胡 源,曾文先
(西北農(nóng)林科技大學(xué)動物科技學(xué)院,陜西楊凌712100)
長鏈非編碼RNA(lncRNA)具有在細(xì)胞特異性表達(dá)的特性[1],參與形成細(xì)胞核中的亞結(jié)構(gòu)并調(diào)節(jié)多種細(xì)胞活動和生物學(xué)過程,包括調(diào)控基因表達(dá)和蛋白質(zhì)的活性、干細(xì)胞自我更新與分化等[2]。但關(guān)于lncRNA 在小鼠精子發(fā)生過程中的作用及其調(diào)節(jié)機(jī)理目前尚未見報道。lncRNA NEAT1作為核心組分參與形成旁斑(paraspeckle)結(jié)構(gòu)[3]。敲除NEAT1影響DBHS(Drosophila melanogaster behavior,human splicing)蛋白在細(xì)胞中的定位,從而影響旁斑結(jié)構(gòu)的形成[4-5]。而旁斑可以阻滯成熟mRNA 的出核與后續(xù)翻譯[6],參與調(diào)控細(xì)胞的分化和生長[7,8]。在細(xì)胞分化的過程中NEAT1的表達(dá)升高[9-11]。本研究旨在探索NEAT1對維持小鼠精子發(fā)生所起的作用,為雄性動物的精子發(fā)生過程和生殖研究提供試驗(yàn)基礎(chǔ)。
試驗(yàn)動物:C57BL/6J小鼠,昆明種小白鼠。細(xì)胞系:GC-1精原細(xì)胞系,293T 細(xì)胞系。病毒包裝系統(tǒng):CD513B-U6表達(dá)質(zhì)粒及包裝質(zhì)粒(pVSV-G、pGag-Pol、pRsv-rev)。
PCR 擴(kuò)增儀;凝膠電泳成像分析系統(tǒng)(Biorad);二氧化碳培養(yǎng)箱(Thermo);超凈工作臺(蘇州);臺式低溫離心機(jī)(Sigma);超純水制備系統(tǒng)(Mill-Q);立式壓力蒸汽滅菌鍋;熒光倒置顯微鏡(Olympus),二氧化碳培養(yǎng)箱(Thermo)。
RNA 提取:使用Trizol法提取細(xì)胞總RNA;反轉(zhuǎn)錄PCR:使用TaKaRa 公司PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser試劑盒;PCR:使用TaKaRa公司Ex Taq?試劑盒,引物信息如下:
上游引物:TACATGGGGGCAGTGTCCTA
下游引物:ACCACAGAAGAGGAAGCACG
包括設(shè)計shRNA;CD513B-U6質(zhì)粒雙酶切:使用BamHI和EcoRI限制性內(nèi)切酶進(jìn)行雙酶切;構(gòu)建CD513B-U6-shRNA 載體及測序。
表1 NEAT1的shRNA 序列信息Table 1 The shRNA sequence information of NEAT1
使用 CD513B-U6-shRNA 載體、pVSV-G1、pGag-Pol、pRev ug包裝載體,轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞系進(jìn)行病毒包裝;采用倍比稀釋法測定慢病毒的滴度,用熒光顯微鏡觀察每孔中發(fā)出綠色熒光的細(xì)胞的數(shù)量,對最后兩個有綠色熒光細(xì)胞的孔進(jìn)行細(xì)胞計數(shù),數(shù)目依次記為X,Y,公式為:
滴度(TU/mL)=(X+Y×10)×1000/2X 孔的病毒溶液的含量(μL)。
使用多聚甲醛固定小鼠的睪丸,石蠟包埋切片后進(jìn)行 H.&E.染色。依據(jù)Kanatsu-Shinohara等[12]采用的方法,當(dāng)生殖細(xì)胞在曲細(xì)精管的管基底膜呈圓周狀分布,并且生殖細(xì)胞有兩層或者兩層以上時,判定該曲細(xì)精管有精子發(fā)生;曲細(xì)精管內(nèi)生殖細(xì)胞沒有達(dá)到兩層的,則判定為無精子發(fā)生。精子發(fā)生比例:有精子發(fā)生精細(xì)管占總體曲細(xì)精管的比例。每個處理組設(shè)置三個重復(fù),每個重復(fù)觀察平均約50個曲細(xì)精管。
提取C57BL/6J小鼠的睪丸組織和GC-1細(xì)胞的RNA,反轉(zhuǎn)錄PCR 后用cDNA 模板進(jìn)行PCR 檢測NEAT1的表達(dá)分布,結(jié)果表明NEAT1 在成年小鼠睪丸以及GC-1細(xì)胞系中均表達(dá)(圖1)。
圖1 NEAT1在睪丸組織和GC-1細(xì)胞中的表達(dá)A.提取的RNA 電泳圖片;B.RT-PCR 結(jié)果;1.GC-1細(xì)胞系;2.睪丸組織Fig.1 NEAT1expression in testicular tissue and GC-1cellsA.Bxtracted RNA electrophoresis;B.RT-PCR resuts;1.GC-1cells;2.Testicular tissues
將干擾shRNA 和雙酶切后的CD513B-U6 載體連接構(gòu)建干擾載體。質(zhì)粒送公司測序,將結(jié)果和設(shè)計的shRNA 進(jìn)行比對,連接成功且未出現(xiàn)堿基突變(圖2),表明NEAT1干擾載體構(gòu)建成功。
利用SBI的第三代慢病毒包裝系統(tǒng),將四個質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞系包裝病毒,16h后進(jìn)行觀察并換成病毒包裝緩沖液,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有約70%的293T 細(xì)胞能夠自發(fā)熒光,表明轉(zhuǎn)染成功(圖3)。48h后收毒,并進(jìn)行滴度測定,測定結(jié)果為1.72×107TU/mL。
圖2 測序結(jié)果分析Fig.2 The analysis of sequencing results
將構(gòu)建的慢病毒感染GC-1 細(xì)胞,熒光顯微鏡下觀察發(fā)現(xiàn)病毒感染細(xì)胞效果良好(圖4)。
提取GC-1細(xì)胞RNA,反轉(zhuǎn)錄PCR 后實(shí)時定量PCR 檢測NEAT1的表達(dá),結(jié)果顯示包裝的干擾慢病毒能夠?qū)EAT1轉(zhuǎn)錄本水平下調(diào)69%,干擾效果良好(圖4)。
圖3 四質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T 細(xì)胞,16h后熒光圖左側(cè)為NEAT1-shRNA 組,右側(cè)為NC組Fig.3 The Fluorescent images at 16hours after the transfection of four plasmids into 293Tcell lineLeft means CD513B-U6-NEAT1-shRNA,Right means CD513B-U6-NC
圖4 慢病毒感染GC-1細(xì)胞效果A,B,C分別為明場圖,熒光圖和疊加圖Fig.4 The efficiency of lentivirus infect GC-1cellsA,B,C are BFI,fluorography and overlay chart
圖5 在GC-1細(xì)胞中檢測RNAi干擾效果Fig.5 RNA interference of NEAT1in GC-1cells
統(tǒng)計并對比干擾組,NC 組和空白組(未注射病毒)小鼠睪丸指數(shù),結(jié)果顯示干擾病毒注射組睪丸指數(shù)大于另外兩組,表明睪丸的重量有輕微增加的趨勢,但統(tǒng)計結(jié)果不顯著(P=0.11)(圖6)。
將干擾和NC組病毒通過睪丸輸出管注射到曲細(xì)精管中,35d后固定干擾病毒注射組和NC 組小鼠睪丸組織并進(jìn)行H.&E.染色。對比不同組的H&E 染色圖發(fā)現(xiàn)注射NEAT1 干擾病毒后小鼠(相對于NC 組)睪丸中有精子發(fā)生的曲細(xì)精管減少,部分管腔內(nèi)生殖細(xì)胞變少,表明干擾NEAT1可能影響小鼠精子發(fā)生(圖7)。
圖6 干擾組、空白組和對照組的睪丸指數(shù)Fig.6 The ratio of testicles in interfering group,blank group and control group
使用Kanatsu-shinohara的標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)計干擾組和NC組的小鼠睪丸內(nèi)有精子發(fā)生的曲細(xì)精管比例,結(jié)果顯示NC 組有精子發(fā)生的曲細(xì)精管的比例為97%,而NEAT1干擾組有精子發(fā)生的曲細(xì)精管比例為86%,明顯減少(P<0.05)(圖8),小鼠睪丸曲細(xì)精管內(nèi)精子發(fā)生過程受到影響。上述結(jié)果表明NEAT1參與維持小鼠睪丸的精子發(fā)生。
圖7 H&E染色圖A,a為NC組,B,b為干擾組Fig.7 The images of H&E stainingA,a are NC group,B,b are interference group
圖8 干擾組與對照組精子發(fā)生比例Fig.8 The spermatogenesis ratio comparison between two groups
在2010年,Archa等[13]研究結(jié)果表明NEAT1在人類胚胎干細(xì)胞中表達(dá),且能作為核心組分形成旁斑。在人類疾病研究方面,NEAT1 參與了一些重大疾病的發(fā)病過程,如卵巢癌,銀屑病等[14-15]。而NEAT1在小鼠精子發(fā)生過程中的作用對于目前尚未見報道。本試驗(yàn)則驗(yàn)證了小鼠NEAT1在睪丸和GC-1細(xì)胞系中表達(dá)并采用干擾的方法探究在小鼠中NEAT1對精子發(fā)生的影響。
試驗(yàn)結(jié)果表明,NEAT1參與調(diào)節(jié)小鼠精子發(fā)生這一重要生物學(xué)過程。在本試驗(yàn)中,干擾NEAT1后試驗(yàn)組小鼠的睪丸指數(shù)輕微增加(相對與注射NC病毒和空白對照睪丸的重量),但統(tǒng)計數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)差異并不顯著,不足以證明NEAT1對小鼠的睪丸重量有明顯的影響。2011年,Nakagawa等[16]研究發(fā)現(xiàn),NEAT1敲除小鼠可以在試驗(yàn)條件下生存且具有繁殖能力,除了無法形成旁斑結(jié)構(gòu)外,并未表現(xiàn)出明顯的表型。這與本研究得到的試驗(yàn)結(jié)果基本一致。小鼠精子發(fā)生數(shù)據(jù)統(tǒng)計結(jié)果表明,注射了干擾NEAT1病毒組(與NC病毒注射組相比)的精子發(fā)生比例有下調(diào),其分別是86%和97%。該結(jié)果暗示了NEAT1有可能具有維持小鼠睪丸中精子發(fā)生的作用,NEAT1 對小鼠的生殖過程有一定的影響,但小鼠仍然具有生殖能力。
目前,在人的胚胎干細(xì)胞里的研究結(jié)果顯示,NEAT1發(fā)揮功能的機(jī)制主要是依賴RNA-蛋白復(fù)合體結(jié)構(gòu)。研究表明,在未分化的人源胚胎干細(xì)胞中,由于缺乏NEAT1 和paraspeckles,一些對于干細(xì)胞多能性維持具有重要作用的mRNA,例如Lin28可以在轉(zhuǎn)錄之后快速出核,翻譯產(chǎn)生干細(xì)胞維持所需要的LIN28蛋白質(zhì),在分化過程中,其通過旁斑這一亞核結(jié)構(gòu)將Lin28 mRNA 滯留在亞核區(qū),阻礙其翻譯表達(dá),表明NEAT1具有調(diào)控人源胚胎干細(xì)胞的命運(yùn)決定的重要作用[6]。而在小鼠的精子發(fā)生過程中,包括SSCs的自我更新與分化和后期的精原細(xì)胞分裂等過程都涉及到很多相關(guān)基因的時序性表達(dá)。比如在SSCs自我更新過程中起重要作用的Lin28(維持干細(xì)胞特性)、PLZF(SSCs中重要干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子,不受GDNF 通路調(diào)控)、Bcl6b(維持SSCs自我更新周期,干擾Bcl6b會促進(jìn)小鼠SSCs的凋亡,敲除則會造成Bcl6b小鼠其曲細(xì)精管內(nèi)不同階段生殖細(xì)胞的比例出現(xiàn)異常)、Etv5(敲除Etv5會導(dǎo)致SSCs功能受損,曲細(xì)精管內(nèi)只含有支持細(xì)胞,雄性不育)等[17-19]。這些重要基因是否會被NEAT1構(gòu)成的旁斑結(jié)構(gòu)進(jìn)行表達(dá)水平調(diào)控或者通過旁斑對mRNA 的滯留效應(yīng)進(jìn)行時序調(diào)控,有待進(jìn)一步試驗(yàn)驗(yàn)證。另外,Nakagawa在2012年的研究表明,另一個lncRNA-Malat1可能調(diào)節(jié)NEAT1的表達(dá),當(dāng)在特定細(xì)胞系中敲除Malat1 后,NEAT1表達(dá)明顯下調(diào),表明Malat1 可以調(diào)控NEAT1 表達(dá),影響旁斑形成[20]。本試驗(yàn)結(jié)果顯示NEAT1可能具有維持小鼠精子發(fā)生的作用,從而一定程度參與小鼠的生殖過程,NEAT1 在該過程發(fā)揮功能的具體機(jī)制是什么以及Malat1 是否參與了調(diào)控NEAT1的表達(dá)進(jìn)而影響后續(xù)的旁斑形成和功能發(fā)揮則需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。
NEAT1在小鼠睪丸組織、GC-1細(xì)胞系中均表達(dá);構(gòu)建的NEAT1干擾病毒可使NEAT1表達(dá)水平下調(diào)69%,表明該慢病毒效果良好;干擾NEAT1后小鼠睪丸里的精子發(fā)生受到一定影響,表明NEAT1參與維持雄性小鼠的精子發(fā)生。
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