劉效瑞,楊 寧,王春明,尚虎山,汪淑霞,王興政
(1.甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心,甘肅 定西 743000;2.西北師范大學(xué),甘肅 蘭州730070)
我國中藥材資源豐富,是世界藥材的主產(chǎn)國,對(duì)中藥材的研究有幾千年的歷史。甘肅省自然條件雖然惡劣,但卻是中藥材生長的適宜地帶,中藥材生產(chǎn)在全國具有明顯的競爭優(yōu)勢,為全國中藥材優(yōu)勢產(chǎn)區(qū)和生產(chǎn)大省,其中黃芪栽培面積和產(chǎn)量約占全國的50%左右。黃芪(Radix Astragali)又名黃耆,為植物和中藥材的統(tǒng)稱。植物黃芪產(chǎn)于內(nèi)蒙古、山西、甘肅、黑龍江等地,為國家三級(jí)保護(hù)植物。黃芪是臨床常用中藥材,其化學(xué)成分眾多,主要含有皂苷類、黃酮類、多糖類等有效成分。黃芪來源于豆科植物膜莢黃芪[Astragalus membranaceus(Fisch.)Bge]和蒙古黃芪[Astragalus membranaceus (Fisch)Bge.Var.mongholicus(Bge.)Hsiao]的干燥根,為我國傳統(tǒng)的補(bǔ)氣藥[1~3]。黃芪的藥用迄今已有2 000多年的歷史,大量的臨床研究證實(shí),黃芪具有保護(hù)心臟及腎臟、雙向調(diào)節(jié)血糖及血壓、抗缺氧、抗自由基氧化、抗衰老、抗腫瘤及增強(qiáng)機(jī)體免疫力等功效[2~3]。目前甘肅黃芪栽培中普遍使用的品種為黃芪屬多種類型的混和體,田間表現(xiàn)良莠混雜,難于管理,且品種(系)親緣關(guān)系不明確,缺乏品種(系)鑒定的分子依據(jù),嚴(yán)重制約著當(dāng)?shù)攸S芪的產(chǎn)量和品質(zhì)。另外,藥材的道地性一直是評(píng)價(jià)藥材品質(zhì)的綜合性標(biāo)準(zhǔn),產(chǎn)生道地性的原因,除了栽培方法、生態(tài)環(huán)境、加工方法外,還與物種居群的遺傳特異性有關(guān)。道地藥材與非道地藥材在形態(tài)和生藥性狀等特征上的差別并不明顯,這給應(yīng)用傳統(tǒng)方法鑒別道地藥材帶來了困難。
隨機(jī)擴(kuò)增DNA多態(tài)性(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)技術(shù)以其操作簡單、快速、花費(fèi)少、DNA用量少、無放射性等優(yōu)點(diǎn),廣泛應(yīng)用于中草藥種質(zhì)資源親緣關(guān)系、遺傳多樣性及藥材道地性研究等方面[4~5]。我們針對(duì)甘肅省黃芪生產(chǎn)及銷售實(shí)際中不能提供科學(xué)的藥材道地性鑒定等問題,利用RAPD技術(shù)對(duì)甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心新選育的2個(gè)黃芪品種(系)進(jìn)行分析鑒定,以考證其遺傳多樣性和親緣關(guān)系。
供試黃芪樣品為隴芪1號(hào)(編號(hào)為HQ1)、HQN03-03(編號(hào)為HQ2),均由甘肅省定西市旱作農(nóng)業(yè)科研推廣中心提供。于2011年7月20日分別采集2個(gè)黃芪品種(系)的幼葉各50片,用硅膠干燥后帶回實(shí)驗(yàn)室。RAPD引物由北京奧科生物技術(shù)公司生產(chǎn),所用Taq酶及dNTPs購自天根生化科技(北京)有限公司。
1.2.1 DNA的提取 采用SDS法提取植物基因組DNA[6~7]。稱取0.3 g干葉片,加液氮研磨至粉末狀移入離心管,加入4mL已預(yù)熱到65℃的提取液充分混勻,65℃水浴30min,每3min混勻1次。向離心管中加入等體積的氯仿異戊醇(24∶1)抽提1 h,8 000 r/min離心15min,取出上清液,再抽提2次,而后加入2倍體積的-20℃的無水乙醇,混勻后放在-20℃下靜置30min,吸出無水乙醇后加入70%乙醇,并輕柔混勻30 s,重復(fù)4~5次,以去除雜質(zhì)。將DNA挑出后放入已加入300 uL TE液的離心管中,待DNA完全溶解后分裝,4℃下保存待用。對(duì)提取的2個(gè)供試黃芪品種(系)的DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,為后期PCR擴(kuò)增提供良好的模板。
1.2.2 PCR擴(kuò)增 擴(kuò)增反應(yīng)在BIO-RAD普通型PCR儀上進(jìn)行。采用RAPD分子標(biāo)記技術(shù),分析鑒別新選育出的2個(gè)黃芪品種(系)的遺傳多樣性和親緣關(guān)系。采用SDS方法提取植物基因組DNA,利用RAPD—PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系(①RAPD反應(yīng)體系模板DNA 1.2 uL,隨機(jī)引物2.0 uL,dNTPs 1.3 uL,Buffer 2.5 uL,Taq酶 0.5 uL,加ddH2O至25.0 uL;②擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性5min后,94℃1 min,35℃ 1 min,72℃ 2 min,共計(jì)40個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。) 進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。然后采用1.4%的瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(EB)染色,UVI凝膠圖像分析系統(tǒng)觀察照相。每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.2.3 數(shù)據(jù)處理 參照Williams等的方法[8],電泳擴(kuò)增圖譜中的每一條帶(DNA片段)均為一個(gè)分子標(biāo)記(Marker),并代表一個(gè)引物結(jié)合位點(diǎn),根據(jù)各分子標(biāo)記在相同電泳遷移率下(相同分子量片段)的有無,統(tǒng)計(jì)得到所有位點(diǎn)的二元數(shù)據(jù),有DNA擴(kuò)增帶(顯性)為1,無帶(隱性)記為0,強(qiáng)帶和弱帶賦值為1。對(duì)于多態(tài)性位點(diǎn),采用在重復(fù)試驗(yàn)中能穩(wěn)定出現(xiàn)的差異帶用于數(shù)據(jù)分析。
從表1可以看出,通過引物篩選,分別從HQ1和HQ2中挑選出譜帶清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性較豐富的12條和13條隨機(jī)引物,用于PCR擴(kuò)增反應(yīng)。從HQ1挑選出的12條引物為P1、P2、P3、P4、P5、P6、P7、P10、 P12、P13、P14、P15 ,從 HQ2挑選出的13條引物為P1、P2、P3、P4、P5、P6、P7、P8、P9、P10、P11、P13、P15。從HQ1篩選出的12條引物共擴(kuò)增出112個(gè)位點(diǎn),不同引物的擴(kuò)增位點(diǎn)變幅為7~13個(gè),平均每條引物能擴(kuò)增出9.3個(gè)位點(diǎn);從HQ2篩選出的13條引物共擴(kuò)增出107個(gè)位點(diǎn),不同引物的擴(kuò)增位點(diǎn)變幅為6~12個(gè),平均每條引物能擴(kuò)增出8.2個(gè)位點(diǎn)。
表1 2個(gè)新選育黃芪品種(系)的引物序列和擴(kuò)增結(jié)果
利用HQ1和HQ2可共用的12條引物,分別擴(kuò)增2個(gè)黃芪品種(系),從而在分子水平上反映2個(gè)黃芪品種(系)間的遺傳差異性。篩選出的12條引物分別為P1、P2、P3、P4、P5、P6、 P7、P9、P10、P13、P14、P15(引物及其擴(kuò)增條帶數(shù)見表1)。結(jié)果顯示,HQ1和HQ2的主譜帶基本一致,說明它們的遺傳背景具有很大的相似性,但是兩者間的次譜帶存在明顯差異。相同引物擴(kuò)增2個(gè)黃芪品種(系)產(chǎn)生的總位點(diǎn)數(shù)的范圍為13~25個(gè);其中多態(tài)性位點(diǎn)的差異變幅為1~3個(gè)。這說明2個(gè)黃芪品種(系)間存在遺傳學(xué)差異,具有遺傳多態(tài)性位點(diǎn)(圖1)。
圖1 HQ1和HQ2的RAPD電泳圖譜
本研究對(duì)模板DNA含量和dNTPs含量兩個(gè)因素進(jìn)行了優(yōu)化分析,建立了適合黃芪材料的RAPD—PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系,并對(duì)引物退火溫度和電泳中瓊脂糖濃度進(jìn)行了篩選,最終確定了黃芪的最適RAPD—PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為:模板DNA 1.2 uL,隨機(jī)引物2.0 uL,dNTPs1.3 uL,Buffer 2.5 uL,Taq酶0.5 uL,ddH2O 17.5 uL;RAPD引物最佳退火溫度為35℃,最適瓊脂糖濃度為1.4%。此體系的建立可以為其它黃芪品種(系)的RAPD擴(kuò)增提供參照依據(jù)。
RAPD是一種顯性標(biāo)記,能從分子水平上揭示材料間存在的遺傳差異[9~11]。從RAPD的結(jié)果可以看出,隴芪1號(hào)篩選出的12條引物共擴(kuò)增出112個(gè)位點(diǎn),平均每條引物能擴(kuò)增出9.3個(gè)位點(diǎn);HQN03-03篩選出的13條引物共擴(kuò)增出107個(gè)位點(diǎn),平均每條引物能擴(kuò)增出8.2個(gè)位點(diǎn)。供試的2個(gè)黃芪品種(系)的主譜帶基本一致,說明它們的遺傳背景具有很大的相似性,2個(gè)黃芪品種(系)間遺傳關(guān)系較近。這種情況可能是由于供試的2個(gè)黃芪品種(系)在種植過程中地理分布近,且黃芪是自花不孕或自交不親和的異花授粉植物[12],從而使二者間相互授粉的幾率大大提高,造成遺傳關(guān)系較近。但次譜帶存在不同程度的差異,從分子水平上說明這2個(gè)黃芪品種(系)具有一定的遺傳差異性,也體現(xiàn)了甘肅省黃芪品種(系)資源具有較豐富的遺傳多樣性。
[1] 國家藥典委員會(huì).中華人民共和國藥典(2010版).(一部)[M].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2009:249-250.
[2] 馬偉明,劉曉瑞,王春明,等.黃芪愈傷組織的誘導(dǎo)及分化培養(yǎng)[J]. 甘肅農(nóng)業(yè)科技,2011(6):30-32.
[3] 劉曉瑞,尚虎山,汪淑霞,等.應(yīng)用高穩(wěn)系數(shù)法對(duì)黃芪品比試驗(yàn)結(jié)果的評(píng)價(jià)[J].甘肅農(nóng)業(yè)科技,2012(1):14-16.
[4] 鄭學(xué)項(xiàng),馮素萍,李維國.DNA分子標(biāo)記研究進(jìn)展[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,37(26):12420-12422.
[5] 任愛農(nóng),秦民堅(jiān).基于RAPD分子標(biāo)記技術(shù)的中藥材鑒定研究進(jìn)展[J]. 中南藥學(xué),2008,6(3):338-341.
[6] 王關(guān)林.植物基因工程(第2版)[M].北京:科學(xué)出版社,2002:742.
[7] 劉湘丹,周日寶,童巧珍,等.百合鱗葉總DNA提取方法的改進(jìn)[J].湖南中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào),2007,27(2):12.
[8] WILLIAMS J G,KUBELIK A R,Libak K J,et al.DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as geneticmarkers[J].Nuc.Aci.Res.,1990,18(22): 6531-6535.
[9] 梁慧敏.不同居群狗牙根RAPD分析[J].草業(yè)學(xué)報(bào),2010,19 (1):258-262.
[10] 劉 歡,慕 平,趙桂琴.基于AFLP燕麥遺傳多樣性研究[J]. 草業(yè)學(xué)報(bào),2008,17(6):121-127.
[11] 解新明,盧小良.利用RAPD標(biāo)記分析狼尾草屬牧草品種間的遺傳關(guān)系[J]. 草業(yè)學(xué)報(bào),2005,14(2):52-56.
[12] 吳松權(quán),廉美蘭.黃芪傳粉特性的研究[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2008,36(21):9148;9303.