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        番茄抗病基因TY-3的SCAR標(biāo)記及檢測(cè)

        2014-01-28 06:30:40張子君劉文奇李海濤馬小青鄒慶道
        園藝與種苗 2014年4期

        張子君,劉文奇,李海濤,馬小青,鄒慶道

        (遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,遼寧沈陽110161)

        番茄(Solanum lycopersicum)是世界上栽培最為廣泛的蔬菜之一。番茄黃化曲葉病毒?。═YLCVD)是近年來我國(guó)番茄生產(chǎn)上嚴(yán)重發(fā)生的一種新病害,該病害在山東、河北等番茄主栽區(qū)發(fā)病嚴(yán)重,有著從南往北逐步擴(kuò)展的趨勢(shì),海城等遼南地區(qū)已有該病出現(xiàn)。該病害由煙粉虱傳播、由雙生病毒侵染引起的病毒病,受害植株葉片黃化、矮縮、坐果率降低,給番茄生產(chǎn)造成嚴(yán)重的損失。除農(nóng)藥防治外,應(yīng)用抗病品種是防治該病害經(jīng)濟(jì)有效的防控措施[1-4]。

        隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷深入研究,獲得與抗病基因緊密連鎖的分子標(biāo)記對(duì)促進(jìn)番茄抗病育種有著重要意義。SCAR標(biāo)記方便、快捷、可靠,可以快速檢測(cè)大量個(gè)體,結(jié)果穩(wěn)定性好,重復(fù)性高,與傳統(tǒng)育種相比,這種方法幾乎不受外界環(huán)境的影響,尤其是針對(duì)一些遺傳力較低,易受環(huán)境影響的性狀,其可靠性大大提高[9]。Ji等[5]利用F2分離群體進(jìn)行遺傳分析和QTL定位后,將抗病基因Ty-3定位到6號(hào)染色體的長(zhǎng)臂上,距離Ty-1基因位點(diǎn)約20 cM,該位點(diǎn)的顯性與加性比率是0.47,且是主效基因。與Ty-3連鎖的SCAR標(biāo)記P6-25是可用來鑒定等位基因Ty-3、Ty-3a和Ty-3b的共顯性標(biāo)記,且目前正被廣泛研究[6]。

        該研究為獲得與抗病基因Ty-3緊密連鎖的分子標(biāo)記,建立抗病基因Ty-3快速、準(zhǔn)確的分子檢測(cè)體系,從分子水平為番茄黃化曲葉病毒病抗病育種提供技術(shù)指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        3份抗病純和材料(Ty-3/Ty-3)來自臺(tái)灣亞蔬中心,編號(hào)為 CK1、CK2、CK3;3 份感病材料(ty-3/ty-3)來自遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜所番茄課題組,編號(hào)為 CK4、CK5、CK6;抗病 F1代雜交種 7 份,均來自上海種都公司,編號(hào)為29(迪達(dá)),30(迪瑞),31(TY4220),32(迪維斯),33(齊達(dá)利),34(TY4430),35(TY1415),這7份雜交種在2011年上海召開的“全國(guó)抗黃化曲葉病毒病品種展示會(huì)”上均表現(xiàn)抗??;F2代單株28份,編號(hào)為100-127,為經(jīng)濟(jì)性狀優(yōu)良的33號(hào)雜交種齊達(dá)利自交分離后代。

        1.2 方法

        1.2.1 特異引物的設(shè)計(jì)??共』騎y-3SCAR標(biāo)記的引物序列,參照付蓉蓉等[7]設(shè)計(jì),交由上海生物工程技術(shù)公司合成(表1)。

        1.2.2 DNA提取。DNA提取采用改良CTAB法,具體方法及步驟參照邱夷鵬等[8]。

        表1 引物序列

        1.2.3 PCR擴(kuò)增體系及反應(yīng)程序。

        該引物的PCR反應(yīng)總體積為25 μL,模板50 ng,dNTP 1.25 μL,引物(10 U)各 1.0 μL,Taq DNA 聚合酶 (2.5 U/μL)0.5 μL,buffer 2.0 μL,Mg2+1.2 μL。PCR的反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5 min,94℃變性1 min,55℃退火 1 min,72℃延伸 1 min,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10 min。電壓5 V/cm下PCR產(chǎn)物利用2.0%瓊脂糖凝膠電泳30 min,Goodview染色,Bio-RAD凝膠成像系統(tǒng)拍照。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 獲得與Ty-3基因緊密連鎖的SCAR標(biāo)記

        從圖1可以看出,利用特異引物對(duì)6份抗、感材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增,3份抗病純合材料CK1、CK2和CK3擴(kuò)增獲得600 bp片段,3份感病材料CK4、CK5和CK6獲得320 bp片段。

        圖1 6份材料的PCR擴(kuò)增圖譜

        2.2 7份抗病雜交種Ty-3基因的檢測(cè)

        如圖2所示,在7份F1代雜交種中,編號(hào)為30、31、32、33的4份雜交種經(jīng)PCR擴(kuò)增獲得600 bp和320 bp兩條帶,說明這4份材料為含有Ty-3抗病基因的雜交種,編號(hào)為29、34、35的3份材料經(jīng)PCR擴(kuò)增后獲得320 bp大小的片段。

        圖2 7份抗病番茄F1的PCR擴(kuò)增圖譜

        2.3 28份F2代單株抗病基因Ty-3的檢測(cè)

        從圖 3 可以看出,101、103、104、106、111、112、113、114、115、116、120、121、125 的 13 個(gè)單株 PCR擴(kuò)增后產(chǎn)生600 bp和320 bp兩條帶,說明這13份材料為抗Ty-3的雜合體(Ty-3/ty-3);編號(hào)為107、110、119、123、124、126、127 的 7 個(gè)單株 PCR 擴(kuò)增后只產(chǎn)生600 bp的一條帶,說明這7個(gè)單株為含有抗病基因的的純合體(Ty-3/Ty-3);編號(hào)為 100、102、105、108、109、117、118、122 的 8 個(gè)單株 PCR 擴(kuò)增后只產(chǎn)生320 bp的1條帶,說明這8份材料不含抗病基因Ty-3,為感病純合材料(ty-3/ty-3)。

        圖3 番茄F2材料的PCR擴(kuò)增圖譜

        3 結(jié)論與討論

        試驗(yàn)利用1個(gè)已獲得的與番茄黃化曲葉病毒病抗病基因Ty-3緊密連鎖的SCAR標(biāo)記,有效檢測(cè)到番茄黃化曲葉病毒病抗病基因Ty-3。利用該標(biāo)記對(duì)7個(gè)田間表現(xiàn)抗病的番茄F1代雜交種進(jìn)行檢測(cè),其中4個(gè)檢測(cè)結(jié)果與田間的抗病表現(xiàn)相一致,另外3個(gè)雜交種沒有檢測(cè)到抗病基因Ty-3,但這3份雜交種在2011年上海種都舉辦的抗TY品種展示會(huì)上均表現(xiàn)抗病,由此推測(cè)這3份雜交種可能不含Ty-3抗病基因,但有可能含Ty-1、Ty-2或其他抗病基因,因此在田間也表現(xiàn)出抗病性;利用標(biāo)記對(duì)來自抗病雜交種齊達(dá)利的28個(gè)F2代分離單株進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明,有20個(gè)單株含有抗病基因Ty-3,抗病純合體7株,抗病雜合體13株,8個(gè)單株不含抗病基因,由于試驗(yàn)檢測(cè)的F2單株數(shù)量較少,所得的數(shù)據(jù)只能為抗病材料的選擇提供依據(jù),尚不能對(duì)抗病基因的遺傳規(guī)律進(jìn)行深入分析,還需進(jìn)一步對(duì)所獲得結(jié)果進(jìn)行抗性鑒定。

        分子標(biāo)記輔助選擇育種(MAS)現(xiàn)已成為作物育種的有力輔助工具,不僅提高了性狀選擇的準(zhǔn)確性,同時(shí)也加快了常規(guī)育種的進(jìn)程,分子育種技術(shù)與常規(guī)育種技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,是今后育種的方向。

        [1]岳寧,丁銘,董家紅,羅延青,等.中國(guó)番茄黃化曲葉病毒在云南的發(fā)生分布及其遺傳多樣性 [J].云南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2008,30(S1):57-62.

        [2]趙統(tǒng)敏,余文貴,周益軍,等.江蘇省番茄黃化曲葉病毒?。═YLCD)的發(fā)生與診斷初報(bào)[J].江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2007,23(6):654-655.

        [3]王冬生,匡開源,袁永達(dá),等.番茄黃化曲葉病毒在上海發(fā)生流行的初步觀察[J].上海蔬菜,2007,(4):61-62.

        [4]吳永漢,張純胄,許方程,等.溫州地區(qū)番茄曲葉病毒病發(fā)生與防治[J].中國(guó)蔬菜,2007,(5):57-58.

        [5]Ji Y,Schuster D J,Scott J W.Ty-3,a begomovirus resistance locus near the Tomato yellow leaf curl virus resistance locus Ty-1 on chromosome 6 oftomato [J].MolecularBreeding,2007,20:271-284.

        [6]Maxwell D P,Martin C,Salus M S,et al.Breeding tomatoes for resistance to tomato-infecting begomoviruses[EB/OL].International Plant Virology Laboratory University of Wisconsin-Madison.2006,http://www.plantpath.wisc.edu/Geminivirus Resistant Tomatoes/index.htm.

        [7]付蓉蓉,劉楊,陳火英.番茄黃化曲葉病的Ty-1和Ty-3抗性基因的 PCR 鑒定[J].分子植物育種(網(wǎng)絡(luò)版),2011,(9):1647-1652.

        [8]邱夷鵬,李海濤,張子君,等.番茄抗晚疫病基因Ph-3的RAPD標(biāo)記[J].園藝學(xué)報(bào),2009,36(8):1227-1232.

        [9]鄒慶道,吳媛媛,李海濤,等.番茄抗晚疫病Ph-3基因RAPD標(biāo)記的克隆與 CAPS 標(biāo)記的建立[J].植物病理學(xué)報(bào),2010,41(3):314-318.

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