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        大菱鲆神經(jīng)肽Y基因克隆及其在工廠化養(yǎng)殖饑餓-投喂策略中的表達(dá)特征分析

        2014-01-02 08:10:50姜志強(qiáng)穆小生雷霽霖
        中國(guó)工程科學(xué) 2014年9期
        關(guān)鍵詞:大菱鲆攝食饑餓

        韓 建,劉 濱,姜志強(qiáng),穆小生,雷霽霖

        (1.大連海洋大學(xué)農(nóng)業(yè)部北方海水增養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遼寧大連116023;2.中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所,農(nóng)業(yè)部海洋漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,青島市海水魚(yú)類種子工程與生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東青島266071;3.中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所計(jì)劃生育生殖生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100101)

        1 前言

        神經(jīng)肽Y(NPY)屬于胰多肽家族,此家族還包括多肽YY(PYY)、胰多肽(PP)和多肽Y(PY)等,NPY與由G蛋白偶聯(lián)受體構(gòu)成的Y受體家族密切相關(guān)[1]。并且NPY與生物體的生長(zhǎng)發(fā)育以及生活行為有很大的關(guān)系[2],尤其是動(dòng)物的攝食,是一種內(nèi)源性的促進(jìn)攝食的非常保守的神經(jīng)遞質(zhì)。NPY第一次在豬的腦部分離提取出來(lái)[3],之后相繼在哺乳動(dòng)物、鳥(niǎo)類、兩棲動(dòng)物和魚(yú)中被鑒定檢測(cè)出來(lái)[4,5]。

        NPY在心血管功能、生殖及應(yīng)激和免疫反應(yīng)中都發(fā)揮著生理效應(yīng)[6~12],其最重要的作用是促進(jìn)攝食,這不僅在哺乳動(dòng)物、鳥(niǎo)類和兩棲動(dòng)物中得到證明[13~15],在魚(yú)類中同樣得到了證明[16],由此可推斷出NPY能夠反映各物種的攝食情況。

        起初,NPY在硬骨魚(yú)類中的功能僅是作為促垂體激素釋放激素來(lái)研究的[17~20],直至1998年,開(kāi)始進(jìn)行NPY在魚(yú)類攝食和能量平衡上的研究。Silverstein等[21]對(duì)大鱗大麻哈魚(yú)和銀大麻哈魚(yú)進(jìn)行2~3周的饑餓實(shí)驗(yàn)后導(dǎo)致其下丘腦中的NPY相似信使核糖核酸(mRNA)的表達(dá)量升高。López-Pati?o等[22]對(duì)金魚(yú)進(jìn)行了研究,證明NPY可促進(jìn)金魚(yú)的攝食。之后,該觀點(diǎn)相繼在斑點(diǎn)叉尾鮰[16]、美洲擬鰈[23]和大西洋鱈[24]等中得到證明。

        大菱鲆屬于鲆科、菱鲆屬,是原產(chǎn)于歐洲北海、波羅的海和地中海沿岸的一種名貴比目魚(yú),1992年由黃海水產(chǎn)研究所引進(jìn)我國(guó)[25]。大菱鲆耐低溫、生長(zhǎng)速度快、肉質(zhì)鮮美,是重要的工廠化養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)魚(yú)類之一。魚(yú)類攝食一直是研究的重點(diǎn)內(nèi)容,大菱鲆作為典型工廠化養(yǎng)殖魚(yú)類,適宜的投喂不僅節(jié)約餌料,而且可避免過(guò)量的餌料對(duì)水質(zhì)的污染。而NPY作為控制攝食和能量平衡的相關(guān)基因,對(duì)其結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征的研究很有必要。

        本文以大菱鲆作為研究對(duì)象,克隆出NPY的全長(zhǎng)互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA)序列并對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析;同時(shí)進(jìn)行NPY的組織特異性表達(dá),并對(duì)大菱鲆進(jìn)行饑餓和再投喂實(shí)驗(yàn),從而研究NPY在攝食調(diào)控中的表達(dá)情況。本文為進(jìn)一步研究NPY基因和大菱鲆攝食的關(guān)系奠定了基礎(chǔ),同時(shí)為進(jìn)一步闡明魚(yú)類攝食調(diào)控的分子機(jī)理提供了理論依據(jù),并且建立了一個(gè)可用來(lái)研究大菱鲆攝食的分子方法,以此為基礎(chǔ)在分子水平上研究魚(yú)類最適于攝食的環(huán)境因素并研發(fā)可促進(jìn)大菱鲆攝食和生長(zhǎng)的相關(guān)技術(shù)與產(chǎn)品。

        2 材料與方法

        2.1 材料與試劑

        本文所用的健康大菱鲆取自煙臺(tái)天源水產(chǎn)有限公司??寺〖敖M織表達(dá)所用大菱鲆的平均體重為(553.35±5.15)g,平均體長(zhǎng)為(32.50±1.31)cm。活體帶回實(shí)驗(yàn)室后,采用乙醚對(duì)其進(jìn)行麻醉,置于冰上進(jìn)行解剖,迅速分離腦組織各部分和肝臟等各組織,用RNAstore樣本保存液保存后,在4℃的冰箱中保存12 h后,放入80℃的冰箱中長(zhǎng)期保存。

        饑餓和再投喂實(shí)驗(yàn)所用的大菱鲆為60日齡稚魚(yú),平均體重為(5.5±0.02) g,平均體長(zhǎng)為(2.6±0.5)cm,養(yǎng)殖水溫為15℃,正常光照,每天7點(diǎn)和17點(diǎn)各投喂1次微顆粒飼料,實(shí)驗(yàn)前馴養(yǎng)2周。

        2.2 方法

        2.2.1 克隆策略和引物設(shè)計(jì)

        利用美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)Gen-Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的大西洋鱈魚(yú)、點(diǎn)帶石斑魚(yú)、牙鲆和美洲擬鰈等魚(yú)類的NPY序列保守區(qū)域,并結(jié)合Primer Primer 5.0,設(shè)計(jì)出擴(kuò)增核心片段的一對(duì)引物F1和R1。并根據(jù)所得的核心片段設(shè)計(jì)5′末端快速擴(kuò)增技術(shù)(RACE)所用的特異引物GSP1和進(jìn)行巢式聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的引物NGSP1;用同樣的方法設(shè)計(jì)出3′RACE所用的特異引物GSP2和巢式引物NGSP2。

        將所得到全長(zhǎng)cDNA序列設(shè)計(jì)用于實(shí)時(shí)定量PCR的特異引物(qF1和qR1),并根據(jù)大菱鲆內(nèi)參基因β-actin的基因序列設(shè)計(jì)引物(βf1和βr1),用于表達(dá)分析。所有引物由鉑尚生物技術(shù)(上海)有限公司合成。以上引物具體序列見(jiàn)表1。

        2.2.2 大菱鲆NPY基因的克隆

        使用TRIzol Reagent(Ambion)從大菱鲆下丘腦中提取出總RNA。使用超微量紫外分光光度計(jì)測(cè)定RNA的濃度,并用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳確定總RNA的完整性,利用Thermo Scientific Revert Aid First Strand cDNA Synthesis Kit(Thermo)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。使用引物F1和R1進(jìn)行中間片段的擴(kuò)增,PCR程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5m in;94℃變性30 s,56℃退火45 s,72℃延伸45 s,運(yùn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸10m in。使用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(天根生化科技(北京)有限公司)對(duì)擴(kuò)增所得片段進(jìn)行分離純化,送到北京六合華大基因科技股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。使用SMARTer?RACE cDNA Amplification Kit(Clonetech)進(jìn) 行5′RACE和3′RACE,反應(yīng)程序如下:94 ℃變性30 s,68℃退火30 s,進(jìn)行25個(gè)循環(huán);72℃延伸3m in。進(jìn)行巢式PCR后獲得目的片段,經(jīng)膠回收后,克隆到pMD? 18-TVector(TaKaRa)上,進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證后,對(duì)陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序。

        2.2.3 序列分析

        使用DNAman 6.0對(duì)開(kāi)放閱讀框(ORF)進(jìn)行分析并推導(dǎo)出氨基酸序列,利用Prot Param工具(http://www.expasy.org/tools/protparam.htm l)預(yù) 測(cè)NPY蛋白的基本理化性質(zhì),運(yùn)用SignalP 4.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對(duì)所推導(dǎo)出的氨基酸序列進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè)。運(yùn)用ClustalX 1.83對(duì)不同物種的NPY氨基酸序列進(jìn)行同源性比對(duì),并用DNAstar中的MegA lign計(jì)算同源性,用MEGA4.0通過(guò)最大似然法構(gòu)建NPY的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

        2.2.4 大菱鲆NPY基因組織特異性表達(dá)

        從大菱鲆的前腦、中腦、后腦、延髓、下丘腦、垂體、腮、心臟、肝臟、頭腎、腎、脾臟、肌肉、胃、腸及膽囊等16個(gè)組織,使用TaKaRa MiniBEST Universal RNA Extraction Kit提取總RNA,使用用于實(shí)時(shí)定量PCR的反轉(zhuǎn)錄試劑盒TaKaRa Prime ScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)物稀釋25倍后參照TaKaRa SYBR?Premix Ex TaqTMⅡ(TliRNaseH Plus)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR。使用兩步法,反應(yīng)程序如下:95℃預(yù)變性30 s;95 ℃ 變性5 s,62 ℃退火26 s,40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束進(jìn)行溶解曲線分析以確定對(duì)目的片段是否進(jìn)行特異性擴(kuò)增。對(duì)每個(gè)樣品設(shè)置3個(gè)平行實(shí)驗(yàn),NPY基因和內(nèi)參基因β-actin使用相同的模版量。

        2.2.5 大菱鲆的饑餓和再投喂實(shí)驗(yàn)

        實(shí)驗(yàn)用魚(yú)進(jìn)行2周的馴養(yǎng)后,最后一次投喂后進(jìn)行饑餓實(shí)驗(yàn),共分為兩組,第一組在喂食中(0 h)及喂食后2 h、4 h、6 h、8 h、12 h、18 h、24 h、48 h和72 h進(jìn)行取樣,饑餓72 h后再次投喂并且于投喂中(0 h)和喂食后2 h進(jìn)行取樣;第二組在饑餓48 h后進(jìn)行再投喂,并同樣在投喂中(0 h)和喂食后2 h進(jìn)行取樣(在喂食中取樣時(shí)允許在喂食15m in后再取樣)。取大菱鲆的下丘腦,實(shí)時(shí)定量PCR的方法如第2.2.4節(jié)所述。

        2.2.6 數(shù)據(jù)分析

        所得的Ct值通過(guò)2-ΔΔCt法計(jì)算NPY基因的相對(duì)表達(dá)量,并且使用SPSS18.0的one-way ANOVA進(jìn)行差異顯著性分析(P<0.05為差異顯著,P>0.05為差異不顯著)。

        3 結(jié)果

        3.1 大菱鲆NPY基因全長(zhǎng)cDNA序列分析及結(jié)構(gòu)特征

        采用PCR技術(shù)獲得NPY基因的核心片段,再通過(guò)RACE方法得到兩端序列,進(jìn)行拼接后得到的全長(zhǎng)cDNA序列經(jīng)tblastx分析確認(rèn)為大菱鲆NPY序列。大菱鲆NPY基因cDNA全長(zhǎng)729 bp,含有70 bp 的5′非翻譯區(qū)(5′-UTR)和359 bp的3′非翻譯區(qū)(3′-UTR),其中3′-UTR含有加尾信號(hào)ATTAAA及PolyA尾。ORF長(zhǎng)300 bp,編碼含99個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),N端28個(gè)氨基酸為信號(hào)肽,信號(hào)肽后是由36個(gè)氨基酸組成的NPY成熟肽,后接蛋白質(zhì)水解加工位點(diǎn)Gly-Lys-Arg,剩余32個(gè)氨基酸為NPY的羧基末端旁側(cè)肽段(CPON)(見(jiàn)圖1)。NPY蛋白的分子質(zhì)量為11 301.9 Da,等電點(diǎn)p I為5.26,分子式為C516H799N131O150S2,脂肪系數(shù)(AI)為101.52,總平均輸水指數(shù)(GRAVY)為-0.284,不穩(wěn)定系數(shù)(Ⅱ)為79.96,推斷此NPY蛋白不穩(wěn)定。NPY蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)由48.48%的α-螺旋、45.45%的無(wú)規(guī)卷曲、3.03%的延伸鏈和3.03%的β轉(zhuǎn)角組成。

        使用DNAstar軟件對(duì)大菱鲆NPY蛋白與其他物種的同源性進(jìn)行比較,結(jié)果顯示大菱鲆NPY與其他物種的同源性在53.9%~98%,其中與牙鲆的同源性最高,為98%。使用ClustalX 18.3對(duì)序列進(jìn)行比對(duì),比對(duì)結(jié)果如圖2所示。進(jìn)一步使用MEGA4.0構(gòu)建NPY蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(見(jiàn)圖3),根據(jù)所得進(jìn)化樹(shù)分析可知,大菱鲆NPY蛋白與鰈形目(牙鲆和美洲擬鰈)和鱸形目(歐洲狼鱸和黑棘鯛)等一同位于硬骨海水魚(yú)類這一簇上,并且大菱鲆NPY蛋白與鰈形目(牙鲆和美洲擬鰈)基本處于同一分支;鯉形目(錦鯉和斑馬魚(yú))和鯰形目(斑點(diǎn)叉尾鮰)處在硬骨淡水魚(yú)類這一簇上;軟骨魚(yú)類(石紋電鰩)、兩棲類(非洲爪蟾)、鳥(niǎo)類(紅原雞)及哺乳動(dòng)物聚合為另一簇。大菱鲆NPY的分子進(jìn)化地位與其生物學(xué)分類地位基本一致。

        圖1 大菱鲆NPY的全長(zhǎng)cDNA序列及所推導(dǎo)出的氨基酸序列Fig.1 The full-length cDNA sequence and deduced amino acid sequence of NPY from turbot

        圖2 大菱鲆與其他物種NPY蛋白的氨基酸序列對(duì)比Fig.2 Contrast of the amino acid sequences of NPY from turbot and other species

        圖3 根據(jù)NPY氨基酸序列使用最大似然法構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.3 Maximum-likelihood phylogenetic tree constructed with the amino acid sequences of NPY

        3.2 大菱鲆NPY基因的組織表達(dá)

        采用實(shí)時(shí)定量PCR對(duì)大菱鲆16個(gè)組織中NPY的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示,大菱鲆NPY基因分布廣泛,在16個(gè)組織中均有不同程度的表達(dá)(見(jiàn)圖4),在腦中的表達(dá)量相對(duì)較高,其中在下丘腦中的表達(dá)量最高,并與其他15個(gè)組織的表達(dá)差異顯著(P<0.05),在肌肉、胃、腸及膽囊中的表達(dá)量相對(duì)較低,而在垂體、腮、心臟、肝臟、腎臟及脾臟中的表達(dá)量最低。

        圖4 大菱鲆NPY基因的m RNA在不同組織中的表達(dá)Fig.4 Expression of NPYm RNA in different tissues of turbot

        3.3 饑餓與投喂策略對(duì)大菱鲆NPY基因的表達(dá)影響

        在饑餓實(shí)驗(yàn)及再投喂實(shí)驗(yàn)中,以饑餓實(shí)驗(yàn)開(kāi)始時(shí)(0 h)NPY基因的mRNA表達(dá)量作為對(duì)照,設(shè)為1。饑餓實(shí)驗(yàn)的結(jié)果顯示,在0~4 h內(nèi),隨著實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行,mRNA的表達(dá)量升高;在4~8 h內(nèi),隨著饑餓時(shí)間的延長(zhǎng),mRNA表達(dá)量呈現(xiàn)下降的趨勢(shì);在8~48 h內(nèi),NPY基因的mRNA表達(dá)量又再次顯著升高,并且遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)饑餓實(shí)驗(yàn)前期(0~8 h)的mRNA表達(dá)量;然而在48~72 h內(nèi),NPY基因的mRNA表達(dá)量再次顯著下降(見(jiàn)圖5)。

        圖5 饑餓對(duì)大菱鲆NPY基因的m RNA表達(dá)量的影響Fig.5 Effects of starvation on the expression of NPYm RNA in turbot

        再投喂實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,饑餓48 h及72 h后再投喂,NPY基因的mRNA表達(dá)量相對(duì)于正常投喂組顯著升高,但同時(shí)又于投喂2 h后呈現(xiàn)顯著的下降趨勢(shì)(見(jiàn)圖6)。

        圖6 饑餓后再投喂對(duì)大菱鲆NPY基因的m RNA表達(dá)量的影響Fig.6 Effects of refeeding after starvation on the expression of NPYm RNA in turbot

        4 討論

        本文通過(guò)使用逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)和RACE技術(shù),從大菱鲆的腦組織中得到全長(zhǎng)為729 bp的NPY cDNA序列,編碼99個(gè)氨基酸組成的NPY蛋白,其中36個(gè)氨基酸組成NPY的成熟肽,這與其他物種的結(jié)果一致[3]。大菱鲆NPY的氨基酸序列跟其他魚(yú)類相比,表現(xiàn)出較高的同源性,特別是與同屬于鲆鰈魚(yú)類的牙鲆及美洲擬鰈的同源性高達(dá)97%~98%。并且根據(jù)所得進(jìn)化樹(shù)分析可知,大菱鲆NPY蛋白位于硬骨海水魚(yú)類這一分支上,與鰈形目(牙鲆和美洲擬鰈)和鱸形目(歐洲狼鱸和黑棘鯛)等的關(guān)系較近;與鯉形目(鯉魚(yú)和斑馬魚(yú))、鯰形目(斑點(diǎn)叉尾鮰)、軟骨魚(yú)類(石紋電鰩)、兩棲類(非洲爪蟾)、鳥(niǎo)類(紅原雞)及哺乳動(dòng)物的關(guān)系較遠(yuǎn),這與同源性分析基本一致。在大菱鲆NPY成熟肽中不含半胱氨酸(C),只在信號(hào)肽第21個(gè)氨基酸位點(diǎn)上有一個(gè)半胱氨酸(C),并且在序列比對(duì)結(jié)果中,信號(hào)肽的第21個(gè)氨基酸位點(diǎn)上都為半胱氨酸(C)。比對(duì)結(jié)果顯示,NPY成熟肽的36個(gè)氨基酸中有26個(gè)高度保守,這說(shuō)明NPY是一種進(jìn)化十分保守的神經(jīng)肽。

        通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),NPY基因在大菱鲆神經(jīng)組織特別是下丘腦中的表達(dá)量較高,這與其他物種的研究結(jié)果一致。下丘腦外側(cè)區(qū)(LHA)為攝食中樞(也稱饑餓中樞),起著決定發(fā)動(dòng)攝食活動(dòng)的作用;腹內(nèi)側(cè)核(VMH)為飽食中樞,起著決定停止進(jìn)食活動(dòng)的作用[26]。NPY基因mRNA在下丘腦中的表達(dá)最高,說(shuō)明NPY可能與攝食和能量平衡的調(diào)節(jié)有關(guān)。NPY在神經(jīng)組織中的表達(dá)量較高,在外周組織中也有表達(dá),但不同物種間外周組織中NPY的表達(dá)量略有不同。在大菱鲆外周組織中NPY在肌肉、胃、腸及膽囊中的表達(dá)量相對(duì)于在垂體、腮、心臟、肝臟、腎臟及脾臟中的表達(dá)量較高,由此可推斷在大菱鲆中NPY可能是腦-腸肽,這在其他魚(yú)類中已得到相應(yīng)的證明[24,27~29]。在腎臟中也檢測(cè)到了NPY的存在,由此可得出NPY有可能與大菱鲆的滲透調(diào)節(jié)有關(guān)。大菱鲆NPY基因在消化系統(tǒng)(胃和腸)中的表達(dá)是除中樞系統(tǒng)(腦部等)外表達(dá)量最高的,這與其他物種的研究結(jié)果相一致[6]。

        饑餓實(shí)驗(yàn)中,隨著饑餓的進(jìn)行,NPY的表達(dá)量顯著變化(P<0.05),呈現(xiàn)先升高再降低,再顯著升高并維持一段高水平表達(dá)后,再次下降的趨勢(shì),說(shuō)明NPY跟大菱鲆的攝食相關(guān),并且饑餓只能暫時(shí)提高NPY的表達(dá)量;在再投喂實(shí)驗(yàn)中,饑餓后再投喂會(huì)使NPY的表達(dá)量升高,并且饑餓時(shí)間越長(zhǎng),再投喂后NPY的表達(dá)水平越高,但是再投喂2 h后表達(dá)量還會(huì)再次下降至相似的水平,這都預(yù)示著NPY對(duì)攝食的調(diào)控可能是一種短期的調(diào)控機(jī)制。大菱鲆饑餓12 h后,NPY基因的表達(dá)水平開(kāi)始顯著上升;而金魚(yú)饑餓72 h后,NPY基因的表達(dá)量才開(kāi)始顯著升高;鯰魚(yú)則需要至少三周的時(shí)間,NPY基因的表達(dá)水平才會(huì)出現(xiàn)變化[16,21],這說(shuō)明可能不同魚(yú)類的耐饑餓程度及NPY的對(duì)攝食調(diào)節(jié)的強(qiáng)度不同。攝食0 h后和攝食2 h后的NPY的表達(dá)量會(huì)發(fā)生顯著變化,這說(shuō)明可能NPY不參與攝食后的消化過(guò)程,只是起到了刺激食欲的作用。NPY基因?qū)︷囸I的生理效應(yīng)與其他攝食刺激因子相一致,如Orexin[30]、AgRP[31]和ghrelin[32],與其他攝食抑制因子的生理效應(yīng)相反,例如 CART[24,33]和 POMC[34,35]。

        這些結(jié)果表明,NPY參與大菱鲆的攝食調(diào)控,并且可能起到促進(jìn)攝食的作用。

        5 結(jié)語(yǔ)

        本文首次克隆了大菱鲆的NPY基因并對(duì)其結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征進(jìn)行了初步研究。大菱鲆NPY基因在神經(jīng)組織中的表達(dá)水平較高,并且在下丘腦中有最大表達(dá)量,這與其他脊椎動(dòng)物的實(shí)驗(yàn)結(jié)果相一致,但NPY在不同物種的外周組織中的表達(dá)量有所變化。在饑餓和再投喂實(shí)驗(yàn)中,初步得出大菱鲆NPY是一種促進(jìn)攝食的食欲刺激因子,與其他物種的研究結(jié)果相一致。但是,NPY促進(jìn)攝食的相關(guān)分子機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。

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