韋毅支 成斌 孫桂蘭 匡中國
貴州省興義市人民醫(yī)院感染性疾病科,貴州興義562400
PCR(FQ-PCR)檢查在肺結(jié)核診斷中的臨床價(jià)值
韋毅支 成斌 孫桂蘭 匡中國
貴州省興義市人民醫(yī)院感染性疾病科,貴州興義562400
目的了解實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)熒光定量PCR(FQ-PCR)監(jiān)測在肺結(jié)核診斷中的臨床價(jià)值。方法采用前瞻性的方法用熒光定量PCR(FQ-PCR)技術(shù)對繼發(fā)性肺結(jié)核患者的痰和結(jié)核性胸膜炎患者的胸水作DNA(TB-DNA)定量監(jiān)測,同時(shí)對非肺結(jié)核患者的痰作DNA(TB-DNA)定量監(jiān)測。結(jié)果繼發(fā)型肺結(jié)核147例,痰涂片陽性率為21.09%,痰TB-DNA陽性例次率為36.73%;痰涂片抗酸染色陽性例次率為15.04%;在痰涂片TB陽性34例次中,痰菌TB-DNA陽性例次率為23.53%。在痰涂TB陰性的192例次中,TB-DNA陽性例次率為39.06%。結(jié)核性膜炎胸水檢查TB-DNA108例次,陽性例次率為12.03%;非肺結(jié)核患者112例。假陰性率為70.21%,假陽性率為9.60%,靈敏度為29.8%,特異度為90.3%。結(jié)論熒光定量PCR(FQ-PCR)TBDNA監(jiān)測結(jié)果與國內(nèi)報(bào)到不一致,其假陰性高,假陽性亦高,靈敏度低,特異度亦不高,且痰涂片抗酸桿菌陽性病人的痰TB-DNA陽性例次率亦低,對臨床診斷幫助不大,不作為疑似肺結(jié)核病人的常規(guī)檢查。
時(shí)動(dòng)態(tài)熒光定量;肺結(jié)核;靈敏度;特異度
肺結(jié)核發(fā)病率呈逐年遞增趨勢,由于抗菌藥物的不合理使用及不規(guī)則治療,使結(jié)核桿菌產(chǎn)生耐藥菌株而致多重耐藥或耐多藥結(jié)核菌產(chǎn)生,給臨床治愈肺結(jié)核帶來了極大困難。痰涂片抗酸染色查到結(jié)核抗酸桿菌和痰結(jié)核菌培養(yǎng)出結(jié)核分枝桿菌是臨床確診肺結(jié)核并與其他肺部疾病鑒別的重要依據(jù)。近年來作為直接檢測分支桿菌、種系鑒定和藥敏試驗(yàn)的許多分子學(xué)方法得到了長足發(fā)展,大大提高了結(jié)核的檢出率,其中,實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)熒光定量PCR(FQPCR)因其技術(shù)成熟具有較高的靈敏度和特異性,已逐漸應(yīng)用于臨床,為了解其在肺結(jié)核診斷中的臨床價(jià)值,對2012年3月—2013年12月之間在我院住院的肺結(jié)核病人和非肺結(jié)核病人進(jìn)行痰或胸水PCR(FQ-PCR)檢測TB-DNA結(jié)果與傳統(tǒng)的痰涂片或胸水涂片查抗酸桿菌的方法進(jìn)行比較,現(xiàn)報(bào)道如下。
1.1 一般資料
采用前瞻性的方法用熒光定量PCR(FQ-PCR)技術(shù)檢測肺結(jié)核患者238例,其中男性155例,女性83例,年齡10~82歲,診斷為繼發(fā)型肺結(jié)核147例,結(jié)核性胸膜炎91例。送檢痰標(biāo)本147例,胸水91例。非肺結(jié)核患者112例。痰標(biāo)本作結(jié)核分枝桿菌DNA (TB-DNA)定量,同時(shí)進(jìn)行痰抗酸染色檢查;胸水作結(jié)核分枝桿菌DNA(TB-DNA)定量,同時(shí)進(jìn)行胸水抗酸染色檢查。對非肺結(jié)核患者的痰液作結(jié)核分枝桿菌DNA(TB-DNA)定量作對照,以臨床診斷結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),分別計(jì)算TB-DNA、抗酸染色檢查的靈敏度、特異性和準(zhǔn)確度,對兩組結(jié)果進(jìn)行比較,以了解其在臨床診斷中的價(jià)值。
1.2 材料與試劑
檢測儀器為廣州達(dá)安DA-7600型檢測系統(tǒng)。試劑亦為廣州達(dá)安生產(chǎn)的結(jié)核分枝桿菌核酸檢驗(yàn)試劑盒(PCR—熒光法)。
1.3 檢驗(yàn)方法
1.3.1 DNA提?。?)陰性質(zhì)控品處理。提取陰性質(zhì)控品,8,000rpm離心數(shù)秒,吸50~0.5mL滅菌離心管中,加入50uL DNA提取液充分混勻,100℃恒溫處理(10±1)min;12,000rpm離心5 min,備用。
(2)痰或胸水處理。①向玻璃管中加入4倍體積的4%NaOH,搖勻,室溫放置15~30 min待液化;②取液化后標(biāo)本1.0~1.5 mL離心管,12,000rpm離心5 min;③去上清,沉淀加滅菌生理鹽水1 mL混勻,12,000 min離心5 min,如此兩次。去上清,沉淀加入50 uL DNA提取液充分混勻,100℃恒溫處理(10±1)min;12,000rpm離心5 min,備用。
1.3.2 PCR擴(kuò)增PE GeneAmp5700操作。
(1)試劑準(zhǔn)備:按比例(TB—PCR反應(yīng)液40 uL/人份+Taq酶/人份)取相應(yīng)的PCR反應(yīng)液及Taq酶,充分混勻后按43 uL/管分裝至0.2mL離心管中,備用。
(2)加樣:向準(zhǔn)備好試劑的0.2 mL離心管中,分別加入處理后的樣品(包括標(biāo)本、陰性質(zhì)控品、臨界陽性質(zhì)控品和強(qiáng)陽性質(zhì)控品)上清液2 uL,或直接加入陽性定量參考品2 uL,8,000rpm離心數(shù)秒,放入儀器樣品槽。
(3)編輯。①按對應(yīng)順序設(shè)置陰性質(zhì)控品、陽性定量參考品以及未知標(biāo)本(含臨界陽性質(zhì)控品和強(qiáng)陽性質(zhì)控品),并在name欄中設(shè)置樣品名稱。選中所有設(shè)置樣品孔,點(diǎn)擊工具欄中P鍵,選擇Prl Primerl后關(guān)閉窗口。②打開instrument窗口設(shè)置循環(huán)條件:93℃2 min,然后按93℃45s→55℃60s→10個(gè)循環(huán),再93℃30s→55℃45s→30個(gè)循環(huán)。保存文件,運(yùn)行。
(4)結(jié)果分析。①反應(yīng)結(jié)束后保存檢測數(shù)據(jù)文件。②分析條件設(shè)置:根據(jù)分析圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值、stop值以及Threshold的Valve值。使Std curve窗口下的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖達(dá)到最佳,即correlation數(shù)值介于-1.0~-0.97。在Analyze自動(dòng)分析結(jié)果。③到Tray窗口記錄未知標(biāo)本數(shù)值(C)。“C”表示樣品的濃度和含量。
1.3.3 質(zhì)量控制陰性質(zhì)控品:增長的曲線不呈S型曲線或Ct值= 30;陽性質(zhì)控品:增長曲線呈S型曲線,且強(qiáng)陽性質(zhì)控品定量參考值在1×106基因拷貝/mL~2.0×107基因拷貝/mL范圍,臨界陽性質(zhì)控品定量參考值在2×102基因拷貝/mL~2.0×104基因拷貝/mL范圍;以上要示需在同一次實(shí)驗(yàn)中同時(shí)滿足,否則本次實(shí)驗(yàn)無效,需從新進(jìn)行。
表1 238例肺結(jié)核痰及胸水兩種方法檢測結(jié)果
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
采用EXCEL 2003軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料以率表示。
繼發(fā)型肺結(jié)核147例,31例痰涂片抗酸染色找結(jié)核分枝桿菌陽性。痰涂片陽性率為21.09%,繼發(fā)型肺結(jié)核痰TB-DNA檢查例次226例次,TB-DNA陽性83例次,陽性例次率為36.73%;痰涂片TB陽性34例次,痰涂片抗酸染色陽性例次率為15.04%;在痰涂片TB陽性34例次中TB-DNA檢查陽性例次為8例次,痰菌陽性TB-DNA陽性例次率為23.53%。在痰涂TB陰性的192例次中,TB-DNA陽性例次為75例次,TB-DNA陽性例次率為39.06%。結(jié)核性膜炎胸水檢查TB-DNA108例次,陽性13例次,陰性95例次,陽性例次率為12.03%。非肺結(jié)核患者112例,查痰TB-DNA 124例次,TB-DNA陽性12例次,假陰性率為70.21%,假陽性率為9.60%。靈敏度為29.8%,特異度為90.3%。具體見表1和表2。
表2 FQ-PCR TB DNA檢測結(jié)果
痰涂片抗酸染色查到結(jié)核抗酸桿菌和痰結(jié)核菌培養(yǎng)出結(jié)核抗酸桿菌仍是確診肺結(jié)核的重要依據(jù),痰涂片抗酸染色法簡單、快速、經(jīng)濟(jì),但敏感性差,不能將結(jié)核分枝桿菌和非結(jié)核分枝桿菌區(qū)別開來,其診斷的特異性低。隨著分子生學(xué)的快速發(fā)展,熒光PCR(FQ-PCR)技術(shù)把核酸擴(kuò)增、雜交和光譜技術(shù)結(jié)合在一起,在封閉狀態(tài)下檢測,避免了擴(kuò)增產(chǎn)物污染而出現(xiàn)假陽性,利用特異性探針,實(shí)時(shí)檢測,與自動(dòng)分析一體化,實(shí)現(xiàn)了精確、特異、簡便、快速的檢測。我院肺結(jié)核147例肺結(jié)核痰涂片陽性檢出率為21.09%,痰菌熒光定量PCR法的陽性檢出例次率為36.73%,痰菌熒光定量PCR法的陽性檢出例次率明顯高于痰涂片抗酸染色陽性例次率(抗酸染色陽性例次率為15.04%),肺結(jié)核痰涂片陽性檢出率與國內(nèi)痰涂片21.0%報(bào)道值相近,但本研究的PCR法檢測陽性率低于國內(nèi)64.0%~90%的報(bào)道的報(bào)道[1-3]。
我院結(jié)核性胸膜炎胸水熒光定量PCR法的陽性檢出例次率為12.03%。明顯低于應(yīng)用PCR技術(shù)檢測胸水中的TB-DNA,敏感性為38.5%的報(bào)道,主要是出現(xiàn)假陰性所致,出現(xiàn)假陰性的原因是DNA聚合酶活力不夠,或因有酚、氯仿等物存在而使其活性受到抑制等因素影響PCR循環(huán)擴(kuò)增效率,減少特異性DNA擴(kuò)增產(chǎn)量。有學(xué)者報(bào)道約5%的標(biāo)本組中測到抑制物的存在,據(jù)認(rèn)為是DNA聚合酶的抵制物[4]。
肺結(jié)核是由結(jié)核分枝桿菌感染而引起的慢性呼吸系統(tǒng)傳染病,根據(jù)WHO統(tǒng)計(jì),目前全世界共有2000萬肺結(jié)核病人,其中95%在發(fā)展中國家,而我國排列世界第二,僅活動(dòng)性肺結(jié)核病人就有近500萬。實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)因其快速簡便,靈敏度高,特異性高等優(yōu)點(diǎn),已經(jīng)成為結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室診斷的重要輔助手段[5]。本研究肺結(jié)核患者痰菌陽性病人TB-DNA陽性例次率為23.53%。非肺結(jié)核患者出現(xiàn)6例痰熒光定量PCR法TB-DNA出現(xiàn)假陽性,假陽性例次率為9.60%,分析其原因考慮為在標(biāo)本預(yù)處理和DNA純化過程操作不當(dāng)造成的標(biāo)本污染所致的假陽性[6]。我院肺結(jié)核患者TB-DNA假陰性率為70.21%,靈敏度為29.8%,特異度為90.3%,故假陰性高,假陽性亦高,靈敏度低,特異度亦不高,且痰涂片抗酸桿菌陽性病人的痰TB-DNA陽性例次率僅為23.53%,故痰或胸水TB-DNA檢驗(yàn)結(jié)果陽性不能肯定肺結(jié)核,陰性亦不能排除肺結(jié)核,雖痰TB-DNA陽性率高于痰涂片陽性率,但臨床診斷價(jià)值不大,故痰或胸水熒光定量PCR法查TB-DNA不作為疑似肺結(jié)核病人的常規(guī)檢查。
[參與文獻(xiàn)]
[1]吳國蘭,陳曉紅,李學(xué)玲,等,4種不同支氣管肺泡灌洗液結(jié)核桿菌檢測方法在肺結(jié)核診斷中的應(yīng)用研究[J].中國臨床醫(yī)生,2013,41(3)39-41.
[2]牛海軍,張信鴿,趙長生,等.實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)在肺結(jié)核診斷中的價(jià)值[J].ATD醫(yī)藥論壇雜志,2013,34(9):132-133.
[3]孫集思,陳亦洋.PCR法檢測痰液結(jié)核桿菌對診斷價(jià)值的研究[J].中國社區(qū)醫(yī)師,2012,14(2):266.
[4]徐偉,張小潤,高林虎.PCR診斷結(jié)核性炎的臨床評價(jià)[J].中國煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志,2010,13(7):1045-1046.
[5]牛海軍,張信鴿,趙長生,等.實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)在肺結(jié)核診斷中的價(jià)值[J].醫(yī)藥論壇雜志,2013,34(9):132-133.
[6]李銳成,劉昕陽,鄒菊賢,等,3860例不同標(biāo)本結(jié)核分枝桿菌DNA檢測結(jié)果分析[J].中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,2013,23(8):1987-1989.
R521
A
1672-5654(2014)10(a)-0156-02
2014-08-05)
韋毅(1973-),男,漢族,貴州省興義市人,碩士,副主任醫(yī)師,主要從事傳染病診療工作。