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        深圳市漢族人群轉(zhuǎn)化生長因子β1基因位點多態(tài)性與結(jié)核病的相關(guān)性研究

        2013-11-16 10:17:06宋英健王正張國良李巍張明霞陳心春楊林
        中國防癆雜志 2013年1期
        關(guān)鍵詞:胸膜炎結(jié)核性等位基因

        宋英健 王正 張國良 李巍 張明霞 陳心春 楊林

        結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的一種世界性的傳染病,感染范圍波及全球1/3的人群,但感染者中只有10%發(fā)展為有癥狀的活動性結(jié)核病,這說明活動性結(jié)核病患者對結(jié)核病的易感因素有別于健康人。而在活動性結(jié)核病患者中臨床表現(xiàn)的差異也在一定程度上表明結(jié)核病患者之間的易感因素存在差別[1]。結(jié)核病在不同人種之間的差異性和雙胞胎之間關(guān)聯(lián)性都說明除環(huán)境和暴露因素外,宿主遺傳因素對結(jié)核病發(fā)生發(fā)展也起到了不可忽視的作用,因此針對結(jié)核病易感基因的研究已成為近年研究的熱點[2-3]。眾所周知,細胞免疫在結(jié)核病免疫反應(yīng)中起著重要作用。而轉(zhuǎn)化生長因子β1(transforming growth factorβ1,TGFβ1)作為一個多功能的細胞因子,可以干擾細胞免疫對于結(jié)核病的應(yīng)答[4]。而且由于TGFβ1可以促進細胞外基質(zhì)合成,導(dǎo)致組織纖維化[5],其與結(jié)核性胸膜炎也有密切的關(guān)系,其中宿主遺傳學(xué)因素可能起著重要的作用。

        國外研究也表明,在伊朗人群中TGFβ1單核苷酸多態(tài)性 (single nucleotide polymorphisms,SNP)位點rs1800470與結(jié)核病的發(fā)生具有相關(guān)性[6]。但是有關(guān)TGFβ1位點與深圳市漢族人群結(jié)核病相關(guān)性研究未見報道。本研究選取的位點rs4803455,其作為標簽SNP(tag SNP,tSNP),不僅攜帶大量SNP信息,而且與動脈粥樣硬化有密切的關(guān)系[7]。國外報道稱,動脈粥樣硬化和結(jié)核病發(fā)病機制和表現(xiàn)具有相似性,其均為慢性起病,并影響巨噬細胞作用,逃避免疫反應(yīng),均形成壞死灶(粥樣硬化斑塊和干酪樣壞死)[8]。所以,筆者利用TaqMan-PCR技術(shù)分析探討廣東省深圳市漢族人群中TGFβ1基因tSNP(rs4803455)位點與結(jié)核病的關(guān)系,尋找TGFβ1(rs4803455)位點基因多態(tài)性與結(jié)核病、特別是結(jié)核性胸膜炎的相關(guān)性。

        資料和方法

        一、研究對象

        選取深圳市人民醫(yī)院和深圳市第三人民醫(yī)院2008年12月至2010年11月收治的深圳市漢族結(jié)核病患者。結(jié)核病組總共373例。所有結(jié)核病患者的診斷均通過其臨床表現(xiàn)、影像學(xué)診斷、病原學(xué)診斷的結(jié)果(根據(jù)中華醫(yī)學(xué)會結(jié)核病學(xué)分會制定的《肺結(jié)核診斷和治療指南》)[9]確診。肺結(jié)核組111例,均根據(jù)痰、肺部手術(shù)、肺活檢組織經(jīng)細菌學(xué)或病理學(xué)結(jié)果確診(痰培養(yǎng)陽性26例,痰涂片陽性56例,肺部手術(shù)或肺活檢組織病理學(xué)檢測為結(jié)核29例)。結(jié)核性胸膜炎患者組57例,根據(jù)引流后的胸腔積液、胸膜活檢組織經(jīng)細菌學(xué)或病理學(xué)診斷結(jié)果確診(胸腔積液確診13例,胸膜活檢組織確診44例)。其他205例結(jié)核病患者臨床確診。對照組為健康體檢和義務(wù)獻血者,共350名。排除標準:合并支氣管哮喘、肺炎、塵肺、糖尿病、腫瘤、動脈硬化等慢性疾病,合并HIV感染、器官移植、使用腎上腺皮質(zhì)激素及其他免疫抑制劑等。所有入選對象均為HIV陰性。其中結(jié)核組中男251例,女122例,年齡(35.9±33.6)歲。對照組中男138名,女212名,年齡(34.8±30.3)歲。肺結(jié)核組中男78例,女33例,年齡(38.0±29.3)歲。結(jié)核性胸膜炎組中男39例,女18例,年齡范圍(34.9±32.4)歲。

        二、檢測方法

        (一)血液標本的采集和DNA的提取、純化及保存

        采集研究對象外周靜脈血1.5ml。采用肝素鋰抗凝后利用血液DNA提取試劑盒(Qiagen,德國)從外周血中提取DNA并純化,取DNA樣本1μl,用分光光度計NanoDrop(Thermo Fisher Scientific,美國)測定DNA純度和濃度。若A260/A280>1.8,A260/A230>2.0,則 DNA 純度合格,純化的DNA經(jīng)瓊脂糖水平電泳儀(上海領(lǐng)成生物科技有限公司)電泳驗證其質(zhì)量,并標化濃度值為5ng/μl,-20℃保存。

        (二)DNA等位基因檢測分析

        1.位點SNP分型:選取上述研究對象所提取的合格DNA樣本,利用TaqMan-PCR技術(shù)檢測rs4803455位點基因類型。其TaqMan探針和引物來自于美國AB公司成品的TaqMan試劑盒(Assay ID:C_30031638_10)。TaqMan探針實驗反應(yīng)體系為10μl,其中通用PCR混合液(2×TaqMan Genotyping Master Mix)5.0μl,引物與探針混合液(40×TaqMan SNP Genotyping Assay Mix)0.25μl,DNA(50ng/μl)1.0μl,然后加入重蒸水(ddH2O)至10μl。實驗過程為讀取擴增前熒光信號、生成擴增數(shù)據(jù)、讀取擴增后的熒光信號。擴增的反應(yīng)條件為95℃10min;95℃15s,60℃1min,共40個循環(huán)[10]。

        2.結(jié)果判定:此SNP位點的等位基因A與等位基因C的探針分別采用綠色熒光素(greenfluorescent protein,VIC)和羧基熒光素(carboxyfluorescein,F(xiàn)AM)進行標記。樣本為等位基因A的純合子時,PCR擴增過程中僅能檢測到VIC熒光;樣本為等位基因C的純合子時,PCR擴增過程中僅能檢測到FAM熒光;樣本為雜合子時,PCR擴增過程中可同時檢測到FAM和VIC兩種熒光。

        3.結(jié)果分析及處理:計算各組等位基因頻率,確定是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。各組等位基因頻率差異采用χ2檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)核病與TGF-β1等位基因的相關(guān)性通過計算比值比 (odds ratio,OR)和95%可信區(qū)間(95%confidence intervals,95%CI)來表示。統(tǒng)計學(xué)分析由SPSS 13.0統(tǒng)計學(xué)分析軟件處理。

        結(jié) 果

        一、等位基因分型結(jié)果

        采用TaqMan探針技術(shù)檢測DNA樣本rs4803455等位基因類型,等位基因頻率和基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,說明檢測結(jié)果有代表性。

        其位點等位基因頻率結(jié)核組和對照組相比差異有統(tǒng)計學(xué)意義,結(jié)核組等位基因C的基因頻率(68.2%)高于對照組(59.4%)(表1)。

        二、分層分析

        1.性別分層:由于結(jié)核組中男性比例較對照組高,采用性別分層分析rs4803455位點等位基因頻率,結(jié)果顯示:兩組男性和女性之間差異均有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)核組等位基因C的基因頻率均高于對照組(表2)。

        2.年齡分層:根據(jù)既往研究[11]按照年齡分層發(fā)現(xiàn),rs4803455位點等位基因頻率在年齡≤25歲中差異無統(tǒng)計學(xué)意義,然而在年齡>25歲中差異有統(tǒng)計學(xué)意義。等位基因C在結(jié)核組中均高表達(表3)。

        3.臨床類型分層:由于TGFβ1與結(jié)核性胸膜炎具有相關(guān)性,根據(jù)臨床類型從結(jié)核病患者中挑選出有病理學(xué)或者細菌學(xué)證據(jù)的肺結(jié)核組和結(jié)核性胸膜炎組。分別與對照組進行統(tǒng)計學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)該位點等位基因頻率在對比分析中肺結(jié)核組、結(jié)核性胸膜炎與對照組之間差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(表4)。兩組等位基因C的基因頻率均高于對照組,在結(jié)核性胸膜炎組更加明顯。

        表1 結(jié)核組和對照組rs4803455等位基因頻率的對比

        表2 結(jié)核組和對照組中不同性別等位基因頻率的對比

        表3 結(jié)核組和對照組不同年齡組等位基因頻率的對比

        表4 肺結(jié)核組和結(jié)核性胸膜炎組與對照組等位基因頻率的對比

        討 論

        眾所周知,結(jié)核分枝桿菌侵入機體后,結(jié)核病的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸不僅取決于結(jié)核分枝桿菌的數(shù)量和毒力,很大程度上還取決于機體的免疫狀態(tài)??菇Y(jié)核免疫主要是通過細胞免疫,而大多數(shù)結(jié)核病患者都存在免疫功能紊亂、免疫力低下的現(xiàn)象[12]。TGFβ1是一類多功能細胞因子,在細胞免疫調(diào)節(jié)方面主要發(fā)揮免疫抑制作用[13]。文獻報道,能夠抑制T細胞特別是Th1的增殖,促進其凋亡[14]。其主要通過下調(diào)白細胞介素2(IL-2)介導(dǎo)的增殖信號來抑制有絲分裂,從而抑制T細胞增殖;對于已激活的T細胞,通過促進T細胞生長停滯、G1期細胞的積累,增加其對凋亡的敏感度。除此之外TGFβ1能夠下調(diào)干擾素-γ(IFN-γ)、腫瘤壞死因子-α(TNF-α)的產(chǎn)生和活性,降低中間產(chǎn)物活性氧的釋放,從而導(dǎo)致單核巨噬細胞失活[15]。而且國外研究也表明,免疫調(diào)節(jié)因子TGFβ1在結(jié)核病患者血清、巨噬細胞和肺泡灌洗液中表達升高,升高的TGFβ1與結(jié)核病復(fù)燃有密切的關(guān)系[2,16]。綜上所述,TGFβ1通過干擾Th1細胞應(yīng)答和巨噬細胞活化,抑制了炎癥反應(yīng),降低了機體的抗菌能力,從而降低了結(jié)核病患者的免疫功能,導(dǎo)致結(jié)核病的發(fā)生與發(fā)展。本實驗利用TaqMan-PCR檢測技術(shù),對廣東省深圳市漢族結(jié)核病患者和健康人TGFβ1基因rs4803455位點基因型進行檢測,尋找其與結(jié)核病的相關(guān)性。

        結(jié)果表明,rs4803455位點在結(jié)核組和對照組中差異有統(tǒng)計學(xué)意義,其中等位基因C在結(jié)核組頻率較對照組高,也明顯高于國外文獻報道,而對照組中等位基因C基因頻率與國外文獻報道相近[17]。提示其可能作為危險因素在結(jié)核病的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用。在性別分層分析中,男性、女性之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義。而在年齡分層中rs4803455位點等位基因頻率在年齡≤25歲組中差異無統(tǒng)計學(xué)意義,然而在年齡>25歲組差異有統(tǒng)計學(xué)意義。提示rs4803455位點基因型在年齡>25歲組預(yù)測作用更大,而年齡本身與基因類型無關(guān)。其差別可能是由于年齡作為一個獨立因素,可以影響機體免疫功能,從而影響TGFβ1免疫應(yīng)答造成。具體原因需要更多的實驗研究證實。

        Li等[18]的研究發(fā)現(xiàn),在結(jié)核性胸膜炎患者胸腔積液中TGF-β1和IL-10抑制結(jié)核保護性免疫細胞Th1細胞的活性,降低IFN-γ的分泌,導(dǎo)致機體免疫力下降。所以,本研究依據(jù)位點rs4803455檢測結(jié)果分別比較已通過細菌學(xué)或者病理學(xué)明確診斷的肺結(jié)核組、結(jié)核性胸膜炎組與對照組之間等位基因頻率的差異,尋找之間的差異。根據(jù)統(tǒng)計學(xué)分析,兩組之間差異均存在統(tǒng)計學(xué)意義,而且在結(jié)核性胸膜炎組中等位基因C為危險因素,其等位頻率明顯高于肺結(jié)核組。

        由于SNP位點間存在連鎖不平衡現(xiàn)象,相關(guān)聯(lián)SNP位點包含的遺傳信息相互重疊,具有冗余性,單個普通SNP位點又缺乏疾病代表性。而International HapMap Consortium[19]運用單體型分型的方法找出了約50萬個tSNP來代表整個人類基因圖譜之中的SNP集合,這些tSNP與表型間的關(guān)聯(lián)性更大。基因位點rs4803455作為tSNP位點代表大量的SNP信息,增加了SNP分型的有效性,對多基因疾病研究極其重要。國外文獻報道該位點位于TGF-β1內(nèi)含子區(qū)域,其與動脈粥樣硬化、近視眼發(fā)病均有密切的關(guān)系[7,20],其中等位基因C作為危險因素在患者組中均高表達,而且其與已報道跟結(jié)核病具有相關(guān)性的rs1800470位點存在連鎖不平衡現(xiàn)象,其中rs4803455等位基因C與rs1800470等位基因C具有明顯的正相關(guān)性[20]。而研究者已發(fā)現(xiàn)在rs1800470位點含有等位基因C的人群血漿中TGF-β1濃度明顯升高[21],從而也可以判斷在rs4803455位點含有等位基因C的人群中血漿中TGF-β1濃度也存在升高現(xiàn)象。這可能是rs4803455位點等位基因C攜帶者更易引起結(jié)核病患者臨床癥狀的主要原因。具體原因有待更多的研究來尋找其與TGF-β1表達和結(jié)核病的關(guān)系。但是作為tSNP的rs4803455位點對于結(jié)核的預(yù)測作用較rs1800470更大。

        綜上所述,TGF-β1中tSNP(rs4803455)位點的基因多態(tài)性可能與深圳地區(qū)中國漢族人群結(jié)核病的發(fā)生具有一定的相關(guān)性,其在結(jié)核性胸膜炎患者的相關(guān)性更加明顯,而在年齡>25歲的患者中這種預(yù)測作用更大。通過對結(jié)核病遺傳易感性的進一步研究將有助于對結(jié)核病特別是結(jié)核性胸膜炎的高危人群進行預(yù)測,并尋找可能的干預(yù)措施以降低結(jié)核病的發(fā)病率,為最終控制結(jié)核病疫情提供科學(xué)依據(jù)和理論基礎(chǔ)。

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