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        RNA 結(jié)合蛋白HuR 對NF-κB 抑制因子α轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制的初步研究*

        2013-12-23 04:08:04于文燕馬小娟孫宏衛(wèi)買買提祖農(nóng)買蘇爾馬瑞斌劉玉新
        中國病理生理雜志 2013年4期
        關(guān)鍵詞:螢光報告基因脂質(zhì)體

        于文燕, 馬小娟, 孫宏衛(wèi), 買買提祖農(nóng)·買蘇爾, 馬瑞斌, 柯 穎, 劉玉新, 馬 琪

        (新疆醫(yī)科大學(xué)1病理生理學(xué)教研室,6機能中心,新疆 烏魯木齊830000;2南方醫(yī)科大學(xué)病理生理學(xué)教研室,廣東 廣州510515;武警新疆總隊醫(yī)院3普外科,4神經(jīng)外科,新疆 烏魯木齊830000;5寧波大學(xué)醫(yī)學(xué)院組織學(xué)教研室,浙江 寧波315000)

        RNA 結(jié)合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)是近年來發(fā)現(xiàn)的具有多種生物學(xué)作用的分子家族,其中HuR 屬于胚胎致死異常視覺家族的RBPs,在體內(nèi)表達廣泛。最初發(fā)現(xiàn)HuR 與神經(jīng)分化相關(guān),通過與靶mRNA 3'UTR 的ARE 結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控RNA 的穩(wěn)定性和蛋白表達。近年發(fā)現(xiàn),HuR 與細胞增殖、炎癥等密切相關(guān)[1-3]。IκB 是核因子κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)的抑制因子,是細胞漿中存在的另一類蛋白質(zhì)家族。IκB 的 主 要 作 用可以概括 如下[4]:阻止NF-κB 核易位、阻止NF-κB 與DNA 結(jié)合、促進NF-κB 與DNA 的κB 序列解離。可見IκB 對于NF-κB 發(fā)揮其正常生物學(xué)功能至關(guān)重要。本研究主要是從轉(zhuǎn)錄后水平研究HuR 對IκB-α在體內(nèi)的調(diào)控,為進一步研究IκB-α 在NF-κB 通路調(diào)控中的作用打下基礎(chǔ)。

        材 料 和 方 法

        1 細胞系

        NIH 3T3 細胞購自美國典型培養(yǎng)物種庫(American Type Culture Collection,ATCC)。

        2 主要試劑

        培養(yǎng)基(DMEM)、胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)、無血清培養(yǎng)基(Opti-MEM)購自Gibco-BRL;質(zhì)粒小量抽提試劑盒、DNA 純化回收試劑盒、100 bp DNA marker、1 kb DNA marker 和預(yù)染蛋白ladder 均購自New England Biolabs(NEB);瓊脂糖粉購自Biowest;LipofectamineTM2000 轉(zhuǎn) 染 試 劑、Platinum ?SYBR? Green Real-time PCR 試劑盒和TRIzol RNA提取試劑購自Invitrogen;ReverTra Ace? qPCR RT Kit 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和RNA 純化試劑盒購自Toyobo;限制性內(nèi)切酶、KOD plus 聚合酶及配套PCR 試劑、T4 DNA 連接酶及配套試劑購自TaKaRa;MAXIscript Kit 購 自Ambion;Streptavidin Agarose Resin 購 自Thermo;酵母RNA 購自Sigma;anti-HA、anti-HuR 和anti-IκB-α 抗體購自Santa Cruz;HRP-linked Antibody購自Cell Signaling Technology;放線菌素D 和Dual-Luciferase Reporter Gene Assay Kit 購自Promega。

        3 質(zhì)粒、引物合成及siRNA 合成

        螢火蟲螢光素酶報告基因質(zhì)粒pGL3-control、海腎(Renilla)螢光素酶報告基因質(zhì)粒pRL-TK、表達pcDNA3-HA-HuR 融合蛋白的真核細胞表達質(zhì)粒pcDNA3-HA-HuR 和pcDNA3 空載體由寧波大學(xué)劉玉新博士惠贈;引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;siRNA 由上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司合成。

        4 主要方法

        4.1 IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因真核表達質(zhì)粒構(gòu)建 使用細胞總RNA 提取試劑TRIzol 提取NIH 3T3 細胞總RNA,以此總RNA 為模板進行RT-PCR反應(yīng),獲得的產(chǎn)物即為NIH 3T3 細胞cDNA 文庫。從GenBank 獲得小鼠IκB-α mRNA 3'UTR 的編碼序列,并設(shè)計引物。上游引物5'-ATC GCC GTG TAA TGG AAA GTG GCA AAA AGA ATG-3',下游引物5'-GCT CTA GAG CTG TCT GTA AAA ATC TGT TTA AT-3'(下劃線部分為Xba I 酶切位點)。以NIH 3T3 細胞的cDNA 文庫為模板,使用KOD plus 聚合酶進行PCR 反應(yīng),擴增IκB-α mRNA 3'UTR 片段。同時從pGL3-control 質(zhì)粒擴增luciferase 片段使用的上游引物5'-GGT AAA GCC ACC ATG GAA GAC G-3'(下劃線部分為 Nco I 的酶切位點),下游引物5'-CACTTTCCA TTA CAC GGC GAT CTT TCC G-3'。將2 次PCR 擴增的片段混合后為模板,擴增luciferase-IκB-α mRNA 3'UTR 片 段,5'-GGT AAA GCC ACC ATG GAA GAC G-3'(下劃線部分為Nco I 的酶切位點),下游引物5'-GCT CTA GAG CTG TCT GTA AAA ATC TGT TTA AT-3'(下劃線部分為Xba I 酶切位點)。將luciferase-UTR 的PCR 產(chǎn)物1%瓊脂糖凝膠電泳,切取目的條帶后用DNA 純化回收試劑盒回收。將pGL3-control 質(zhì)粒以及回收的luciferase-UTR片段分別行Xba I 和Nco I 雙酶切,將luciferase-IκBα mRNA 3'UTR 通過Xba I 和Nco I 酶切位點插入pGL3-control 以取代質(zhì)粒中原有的螢火蟲螢光素酶基因;酶切產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,切取目的條帶后用DNA 純化回收試劑盒回收?;厥盏拿盖泻筝d體與目的片段按摩爾比1∶4 混合,用T4 DNA 連接酶于16 ℃連接16 h,轉(zhuǎn)化DH5α 感受態(tài)細胞,鋪Amp+瓊脂板,12 h 后挑取單克隆,置于5 mL 的Amp+LB 培養(yǎng)液中搖菌12 h,使用質(zhì)粒微提試劑盒提取質(zhì)粒。對所提取的質(zhì)粒分別進行PCR、Xba I 和Nco I 雙酶切鑒定及測序鑒定,所構(gòu)建的質(zhì)粒命名為pGL3-UTR。

        4.2 脂質(zhì)體LipofectamineTM2000 轉(zhuǎn)染質(zhì)粒 轉(zhuǎn)染前一天接種3T3 細胞于6 cm 皿,次日融合度約60%左右。每1 μg 質(zhì)粒按照3 μL 脂質(zhì)體計算,分別用無血清培養(yǎng)基Opti-MEM 50 μL 稀釋質(zhì)粒及脂質(zhì)體,室溫孵育5 min。將稀釋后的脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑加入質(zhì)粒中,混勻離心,室溫孵育15 min。細胞換液,加入無血清DMEM 900 μL。將質(zhì)粒和脂質(zhì)體混合物加入細胞中,37 ℃培養(yǎng)3 h。3 h 后補液至4 mL 并補充10%血清。

        4.3 過表達HuR 對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性及蛋白表達影響 3.5 cm 皿NIH 3T3 細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3-HAHuR 1 μg,對照組轉(zhuǎn)染pcDNA3 1 μg 24 h 后,給予放線菌素D 5 mg/L 處理1 h。放線菌素D 可以抑制RNA 的合成,從而檢測RNA 的穩(wěn)定性。提取mRNA檢測IκB-α mRNA 變化;6 cm 皿NIH 3T3 細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3-HA-HuR 1 μg,對照組轉(zhuǎn)染pcDNA3 1 μg 24 h 后,收集細胞提取細胞總蛋白,Western blotting 檢測IκB-α 蛋白表達變化。

        4.4 報告基因檢測 雙螢光素酶報告基因系統(tǒng),即結(jié)合螢火蟲螢光素酶底物和海腎螢光素酶底物共報告基因測試技術(shù),在用螢火蟲螢光素酶(pGL3)定量基因表達時,通常采用海腎螢光素酶(pRL-TK)底物共報告基因作為內(nèi)參照,來減少內(nèi)在的變化因素所帶來的的實驗的誤差,如排除培養(yǎng)細胞的數(shù)目和活力的差別,以及細胞轉(zhuǎn)染和裂解效率的差別等。按照Dual-Luciferase Reporter Gene Assay Kit 說明書操作,將試劑盒中的專用細胞裂解液(5 ×passive lysis)用PBS 稀釋為1 ×passive lysis。轉(zhuǎn)染后的24 孔板3T3 細胞,每孔加入150 μL 1 ×passive lysis,室溫搖床裂解15 min。吸取裂解產(chǎn)物于新離心管,凍存于-80 ℃冰箱30 min。將上清恢復(fù)至室溫后混勻,吸5 μL 上清,按照Dual-Luciferase Reporter Gene Assay Kit 說明進行報告基因活性檢測。

        4.5 制備biotin 標記的IκB-α 與GAPDH mRNA 3'UTR 探針 對照組以GAPDH 3'UTR 為模版,實驗組以質(zhì)粒pGL3-UTR 為模板擴增帶有T7 promoter 的單鏈DNA 序列,以作為下一步進行體外轉(zhuǎn)錄的模板DNA,用DNA 回收試劑盒回收PCR 產(chǎn)物。以上述單鏈3'UTR 序列為模板按照MAXIscript Kit 說明書進行體外轉(zhuǎn)錄實驗,得到biotin 標記的IκB-α mRNA 3'UTR 的探針。體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)結(jié)束后,于反應(yīng)液中加入RNase-free DNase 10 U,混勻后置于37 ℃水浴反應(yīng)10 min,使模板DNA 充分降解。使用RNeasy?Kit 對體外轉(zhuǎn)錄得到的RNA biotin-3'UTR 探針進行純化。純化得到的RNA 探針進行濃度測定,凍于-80 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        4.6 Streptavidin-biotin RNA-pull down 待3T3 細胞的融合度達到90%時,用細胞刮刀刮下6 cm 皿內(nèi)的細胞,用1 mL 預(yù)冷PBS 沖洗細胞刮刀和6 cm 皿,收集懸液置于EP 管內(nèi),以上操作均在冰上完成。12 000 ×g 4 ℃離心30 s 得到細胞沉淀,棄上清,加入300 μL 細胞裂解液(1. 5 g/L 肝素、2 mmol/L DTT、蛋白酶抑制劑、磷酸酶抑制劑)于4 ℃裂解細胞1 h。細胞裂解液以12 000 ×g 4 ℃離心10 min,收集裂解上清于DEPC 處理過無RNase 酶的EP 管內(nèi)。裂解上清中加入biotin 標記的3'UTR 探針(約400 ng)、酵母RNA(100 μg/L,1.5 μL)、RNase inhibitor(1 ×105U/L,3 μL)、肝素(1.5 g/L),4 ℃共孵育3 h。取20 μL 鏈親和素標記的beads 置于無RNase 的EP 管內(nèi),用細胞裂解液500 μL 洗滌streptavidin beads,500 ×g 4 ℃離心5 min,棄上清,備用。探針與裂解液共孵育3 h 后,12 000 ×g 4 ℃離心5 s 后,轉(zhuǎn)移至預(yù)先洗滌過的beads 中,4 ℃共孵育3 h。上述共孵育3 h 后混合溶液用750 μL 細胞裂解液洗滌,以洗掉beads 上結(jié)合的非特異蛋白。500 ×g 4 ℃離心5 min,棄上清。重復(fù)清洗beads 4 次。洗滌beads 4 次后,加入2 × Loading Buffer 20 μL 95 ℃變性5 min,12 000 r/min 離心3 min,用于Western blotting檢測。

        4.7 脂質(zhì)體LipofectamineTM2000 轉(zhuǎn)染干擾片段siRNA 轉(zhuǎn)染前1 d 接種3T3 細胞于3.5 cm 皿,次日融合度約30%左右。將公司合成的3 對干擾HuR 的siRNA(序列見表1)按照濃度1∶1∶1 混合,混勻后按照siNC、siHuR 25 nmol/L 及3 μL 脂質(zhì)體計算,分別用無血清培養(yǎng)基Opti-MEM 50 μL 稀釋siRNA 及脂質(zhì)體,室溫孵育5 min。將稀釋后的脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑加入siRNA 中,混勻離心,室溫孵育15 min。細胞換液,加入無血清DMEM 600 μL 將質(zhì)粒和脂質(zhì)體混合物加入細胞中,37 ℃培養(yǎng)6 h。6 h 后補液至4 mL 并補充10%血清。

        表1 HuR siRNA 的序列Table 1. Sequences of HuR siRNA

        4.8 干擾HuR 表達對IκB-α mRNA 及蛋白表達影響 3.5 cm 皿NIH 3T3 細胞轉(zhuǎn)染HuR siRNA 24 h后,將其傳代,平分為2 皿,1 皿用于檢測HuR 及IκB-α mRNA 表達,另1 皿給予放線菌素D 處理1 h,提取mRNA 檢測IκB-α mRNA 穩(wěn)定性改變。6 cm 皿NIH 3T3 細胞轉(zhuǎn)染HuR siRNA 48 h 后,裂解細胞,Western blotting 檢測HuR 及IκB-α 蛋白表達。

        4.9 實時定量PCR 檢測mRNA 穩(wěn)定性 過表達或干擾HuR 表達處理后的3T3 細胞給予放線菌素D 5 mg/L 處理1 h,TRIzol 法提取細胞總RNA,RNA 反轉(zhuǎn)錄按照ReverTra Ace? qPCR RT Kit 逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書進行操作。實時定量PCR 反應(yīng)體系按照Platinum? SYBR? Green Real-time PCR 試劑盒說明書進行配制及操作,以β-actin 作為內(nèi)參照。引物序列見表2。

        表2 qPCR 的引物序列Table 2. Primer sequences for qPCR

        5 灰度分析

        使用ImageJ 灰度分析軟件進行蛋白質(zhì)免疫印跡圖像灰度分析,分別測定出各個時點蛋白表達量的灰度值及相對應(yīng)actin 蛋白表達量的灰度值,二者的比值代表各時點蛋白的相對表達量,并以相對表達量進行統(tǒng)計學(xué)分析。

        6 統(tǒng)計學(xué)處理

        使用統(tǒng)計軟件為SPSS 13.0,首先采用Levene 進行方差齊性檢驗,文中樣本方差均齊,則采用單因素方差分析(One-way ANOVA),以P <0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義,繪圖軟件為OriginPro 8.0。

        結(jié) 果

        1 IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因真核表達質(zhì)粒構(gòu)建

        將提取的質(zhì)粒pGL3-UTR 分別用Nco I 和Xba I進行雙酶切鑒定。電泳結(jié)果表明,經(jīng)雙酶切后可得到約3.6 kb 和2.2 kb 的片段,符合預(yù)期大小,見圖1。DNA 測序結(jié)果同時證實質(zhì)粒構(gòu)建成功。

        2 IκB-α mRNA 3'UTR 驅(qū)動的報告基因的表達

        陰性對照組:轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pGL3-control 1 μg 和pRL-TK 0.1 μg;實驗組:轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pGL3-UTR 1 μg和pRL-TK 0.1 μg。實驗組與對照組分別在轉(zhuǎn)染報告基因質(zhì)粒24 h 后檢測報告基因螢光素酶活性,與對照組相比,過表達pGL3-UTR 后,報告基因螢光素酶活性明顯增高,見圖2。

        Figure 1. Identification of vector pGL3-UTR with restrictive endonuclease digestion.M:1 kb DNA marker;1:pGL3-UTR;2:pGL3-UTR digested by Nco I and Xba I.圖1 pGL3-UTR 螢光素酶報告基因重組質(zhì)粒的鑒定

        Figure 2. The influence of overexpressing pGL3-UTR on the luciferase activity of IκB-α mRNA 3'UTR reporter gene.Mean±SD.n=3. * P <0.05 vs pGL3-control.圖2 過表達pGL3-UTR 對IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因螢光素酶活性的影響

        3 HuR 蛋白對IκB-α mRNA 3'UTR 驅(qū)動的報告基因螢光素酶活性的影響

        陰性對照:轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pGL3-UTR 1 μg、pRL-TK 0.1 μg 和pcDNA3 1 μg;實驗組:轉(zhuǎn)染質(zhì)粒pGL3-UTR 1 μg、pRL-TK 0. 1 μg 和pcDNA3-HA-HuR 1 μg。實驗組與對照組分別轉(zhuǎn)染報告基因質(zhì)粒24 h后檢測,與對照組相比,過表達pcDNA3-HA-HuR 后,報告基因螢光素酶活性明顯增高,見圖3。

        Figure 3. The influence of overexpressing pcDNA3-HA-HuR on the IκB-α mRNA 3'UTR reporter gene. Mean ±SD. n=3. * P <0.05 vs pcDNA3.圖3 過表達pcDNA3-HA-HuR 對IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因螢光素酶活性的影響

        4 Streptavidin-biotin RNA-pull down 技術(shù)證明HuR 蛋白可與IκB-α mRNA 3'UTR 特異性結(jié)合

        Streptavidin-biotin RNA-pull down 后,biotin-IκBα 3'UTR RNA 探針組可以檢測到HuR 蛋白,而biotin-GADPH 3'UTR RNA 探針組為陰性,表明HuR 蛋白可以特異性地與IκB-α 3'UTR RNA 結(jié)合,見圖4。

        Figure 4. The result of RNA pull-down assay.圖4 RNA pull-down 結(jié)果

        5 過表達HuR 對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性及蛋白表達的影響

        與對照相比,過表達pcDNA3-HA-HuR 后,IκB-α mRNA 穩(wěn)定性無明顯變化,見圖5,IκB-α 蛋白表達明顯上調(diào),見圖6。

        Figure 5. The influence on IκB-α mRNA stability by overexpressing pcDNA3-HA-HuR. Mean±SD.n=3.圖5 過表達pcDNA3-HA-HuR 對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性的影響

        Figure 6. The influence on IκB-α protein by overexpressing pcDNA3-HA-HuR.Mean±SD. n =3. * P <0.05 vs pcDNA3.圖6 過表達pcDNA3-HA-HuR 對IκB-α 蛋白表達的影響

        6 干擾HuR 表達后觀察其對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性及蛋白表達的影響

        qPCR 檢測HuR mRNA 表達干擾效率約80%,干擾HuR mRNA 后對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性無明顯影響,見圖7。HuR 蛋白表達明顯被干擾后,IκB-α 蛋白表達明顯下調(diào),見圖8。

        討 論

        核因子κB 抑制蛋白是核因子κB 的抑制因子。IκB 蛋白家族與Rel/NF-κ 蛋白家族一樣,也是一個大家族,它們都來源于相同祖先NF-κB/IκB 超家族的Rel 同源區(qū)- 錨蛋白重復(fù)序列區(qū)(Rel homology domain-ankyrin repeat domain,RHD-ARD)結(jié) 構(gòu)[5]。IκB 蛋白家族的成員主要包括:IκBα、IκBβ、IκBε、Bcl-3、IκBγ、IκBδ、p100 和p105 等。

        在一般的生理情況下,非活化狀態(tài)的NF-κB 以與IκBα 聚合的三聚體形式或與前體蛋白聚合的二聚體形式存在于胞漿中,此時NF-κ B 的Rel 同源區(qū)均被IκB 占據(jù),遮蓋了NF-κB 的核定位序列(nuclear localization signal,NLS),因而NF-κB 不能轉(zhuǎn)位入核,不能調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄翻譯表達,處于無活性狀態(tài)。當細胞受到合適的胞外信號前炎癥細胞因子如IL-1、TNF-α 以及低氧、氧化劑、脂多糖、細菌、病毒、紫外線、某些變應(yīng)原等多種因素的刺激時,引起一系列連鎖的酶促反應(yīng)。當IκB 被蛋白酶體降解后,IκB 與NF-κB 的RHD 區(qū)分離,NF-κB 的NLS 暴露出來,轉(zhuǎn)位到細胞核內(nèi),與靶基因上的κB 位點發(fā)生特異性結(jié)合,調(diào)控相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯[6]。

        由此可見IκBα 對于核轉(zhuǎn)錄因子NF-κB 發(fā)揮其正常功能具有重大意義,本研究從轉(zhuǎn)錄后水平探討體內(nèi)調(diào)控IκBα 生物學(xué)功能的機制,從而為進一步研究其在NF-κB 通路中的作用機制打下良好基礎(chǔ)。

        Figure 7. The influence on the IκB-α mRNA stability by interfering HuR.Mean±SD.n=3. * P <0.05 vs siNC.圖7 HuR 干擾效率檢測及對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性的影響

        Figure 8. The influence on the IκB-α protein by interfering HuR.Mean±SD.n=3. * P <0.05 vs siNC.圖8 HuR 干擾效率檢測及對IκB-α 蛋白表達的影響

        基因表達調(diào)控是在多級水平上進行的:基因活化、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工、翻譯、翻譯后加工等[7]?;蜣D(zhuǎn)錄起始的調(diào)控是大多數(shù)基因的主要調(diào)控形式,但是其它的調(diào)控能夠在從DNA 到蛋白質(zhì)途徑發(fā)揮作用,來調(diào)節(jié)所產(chǎn)生的基因產(chǎn)物數(shù)量?;虮磉_的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控一般指在RNA 聚合酶結(jié)合到基因啟動子后,對轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進行的一系列修飾,主要包括:轉(zhuǎn)錄的提前終止、剪接、mRNA 通過核孔和胞質(zhì)內(nèi)定位、RNA 編輯、翻譯起始和翻譯效率,mRNA 的穩(wěn)定性等多個環(huán)節(jié)。

        轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制比其它調(diào)節(jié)形式更快捷和經(jīng)濟[8],可以根據(jù)機體內(nèi)外環(huán)境的變化迅速調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白的表達水平,對于機體維持內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定至關(guān)重要。在基因表達轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中,mRNA 穩(wěn)定性及翻譯的調(diào)控具有重要的作用[9-12],通過這兩種形式的調(diào)控,細胞可以對內(nèi)外源性刺激作出迅速的反應(yīng)。研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄本中調(diào)控mRNA 穩(wěn)定性等的元件存在于3'非翻譯區(qū)(3'UTR)[13],大部分轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制的靶向部位都位于轉(zhuǎn)錄本mRNA 的3'UTR 區(qū)?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)約5% ~8%的人類基因編碼的mRNA 其3'UTR區(qū)含有ARE 序列。ARE 序列是一段長度約為50 ~150 nt、富含腺嘌呤和尿嘧啶的序列,與mRNA 的穩(wěn)定性有密切關(guān)系。ARE 序列能夠招募許多ARE 結(jié)合蛋白(ARE-binding proteins,ARE-BP),這些AREBP 相互協(xié)作或競爭地與mRNA 的ARE 結(jié)構(gòu)域結(jié)合,共同調(diào)節(jié)mRNA 的穩(wěn)定性和翻譯水平。

        Hu 家族蛋白是一種mRNA 結(jié)合蛋白[14],因與果蠅體內(nèi)的胚胎致死異常視覺蛋白同源,所以Hu 家族又被稱為類胚胎致死異常視覺(ELAVL)家族。Hu 家族有4 個成員:HuB(Hel-N1)、HuC、HuD 和HuR(ELAVLl),前3 個成員主要在終端分化的神經(jīng)組織表達并與神經(jīng)發(fā)育有關(guān),而HuR 在其它組織中也廣泛表達。在HuR 蛋白上有3 個RNA 識別模序(RNA recognition motif,RRMs),可以與ARE(AUrich element)特定位點結(jié)合。

        近年來研究發(fā)現(xiàn)HuR 在P13K/Akt/NF-κB、p38 MAPK、Wnt 等細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中或應(yīng)激、低氧條件啟動下穿過細胞核到達細胞漿,在胞漿中穩(wěn)定mRNA 減少其降解,延緩mRNA 半衰期,而加強靶因子的翻譯表達[15]。

        本實驗中構(gòu)建了IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因真核表達質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)染細胞檢測報告基因,與對照組相比,其報告基因數(shù)值明顯增高,表明IκB-α mRNA的3'UTR 區(qū)在其發(fā)揮生物學(xué)功能中具有重要作用;將RNA 結(jié)合蛋白HuR 的真核表達質(zhì)粒與IκB-α mRNA 3'UTR 報告基因真核表達質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染細胞后檢測,其報告基因與對照組相比數(shù)值明顯增高,表明HuR 可以對IκB-α mRNA 3'UTR 的生物學(xué)功能進行調(diào)控。體外標記IκB-α mRNA 3'UTR 生物素探針及RNA pull-down 實驗,進一步證實HuR 可以與IκB-α mRNA 3'UTR 特異性結(jié)合而發(fā)揮其調(diào)節(jié)作用。

        為進一步研究HuR 對IκB-α 的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制,在細胞中分別過表達及干擾HuR,以觀察其對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性及蛋白表達的影響。結(jié)果顯示分別過表達及干擾HuR 后,對IκB-α mRNA 穩(wěn)定性影響不大,但IκB-α 蛋白表達分別出現(xiàn)上調(diào)及下調(diào)現(xiàn)象,說明HuR 對IκB-α 的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用,主要是通過加強其翻譯作用而實現(xiàn)的。

        綜上所述,本研究中證實RNA 結(jié)合蛋白HuR 可以與IκB-α mRNA 3'UTR 特異性結(jié)合,并通過加強IκB-α 的翻譯來調(diào)節(jié)其生物學(xué)功能,為進一步研究其在NF-κ 通路中發(fā)揮的重要作用提供了理論依據(jù)。

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