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        重組大腸桿菌表達(dá)水稻白葉枯病菌FtsZ蛋白

        2014-03-21 11:47:23陳洋黃運(yùn)紅李素珍龍中兒
        生物技術(shù)通報(bào) 2014年11期
        關(guān)鍵詞:葉枯病克隆質(zhì)粒

        陳洋 黃運(yùn)紅 李素珍 龍中兒

        (江西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,南昌 330022)

        重組大腸桿菌表達(dá)水稻白葉枯病菌FtsZ蛋白

        陳洋 黃運(yùn)紅 李素珍 龍中兒

        (江西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,南昌 330022)

        旨在通過(guò)現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)制備水稻白葉枯病菌FtsZ蛋白。以水稻白葉枯病菌總DNA為模板,采用巢式PCR方法擴(kuò)增獲得水稻白葉枯病菌ftsZ基因,構(gòu)建ftsZ基因的表達(dá)載體pET-22b-ftsZ,轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主E. coli BL21后,經(jīng)PCR、Nde I/ Xho I雙酶切及測(cè)序鑒定、陽(yáng)性克隆子經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),融合蛋白經(jīng)鎳柱純化后,通過(guò)SDS-PAGE和Western blotting分析鑒定。結(jié)果顯示,水稻白葉枯病菌ftsZ基因的重組表達(dá)載體構(gòu)建成功,且陽(yáng)性克隆子在IPTG的誘導(dǎo)下表達(dá)了FtsZ-6×His融合蛋白,并通過(guò)鎳柱純化獲得了電泳純的FtsZ-6×His融合蛋白。

        FtsZ蛋白 水稻白葉枯病菌 大腸桿菌 基因重組

        FtsZ蛋白是真核細(xì)胞微管蛋白的原核同系物,在細(xì)菌體內(nèi)高度保守,具有GTPase活性,并能受GTP的誘導(dǎo)發(fā)生聚合,是原核生物細(xì)胞分裂的關(guān)鍵蛋白之一[1]。由于在細(xì)胞分裂中的重要作用及其高度的保守性,F(xiàn)tsZ是抗菌藥物開(kāi)發(fā)的理想靶標(biāo)之一[2]。水稻白葉枯病是水稻白葉枯病菌(Xanthomonas oryzae)引起的水稻生產(chǎn)上的嚴(yán)重病害之一,導(dǎo)致水稻葉片枯萎,光合作用受到妨礙,稻穗充實(shí)率降低,不實(shí)粒增加,同時(shí)可造成米質(zhì)疏松脆裂,食味降低[3,4]。目前,常用手段是使用噻枯唑作為防治水稻白葉枯病的主要化學(xué)藥劑,但水稻白葉枯病菌對(duì)噻枯唑的敏感性逐漸下降,抗藥突變體已出現(xiàn)[5,6]。因此,研發(fā)經(jīng)濟(jì)、高效、無(wú)毒的抗水稻白葉枯病菌的農(nóng)用抗生素具有重要的意義。

        本研究構(gòu)建pET-22b-ftsZ重組表達(dá)載體,進(jìn)行水稻白葉枯病菌FtsZ的體外表達(dá),旨在為進(jìn)一步構(gòu)建靶向抑制FtsZ的抗生素篩選模型奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌種與質(zhì)粒 水稻白葉枯病菌(X. oryzae),購(gòu)自武漢大學(xué)中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(菌株保藏編號(hào):CCTCC AB 91123),Escherichia coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞和pMD19-T Vector克隆載體購(gòu)自大連寶生物公司,E. coli BL21感受態(tài)細(xì)胞由南昌大學(xué)惠贈(zèng),

        pET-22b(+)載體由本實(shí)驗(yàn)室于-20℃冰箱保存。

        1.1.2 培養(yǎng)基 NB液體培養(yǎng)基,LB固體培養(yǎng)基,LB液體培養(yǎng)基,SOC培養(yǎng)基。

        1.1.3 試劑 DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)、蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)、限制性?xún)?nèi)切酶Nde I、Xho I為大連寶生物公司產(chǎn)品,GoldView、咪唑?yàn)镾olarbio公司產(chǎn)品,胰蛋白胨和酵母提取物為Oxoid公司產(chǎn)品,Ezup柱式細(xì)菌基因組提取試劑盒、SanPrep柱式DNA凝膠回收試劑盒和SanPrep柱式質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒、SDS、Tris、IPTG、氨芐青霉素為生工生物工程(上海)有限公司產(chǎn)品,Protein IsoTMNi-NTA Resin和預(yù)染蛋白Marker為北京全式金產(chǎn)品,抗His標(biāo)簽鼠單克隆抗體(一抗)和HRP標(biāo)記的羊抗鼠多克隆抗體(二抗)為Sigma公司產(chǎn)品,其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。

        1.2 方法

        1.2.1 水稻白葉枯病菌總DNA的提取 采用上海生工生物工程Ezup柱式細(xì)菌基因組提取試劑盒提取,具體操作按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。

        1.2.2 ftsZ基因的擴(kuò)增 根據(jù)NCBI上X. oryzae pv. Oryzae KACC10331全基因組序列(ID:58155)及其ftsZ基因(ID:3264933),分別設(shè)計(jì)擴(kuò)增ftsZ的引物(forward1:5'-GGCGAGCAGGTAGGCGGTAAAATT-3',backward1:5'-ACAATGCAGACAGACGCTGAATCGA-3')和特異性引物(forward2:5'-GGAATTCCATATGGCACATTTCGAACTGATTG-3',backward2:5'-CCGCTCGAGGTCGGCCTGGCGGCGCAGG-3')。50 μL PCR反應(yīng)體系含TaKaRa LA Taq(5 U/μL)0.5 μL,2× GC PCR Buffer I 25 μL,dNTP Mixture(各2.5 mmol/L)8 μL,基因組DNA 1 μL,forward1(25 μmol/L)1 μL,backward1(25 μmol/L)1 μL,滅菌超純水13.5 μL。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性1 min;94℃變性1 min,57℃退火30 s,72℃延伸90 s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸 5 min。第二次PCR除更換引物,以第一次PCR產(chǎn)物為模板外,其余條件不變。擴(kuò)增后,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物。

        1.2.3 pET-22b-ftsZ重組質(zhì)粒的構(gòu)建 用上海生工SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒回收目的條帶,按pMD19-T Vector說(shuō)明書(shū)配置連接體系,并轉(zhuǎn)化入感受態(tài)細(xì)胞E. coli DH5α后,涂布于含50 μg/mL氨芐西林鈉的LB固體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)12 h后提取質(zhì)粒,通過(guò)質(zhì)粒PCR及Nde I 和Xho I 限制性?xún)?nèi)切酶雙酶切鑒定出陽(yáng)性克隆子后送上海生工測(cè)序[7]。

        用 Nde I和Xho I限制性?xún)?nèi)切酶分別處理pET-22b(+)載體和目的基因片段,將處理后的質(zhì)粒與目的基因連接,連接條件參考pMD19-T Vector說(shuō)明書(shū)。重組質(zhì)粒以同樣的方式轉(zhuǎn)入感受態(tài)E. coli BL21,以載體的氨芐抗性標(biāo)記初篩轉(zhuǎn)化子,再提取質(zhì)粒,以Nde I和Xho I限制性?xún)?nèi)切酶雙酶切及質(zhì)粒PCR鑒定,將陽(yáng)性克隆子送至上海生工測(cè)序[8]。

        1.2.4 目的基因的誘導(dǎo)表達(dá) 取1 mL培養(yǎng)過(guò)夜的E.coli BL21陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子菌懸液接種于裝有50 mL LB液體培養(yǎng)基的錐形瓶中,200 r/min、37℃培養(yǎng)3 h[9],再加IPTG母液使其終濃度為0.6 mmol/L,繼續(xù)培養(yǎng)3 h。取誘導(dǎo)菌懸液1 mL于12 000 r/min 離心30 s,棄上清,加100 μL 1% SDS重懸菌體,沸水浴5 min后,SDS-PAGE電泳分析表達(dá)結(jié)果[10]。

        1.2.5 目的蛋白的純化 取經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)的菌懸液以8 000 r/min 離心20 min,棄上清,加10倍菌體質(zhì)量的裂解液,超聲破碎(3 s工作,5 s間歇,99個(gè)循環(huán),400 W功率)后,再12 000 r/min離心30 min,取上清上鎳柱純化,最后以1倍柱體積的500 mmol/L 咪唑平衡液洗脫目的蛋白。

        1.2.6 Western blotting分析 按文獻(xiàn)[10]的方法進(jìn)行。具體操作如下:將咪唑洗脫下的蛋白溶液進(jìn)行SDS-PAGE電泳;剪一塊與膠大小相當(dāng)?shù)腜VDF膜,以甲醇浸泡60 s活化,并放入轉(zhuǎn)膜液中,取3張經(jīng)轉(zhuǎn)膜液浸泡過(guò)的大濾紙放在轉(zhuǎn)膜儀上,再依次放上PVDF膜、SDS-PAGE膠和3張經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)膜液浸泡過(guò)的略小于膠的濾紙(注意避免產(chǎn)生氣泡),蓋上轉(zhuǎn)膜儀,連接電泳儀后,67 mA恒流60 min,將目的蛋白從聚丙烯酰胺凝膠上轉(zhuǎn)至PVDF膜上,而后將PVDF膜放入裝有5%脫脂牛奶的培養(yǎng)皿中封閉60 min,10 mmol/L的PBS洗滌4次。將PVDF膜放入含10 mL(1∶5 000,V/V)His一抗的培養(yǎng)皿中,室溫條件下中速水平搖床上孵育1 h,充分反應(yīng)后,用0.01 mol/L PBS 洗滌4次,以除去未結(jié)合His一抗,后將與一抗反應(yīng)的PVDF膜放入含10 mL(1∶5 000,V/V)羊抗鼠二抗的培養(yǎng)皿中,并在室溫條件下中速的水平搖床上反應(yīng)30 min,再用0.01 mol/LPBS洗滌4次,

        以除去未結(jié)合羊抗鼠二抗體;在避光條件下,將與二抗反應(yīng)后的PVDF膜放入DAB顯色液中,反應(yīng)10 min,0.01 mol/L PBS洗滌3次,晾干,照相保存。

        2 結(jié)果

        2.1 總DNA的提取

        提取的水稻白葉枯病菌總DNA經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果(圖1)顯示,DNA條帶明顯,通過(guò)核酸分析檢測(cè)儀測(cè)得DNA濃度為81.8 μg/μL,豐度適宜,可用作PCR的模板。

        圖1 水稻白葉枯病菌總DNA

        2.2 目的基因的獲得

        分別采用巢式PCR及普通PCR技術(shù)擴(kuò)增目的基因,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果(圖2)顯示,巢式PCR產(chǎn)物中的目的基因豐度和純度更高,符合預(yù)期目的。

        圖2 ftsZ的PCR產(chǎn)物

        2.3 pMD19-ftsZ重組質(zhì)粒鑒定

        2.3.1 質(zhì)粒PCR鑒定 質(zhì)粒PCR結(jié)果(圖3)顯示,以基因組DNA及以pMD19-ftsZ重組質(zhì)粒為模板都擴(kuò)增出含有目的基因大小的條帶,說(shuō)明pMD19-ftsZ重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。

        圖3 pMD19-T-ftsZ重組質(zhì)粒的PCR鑒定圖

        2.3.2 雙酶切鑒定 用Nde I和Xho I對(duì)pMD19-ftsZ重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切后,結(jié)果(圖4)顯示,目的基因與pMD19-T Vector分離,大小符合預(yù)期。

        2.4 pET-22b-ftsZ重組質(zhì)粒鑒定

        2.4.1 質(zhì)粒PCR鑒定 pET-22b-ftsZ重組質(zhì)粒的PCR結(jié)果(圖5)與重組載體pMD19-ftsZ的質(zhì)粒PCR結(jié)果一致,說(shuō)明ftsZ基因已轉(zhuǎn)入pET載體中。

        圖5 pET-22b-ftsZ融合質(zhì)粒PCR鑒定

        2.4.2 雙酶切鑒定 用Nde I 和Xho I 對(duì)pET-22bftsZ重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切后,結(jié)果(圖6)顯示,目的基因與pET-22b(+)質(zhì)粒分離,大小符合預(yù)期。

        2.5 測(cè)序鑒定

        將測(cè)序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中X. oryzae pv. Ory-

        zae KACC10331的ftsZ基因(ID:3264933)序列比對(duì),兩者匹配度為100%。

        圖6 pET-22b-ftsZ重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定

        2.6 FtsZ蛋白的表達(dá)與純化

        根據(jù)表達(dá)載體pET-22b(+)的特點(diǎn)及重組質(zhì)粒pET-22b-ftsZ 的構(gòu)建過(guò)程可以預(yù)測(cè),E. coli BL21表達(dá)的FtsZ蛋白為一個(gè)C-末端帶有組氨酸標(biāo)簽的融合蛋白(FtsZ-6×His融合蛋白),可以用鎳柱純化。FtsZ-6×His融合蛋白的表達(dá)與純化結(jié)果(圖7)顯示,在細(xì)胞破碎上清液的電泳條帶中,目的蛋白條帶明顯,證明目的蛋白以可溶的形式存在,其分子量略大于40 kD,符合預(yù)期估算的44 kD。純化的FtsZ-6×His 融合蛋白以單條帶的形式存在(圖7泳道1),表明經(jīng)鎳柱純化的FtsZ蛋白達(dá)到電泳純。

        同時(shí),試驗(yàn)采用Western blotting分析了宿主細(xì)胞破碎后的上清液和經(jīng)鎳柱純化后的目的蛋白溶液,電泳條帶都在預(yù)期分子量大小的位點(diǎn)上顯色(圖8),結(jié)果證實(shí)了FtsZ蛋白表達(dá)成功,且表達(dá)的FtsZ蛋白為帶有組氨酸標(biāo)簽的融合蛋白。

        3 討論

        目前,有關(guān)水稻白葉枯病的研究,主要集中在水稻白葉枯病菌的致病性相關(guān)基因[12,13]、水稻白葉枯病菌的遺傳多樣性[14,15]、水稻白葉枯病菌抗性水稻的選育[16,17]以及抗水稻白葉枯病菌的藥劑[18,19]等幾個(gè)方面。噻枯唑是防治水稻白葉枯病的主要化學(xué)藥劑,但水稻白葉枯病菌對(duì)噻枯唑的敏感性逐漸下降,抗藥突變體已出現(xiàn)[3,4],尚未找到能夠替代噻枯唑的有效化學(xué)藥劑。研發(fā)抗水稻白葉枯病菌的新型抗生素對(duì)水稻白葉枯病菌的防治具有重要意義。

        新抗生素的研發(fā)策略主要有三,一是通過(guò)對(duì)已知抗生素的結(jié)構(gòu)改造、甚至全合成的手段獲得已知抗生素的結(jié)構(gòu)類(lèi)似物[20,21],甚至全新結(jié)構(gòu)的抗生素,以克服細(xì)菌的耐藥現(xiàn)象;二是不斷拓展抗生素來(lái)源,通過(guò)篩選新的微生物物種獲得新的抗生素[22,23];三是創(chuàng)新抗生素篩選模型,將傳統(tǒng)的抗生素離體篩選模型,如平板拮抗法、孢子萌發(fā)測(cè)定、杯碟法、紙片法等,發(fā)展到基于抗生素作用機(jī)理及特定靶標(biāo),尤其是全新靶標(biāo)的高通量篩選模型[24,25]等。

        圖7 FtsZ蛋白的純化

        圖8 純化FtsZ 的Western blotting分析

        FtsZ蛋白是一種出現(xiàn)在原核細(xì)胞分裂位點(diǎn)上的第一個(gè)蛋白,起到細(xì)胞骨架作用,形成的FtsZ蛋白聚合體吸引與其結(jié)合的蛋白裝配成原絲,螺旋成為Z環(huán),進(jìn)一步吸引膜結(jié)合蛋白,通過(guò)直接或間接作用形成隔膜,然后引導(dǎo)整個(gè)分裂過(guò)程。它廣泛分布于原核生物細(xì)胞內(nèi),其保守性高,已成為抗細(xì)菌抗生素篩選的理想靶標(biāo)[2,26]。本研究實(shí)現(xiàn)了水稻白葉枯病菌FtsZ蛋白的體外表達(dá),為進(jìn)一步開(kāi)發(fā)靶向抑制FtsZ蛋白生物活性、進(jìn)而抑制細(xì)胞分裂的抗水稻白葉枯病菌的抗生素奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        4 結(jié)論

        本研究以水稻白葉枯病菌總DNA為模板,采用巢式PCR方法擴(kuò)增獲得水稻白葉枯病菌ftsZ基因,構(gòu)建了ftsZ基因的表達(dá)載體pET-22b-ftsZ。表達(dá)載體

        轉(zhuǎn)化宿主E. coli BL21后,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)了FtsZ-6×His融合蛋白,并通過(guò)鎳柱純化獲得了電泳純的FtsZ-6×His融合蛋白。

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        (責(zé)任編輯 馬鑫)

        Expression of FtsZ Protein from Xanthomonas oryzae in Escherichia coli

        Chen Yang Huang Yunhong Li Suzhen Long Zhonger
        (College of Life Science,Jiangxi Normal University,Nanchang 330022)

        It was to prepare FtsZ protein using techniques of modern molecular biology. The ftsZ gene was amplified from Xanthomonas oryzae by nested PCR, and recombinant plasmid pET-22b-ftsZ was constructed and transformed to E.coli BL21. The clony fragment was identificatified by PCR screening, Nde I/Xho I digestion and DNA sequencing, the positive clones were induced by IPTG for expression;the fusion protein was purified through Ni-NTA Resin, and identified by SDS-PAGE and Western blotting. Results showed that the recombinant plasmid pET-22b-ftsZ was constructed successfully, the FtsZ-6×His fusion protein was expressed in recombined E. coli BL21 induced by IPTG, and purified through Ni-NTA Resin by electrophoretic purity.

        FtsZ protein Xanthomonas oryzae Escherichia coli Genetic recombination

        2014-04-09

        國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31160029,31360018),江西省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20122BAB204008,20132BAB204007)

        陳洋,男,碩士研究生,研究方向:微生物藥物學(xué);E-mail:845487250@qq.com

        龍中兒,男,博士,教授,研究方向:基礎(chǔ)和應(yīng)用微生物學(xué);E-mail:Longzhonger@163.com

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