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        一株纖維素酶產(chǎn)生菌SWU6菌株的篩選鑒定*

        2014-02-14 07:13:46吳晶晶王愛(ài)印
        蠶學(xué)通訊 2014年4期
        關(guān)鍵詞:蠶沙桑枝芽孢

        吳晶晶 王愛(ài)印 周 敏 陳 林 謝 潔

        (西南大學(xué)生物技術(shù)學(xué)院,重慶 400715)

        蠶桑產(chǎn)業(yè)副產(chǎn)物蠶沙及桑枝富含纖維素,但均未被有效利用[1-3]。我國(guó)僅五大蠶區(qū)的蠶沙年產(chǎn)量已超過(guò)100萬(wàn)t[4];2013年我國(guó)桑園面積超過(guò)84.7萬(wàn)hm2[5],桑樹用葉后產(chǎn)生大量廢棄桑枝。目前,大部分蠶沙被直接廢棄或不經(jīng)處理作為農(nóng)田肥料[1],而桑枝常被廢棄田間或焚燒[3,6]。蠶沙及桑枝現(xiàn)有處理方式,不僅帶來(lái)極大的環(huán)境污染,也使蘊(yùn)藏在其中以纖維素為主的生物質(zhì)能源未被有效利用。多種真菌、細(xì)菌能通過(guò)產(chǎn)生纖維素酶而在自然界纖維素的降解過(guò)程發(fā)揮作用[7-8]。富含纖維素生物質(zhì)原料的酶解條件溫和,且不帶來(lái)次生環(huán)境污染,篩選獲得纖維素酶高產(chǎn)菌株對(duì)蠶桑產(chǎn)業(yè)副產(chǎn)物的有效利用具有重要作用。

        校園富含枯枝落葉的土壤有利于纖維素酶產(chǎn)生菌的富集。在長(zhǎng)期適應(yīng)環(huán)境的過(guò)程中,土壤中存在的微生物可以通過(guò)分泌包括纖維素酶在內(nèi)的多種酶類參與環(huán)境物質(zhì)循環(huán)。本研究選擇從校園綠化林地土壤中分離纖維素酶產(chǎn)生菌,通過(guò)剛果紅培養(yǎng)基水解圈法及胞外纖維素酶測(cè)定方法篩選纖維素酶高產(chǎn)菌株,并對(duì)產(chǎn)酶菌株進(jìn)行了菌種鑒定。以期為包括蠶沙、桑枝在內(nèi)的富含纖維素生物質(zhì)原料的降解及潔凈能源的開發(fā)提供潛在生產(chǎn)菌。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 土壤樣品

        采自西南大學(xué)校園綠化地。

        1.1.2 培養(yǎng)基配方

        初篩培養(yǎng)基(羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基):CMC-Na 15g,NH4NO31g,蛋白胨1g,MgSO4·7H2O 0.5g,KH2PO41g,瓊脂20g,H2O 1 000mL,pH7.0,121℃滅菌20min后備用[9]。鑒別培養(yǎng)基(剛果紅培養(yǎng)基):KH2PO40.5g,MgSO40.25g,瓊脂18.0g,明膠2.0g,CMC-Na 2.0g,剛果紅0.20g,蒸餾水1 000mL,pH7.0[9]。液體發(fā)酵培養(yǎng)基:蛋白胨10g,酵母粉10g,CMC-Na 10g,NaCl 1.5g,KH2PO41g,MgSO4·7H2O 0.3g,pH7.0[10],蒸餾水1 000mL。

        1.2 方法

        1.2.1 纖維素酶產(chǎn)生菌的分離

        稱取1g土壤樣品加入到99mL含有玻璃珠的生理鹽水中,作為10-2稀釋度,振蕩30min混勻后做一系列10倍稀釋,將10-3、10-4、10-5稀釋液各取100μL涂布于初篩羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基,每個(gè)稀釋度2次重復(fù)。28℃培養(yǎng)48h挑取生長(zhǎng)較快的單菌落在羧甲基纖維素鈉培養(yǎng)基上純化獲得純培養(yǎng)[11]。

        1.2.2 纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選與保存

        初篩獲得的菌株用滅菌接種環(huán)點(diǎn)接至剛果紅培養(yǎng)基表面,每個(gè)菌株3個(gè)重復(fù),28℃培養(yǎng)48h,根據(jù)菌體在剛果紅培養(yǎng)基平板上形成水解圈直徑(D)與菌落直徑(d)比值的大小,初步判斷菌株纖維素酶活性,之后選取直徑比(D/d)較大且生長(zhǎng)迅速的菌株進(jìn)行下一步研究[12]。同時(shí),從平板上挑取單菌落接種至液體發(fā)酵培養(yǎng)基,160r/min震蕩培養(yǎng)24h后,取500uL菌液加入等體積30%甘油,于1.5mL離心管中混勻后保存至-80℃冰箱備用。

        1.2.3 葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制

        精確稱取100℃干燥至恒重的葡萄糖0.10g,加蒸餾水溶解并定容至1.00ml,配成1.00mg/ml的葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液。取7支帶有刻度的試管,首先按表1加入葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液,并用蒸餾水定容至總體積2mL后加入DNS試劑3mL,沸水浴反應(yīng)10min,取出冷卻后補(bǔ)加蒸餾水至總體積25ml,充分混勻,用空白管溶液調(diào)零,在540nm測(cè)定各管的吸光值。用EXCEL軟件,以葡萄糖質(zhì)量數(shù)(mg)為縱坐標(biāo),吸光值為橫坐標(biāo),繪制葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        表1 繪制葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí)加入各試管中的葡萄糖量

        1.2.4 纖維素酶活性的測(cè)定

        參照葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線,用DNS法測(cè)定產(chǎn)酶菌株發(fā)酵上清液水解CMC-Na后生成的葡萄糖量。酶促反應(yīng)體系包括用0.2MpH4.8的乙酸緩沖液配置的1%CMC-Na溶液1mL,目的菌株發(fā)酵上清液1mL(對(duì)照管加入滅活的發(fā)酵上清液),充分混勻后置于50℃酶促反應(yīng)30min,隨后迅速加入DNS試劑3mL,沸水浴10min后加入去離子水定容至25mL。用對(duì)照管調(diào)零,在540nm測(cè)定吸光值,根據(jù)葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線,以三次平行測(cè)定平均值計(jì)算還原糖生成量[13]。以每毫升發(fā)酵上清液酶促反應(yīng)30min釋放1ug葡萄糖的量為一個(gè)酶活單位(U)。本研究測(cè)定了目的菌株發(fā)酵12h,24h,48h,72h及96h菌株SWU6發(fā)酵上清液的纖維素酶活性。

        1.2.5 菌種鑒定

        1.2.5.1 菌體培養(yǎng)特征、形態(tài)觀察

        在28℃,馬鈴薯葡萄糖固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)目的菌株24~48h觀察菌落形態(tài)特征,將目的菌株接種到剛果紅培養(yǎng)基上培養(yǎng)48h后觀察菌落水解圈。將在馬鈴薯固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)24~48h的目的菌株進(jìn)行革蘭氏染色和芽孢染色。

        1.2.5.2 生理生化反應(yīng)特征測(cè)定

        菌株需氧性、運(yùn)動(dòng)性測(cè)定、過(guò)氧化氫酶試驗(yàn)、淀粉水解、明膠液化試驗(yàn)、硝酸鹽還原等試驗(yàn)均參照文獻(xiàn)進(jìn)行[14,15]。

        1.2.5.3 基于16SrDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育分析

        將目的菌株接種至PDA固體培養(yǎng)基37℃培養(yǎng)36h后,提取基因組DNA作為模板,用細(xì)菌16SrDNA基因通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物序列為27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′和1492R:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′。PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min;94℃變性30s,50℃退火45s,72℃延伸60s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸8min,擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,純化PCR產(chǎn)物送至上海生物工程股份有限公司測(cè)序。所得16SrDNA序列在 GenBank里進(jìn)行比對(duì)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST),下載同源性較高序列,利用MEGA4.0軟件,使用N-J法進(jìn)行1 000次步長(zhǎng)計(jì)算,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[16]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 纖維素酶產(chǎn)生菌的分離與篩選

        從校園綠化地土壤中初篩獲得10個(gè)能夠產(chǎn)生纖維素酶的分離株,將其接種于鑒別培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)48h后測(cè)量水解圈直徑與菌落直徑的比值,其中SWU6菌株水解圈與菌落直徑比值最大,為9.12(表2)。

        表2 纖維素酶產(chǎn)生菌水解圈直徑與菌落直徑比值

        圖1 SWU6菌株發(fā)酵不同時(shí)間發(fā)酵上清液纖維素酶活力

        2.2 纖維素酶活性的測(cè)定

        根據(jù)葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算回歸方程為:y=0.646 8x+0.044 4,R2=0.986 8,并據(jù)此測(cè)定目的菌株SWU6發(fā)酵12h,24h,48h,72h及96h上清液的纖維素酶活性分 別 為 110.37U/mL,136.24U/mL,131.93U/mL,126.55U/mL,126.98U/mL(圖1)。SWU6菌株發(fā)酵前期纖維素酶活性逐漸升高,24h左右達(dá)到峰值,隨后單位體積發(fā)酵上清液的纖維素酶活性呈下降趨勢(shì)。

        2.3 菌種鑒定

        2.3.1 菌落及菌體形態(tài)特征

        圖2 SWU6菌株在PDA培養(yǎng)基上的菌落特征

        SWU6菌株在PDA培養(yǎng)基表面形成的菌落呈乳白色、透明、濕潤(rùn)、圓形,表面光滑,中央凸起,有光澤(圖2)。其在半固體培養(yǎng)基表層擴(kuò)散生長(zhǎng),為具運(yùn)動(dòng)性的好氧菌(表3)。革蘭氏染色結(jié)果表明SWU6菌株為革蘭氏陽(yáng)性桿狀細(xì)菌(圖3,表3)。SWU6菌株經(jīng)芽孢染色后觀察,其菌體中央具有單個(gè)橢圓形綠色芽孢(圖4,表3)。

        表3 菌株SWU6的形態(tài)及培養(yǎng)特征

        圖3 SWU6菌株革蘭氏染色結(jié)果

        圖4 SWU6菌株芽孢染色結(jié)果

        2.3.2 SWU6菌株的生理生化特征

        生理生化檢測(cè)結(jié)果表明,纖維素酶產(chǎn)生菌SWU6菌株過(guò)氧化氫酶、硝酸鹽還原呈陽(yáng)性;能夠水解淀粉、液化明膠;能夠在含7%NaCl的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)(表4)。結(jié)合對(duì)菌株SWU6的形態(tài)及培養(yǎng)特征菌株觀察結(jié)果,初步判斷纖維素酶產(chǎn)生菌SWU6為芽孢桿菌屬菌株。

        表4 菌株SWU6的生理生化特征

        2.3.3 基于16SrDNA的系統(tǒng)發(fā)育分析

        以SWU 6菌株基因組DNA為模板,用16SrDNA通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到一條長(zhǎng)約1500bp的片段?;厥漳康钠嗡椭辽虾I锕こ坦煞萦邢薰緶y(cè)序,得到一條長(zhǎng)為1457bp的片段。該序列在NCBI上的Blast序列比對(duì)結(jié)果顯示,其與多株芽孢桿菌屬菌株的16SrDNA序列的相似度在98%以上,基于16SrDNA的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明SWU6菌株與登錄號(hào)為NR 116240甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillusmethylotrophicus)處于同一最小分支 (圖5)。根據(jù)SWU6菌體形態(tài)、培養(yǎng)特征及生理生化特征測(cè)定結(jié)果,并結(jié)合基于16S rDNA的系統(tǒng)發(fā)育分析,將該纖維素酶產(chǎn)生菌鑒定為甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillusmethylotrophicus)。

        圖5 SWU6菌株基于16SrDNA的系統(tǒng)發(fā)育樹

        3 討 論

        利用纖維素酶高產(chǎn)菌株對(duì)蠶沙、桑枝等富含纖維素的生物質(zhì)原料進(jìn)行處理能為開發(fā)潔凈能源提供新的選擇。本文利用鑒別培養(yǎng)基水解圈法篩選獲得纖維素酶產(chǎn)生菌SWU6菌株,并采用胞外酶活檢測(cè)方法(DNS法)測(cè)定了發(fā)酵不同時(shí)間上清液的纖維素酶活性。檢測(cè)結(jié)果表明SWU6菌株發(fā)酵24h,其纖維素酶活達(dá)到峰值。根據(jù)該菌株的形態(tài)特征、生理生化檢測(cè)結(jié)果以及基于16SrDNA的系統(tǒng)發(fā)育分析,將其鑒定為甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillusmethylotrophicus)。芽孢桿菌是自然界中降解纖維素的主要細(xì)菌,其中枯草芽孢桿菌和蠟狀芽孢桿菌常表現(xiàn)出最高的纖維素酶生產(chǎn)活性[17],而甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌產(chǎn)生纖維素酶卻鮮見(jiàn)報(bào)道。

        蠶沙、桑枝等蠶桑產(chǎn)業(yè)副產(chǎn)物的加工處理通常需要纖維素酶、木質(zhì)素降解酶類及半纖維素酶等多種酶協(xié)同完成。后續(xù)研究將在本文研究基礎(chǔ)上,優(yōu)化B.methylotrophicusSWU 6菌株產(chǎn)纖維素酶發(fā)酵條件。同時(shí),進(jìn)一步分離篩選多種酶類的高產(chǎn)菌株,構(gòu)建復(fù)合菌劑,用其處理蠶沙、桑枝等廢棄生物質(zhì)原料,以期在生產(chǎn)中提高蠶桑產(chǎn)業(yè)副產(chǎn)物加工處理的效率及質(zhì)量。

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