摘要:研究合成了茶尺蠖核型多角體病毒(Ectropis oblique nuclear polyhedrosis virus,EcobNPV)的地高辛標(biāo)記DNA探針,采用斑點雜交檢測茶園幾種核型多角體病毒。結(jié)果表明,以含EcobNPV克隆片段的大腸桿菌菌液為樣品時,斑點雜交檢測靈敏度為80 CFU/μL。以感染病毒致死的茶尺蠖幼蟲為試材,提取病毒基因組DNA,采用斑點雜交法檢測均得到強(qiáng)的雜交信號。斑點雜交檢測可有效區(qū)分茶園中幾種核型多角體病毒,表明地高辛標(biāo)記DNA探針的特異性好。
關(guān)鍵詞:茶尺蠖核型多角體病毒(Ectropis oblique nuclear polyhedrosis virus,EcobNPV);地高辛標(biāo)記DNA探針;斑點雜交;檢測
中圖分類號:Q93-331;S476+.1 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2013)23-5894-04
茶尺蠖(Ectropis obliqua Prout)屬鱗翅目尺蠖蛾科害蟲,我國各茶區(qū)均有發(fā)生。以幼蟲食葉為害,嚴(yán)重影響茶葉的產(chǎn)量,且易導(dǎo)致茶樹早衰、耐寒力變差[1]。茶尺蠖核型多角體病毒(Ectropis oblique
nuclear polyhedrosis virus,EcobNPV)于1977年在我國首次發(fā)現(xiàn)[2],屬桿狀病毒科,核型多角體病毒屬。EcobNPV是茶尺蠖的重要致病微生物,它通過幼蟲取食后侵入蟲體并迅速增殖,使其感染發(fā)病而死亡,并且對茶尺蠖幼蟲感染力強(qiáng),致死率高,對人、畜及天敵昆蟲安全[3-7],尤其是其可通過感病幼蟲的排泄物或尸體等進(jìn)行水平擴(kuò)散,通過產(chǎn)卵進(jìn)行垂直傳遞[8],對茶尺蠖危害具有良好的持續(xù)控制效果。我國較早開展了EcobNPV的生物學(xué)及應(yīng)用基礎(chǔ)研究,現(xiàn)在該病毒制劑已獲批農(nóng)藥登記許可,廣泛應(yīng)用于各種類型茶園。
目前,EcobNPV主要使用常規(guī)PCR技術(shù)進(jìn)行定性檢測,該方法存在操作過程易污染、單次檢測樣本少且假陽性高等缺點,而核酸斑點雜交技術(shù)因具有靈敏度高、結(jié)果觀察直觀和在單位膜上可完成多個樣品的同時檢測等優(yōu)點,尤其是非放射性標(biāo)記的發(fā)展,使該技術(shù)在病毒和類病毒的研究和檢測中得到廣泛應(yīng)用[9]。同時核酸斑點雜交技術(shù)還可反映病毒株間在基因水平上親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近或異同。
為監(jiān)測茶尺蠖核型多角體病毒在茶園的流行動態(tài),并比較其與某些昆蟲桿狀病毒的同源性,本研究以EcobNPV為試驗材料,探索了該病毒的核酸斑點雜交檢測技術(shù)。
1 材料與方法
1.1 試驗材料
EcobNPV湖北分離株由湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹茶葉研究所茶植保課題組提供。EcobNPV安徽分離株由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所提供。茶毛蟲、茶刺蛾、茶小卷葉蛾、感染EcobNPV的茶尺蠖均為2011年在本所茶園收集。
1.2 試驗試劑
dNTP購自Promega公司;Taq DNA聚合酶購自Takara公司;帶正電的尼龍膜為Amersham Pharmacia Biotech公司產(chǎn)品;探針標(biāo)記試劑盒和雜交檢測試劑盒為New England Biolabs公司產(chǎn)品。
1.3 核酸雜交
1.3.1 病毒提純 采用常規(guī)方法[10,11]進(jìn)行病毒提純。在供試的茶毛蟲、茶刺蛾、茶小卷葉蛾、感染EcobNPV的茶尺蠖中加入PBS 緩沖液充分研磨后,4層紗布過濾,濾液4 ℃條件下500 r/min 離心5 min棄沉淀,上清液3 500 r/min離心30 min。用適量緩沖液繼續(xù)懸浮沉淀,3 500 r/min 離心30 min。差速離心反復(fù)進(jìn)行多次,直至多角體懸液呈乳白色狀。
1.3.2 基因組DNA的提取 取適量純化的多角體懸液加入等體積的新配制的堿裂解液(0.1 mol/L Na2CO3,0.05 mol/L NaCl),37 ℃水浴30~60 min;加100 mg/mL SDS至終濃度為10 mg/mL,加蛋白酶K至終濃度為200 μg/mL,37 ℃水浴1 h;加入等體積水飽和酚∶氯仿(體積比25∶24),振蕩混勻,4 ℃條件下12 000 r/min離心10 min;取上清液加入等體積的氯仿,振蕩混勻,4 ℃ 12 000 r/min離心15 min,重復(fù)此步驟1次;取上清液加入0.1倍體積的3 mol/L 醋酸鈉(pH 5.4)和2.5倍體積無水乙醇,-20 ℃沉淀20 min 后12 000 r/min離心15 min,棄上清液,用70%乙醇洗滌2次,于超凈臺上吹干,用適量水或TE溶解,4 ℃保存?zhèn)溆肹12-14]。
1.3.3 目的片段PCR擴(kuò)增 根據(jù)EcobNPV基因組序列(NC_008586.1)設(shè)計了1對特異性引物,由上海生工生物技術(shù)服務(wù)有限公司合成。引物序列為10F:5′-ATGATACTCGTTACAGTTACAACCC-3′和10R:5′-TTAATACGCAGGTCCTGAATAC-3′。PCR反應(yīng)采用25 μL體系:模板DNA 1 μL,10×buffer 2.5 μL,dNTPs 0.5 μL,正反引物各0.5 μL,Tag酶0.25 μL,加滅菌雙蒸水至25 μL。擴(kuò)增程序為:95 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性30 s,52 ℃ 退火45 s,72 ℃延伸90 s,循環(huán)30次;最后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。最后,用瓊脂糖凝膠DNA試劑盒純化回收擴(kuò)增片段,測定濃度。
1.3.4 探針標(biāo)記 將回收的PCR片段合成探針,按試劑盒(DIG-High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I)標(biāo)明的方法,在Klenow大片段介導(dǎo)下合成地高辛標(biāo)記的DNA探針,標(biāo)記探針置于-20 ℃保存。
1.3.5 Dot-blot雜交 取基因組DNA,在經(jīng)2×SSC浸泡5 min后晾干的帶正電荷的尼龍膜上點樣,每樣約1.0 μL,室溫下晾干。加樣后的尼龍膜用蛋白酶K(100 μg/mL)在37 ℃處理30 min,2×SSC洗滌2次后用變性液(0.5 mol/L NaOH+1.5 mol/L NaCl)65 ℃孵育30 min,再用中和液(0.5 mol/L Tris-HCl+1.5 mol/L NaOH,pH 7.5)室溫下洗5 min,10×SSC洗滌1次,置于UVC500 UV型紫外交聯(lián)儀中固定3 min。將膜置于雜交管中(預(yù)雜交液1 mL/cm2)68 ℃預(yù)雜交6 h。取地高辛標(biāo)記的核酸探針煮沸5 min,冰上迅速冷卻5 min,加入到預(yù)雜交液中,68 ℃雜交12 h。雜交結(jié)束后,將膜取出,用含0.1%SDS的2×SSC室溫下洗滌5 min,重復(fù)1次,然后用含0.1%SDS的0.5×SSC于68 ℃洗膜15 min,重復(fù)1次,最后進(jìn)行雜交結(jié)果的檢測。
1.3.6 結(jié)果檢測 按0.1 mL/cm2的量將膜放入洗液中,室溫下適當(dāng)振蕩5 min,排干洗液。加入100 mL封閉液室溫孵育30 min,然后加入20 mL 抗體溶液室溫孵育30 min,再去除溶液。按1 cm2膜0.5 mL的量加入洗液,室溫洗膜15 min,輕微搖動,去除溶液,重復(fù)1次。加20 mL檢測溶液平衡2~5 min,排干封閉液,加入20 mL底物顯色液,置于黑暗處顯色,最后加入雙蒸水終止反應(yīng),觀察結(jié)果。
2 結(jié)果與分析
2.1 茶尺蠖核型多角體病毒基因組DNA電泳結(jié)果
收集在室內(nèi)感染病毒致死的茶尺蠖幼蟲蟲尸,研磨后差速離心,采用常規(guī)方法提取病毒基因組DNA,經(jīng)瓊脂糖電泳后顯示的條帶明亮、清晰,表明提取的茶尺蠖核型多角體病毒基因組DNA結(jié)果理想(圖1)。
2.2 目的片段擴(kuò)增結(jié)果
取PCR產(chǎn)物2 μL于1%瓊脂糖電泳進(jìn)行檢測,結(jié)果在約700 bp處有DNA片段,與預(yù)計大小一致(圖2)。將該擴(kuò)增片段回收連接到載體pMD18-T上,然后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中得到重組質(zhì)粒,經(jīng)PCR鑒定,片段大小為700 bp,與預(yù)期結(jié)果相符(圖3)。進(jìn)一步測序分析也與預(yù)期序列相符。
將PCR產(chǎn)物回收,取1 μL稀釋100倍使用分光光度計測定DNA濃度為137 ng/μL,且OD260 nm/ OD280 nm接近2,表明核酸較純,可直接用于探針標(biāo)記。
2.3 地高辛標(biāo)記探針的效價及靈敏度檢測
標(biāo)記探針用0.1 mol/L NaOH以10倍梯度進(jìn)行稀釋,然后取1 μL稀釋溶液在雜交膜上點樣,采用檢測試劑盒進(jìn)行檢測,根據(jù)催化底物發(fā)光后在X膠片上產(chǎn)生的信號強(qiáng)度,以試劑盒中提供的地高辛標(biāo)記物作參照,判斷所標(biāo)記探針的活性。結(jié)果表明,當(dāng)探針稀釋至1×106時仍產(chǎn)生可見雜交信號,表明所得標(biāo)記探針具有較強(qiáng)的活性。當(dāng)用NBT/BCIP為底物通過化學(xué)顯色判斷結(jié)果時,其靈敏度較化學(xué)發(fā)光檢測法低1個數(shù)量級。
以含病毒基因片段的大腸桿菌(Escherichia coli)陽性克隆菌液為樣品,經(jīng)倍比稀釋后取2 μL在雜交膜上點樣,以測定斑點雜交檢測的靈敏度。結(jié)果顯示,當(dāng)EcobNPV陽性克隆菌液稀釋至1 280倍時,仍可產(chǎn)生可見的雜交信號(圖4),其檢測靈敏度相當(dāng)于80 CFU/μL。
2.4 斑點雜交檢測茶園幾種核型多角體病毒的特異性
經(jīng)病毒飼養(yǎng)的茶尺蠖幼蟲蟲尸在緩沖液中研磨后差速離心,提取基因組DNA,在雜交膜上點樣,每樣約1.0 μL,以相同處理健康茶尺蠖幼蟲基因組DNA為陰性對照。雜交檢測結(jié)果表明,所有經(jīng)病毒飼養(yǎng)的樣品均產(chǎn)生較強(qiáng)的雜交信號,而陰性對照基本無雜交信號。
用所標(biāo)記的EcobNPV探針對供試的茶毛蟲、茶刺蛾、茶尺蠖核型多角體病毒和茶小卷葉蛾顆粒體病毒進(jìn)行斑點雜交法檢測。結(jié)果表明(圖5),除茶尺蠖核型多角體病毒(湖北分離株、安徽分離株)外,其他病毒均未產(chǎn)生雜交信號,而陰性對照也沒有雜交信號產(chǎn)生,表明所標(biāo)記探針檢測EcobNPV具有很好的特異性。
3 討論
在利用昆蟲病毒防治茶園害蟲的過程中,病毒檢測技術(shù)的靈敏度和可操作性是影響生物防治效果的重要制約因子。已報道的用于昆蟲病毒檢測的方法主要有ELISA和PCR[15],但蟲體在初感染病毒后由于病毒含量較低,使用常規(guī)的ELISA靈敏度不夠,而使檢測結(jié)果呈現(xiàn)陰性。此外,PCR用于病毒檢測時需對多個樣品分別操作,不適合大批量樣品的同時檢測。本研究采用地高辛標(biāo)記的DNA探針,通過斑點雜交,并結(jié)合化學(xué)發(fā)光顯影,能有效檢測茶園中各種核型多角體病毒,其特異性強(qiáng),靈敏度較ELISA更高,在單位膜上可同時檢測大量樣品,且所制備的探針溶液可多次重復(fù)使用。因此,該技術(shù)應(yīng)用于茶園茶尺蠖種群帶毒狀況和病毒材料的篩選更具優(yōu)勢。
利用病毒防治茶尺蠖已成為目前茶園生物防治的一個亮點,具有廣闊的應(yīng)用前景。病毒檢測是茶園生物防治和有機(jī)茶生產(chǎn)過程中的一個重要環(huán)節(jié)。因此,EcobNPV核酸斑點雜交檢測技術(shù)的建立有利于了解茶園中病毒的發(fā)生與分布情況,也為有機(jī)茶園的推廣提供了技術(shù)手段。
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