朱柄銘, 陳文璟, 蘇運(yùn)欽, 溫旺榮
(暨南大學(xué)附屬第一醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心,廣東廣州510632)
糖尿病腎病是糖尿病重要的微血管病變之一,終末期患者5年存活率僅為20%[1],是I型糖尿病患者的主要死因;在II型糖尿病中其嚴(yán)重性僅次于心、腦血管疾?。?]。由于其呈漸進(jìn)式緩慢發(fā)展,起病隱匿,加之當(dāng)今診斷手段的局限性,不易早期診斷及治療,一旦確診,整個(gè)病程將無法逆轉(zhuǎn)。這就需要我們發(fā)現(xiàn)能早期對(duì)其進(jìn)行診斷的標(biāo)志物。研究證明microRNAs(miRNAs)在糖尿病及其并發(fā)癥中發(fā)揮重要作用,但研究都局限于動(dòng)物模型或者組織細(xì)胞,也有對(duì)血漿研究的報(bào)道,而缺乏對(duì)血清中相關(guān)miRNAs表達(dá)的研究。miRNAs能游離于細(xì)胞,穩(wěn)定存在于血清中,且血清miRNAs檢測(cè)具有創(chuàng)傷小、靈敏度和特異性高的特點(diǎn)[3-4],這就為糖尿病腎病的分子診斷,尤其對(duì)早期臨床癥狀、體征不明顯的患者提供了早期診斷與預(yù)測(cè)的可能。
2012/04~2013/05暨南大學(xué)附屬第一醫(yī)院收治的門診、住院病人以及健康體檢者125例,其中符合WHO糖尿病專家委員會(huì)提出的糖尿病診斷標(biāo)準(zhǔn)且尿微量白蛋白(urinary microalbumin,UmAlb)在正常參考范圍 (<14.29 mg/L)的25例II型糖尿病患者為糖尿病A(diabetes mellitus A,DMA)組,平均年齡(58.28±9.02)歲,男13例,女12例;符合II型糖尿病診斷,且UmAlb超出正常參考范圍(>14.29 mg/L),同時(shí)其腎臟檢驗(yàn)學(xué)及影像學(xué)檢測(cè)指標(biāo)均無異常的25例患者為糖尿病B(diabetes mellitus B,DMB)組,平均年齡(59.64±10.19)歲,男15例,女10例;經(jīng)腎臟檢驗(yàn)學(xué)、影像學(xué)以及病理學(xué)活檢確診的25例糖尿病腎病患者為糖尿病腎病(diabetic nephropathy,DN)組,平均年齡(60.28±8.89)歲,男16例,女9例;由糖尿病腎病引發(fā)且符合美國(guó)腎臟病基金會(huì)K/DOQI專家組對(duì)慢性腎臟疾病(chronic kidney disease,CKD)分期建議中的CKD5期,且出現(xiàn)尿毒癥癥狀的25例患者為尿毒癥(uraemia,UM)組,平均年齡(61.84±9.56)歲,男12例,女13例;25例性別、年齡相匹配的健康體檢者設(shè)為正常對(duì)照(normal control,NC)組,平均年齡(57.00 ±9.36)歲,男14 例,女11例,其腎臟檢驗(yàn)學(xué)和影像學(xué)檢測(cè)指標(biāo)均未見異常且無任何糖尿病病史。
TRNzol-A+和RNase-Free ddH2O購自北京Tiangen;氯仿、異丙醇和無水乙醇購自廣州達(dá)暉生物技術(shù)有限公司;逆轉(zhuǎn)錄5×Buffer和dNTP購自Invitrogen;MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶購自中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司;血清miRNA實(shí)時(shí)定量PCR試劑盒HairpinitTMmiRNAs qPCR Quantitation Kit、線蟲 miRNA CelmiR-39的雙鏈mimics及Hsa-miR-21和Cel-miR-39逆轉(zhuǎn)錄引物購自上海GenePharm;中國(guó)科技大學(xué)中佳公司KDC-160HR高速冷凍離心機(jī);ESCO生物安全柜 (II級(jí)B2型);Eppendorf公司生產(chǎn)的Biophotomet生物分光光度計(jì)及加樣槍;Applied Biosystems公司生產(chǎn)的ABI7000型定量PCR儀。
3.1 血清制備 用真空無抗凝管抽取實(shí)驗(yàn)對(duì)象3~4 mL外周靜脈血,常溫下待血液凝固,1 h內(nèi)進(jìn)行處理。血標(biāo)本在3 500 r/min下離心10 min,轉(zhuǎn)移上層血清至1.5 mL Eppendorf管,-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>
3.2 總RNA抽提 冷藏血清樣本置冰上融化后,充分混勻,吸取200μL加入3倍體積TRNzol-A+中,于振蕩器上充分混勻,勻漿在室溫靜置5 min,使核酸蛋白復(fù)合物完全分離。為控制提取過程中樣本間的差異,在靜置結(jié)束后,向每份勻漿樣本中加入人工合成的20μmol/L線蟲Cel-mirR-39 mimics 4μL作為外源性內(nèi)參照,充分混勻,用于提取、逆轉(zhuǎn)錄及后續(xù)定量檢測(cè)全過程。4℃、12 000 r/min離心10 min,取上清。加入120 mL氯仿,劇烈漩渦混勻15 s,室溫靜置3 min。4℃、12 000 r/min離心12 min。將離心得到的水相(約400μL)轉(zhuǎn)移至新的 Eppendorf管中,再加入等體積異丙醇,混勻,室溫靜置25 min。4℃、12 000 r/min離心 10 min,去上清。用 RNase-Free ddH2O與無水乙醇配制的1 mL 75%乙醇洗滌沉淀,4℃、5 000 r/min離心3 min。吸凈上清,室溫晾干約2~3 min,加入30μL RNase-Free ddH2O,吹打混勻,充分溶解 RNA。A260/A280為 1.8~2.1,取RNA濃度為25~50 ng/L進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)。
3.3 引物設(shè)計(jì)與合成 miRBASE數(shù)據(jù)庫(http://www.Mirbase.org/)提供有成熟的 Has-miR-21 和Cel-miR-39序列,見表1,由上海GenePharm公司根據(jù)表1中的序列設(shè)計(jì)特異性莖環(huán)結(jié)構(gòu)(stem-loop)逆轉(zhuǎn)錄引物、PCR擴(kuò)增引物以及 Cel-miR-39雙鏈mimics,見表 2。
表1 Has-miR-21和Cel-miR-39雙鏈mimics的序列Table 1.Sequences for Has-miR-21 and Cel-miR-39 double-stranded mimics
表2 用于擴(kuò)增Has-miR-21和Cel-miR-39的實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物Table 2.Real-time fluorescence quantitative PCR primers for amplification of miR-21and Cel-miR-39
3.4 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng) 20μL體系包括5×buffer 4μL,dNTP(10 mmol/L)0.75μL,逆轉(zhuǎn)錄引物(1 mol/μL)1.20μL,MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶(2 ×108U/L)0.2 μL,總RNA樣本5μL,剩余體積用 RNase-Free ddH2O補(bǔ)足。反應(yīng)設(shè)1個(gè)復(fù)孔,反應(yīng)條件:16℃ 30 min,42℃ 30 min,85 ℃ 5 min。
3.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 20μL體系包括2×real time PCR buffer 10 μL(內(nèi)含 3 mmol/L Mg2+,0.2 mmol/L dNTP和SYBR Green I熒光染料),正、反向特異引物套裝(5 mol/μL)0.32μL,Taq DNA聚合酶(5×106U/L)0.2 μL,cDNA 模板2 μL,剩余體積用RNase-Free ddH2O補(bǔ)足。反應(yīng)設(shè)1個(gè)復(fù)孔,反應(yīng)條件:95℃ 3 min;95℃12 s,62℃ 50 s,40個(gè)循環(huán)。
3.6 血清miR-21表達(dá)量 相對(duì)表達(dá)量用2-ΔΔCt表示,-ΔΔCt= -[(標(biāo)本 Cttarget-標(biāo)本 CtCel-miR-39)-(對(duì)照Cttarget-對(duì)照 CtCel-miR-39)],以正常對(duì)照組中miR-21的Ct值為對(duì)照。
3.7 ROC(receiver operating characteristic)曲線 使用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件以敏感性為縱坐標(biāo),(1-特異性)為橫坐標(biāo)作圖,繪制ROC曲線。通過ROC曲線下面積(area under the curve,AUC)大小判斷血清miR-21的診斷效果,其面積一般在0.5~1.0之間。AUC≤0.7時(shí)表示診斷價(jià)值較低;0.7<AUC≤0.9時(shí)表示診斷價(jià)值中等;AUC>0.9時(shí)表示診斷價(jià)值較高;AUC接近0.5時(shí),即ROC曲線接近對(duì)角線,則診斷試驗(yàn)失去臨床意義。
利用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。相對(duì)表達(dá)量成偏態(tài)分布且方差不齊,將2-ΔΔCt進(jìn)行對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換,經(jīng)K-S檢驗(yàn)和Levene檢驗(yàn),數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布且具方差齊性(均P>0.05)。利用單因素方差分析(Oneway ANOVA檢驗(yàn))進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,多變量間兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn)。選用Pearson和Spearman相關(guān)分析檢測(cè)血清miR-21表達(dá)水平與其它臨床指標(biāo)的關(guān)系。根據(jù)血清中miR-21的相對(duì)表達(dá)量建立logistic回歸模型,繪制ROC曲線評(píng)價(jià)血清miR-21的診斷效能。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
miR-21熔解曲線約在(77.5±0.7)℃ 呈現(xiàn)單峰;Cel-miR-39熔解曲線約在(82.4±0.6)℃呈現(xiàn)單峰,且均無引物二聚體與其它非特異雜峰存在,陽性反應(yīng)的峰可與陰性、空白對(duì)照明顯區(qū)分開,表明PCR反應(yīng)參數(shù)合適,擴(kuò)增目標(biāo)產(chǎn)物特異性較好。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證,可見80 bp左右單一條帶,見圖1。
Figure 1.Serum miR-21 PCR product electrophoresis for each group.1:20 bp marker;2:normal control;3:diabetes mellitus A patients;4:diabetes mellitus B patients;5:diabetic nephropathy patients;6:uremia patients;7:negative control.圖1 各組血清中miR-21擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
各組血清樣本中miR-21及Cel-miR-39的擴(kuò)增反應(yīng)曲線呈標(biāo)準(zhǔn)S型,陰性對(duì)照產(chǎn)生微弱非特異信號(hào)呈不規(guī)則曲線,空白對(duì)照無擴(kuò)增曲線,見圖2。
Figure 2.The amplification curves of real-time fluorescence quantitative PCR for serum miR-21 and exogenous internal reference CelmiR-39 in each group.A~E:Cel-miR-39 curves;F:miR-21 curve of diabetes mellitus A patients;G:miR-21 curve of normal control;H:miR-21 curve of diabetes mellitus B patients;I:miR-21 curve of diabetic nephropathy;J:miR-21 curve of uraemia;K:miR-21 curve of negative control;L:Cel-miR-39 curve of negative control;M:miR-21 curve of blank control;N:Cel-miR-39 curve of blank control.圖2 各組血清中miR-21及外源性內(nèi)參Cel-miR-39的實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增曲線
經(jīng)單因素方差分析,比較5組間的相對(duì)表達(dá)量有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=81.92,P<0.01),進(jìn)一步使用LSD-t檢驗(yàn)做兩兩比較,正常對(duì)照組血清miRNAs水平顯著低于糖尿病A組,顯著高于其它3組(4組均P<0.01);糖尿病A組的血清miRNAs水平顯著高于糖尿病B組、糖尿病腎病組以及尿毒癥組(3組均P<0.01);糖尿病腎病組血清miRNAs水平顯著高于尿毒癥組,顯著低于糖尿病B組(2組均P<0.01),見圖3。
血清miR-21水平與糖尿病腎病組患者年齡、性別、血清肌酐(serum creatinine,SCr)、血尿素氮(blood urea nitrogen,BUN)、空腹血糖(fasting blood glucose,F(xiàn)BG)、糖化血紅蛋白(glycosylated hemoglobin A1c,HbA1c)、尿蛋白 (urinary microprotein,UMTP)以及尿肌酐(urinary creatinine,UCr)無相關(guān)性,但與胱抑素 C(cystatin C,CysC)、UmAlb、Um-Alb/UCr比值呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.01,P<0.05,P <0.05),見表3。
Figure 3.The serum miR-21 expression level in each group.NC:normal control;DMA:diabetes mellitus A patients;DMB:diabetes mellitus B patients;DN:diabetic nephropathy patients;NM:uremia patients.n=25.**P <0.01 vs NC;##P < 0.01 vs DMA;△△P <0.01 vs DN.圖3 各組血清中miR-21表達(dá)量
5.1 ROC曲線下面積 根據(jù)建立的Logistic回歸模型計(jì)算血清miR-21的ROC曲線下面積,在DN組+NC組、DN組+DMA組、DN組+DMB組、DN組 +DMA組 +NC組、DN組 +DMB組 +NC組、DN組+DMA組+DMB組、DN組+DMA組+DMB組+NC組,7組人群中診斷糖尿病腎病的AUC分別為0.848(95%CI:0.737~0.959)、0.896(95%CI:0.812~0.980)、0.782(95%CI:0.641 ~0.922)、0.838(95%CI:0.743 ~0.933)、0.796(95%CI:0.675~0.917)、0.808(95%CI:0.704 ~0.911)和0.845(95%CI:0.752~0.939),見圖4。
表3 血清miR-21水平與糖尿病腎病患者臨床指標(biāo)的關(guān)系Table 3.The association between miR-21 level and clinical parameters in patients with diabetic nephropathy(Mean±SD)
Figure 4.The ROC curves of serum miR-21 in different groups for the diagnosis of diabetic nephropathy.圖4 不同組群血清中miR-21診斷糖尿病腎病的ROC曲線
5.2 診斷效能 根據(jù)不同組群血清中miR-21的相對(duì)表達(dá)量建立的logistic回歸模型,血清miR-21在鑒別DN組與NC組、DMA組、DMB組的敏感性和特異性分別為 80.0%和 72.0%、72.0%和 88.0%、72.0%和 84.0%,準(zhǔn)確性分別為 76.0%、80.0%和78.0%;在鑒別DN組與DMA組+NC組、DMB組+NC組、DMA組+DMB組的敏感性和特異性分別為76.0% 和 77.0%、76.0% 和 82.0%、70.0% 和86.0%,準(zhǔn)確性分別為 76.5%、79.0% 和 78.0%;在DN組+DMA組+DMB組+NC組中診斷糖尿病腎病的的敏感性和特異性分別為76.0%和77.3%,準(zhǔn)確性為76.7%。各組群的Youden指數(shù)(Youden index,YI)介于0~1之間,表明診斷試驗(yàn)真實(shí)性較好,見表4。
miRNAs是一類長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈小分子RNA,通過轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)物對(duì)mRNA的調(diào)節(jié)參與到基因表達(dá)的調(diào)控[5],Calin等[6]研究發(fā)現(xiàn),定位于腫瘤相關(guān)基因組區(qū)域的miRNA達(dá)50%以上,可能具有原癌或抑癌基因的功能,與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。越來越多的研究發(fā)現(xiàn)miRNAs表達(dá)異常也參與糖尿病及其并發(fā)癥等疾病的發(fā)生發(fā)展[7-11]。具有癌基因特征的miR-21已在多種腫瘤疾病中得以深入研究,最近在糖尿病腎病研究領(lǐng)域也開始引發(fā)關(guān)注[12-14],但目前研究多集中于miR-21在糖尿病腎病動(dòng)物模型或組織細(xì)胞中的調(diào)控機(jī)制與表達(dá)特點(diǎn),本文首次涉及到血清miR-21的表達(dá)研究。雖然曾健英等[15]報(bào)道3種血清微小RNA檢測(cè)在糖尿病腎病中的作用,但其全血中添加了依地酸二鈉(EDTA-Na2)進(jìn)行抗凝,實(shí)驗(yàn)樣本已不是血清而是血漿。
表4 血清miR-21對(duì)不同組群中糖尿病腎病的診斷效能Table 4.Serum miR-21 diagnostic efficacy for diabetic nephropathy in different groups(%)
本研究用于檢測(cè)血清miR-21表達(dá)量的實(shí)時(shí)熒光定量PCR,需要利用合適的內(nèi)參來消除RNA提取時(shí)樣品間的差異,因此,內(nèi)參的穩(wěn)定性決定著檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。目前多數(shù)研究選用的內(nèi)參都源自血清本身所含有的miRNAs、snRNA及管家基因等經(jīng)典內(nèi)參[17],而這些內(nèi)參在血清中的來源尚不明了,含量也遠(yuǎn)不及組織細(xì)胞,甚至在不同的疾病狀態(tài)下表達(dá)量還可發(fā)生變化[16],給這些內(nèi)參在血清中的表達(dá)帶來了不確定性。人工合成的外源性miRNAs由于人體內(nèi)不曾有該種序列且不受體內(nèi)復(fù)雜環(huán)境的影響,以此作為內(nèi)參則能很好地解決上述缺陷。因此,本研究選用合成的外源性內(nèi)參Cel-miR-39[17-18]。
本研究發(fā)現(xiàn),miR-21在糖尿病腎病患者血清中的表達(dá)量顯著低于正常人以及糖尿病A、B組患者(3組均P<0.01),但卻顯著高于有尿毒癥癥狀的患者(P<0.01),血清miR-21的這一變化趨勢(shì)與Zhang等[19]在早期糖尿病腎病小鼠腎小球系膜細(xì)胞中的研究結(jié)果一致。血清miR-21的低表達(dá)與CysC、UmAlb、UmAlb/UCr比值有顯著負(fù)相關(guān)性,而與年齡、性別、SCr、BUN、FBG、HbA1c、UMTP 以及UCr沒有相關(guān)性,其中與UmAlb具有顯著負(fù)相關(guān)進(jìn)一步支持了Zhang等認(rèn)為miR-21高表達(dá)可降低尿蛋白排泄率、是糖尿病腎病保護(hù)因素的觀點(diǎn)。Logistic回歸及ROC曲線分析表明血清miR-21在糖尿病腎病和正常組,糖尿病腎病和糖尿病A組,糖尿病腎病和糖尿病B組,糖尿病腎病和糖尿病A組及正常組,糖尿病腎病和糖尿病B組及正常組,糖尿病腎病和糖尿病A組及糖尿病B組,糖尿病腎病和糖尿病A組、糖尿病B組及正常組等7組人群中診斷糖尿病腎病具有較好的實(shí)用價(jià)值,且在7組人群中診斷糖尿病腎病的ROC-AUC、敏感性和特異性都較為理想,說明miR-21或可作為糖尿病腎病的潛在分子診斷指標(biāo)。另外值得注意的是,我們首次發(fā)現(xiàn)血清miR-21在糖尿病A組中較正常組顯著升高(P<0.01),一旦患者UmAlb超出正常,血清 miR-21的表達(dá)則開始迅速下降,隨著病情發(fā)展直到尿毒癥癥狀出現(xiàn),血清miR-21一直趨于降低。與此類似,Szeto等[20]認(rèn)為糖尿病腎病引起的CKD患者尿沉渣中miR-21表達(dá)量與腎小球?yàn)V過率呈正相關(guān),尿沉渣中有高含量miR-21的患者血透生存期較長(zhǎng),證明高表達(dá)的miR-21或許是糖尿病腎病的保護(hù)因素,同時(shí)還提示miR-21或可在糖尿病患者中預(yù)測(cè)糖尿病腎病的發(fā)生,對(duì)糖尿病腎病的早期診斷具有一定的提示作用,還可作為評(píng)估糖尿病腎病患者病情的一項(xiàng)潛在分子指標(biāo)。
就目前糖尿病腎病的診斷與治療現(xiàn)狀而言,如何提高糖尿病腎病早期診斷水平仍然是一個(gè)極具挑戰(zhàn)性的問題。近來的研究認(rèn)為在糖尿病腎病模型的腎臟組織、細(xì)胞中具有特異miRNAs表達(dá)譜的變化特征,雖然組織細(xì)胞中的miRNAs表達(dá)譜可能與糖尿病腎病的發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后相關(guān),但檢測(cè)手段繁雜、極具創(chuàng)傷性,不便于臨床診斷的開展。較之而言,外周循環(huán)中的血清有著應(yīng)用簡(jiǎn)便,創(chuàng)傷微小,利于推廣等優(yōu)勢(shì)。而且血清中miRNAs能經(jīng)受RNA酶降解,在煮沸、酸堿、反復(fù)凍融、長(zhǎng)期保存等嚴(yán)酷環(huán)境下仍可穩(wěn)定存在[21]。本研究采用SYBR Green I熒光定量 PCR檢測(cè)血清miR-21,操作快速、簡(jiǎn)單,且成本低廉,僅需200μL血清即可完成定量測(cè)定。我們的研究結(jié)果,提示了血清miR-21可能在糖尿病腎病診斷中起到重要作用,至于何種機(jī)制有待進(jìn)一步研究。有理由相信,隨著miRNAs在糖尿病腎病研究領(lǐng)域的廣泛深入,血清miRNAs應(yīng)用于診斷糖尿病腎病可提高對(duì)其的診治水平,改善預(yù)后。