陳寅恪一家抵達(dá)桂林后，最初落腳于中央研究院物理研究所。1938年初，長沙臨時大學(xué)與中研院史語所、社會科學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)撤離長沙遷往昆明時，物理所、地質(zhì)所、心理所等三個研究所也隨之撤離。鑒于各方面原因，三個所抵達(dá)桂林后不再前行，并索性在離桂林市40華里外的良豐鎮(zhèn)郊外山腳下安營扎寨住了下來。

陳一家到達(dá)桂林，根據(jù)朱家驊電示，中研院物理研究所所長丁西林專程派車把陳氏一家接到所內(nèi)暫住。

歷盡千險萬難，死里逃生的陳家，對這一歷史性的會面，自是百感交集，愴然難忘。許多年后，寅恪的大女兒流求深情地回憶道：“抵達(dá)物理所時，天色已全黑，丁伯伯（西林）讓我們住進(jìn)他的宿舍里，緊接著研究所的伯伯、伯母們來熱情問候，真像回到老家一樣。環(huán)顧宿舍，雖是茅草房頂，竹籬夾墻，但是人情溫暖，父母眉頭也舒展開了?！?/p>

按照流求的說法，“父親原打算繼續(xù)上路赴四川李莊歷史語言研究所”，而史語所的同人也翹首以待，渴盼著大師的到來，為這座萬里長江第一古鎮(zhèn)增添新的活力與砝碼。遺憾的是，陳寅恪夫婦的身體狀況均不允許繼續(xù)前行，使這一計劃隨著歲月的流逝而漸漸偏離了前行的軌道，終致大師的身影與李莊擦肩而過。

1942年8月1日，陳寅恪給傅斯年的信中道出了自己不能繼續(xù)前行的詳情。盡管陳氏發(fā)出了“重返故國，精神一振，扶病就道，直抵桂林”的慷慨之詞，但信中可見，身心俱疲的陳寅恪很有些打退堂鼓的意思，并極想在桂林這個山清水秀的古城小憩一陣，等身體復(fù)原后再做他圖。

此前，陳寅恪已致信中英庚款負(fù)責(zé)人杭立武，商量設(shè)講座事，已蒙同意，所聘薪金由中英庚款與廣西大學(xué)合出，為兩家合聘之局，每周開課三小時，只是“月薪則不多”。但慮及“半年或數(shù)月之內(nèi)，弟個人及全家皆不能旅行，又不可無收入以維持日食，授課之時既少，可整理年來在港大講授舊稿，藉此暫為休息過渡之計，作漸次內(nèi)遷之準(zhǔn)備”。

陳氏對自己面臨的窘境和日后的打算說得極為清楚，但在此信尚未發(fā)出時，重慶方面的中央研究院總干事葉企孫，已命人于前一日將聘書匆匆發(fā)往桂林，請陳寅恪出任“中央研究院歷史語言研究所專任研究員”。

而這一切，正在李莊主持工作的史語所所長傅斯年卻蒙在鼓里。當(dāng)?shù)弥~企孫竟瞞著鍋臺上了炕，致自己這位史語所掌門人于不顧，膽大妄為，擅自聘陳寅恪為“專職”之后，傅斯年怒火頓起，立即以筆當(dāng)炮向葉企孫討伐起來。

葉企孫，上海人，早年畢業(yè)于清華學(xué)校，后入美國芝加哥大學(xué)物理系就讀。1920年獲碩士學(xué)位，轉(zhuǎn)赴哈佛大學(xué)研究院攻讀實驗物理，1923年獲哲學(xué)博士學(xué)位，1924年回國，應(yīng)東南大學(xué)之聘擔(dān)任物理學(xué)副教授。1925年8月應(yīng)清華大學(xué)之聘，擔(dān)任物理學(xué)副教授并開始了理學(xué)方面的畢生創(chuàng)業(yè)。1929年出任清華大學(xué)理學(xué)院院長、校務(wù)委員會主席兼代理校長?？箲?zhàn)爆發(fā)后隨校南遷，出任西南聯(lián)合大學(xué)物理系教授、清華大學(xué)特種研究委員會主席、校務(wù)委員。

葉氏作為一位優(yōu)秀的物理學(xué)教授，突然轉(zhuǎn)行出任中央研究院總干事，這主要是代院長朱家驊的盛意。珍珠港事件爆發(fā)前，代理總干事傅斯年高血壓病例甚重，需靜心休養(yǎng)一段時間，中研院總辦事處急需有人接替這一職務(wù)主持處理一院的繁雜事務(wù)。

在朱家驊、翁文灝、傅斯年等人的懇切要求下，西南聯(lián)大常委梅貽琦終于同意葉企孫以請假的名義離開清華，專任中央研究院總干事職。按照葉企孫自己的說法：“據(jù)吾推測，中研院要吾擔(dān)任總干事的理由，是因為吾對各門科學(xué)略知門徑，且對于學(xué)者間的糾紛，尚能公平處理，使能各展所長?！?/p>

1941年9月11日，梅貽琦致信葉企孫：“足下之去中研院，在清華為一重大損失，在琦個人尤感悵悵，但為顧國內(nèi)一重要學(xué)術(shù)機(jī)關(guān)之發(fā)展起見，不應(yīng)自吝，乃不得不允君請假，暫就該院職務(wù)?！?月底，葉企孫離開昆明飛赴重慶，正式接替傅斯年出任中央研究院總干事職。傅則于同年12月初，攜妻帶子離開重慶，遷往李莊史語所主持工作。

令葉企孫沒有想到的是，半年之后，因陳寅恪聘任一事，竟惹得傅斯年暴跳起來。