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        新疆沙灣牛病毒性腹瀉病毒基因2型毒株的分離鑒定

        2013-11-23 06:52:42王國(guó)超王滬生孟慶玲劉昱成楊海波賀志昊陳創(chuàng)夫
        中國(guó)獸醫(yī)雜志 2013年10期
        關(guān)鍵詞:新疆檢測(cè)

        王國(guó)超,王滬生,喬 軍,孟慶玲,劉昱成,楊海波,賀志昊,陳創(chuàng)夫

        (1.石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,新疆 石河子832003;2.新疆沙灣縣獸醫(yī)站,新疆 沙灣832002)

        牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)屬黃病毒科(Flaviviridae)瘟病毒屬 (Pestivirus)成員,屬內(nèi)同時(shí)還包括豬瘟病毒(CSFV)、綿羊邊界病病毒(BDV)。BVDV主要引起牛的以發(fā)熱、黏膜糜爛潰瘍、白細(xì)胞減少、腹瀉、咳嗽及懷孕母牛流產(chǎn)或產(chǎn)出畸形胎兒為主要特征的一種傳染病。目前,該病在全球范圍內(nèi)廣泛流行,在養(yǎng)牛業(yè)發(fā)達(dá)的國(guó)家更為嚴(yán)重。新生牛的持續(xù)性感染常年帶毒、排毒,是畜群中主要的傳染源。當(dāng)持續(xù)感染動(dòng)物再次感染抗原性相關(guān)的BVDV時(shí)可會(huì)引起致死性的黏膜?。?]。同時(shí),BVDV還是牛源生物制品(血清、凍精、胚胎、疫苗等)的潛在污染源,給畜牧業(yè)生產(chǎn)和相關(guān)產(chǎn)業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[2-3]。

        BVDV基因組為單股正鏈RNA分子,長(zhǎng)度約為12.3kb,5′端無(wú)“帽子”結(jié)構(gòu),3′端無(wú)Poly(A)“尾巴”結(jié)構(gòu),病毒基因組由 5′-UTR、開(kāi)放閱讀框(ORF)和3′-UTR組成[4]。5′-UTR 序列在 BVDV基因組中有較高的保守性,利用此特性可對(duì)BVDV的感染進(jìn)行分子診斷和病原基因分型。目前通常認(rèn)為,根據(jù)其5′-UTR是否存在Pst1位點(diǎn)BVDV可分為兩種基因型,即BVDV-1和BVDV-2,不同的基因型在抗原性上存在較大差異[4]。根據(jù)其接種細(xì)胞后是否產(chǎn)生細(xì)胞病變(CPE),又可以將其分為兩種生物型,即致細(xì)胞病變型(CP)和非致細(xì)胞病變型(NCP),每種基因型同時(shí)存在這兩種生物型,兩種生物型在毒力和致病性方面沒(méi)有明顯差別[5]。為了了解在新疆是否同時(shí)存在BVDV-1和BVDV-2的感染,本研究對(duì)2012年采集沙灣縣某牛場(chǎng)疑似BVDV感染牛的病料進(jìn)行了BVDV的檢測(cè)和分離。

        1 材料與方法

        1.1 細(xì)胞、菌株、毒株及試劑 MDBK 細(xì)胞、BVDV NADL標(biāo)準(zhǔn)毒株,購(gòu)自中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所。宿主菌E.coli DH5α均由本實(shí)驗(yàn)室保存,pMD19-T載體、反轉(zhuǎn)錄酶 M-MLV及RNA抑制劑,購(gòu)自TaKaRa公司。1640高糖培養(yǎng)基、犢牛血清(經(jīng)過(guò)BVDV檢測(cè)陰性),購(gòu)自美國(guó)GIBCO公司;TRIzol Reagent,購(gòu)自Invitrogen公司;DNA回收試劑盒、DNA Marker、dNTP和Taq酶,購(gòu)自廣州東盛生物科技有限公司。

        1.2 病料采集 從新疆沙灣縣周邊某牛場(chǎng)采集臨床癥狀疑似BVDV感染牛的血液、糞便、腸黏膜、淋巴結(jié)、脾臟等病料15份,置于-80℃保存。

        1.3 引物設(shè)計(jì)及合成 根據(jù)已經(jīng)發(fā)表的BVDV 5′-UTR序列和E2基因序列選擇相對(duì)保守區(qū)域分別設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物,其中P1-P2用于篩查疑似病料是否為BVDV陽(yáng)性,P3-P4和P5-P6分別用于BVDV基因1型和基因2型E2基因的擴(kuò)增。引物及測(cè)序服務(wù)由北京華大基因公司完成。P1:5′-CCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACT-3′;P2:5′-GGAACTCCATGTGCCATGTACA-3′。E2基因引 物 P3:5′-GGGCCAGCCTTCCAGATGGT-3′;P4:5′-TCCCCCTTTAACATGTATTG-3′。 P5:5′-GGGCCAGCCTTCCAGATGGT 3′;P6:5′-TCCCCCTTTAACATGTATTG-3′。

        1.4 RT-PCR擴(kuò)增及5′-UTR的克隆 參照 TRIzol說(shuō)明操作提取病料總RNA,以提取的RNA為模板進(jìn)行RT反應(yīng),再以RT產(chǎn)物為模板進(jìn)行5′-UTR PCR檢測(cè)。RT反應(yīng)采用20μL反應(yīng)體系:M-MLV 5 ×Buffer 5μL,dNTP(2.5μmol/L)4 μL,下游引物(20pm)1μL,RNase inhibition 1μL,M-MLV reverse enzyme 1μL,RNA-free Water 8 μL,20μL體系,混勻37℃反轉(zhuǎn)錄1h。以RT產(chǎn)物為模板,采用50μL反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增:10×Buffer 5μL,cDNA 5μL,上游引物1μL,下游引物1μL,Taq酶0.5μL,H2O 33.5μL。PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min;94℃變性50s,58℃退火40s,72℃延伸30s,40個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。將PCR擴(kuò)增用DNA凝膠回收試劑盒回收后與載體pMD19-T連接,通過(guò)PCR和酶切進(jìn)一步篩選驗(yàn)證陽(yáng)性克隆。將鑒定正確的重組載體送北京華大基因公司測(cè)序;用DNAMAN軟件對(duì)測(cè)序進(jìn)行分析。

        1.5 病毒的分離鑒定

        1.5.1 樣品的處理 對(duì)于RT-PCR檢測(cè)陽(yáng)性的組織病料,加入4體積的PBS緩沖液研磨,以12 000 r/min(4℃)離心15min。吸取上清液,按0.1%體積加入雙抗,混勻在4℃作用過(guò)夜,12 000r/min(4℃)離心15min吸取上清,0.22μm濾膜過(guò)濾,-80℃保存用于病毒的分離。對(duì)于RT-PCR檢測(cè)陽(yáng)性的血液樣品用淋巴細(xì)胞分離液無(wú)菌分離外周血單核細(xì)胞(PBMC),吸取后置于1640培養(yǎng)液中待用。

        1.5.2 病毒分離 將長(zhǎng)成單層的MDBK細(xì)胞用PBS沖洗3遍,將處理好的病料上清液或PBMC接種MDBK單層細(xì)胞,置于37℃、5%CO2吸附2h,然后加入1640細(xì)胞維持液(含2%犢牛血清),每日觀察細(xì)胞3次,同時(shí)設(shè)立正常細(xì)胞和接種NADL毒株細(xì)胞作對(duì)照。連續(xù)盲傳5代,觀察是否出現(xiàn)細(xì)胞病變(CPE)。待出現(xiàn)CPE時(shí),反復(fù)凍融3次后,培養(yǎng)液用2%磷鎢酸負(fù)染后電鏡觀察。

        1.5.3 BVDV-SW 分離株 E2基因的擴(kuò)增、克隆、遺傳進(jìn)化分析 用TRIzol提取BVDV-SW 株總RNA,分別用BVDV基因1型和基因2型E2基因特異性引物P3-P4和P5-P6進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)條件均為:95℃預(yù)變性4min;94℃變性40s,52℃退火50s,72℃延伸90s,40個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。將擴(kuò)增出來(lái)的目的片段回收后與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)化克隆后挑取單菌落,做菌液PCR篩選,篩選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行測(cè)序分析。用MEGA5.0軟件(Phylogeny/Bootstrap test of phylogeny/neighbor-joining,Bootstrap 重 復(fù) 次 數(shù) 為1 000次)構(gòu)建E2基因的遺傳進(jìn)化樹。

        2 結(jié)果

        2.1 病料檢測(cè)結(jié)果 利用5′-UTR引物對(duì)15份病料進(jìn)行RT-PCR檢測(cè),結(jié)果有4份樣品(其中2份為糞便樣品,2份為血液樣品)擴(kuò)增出與預(yù)期值相符的293bp的目的片段(圖1)。目的片段克隆入T載體后,用PCR方法篩選重組菌(圖2)并進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果從樣品擴(kuò)增出的5′-UTR 與 BVDV-2 5′-UTR同源性為99.2%,證實(shí)疑似病料確實(shí)屬于BVDV感染。

        圖1 5′UTR PCR擴(kuò)增

        圖2 陽(yáng)性重組菌液的PCR鑒定

        2.2 病毒分離結(jié)果 當(dāng)盲傳傳至第4代時(shí),MDBK出現(xiàn)規(guī)律性的細(xì)胞病變(CPE)(圖3),主要表現(xiàn)為:梭狀或三角狀細(xì)胞開(kāi)始變圓,部分細(xì)胞開(kāi)始脫落,漂浮在維持液中;在瓶壁上呈現(xiàn)拉網(wǎng)狀,胞漿中出現(xiàn)大小不等的空泡,細(xì)胞碎片漂浮在液面上。在產(chǎn)生細(xì)胞病變的培養(yǎng)液負(fù)染后電鏡觀察到球形、有囊膜、直徑約為50~60nm、囊膜表面有突起的病毒粒子,形態(tài)結(jié)構(gòu)與BVDV顆粒相符(分離株命名為BVDV-SW)。

        圖3 BVDV-SW分離株在MDBK細(xì)胞上引起的細(xì)胞病變

        2.3 BVDV-SW分離毒株E2基因的擴(kuò)增、克隆與序列分析 測(cè)序結(jié)果分析顯示,BVDV-SW分離株E2基因與NADL(屬于BVDV-1)參考株的同源性為67.05%,與BVDV890、XJ-04參考株同源性分別為82.36%和84.36%,經(jīng)過(guò)Nucleotide blast分析后,與BVDV-2型同源性比較高,屬于BVDV-2型。

        圖4 E2基因PCR擴(kuò)增

        2.4 BVDV E2基因系統(tǒng)進(jìn)化分析 將分離株BVDV-SW的E2蛋白基因與GenBank發(fā)表的BVDV基因1型標(biāo)準(zhǔn)毒株和基因2型標(biāo)準(zhǔn)毒株及其他參考毒株進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析(圖6),結(jié)果顯示:進(jìn)化樹明顯分成兩個(gè)分支,分離株BVDV-SW 和17237(BVDV-2型,分離于歐洲)聚為一個(gè)小分支,與C24V、NADL(均屬于BVDV-1型)標(biāo)準(zhǔn)株的親緣關(guān)系均較遠(yuǎn);BVDV-SW與XJ-04毒株關(guān)系較近,同源率較高。

        圖5 E2基因重組菌液的PCR鑒定

        圖6 基于BVDV E2基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析

        3 討論與小結(jié)

        近年來(lái),隨著新疆畜牧業(yè)的快速發(fā)展,BVDV在動(dòng)物血清中陽(yáng)性率較高。王治才等對(duì)新疆7個(gè)地區(qū)羔羊作了BVDV的感染調(diào)查,平均陽(yáng)性率為73.6%[6]。鐘發(fā)剛等通過(guò)對(duì)2006年~2008年新疆7個(gè)地區(qū)15個(gè)牛場(chǎng)472份全血樣品進(jìn)行了RTPCR檢測(cè),發(fā)現(xiàn)42%的樣品為陽(yáng)性[7],證實(shí)該病在新疆牛羊中廣泛流行。為了科學(xué)防控本病,目前有必要開(kāi)展該病的分子流行病學(xué)調(diào)查和病原的分離鑒定研究。

        用于BVDV的分離的病料可采用疑似BVDV感染牛的血液、糞便、腸黏膜、淋巴結(jié)和脾臟等[8]。本研究發(fā)現(xiàn),采用發(fā)病牛血液從中分離出外周血單核細(xì)胞(PBMC)較易分離出BVDV。在發(fā)病牛糞便中雖然可以檢測(cè)到大量的病毒粒子,但由于糞便中存在有毒物質(zhì),會(huì)影響細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu),易造成CPE假象,所以糞便樣品適合作為RT-PCR檢測(cè)對(duì)象而不適合作為分離病毒的材料。另外,有研究證實(shí)牛源細(xì)胞、血清及其相關(guān)制品、凍精本身存在BVDV污染,因此在分離BVDV時(shí)要先檢測(cè)分離所用的細(xì)胞和血清本身是否存在BVDV污染[9]。

        現(xiàn)有的研究資料顯示,目前國(guó)內(nèi)分離鑒定的毒株以BVDV-1占優(yōu)勢(shì)地位,BVDV-2流行較少,而BVDV-2主要流行于南美、北美以及一些歐洲國(guó)家。然而隨著國(guó)際畜禽貿(mào)易活動(dòng)的增加,近幾年亞洲國(guó)家也分離到了一些 BVDV-2流行毒株[10-12],我國(guó)也有分離到 BVDV-2毒株的報(bào)道[13-14]。鐘發(fā)剛等通過(guò)對(duì)新疆7個(gè)地區(qū)472份全血樣品中RT-PCR檢測(cè)為陽(yáng)性的24份樣品擴(kuò)增出的5′-UTR測(cè)序比較發(fā)現(xiàn),BVDV流行株基因型主要為BVDV-1b(18份)和BVDV-1c(6份),而沒(méi)有檢測(cè)到BVDV-2的感染[7]。然而,本研究證實(shí)目前在新疆某些奶牛場(chǎng)牛群中存在BVDV-2感染,并且流行毒株具有較強(qiáng)的致病力,推測(cè)這可能與近幾年日益頻繁的國(guó)內(nèi)外畜禽貿(mào)易活動(dòng)有關(guān)。本研究為新疆奶牛BVDV的科學(xué)防控提供了一定的理論依據(jù)。

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