郭瑩瑩 陳關(guān)勇 馬世福 (黑龍江省前進(jìn)農(nóng)場畜牧科 黑龍江佳木斯 156331)
副結(jié)核病是由副結(jié)核分枝桿菌引起的一種慢性消耗性傳染病,該病對(duì)奶牛業(yè)和肉牛業(yè)發(fā)達(dá)的國家造成巨大損失。目前尚無有效的治療方法,只能及時(shí)檢出,隔離,淘汰病畜。依據(jù)IS900為副結(jié)核特有的插入序列,其拷貝數(shù)高達(dá)20這一特點(diǎn),以其副結(jié)核C-2株染色體脫氧核糖核酸(DNA)為模板,設(shè)計(jì)特異性引物,建立IS900基因的PCR擴(kuò)增。將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳,在電泳圖上,出現(xiàn)與目的基因等長的DNA帶。這種方法對(duì)于快速準(zhǔn)確的確診副結(jié)核病,具有重要的意義。
副結(jié)核分枝桿菌又稱禽分枝桿菌副結(jié)核亞種,是引起副結(jié)核病的病原。副結(jié)核分枝桿菌主要感染牛羊等反芻動(dòng)物,在原生動(dòng)物負(fù)鼠,野兔,野生貓,野豬,赤鹿,野牛等動(dòng)物體內(nèi)也可分離出該菌,甚至在食肉鳥類,靈長類動(dòng)物及人體中也發(fā)現(xiàn)其存在。被感染的動(dòng)物表現(xiàn)為頑固性腹瀉,呈間歇性或周期性,嚴(yán)重者糞便如水樣,噴射狀排出或稀粥樣,惡臭,含有蛋白凝塊,氣泡和大量粘液。隨著腹瀉癥狀的延續(xù),病畜出現(xiàn)貧血,進(jìn)行性消瘦。許多牛在發(fā)病后,高度渴感而大量飲水,下頜間隙和胸部等處出現(xiàn)不同程度的浮腫,腫脹面積大小不一。剖檢發(fā)現(xiàn),小腸末端出現(xiàn)廣泛的肉芽腫。取病料后鏡檢觀察,發(fā)現(xiàn)革蘭氏陽性的短桿菌,抗酸性染色陽性,為紅色成叢或成堆的兩端鈍圓的中小桿菌。副結(jié)核病的潛伏期長,病程緩慢,雖然年發(fā)病率僅為1%~2%,但感染率極高。
PCR技術(shù)是20世紀(jì)80年代中期發(fā)展起來,又稱聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是體外擴(kuò)增DNA的途徑之一。他主要通過選擇目的基因后,設(shè)計(jì)特異性的引物,在DNA聚合酶,脫氧核苷三磷酸(dNTP)的作用下“變性-退火-延伸”循環(huán)若干次,繼而達(dá)到在幾小時(shí)內(nèi)將目的基因擴(kuò)增到幾十萬倍甚至幾百萬倍的目的。變性,即將模板DNA加熱至93℃左右后,模板DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)打開,成為單鏈,為與引物結(jié)合做好準(zhǔn)備。退火,即模板DNA變成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合,然后DNA模板-引物結(jié)合物在DNA聚合酶的作用下以寡核苷酸為反應(yīng)原料,以靶序列為模板,按堿基互補(bǔ)配對(duì)和半保留復(fù)制原理合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。
副結(jié)核分枝桿菌有19個(gè)不同的插入序列,每個(gè)插入序列有其獨(dú)特的拷貝數(shù)。IS900一般為14~20個(gè)拷貝,其長度為1451 bp(注:bp表示堿基數(shù)量),G+C含量為66%,IS1311有7個(gè)拷貝,ISMav2有3個(gè)拷貝,f57有一個(gè)拷貝,Locus255有一個(gè)拷貝。本文將擴(kuò)增副結(jié)核的插入序列IS900基因的片段。
菌株為副結(jié)核分枝桿菌C-2株。試劑包括dNTP、Taq DNA聚合酶、DNA Marker(DL2000)、瓊脂糖、TE、溴化乙錠、溴酚藍(lán)。儀器與設(shè)備包括PCR儀、電泳槽、微波爐、微型離心機(jī)、移液器、電子天平。
PCR引物的設(shè)計(jì):以副結(jié)核特有的IS900序列(Gene Bank Accession No.為S74401)為模板設(shè)計(jì)特異性引物,P1:5'CGGCACGGCTCTTGTTGT 3';P2:5'TGGTCGTCTGCTGGGTTGA 3'。兩引物的間距為577bp。
PCR擴(kuò)增的反應(yīng)條件。在離心管中加入下列擴(kuò)增反應(yīng)液:菌體DNA模板1.5微升,上下游引物各0.5微升,Taq DNA聚合酶0.5微升,10×buffer 2.5微升,dNTP2微升,加滅菌水17.5微升,反應(yīng)總體積為25微升。瞬時(shí)離心,把管壁上的液體甩下去。將離心管放入PCR儀中。98℃預(yù)變性8分鐘后,按下列溫度進(jìn)行30個(gè)循環(huán):99℃變性1分鐘,55℃復(fù)性1分鐘,72℃延伸1分鐘。
用電子天平稱取1克瓊脂糖倒入錐形瓶中,加入100毫升TE,配成濃度為1%的瓊脂糖凝膠溶液。再向溶液中加入6~7微升的溴化乙錠。稍涼后,倒入瓊脂糖凝膠板中,待其凝固后備用。瓊脂糖凝膠電泳檢測,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行濃度為1%的瓊脂糖凝膠電泳,電泳結(jié)束后,將瓊脂板放在紫外投影儀下觀察,記錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
在電泳圖譜上可見兩條很亮的DNA帶位于約分子質(zhì)量標(biāo)記中500~750bp之間,由于設(shè)計(jì)的兩個(gè)引物之間的間距為577bp,由此可以看出已經(jīng)成功的擴(kuò)增出IS900的基因片段。(見圖1)
本次實(shí)驗(yàn)通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),再結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳檢測,成功的擴(kuò)增了副結(jié)核分枝桿菌的插入序列—IS900基因片段,得到與目的基因大小相同的DNA帶,使體外擴(kuò)增特異性基因成為可能。這可以做為副結(jié)核病診斷的現(xiàn)實(shí)基礎(chǔ),為快速準(zhǔn)確的檢出副結(jié)核病畜及未發(fā)病的帶菌畜提供依據(jù)。隨著牛奶檢測要求和進(jìn)口牛數(shù)日益增加,副結(jié)核病的檢測日益受到人們的關(guān)注。最新研究的PCR-限制性內(nèi)切酶技術(shù)和熒光PCR的出現(xiàn),對(duì)于清除和預(yù)防副結(jié)核病,保護(hù)人們的身體健康,促進(jìn)畜牧業(yè)快速健康發(fā)展,具有重要的指導(dǎo)意義。
圖1 PCR產(chǎn)物的電泳圖