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        基于LevelSet的超聲乳腺腫瘤圖像的輪廓提取

        2013-12-10 07:05:28黃韞梔HUANGYunzhi
        關(guān)鍵詞:輪廓梯度邊界

        黃韞梔 HUANG Yunzhi

        劉 奇 LIU Qi

        四川大學(xué)電氣信息學(xué)院醫(yī)學(xué)信息工程系四川成都 610065

        乳腺癌發(fā)病率居女性癌癥首位,近年呈不斷上升趨勢(shì),因此開(kāi)展乳腺癌的診斷和防治研究具有重要意義。超聲診斷以其無(wú)損傷、非侵入性、靈敏度高、適用于鑒別軟組織等特點(diǎn),越來(lái)越多地應(yīng)用于乳腺腫瘤的輔助檢測(cè),而對(duì)乳腺腫瘤超聲圖像進(jìn)行分割以獲取腫瘤的邊界是判斷乳腺腫瘤良惡性的關(guān)鍵。由于超聲圖像存在大量的斑點(diǎn)噪聲,圖像質(zhì)量明顯下降,造成醫(yī)學(xué)圖像的復(fù)雜性和多樣性,從而大大增加了乳腺腫瘤分割的難度。本研究旨在采用曲率各向異性擴(kuò)散的方法,在保留主要邊界信息的前提下對(duì)超聲乳腺圖像加以平滑,并利用水平集的方法自動(dòng)提取乳腺腫瘤輪廓,為后續(xù)研究打下基礎(chǔ)。

        1 資料與方法

        1.1 腫瘤粗定位 鎖定目標(biāo),提取腫瘤所在的方形區(qū)域(圖1),以減小后期進(jìn)行自動(dòng)輪廓提取的迭代時(shí)間,并增加迭代的成功率。

        1.2 保留邊緣平滑濾波 傳統(tǒng)的圖像平滑算法如均值濾波、中值濾波和高斯濾波等,屬于各向同性擴(kuò)散,這些平滑算子在去除噪聲的同時(shí)會(huì)模糊甚至破壞圖像的邊緣[1]。為了在去除噪聲的同時(shí)保持圖像的邊緣,Perona等[2]提出在不同的方向設(shè)置不同分布系數(shù)的各向異性擴(kuò)散濾波(anisotropic diffusion),建立了各向異性擴(kuò)散方程:

        圖1 腫瘤粗定位

        其中原始圖像f (x, y)作為其初始值,在不同時(shí)刻可以得到在此時(shí)刻下擴(kuò)散濾波后的圖像。若設(shè)置:

        為擴(kuò)散程度的主控因子,其中X=(x,y)代表圖像中像素點(diǎn)的位置,g(X)表示每個(gè)像素點(diǎn)的梯度強(qiáng)度[3]。顯然,C(X)是梯度幅值的減函數(shù)。采用該方法對(duì)乳腺超聲圖像的濾波效果見(jiàn)圖2。

        圖2 A.包含腫瘤的區(qū)域;B.基于梯度各向異性擴(kuò)散濾波(步長(zhǎng)=0.25,迭代次數(shù)=5,傳導(dǎo)系數(shù)=5)

        本次實(shí)驗(yàn)中,以公式(3)作為主控因子表達(dá)式的曲率各向異性擴(kuò)散(MCDE)[4]對(duì)圖像進(jìn)行濾波。MCDE方程見(jiàn)公式(4)。

        對(duì)比圖2B和圖3B可知,與經(jīng)典的Perona-Malik擴(kuò)散方式相比,MCDE具有更低的敏感度,在去除噪聲和保留超聲圖像的邊界信息方面優(yōu)于梯度各向異性擴(kuò)散,并能夠更好地保留圖像中的結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)。此外,對(duì)比圖2B和圖3C可知,MCDE使用更少的迭代即可以得到一個(gè)可接受的結(jié)果。因此,采用MCDE對(duì)超聲醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行預(yù)處理,不僅能夠減少圖像中的斑點(diǎn)和噪聲,同時(shí)能夠保留乳腺腫瘤的對(duì)比度和形狀。1.3 邊緣的潛在圖像 圖像的梯度強(qiáng)度廣泛應(yīng)用于圖像分析,幫助檢測(cè)物體的輪廓以及分離均勻區(qū)域。為了能夠得到更加準(zhǔn)確的輪廓,先將經(jīng)過(guò)MCDE濾波后的圖像再次進(jìn)行濾波——高斯濾波(選擇合適的標(biāo)準(zhǔn)差,控制圖像邊緣的影響范圍),然后計(jì)算圖像的梯度。濾波后的梯度圖像見(jiàn)圖4,其中σ=1.0。

        圖3 A.包含腫瘤的區(qū)域;B、C.基于曲率各向異性擴(kuò)散濾波(B:步長(zhǎng)=0.25,迭代次數(shù)=5,傳導(dǎo)系數(shù)=5;C:步長(zhǎng)=0.25,迭代次數(shù)=3,傳導(dǎo)系數(shù)=5)

        圖4 梯度圖像

        在曲面演化的過(guò)程中,需要設(shè)置演化終止時(shí)的條件,本實(shí)驗(yàn)中終止的條件就是曲面到達(dá)了圖像邊緣。為了產(chǎn)生邊緣的潛在圖像,本次實(shí)驗(yàn)中選用Sigmoid函數(shù)[5,6]:

        其中g(shù)是輸入像素的梯度,g'是輸出像素的梯度,gmax、gmin是經(jīng)過(guò)MCDE濾波以后所得圖像的最大梯度值和最小梯度值,α定義了輸入梯度值范圍的寬度,β定義了圍繞在范圍中心的梯度。所得潛在邊界見(jiàn)圖5。

        圖5 潛在的腫瘤邊界

        Osher等[7,8]于1982年提出了基于幾何變形模型的水平集方法。利用水平集實(shí)現(xiàn)圖像分割的典型用法為:由用戶(hù)先定義出待分割對(duì)象的初始輪廓,再利用水平集的進(jìn)化功能,使水平集一直進(jìn)化到符合待分割對(duì)象的解剖結(jié)構(gòu)為止。

        在尋找腫瘤邊界的過(guò)程中,不能保證速度函數(shù)F恒正[9-12],因而不能利用FastMarching[13]提取乳腺腫瘤輪廓,需采用動(dòng)態(tài)水平集:

        其中初始條件為距離函數(shù):

        2.1 簡(jiǎn)單的初始輪廓 按照以下方式生成一個(gè)初始水平集曲面:①待分割區(qū)域內(nèi)用戶(hù)提供一個(gè)用于輪廓擴(kuò)張的種子點(diǎn)(a,b),一個(gè)好的種子點(diǎn)集將增大分割一個(gè)復(fù)雜對(duì)象而不丟失數(shù)據(jù)的可能性。在腫瘤輪廓提取實(shí)驗(yàn)中,由于腫瘤的特殊形狀,一般設(shè)置軸線(xiàn)上的中心位置為種子點(diǎn)。②以種子點(diǎn)為圓心,建立一個(gè)半徑為r的圓,該圓作為初始的輪廓曲線(xiàn),初始水平集曲面的方程表達(dá)式為:

        水平集的初始輪廓見(jiàn)圖6。

        圖6 水平集的初始輪廓

        2.2 乳腺輪廓的提取 曲面隨著時(shí)間而變化,嵌入其中的零水平集曲線(xiàn)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)也會(huì)隨之發(fā)生改變。在曲面演化過(guò)程中,可利用圖像信息,如灰度均值、梯度和邊緣等來(lái)控制曲面演化的過(guò)程。通用的曲面運(yùn)動(dòng)偏微分方程(PDE)為:

        其中A(X)是水平對(duì)流系數(shù),將水平線(xiàn)集引向?qū)ο蟮倪吔?;P(X)是傳播(膨脹)系數(shù),用于初始輪廓的擴(kuò)散;其中Z(X)是一個(gè)曲率均值的空間調(diào)節(jié)器系數(shù):高曲率區(qū)域的平滑系數(shù),進(jìn)一步將噪聲平滑,曲率越大,分割結(jié)果越平滑,然而曲率縮放比例太大會(huì)把輪廓移出形狀邊界[15]。常數(shù)α、β、γ是每個(gè)系數(shù)在界面運(yùn)作上相關(guān)影響的權(quán)值。因而曲面演化的方程表達(dá)式即為:

        2.2.1 測(cè)地活動(dòng)輪廓(GAC) Caselles等[16]闡述了公式(10)的具體實(shí)現(xiàn),即GAC的求解。演化過(guò)程需要定義達(dá)到收斂的標(biāo)準(zhǔn)或達(dá)到迭代器的最大數(shù)量,和邊界的潛在圖像一起構(gòu)成水平集的停止條件。本實(shí)驗(yàn)的收斂標(biāo)準(zhǔn)是以水平集函數(shù)的均方根變換的形式來(lái)定義的。如果均方根變換在用戶(hù)指定的一個(gè)門(mén)限之下,運(yùn)動(dòng)將會(huì)聚合到一點(diǎn)。具體參數(shù)設(shè)置:收斂標(biāo)準(zhǔn):RMS=0.02,迭代器的最大數(shù)量為1200。

        圖7顯示了利用GAC采用表1中的參數(shù)所得的圖像輪廓。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中測(cè)地線(xiàn)方法中的參數(shù)和傳播參數(shù)很難控制,并且從測(cè)試的結(jié)果也發(fā)現(xiàn)最后得到的速度圖像收斂到的邊緣處并不清晰,與原圖結(jié)構(gòu)有很大差異。圖7B中孔洞即是分割的泄露。

        圖7 測(cè)地活動(dòng)輪廓水平集分割腫瘤

        表1 GAC水平集分割的參數(shù)設(shè)置(曲率縮放=1.0,水平縮放=1.0)

        對(duì)于超聲乳腺腫瘤圖像的分割,需要一個(gè)相對(duì)較大的傳播縮放比例:①超聲圖像的邊界對(duì)比較低;②乳腺腫瘤生理結(jié)構(gòu)的邊界形狀比較復(fù)雜。但是這些縮放比例參數(shù)的最優(yōu)值只能通過(guò)不斷地實(shí)驗(yàn)得到。

        2.2.2 閾值水平集分割 由于速度函數(shù)的定義直接關(guān)系到水平集方法的分割質(zhì)量,針對(duì)GAC方法在連接成員方案中出現(xiàn)的“泄漏”,因此對(duì)GAC水平集的分割算法中的速度函數(shù)進(jìn)行修改,并且定義一個(gè)灰度值范圍來(lái)對(duì)相關(guān)的組織類(lèi)型繼續(xù)分類(lèi),然后求出對(duì)那個(gè)亮度范圍基于水平集等式上的傳播系數(shù)。任意點(diǎn)的速度函數(shù)F:

        缺省了公式(10)中的水平對(duì)流系數(shù)。速度函數(shù)F中,需滿(mǎn)足圖8所示的要求傳播項(xiàng):

        其中g(shù)(X)為輸入的待分割圖像中各點(diǎn)的灰度值,U為閾值上限,L為閾值下限[17]。

        對(duì)于公式(12)中閾值L和U的選取,可以參照以下2點(diǎn):①乳腺腫瘤超聲中,目標(biāo)處于低灰度值范圍,因此L值一般采用ROI區(qū)域中的最小灰度值。下門(mén)限設(shè)置成負(fù)數(shù),以便確保被分割對(duì)象的內(nèi)部出現(xiàn)在二值區(qū)域內(nèi)。②U值采用大津閾值法(Ostu)[18],即類(lèi)間方差最大化或類(lèi)中差異最小化進(jìn)行估計(jì)。

        圖8 傳播系數(shù)函數(shù)

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)圖9,其中各參數(shù)設(shè)置見(jiàn)表2。下門(mén)限設(shè)置成一個(gè)大的負(fù)數(shù)以便確保被分割對(duì)象的內(nèi)部將出現(xiàn)在二值區(qū)域內(nèi)。閾值水平集的方法改進(jìn)了GAC和FastMarching分割方法在弱邊界處出現(xiàn)“泄漏”,并且提取到與圖10手工勾邊較為相似的輪廓,較好地包裹了腫瘤區(qū)域。

        圖9 閾值水平集分割結(jié)果。圖10 醫(yī)師手動(dòng)勾畫(huà)的輪廓

        表2 閾值水平集分割的參數(shù)設(shè)置(曲率縮放=1.0)

        2.2.3 閾值水平集分割定量分析 為了評(píng)價(jià)分割結(jié)果的精度,以醫(yī)師手工勾畫(huà)的結(jié)果作為“金標(biāo)準(zhǔn)”,圖11顯示了自動(dòng)提取病灶區(qū)域與“金標(biāo)準(zhǔn)”之間的關(guān)系。本文采用Udupa[19]提出的3種不同的測(cè)量誤差對(duì)99幅乳腺腫瘤(61幅良性腫瘤,38幅惡性腫瘤)圖像的分割結(jié)果進(jìn)行定量分析:假陽(yáng)性(FP)、假陰性(FN)、真陽(yáng)性(TP):

        圖12和表3顯示了99例腫瘤利用閾值水平集進(jìn)行自動(dòng)分割后得到的FP、FN、TP的測(cè)量結(jié)果。由于獲取的乳腺超聲圖像會(huì)出現(xiàn)邊界極不清晰的情況,使得自動(dòng)分割未獲得滿(mǎn)意的結(jié)果(<5%,如圖12A中第42例和圖12B中第26例),此時(shí)不能完全依靠自動(dòng)分割,還需要醫(yī)師進(jìn)一步調(diào)整腫瘤輪廓以獲得比較滿(mǎn)意的結(jié)果。

        圖11 自動(dòng)分割區(qū)域和手動(dòng)分割區(qū)域真陽(yáng)性、假陽(yáng)性、假陰性比較

        圖12 閾值水平集獲取的超聲乳腺腫瘤輪廓(圖像均采自四川大學(xué)華西醫(yī)院超聲科)

        表3 99例腫瘤分割的誤差測(cè)度(99例圖像均采自四川大學(xué)華西醫(yī)院超聲科)

        3 結(jié)束語(yǔ)

        本文首先定位到超聲圖像中的腫瘤區(qū)域,然后針對(duì)乳腺腫瘤超聲圖像自身的一些缺點(diǎn)如圖像對(duì)比度低、斑點(diǎn)噪聲大、部分邊緣缺失、腫瘤內(nèi)部微細(xì)結(jié)構(gòu)分布復(fù)雜(如血管、鈣化灶等),特別是惡性腫瘤還具有復(fù)雜形狀等,提出了針對(duì)性的MCDE的方法進(jìn)行濾波處理,平滑了噪聲,但邊緣信息丟失甚少,對(duì)于后期圖像處理至關(guān)重要。乳腺腫瘤邊界的提取采用LevelSet方法,其中最關(guān)鍵的是速度函數(shù)的確定,不同速度函數(shù)導(dǎo)致不同的分割效果,不同圖像的目標(biāo)分割需要的速度函數(shù)也不盡相同。本實(shí)驗(yàn)首先設(shè)定腫瘤的初始輪廓,然后測(cè)試了GAC以及閾值水平集方法在腫瘤自動(dòng)分割中的效果。然而GAC方法的實(shí)驗(yàn)參數(shù)較難控制,容易出現(xiàn)分割泄露,分割效果不佳;相對(duì)而言,閾值水平集分割只需要通過(guò)Ostu方法找到閾值,通過(guò)小范圍的偏移就可以獲得與手動(dòng)勾邊相似的輪廓,大幅度改善了GAC的分割效果。自動(dòng)提取腫瘤邊界為后續(xù)腫瘤良惡性的判斷打下了重要基礎(chǔ),也正朝著解放醫(yī)師讀片工作、自動(dòng)診斷腫瘤的方向上前進(jìn)。

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