明Cx30在毛囊、表皮和指甲中高度表達(dá),并證明其在表皮細(xì)胞的分化、毛囊和指甲的生長過程中起到了重要的作用,由此推測突變的Cx30可能影響這些組織的增殖和分化,從而導(dǎo)致HED的發(fā)生。連接蛋白結(jié)構(gòu)上具有相似性,每種連接蛋白都具有4個(gè)跨膜區(qū),2個(gè)胞外區(qū),3個(gè)胞內(nèi)區(qū),人類Cx30編碼261個(gè)氨基酸,與Cx26具有77%的同源性[18]。本研究在患者中檢測到的突變發(fā)生在Cx30的氨基末端,為了進(jìn)一步明確此突變的致病機(jī)制,我們對不同種屬的氨基酸序列進(jìn)行了比對,并對突變前后Cx30的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了比較,通過氨基酸序列比對可以看出Cx30的第11個(gè)氨基酸位置(p. G11)在人、猩猩、狗、鼠、牛、雞各個(gè)種屬中高度保守。甘氨酸是只含有2個(gè)碳原子的脂肪族氨基酸,當(dāng)甘氨酸被含有6個(gè)碳原子帶有正電荷的精氨酸取代后,不僅增加了側(cè)鏈的長度,還引入了能提供正電荷的氨基,三級(jí)結(jié)構(gòu)分析顯示,突變之前甘氨酸(Gly11)可以與Cx30氨基端的組氨酸(His7)和纈氨酸(Val13)形成氫鍵,從而維持Cx30正常的三級(jí)結(jié)構(gòu);突變成精氨酸(Arg11)之后,增加的側(cè)鏈還可以與氨基端的蘇氨酸(Thr8)和第一跨膜區(qū)的蘇氨酸(Thr26)形成氫鍵,這可能會(huì)影響Cx30的正常折疊,從而影響其正常的空間構(gòu)象。另外,突變?yōu)榫彼嶂驝x30氨基末端的局部區(qū)域還增加了正電荷,這可能會(huì)對Cx30正常結(jié)構(gòu)的形成產(chǎn)生影響,或?qū)π纬傻倪B接蛋白通道的通透性產(chǎn)生影響。

        有汗型外胚層發(fā)育不良的臨床表現(xiàn)具有多樣性,本研究中患者主要表現(xiàn)為甲和毛發(fā)的異常,不伴有掌跖角化?;颊吆推涓赣H的表現(xiàn)不盡相同,患者指、趾甲表現(xiàn)為甲板短小,甲發(fā)育不良、短縮、變薄,有深的縱紋,而其父親則表現(xiàn)為指、趾甲增厚、呈灰黃色;患者毛發(fā)損害較重,頭發(fā)及各種體毛均缺如,而其父親毛發(fā)損害較輕,除陰毛、腋毛稀少外頭發(fā)、眉毛及睫毛等均正常。同為c.31G>A(p.G11R)突變導(dǎo)致的HED,文獻(xiàn)[8,10,12]報(bào)道的家系中患者有典型的三大癥狀(甲發(fā)育不良、掌跖角化、毛發(fā)稀疏或完全缺如);陳楠[9]、劉寧等[11]報(bào)道的家系與本研究患者的表現(xiàn)相同,除了甲和毛發(fā)異常外,不伴有掌跖角化;除此之外此突變還可伴有杵狀指和或智力低下等[8,9]。同一突變在相同種族人群中導(dǎo)致的表型差異可能與基因突變的外顯度不同相關(guān),或與某些未知的調(diào)節(jié)機(jī)制相關(guān),也可能與環(huán)境因素相關(guān)。

        HED臨床表現(xiàn)的多樣性和個(gè)體差異對臨床診斷造成困難,利用GJB6基因突變檢測方法對HED患者進(jìn)行檢測能夠明確病因,從而更好地為患者提供遺傳咨詢。對Cx30蛋白結(jié)構(gòu)的分析能使我們更好地理解HED的致病機(jī)制。

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        (編輯 陳姜)

        R394.3

        A

        0258-4646(2014)10-0941-04

        蔣樹娟(1985-),女,博士研究生.

        何蓉,E-mail:her@sj-hospital.org

        2013-06-01

        網(wǎng)絡(luò)出版時(shí)間:

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