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        基于454焦磷酸測(cè)序法的典型草原土壤真核生物多樣性

        2013-04-25 09:29:44井趙斌程積民張寶泉李紅紅
        草業(yè)科學(xué) 2013年11期
        關(guān)鍵詞:封育真核群落

        井趙斌,程積民,2,張寶泉,李紅紅

        (1.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,陜西 楊凌712100; 2.中國(guó)科學(xué)院水利部水土保持研究所,陜西 楊凌 712100;3.西北農(nóng)林科技大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,陜西 楊凌712100)

        在陸地生態(tài)系統(tǒng)中,土壤是原核生物(如古細(xì)菌、細(xì)菌和放線菌等)和真核生物(原生動(dòng)物、真菌、藻類(lèi)和地衣等)棲息的場(chǎng)所。真核生物包括原生生物界、真菌界、植物界和動(dòng)物界,這些動(dòng)物、植物、微生物在土壤中各自發(fā)揮著重要的作用。比如,微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)的核心,主要扮演著“分解者”的角色,在有機(jī)物分解與轉(zhuǎn)化、養(yǎng)分循環(huán)與利用、土壤肥力形成和溫室氣體產(chǎn)生中發(fā)揮著重要的作用,更是地球C、N、P和S等物質(zhì)循環(huán)的“調(diào)節(jié)器”[1]。而真菌影響生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和功能,在分解植物菌根共生體和病原體中扮演著重要的角色[2]。

        近年來(lái),以隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性(RAPD)、變性梯度凝膠電泳(DGGE)等分子生物學(xué)技術(shù)為基礎(chǔ)的方法在土壤真核生物和微生物研究中得到了廣泛的應(yīng)用,如Gao等[3]利用PCR-RAPD方法對(duì)重金屬污染的土壤進(jìn)行了分析,表明RAPD標(biāo)記可以作為一個(gè)有效評(píng)價(jià)土壤健康的方法。Naether等[4]利用16S rRNA基因指紋識(shí)別方法(末端限制片段長(zhǎng)度多態(tài)性T-RFLP和變性梯度凝膠電泳DGGE)對(duì)來(lái)自德國(guó)3個(gè)不同地區(qū)草原和森林的土壤中酸桿菌門(mén)(Acidobacteria)進(jìn)行了分析,結(jié)果表明,草地和森林中酸桿菌門(mén)的多樣性差異很大,土壤pH值、有機(jī)碳、總氮、C∶N比、磷、硝酸鹽、氨、土壤水分、土壤溫度和土壤呼吸對(duì)酸桿菌門(mén)群落組成均有顯著影響。但這些方法存在很大的局限性,通常只能檢測(cè)到環(huán)境中優(yōu)勢(shì)菌群的存在,只有占整個(gè)群落細(xì)菌數(shù)量約1%或以上的類(lèi)群能夠被檢測(cè)到[5-6]。Roche 454高通量測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)為土壤微生物群落多樣性的研究帶來(lái)了新的思路,該技術(shù)已在真核生物和土壤微生物研究中有報(bào)道。例如Bates等[7]利用454測(cè)序平臺(tái)對(duì)主要古細(xì)菌在全球范圍的分布進(jìn)行了分析,采樣點(diǎn)遍及南、北美洲和南極洲共146個(gè)點(diǎn),發(fā)現(xiàn)土壤C∶N比是唯一與古細(xì)菌相對(duì)豐度相關(guān)的因子,即低的C∶N比有高的古細(xì)菌豐度,其中泉古菌門(mén)(Crenarchaeota)是古細(xì)菌中的優(yōu)勢(shì)菌。Will等[8]利用454測(cè)序技術(shù),對(duì)不同土地利用方式下的9個(gè)草地土壤細(xì)菌V2-V3 16S rRNA基因區(qū)進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌多樣性(H′)與有機(jī)碳含量、總氮含量和碳氮比之間呈正相關(guān)性,這種相關(guān)性隨著土層深度的增加而降低。Liu等[9]利用焦磷酸測(cè)序技術(shù)分析了飲用水生物膜中的真核生物與細(xì)菌群落,認(rèn)為細(xì)菌群落占主要地位。

        草地是我國(guó)陸地生態(tài)系統(tǒng)重要的組成部分,由于氣候變化和人為因素等的影響,我國(guó)草地退化嚴(yán)重,其中土壤退化是其所面臨的一個(gè)主要問(wèn)題。封育被認(rèn)為是實(shí)現(xiàn)植被自然恢復(fù)的有效手段之一[10-11]。目前,國(guó)內(nèi)外關(guān)于長(zhǎng)期封育對(duì)草地地上植被、土壤養(yǎng)分和微生物的影響已有大量的研究[10-14],但對(duì)土壤微生物的研究?jī)H局限于微生物量等方面,測(cè)定方法以傳統(tǒng)培養(yǎng)法為主。我國(guó)尚未見(jiàn)基于454焦磷酸測(cè)序法對(duì)草地土壤真核生物多樣性的研究?;诖?,本研究利用454 Roche高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)黃土區(qū)典型草地表層土壤中真核生物進(jìn)行深度測(cè)序,對(duì)封育草地土壤真核生物多樣性進(jìn)行分析,旨在探討454測(cè)序技術(shù)在研究草地土壤生物多樣性方面的優(yōu)勢(shì),為該技術(shù)的應(yīng)用提供理論和實(shí)踐基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1研究區(qū)概況 本研究區(qū)位于云霧山草原自然保護(hù)區(qū),保護(hù)區(qū)在寧夏回族自治區(qū)固原市北部45 km (106°24′-106°28′ E,36°13′-36°19′ N),海拔1 800~2 150 m,處于黃土高原腹地,植被類(lèi)型為典型草原。本區(qū)為溫帶半干旱區(qū)大陸性氣候,年平均氣溫7.01 ℃;7月氣溫最高22~25 ℃;1月氣溫最低-18~-15 ℃;>0 ℃年積溫2 847~3 592 ℃·d;年日照時(shí)長(zhǎng)2 300~2 500 h;年降水量425.5 mm,60%~75%的降水集中分布于夏季7-9月;無(wú)霜期137 d。保護(hù)區(qū)總面積為6 660 hm2,其中包括核心區(qū)(1 000 hm2)、緩沖區(qū)(1 300 hm2)和試驗(yàn)區(qū)(4 360 hm2),核心區(qū)內(nèi)設(shè)置有不同封育時(shí)期的群落類(lèi)型。經(jīng)2012年全面考察,保護(hù)區(qū)內(nèi)共有植物313種,其中栽培植物16種,野生植物297種,主要優(yōu)勢(shì)植物有長(zhǎng)芒草(Stipabungeana)、大針茅(S.grandis)、百里香(Thymusmongolicus)、鐵桿蒿(Artemisiasacrorum)和星毛委陵菜(Potentillaacaulis)等。

        1.2研究方法

        1.2.1樣地選擇及土壤樣品采集 于2012年8月中旬,在核心區(qū)選擇不同封育年限(5、9、15、22和30 a)的天然草地群落作為采樣地,同時(shí),在保護(hù)區(qū)外圍選擇自由放牧樣地作為對(duì)照。在每個(gè)樣地上坡、中坡和下坡每隔15 m設(shè)置1 m× 1 m的樣方3個(gè)。植物樣方調(diào)查結(jié)束后,去除地面枯落物,在每個(gè)樣方四個(gè)角和中間位置各打一個(gè)土鉆(直徑4 cm)混勻作為一個(gè)土樣,采樣深度0-20 cm。采集的新鮮土樣快速過(guò)1.4 mm的篩后,從9個(gè)土壤中各取約10 g快速混勻后用液氮冷凍,帶回實(shí)驗(yàn)室放入-80 ℃冰箱保存,用于微生物群落多樣性分析;剩余下的土樣分成兩部分,一部分放入4 ℃冰箱保存,用于土壤微生物量等測(cè)定;另一部分室內(nèi)風(fēng)干,用于土壤養(yǎng)分和酶活性等測(cè)定。

        1.2.2土壤理化性質(zhì)測(cè)定 土壤有機(jī)碳測(cè)定采用低溫外加熱重鉻酸鉀氧化-比色法,全氮、全磷含量利用元素分析儀(VARIO EI III CHON,Elmentar,Germany)。土壤速效鉀用NH4OAc提取后,用火焰光度計(jì)測(cè)定,速效磷用NaHCO3法提取后,用分光光度計(jì)測(cè)定。

        1.2.3土壤總DNA提取 稱(chēng)取0.5 g研磨成粉末并充分混勻的土壤樣品,使用OMEGA公司的E.Z.N.A Soil DNA抽提試劑盒提取基因組DNA。具體操作步驟參考試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)抽提的基因組DNA,所得DNA于-20 ℃保存用于后續(xù)試驗(yàn)。

        1.2.4PCR擴(kuò)增與454高通量測(cè)序 根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)[9,15]選擇V4區(qū)引物3NDf和V4_euk_R2用于真菌18S rRNA分析,其序列為3NDf-5′-GGCAAGTCTGGTGCCAG-3′、V4_euk_R2-5′-ACGGTATCT(AG) ATC(AG)TCT TCG-3′,該引物序列是帶有“5′454 A、B接頭-特異引物3′”的融合引物,A為測(cè)序端,需加標(biāo)簽,B端引物可以共同。PCR反應(yīng)體系為20 μL,包括:5×FastPfu Buffer 4 μL,2.5 mmol·L-1dNTPs 2 μL,引物(5 μmol·L-1)各0.8 μL,F(xiàn)astPfu Polymerase 0.4 μL,模板DNA 10 ng, 用ddH2O補(bǔ)足20 μL。PCR反應(yīng)條件 95 ℃預(yù)變性2 min,95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,25個(gè)循環(huán)。72 ℃延伸5 min,10 ℃保存。2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,使用AxyPrepDNA凝膠回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物。

        所得PCR產(chǎn)物經(jīng)切膠回收后用PicoGreenR dsDNA定量試劑盒進(jìn)行熒光定量,然后按照每個(gè)樣品測(cè)序量比例混合。樣品送到上海美吉生物公司用454高通量測(cè)序儀測(cè)序。

        1.3數(shù)據(jù)分析與處理 數(shù)據(jù)分析流程主要包括:1)測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與優(yōu)化。首先將測(cè)序接頭、Barcode和前引物序列去除后進(jìn)行有效序列統(tǒng)計(jì)分析;然后利用Seqcln檢測(cè)接頭和修剪末端,Mothur篩選得到優(yōu)化序列。2)序列分析。利用軟件Mothur經(jīng)與Silva數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),使用UCHIME檢測(cè)去除Chimeric序列,最后用Furthest neighbor方法根據(jù)序列相似度的方法將序列聚類(lèi)生成OUT(Operational Taxonomic Units)。3)生態(tài)學(xué)分析。利用Mothur軟件進(jìn)行多樣性指數(shù)、稀釋曲線、分類(lèi)學(xué)和群落結(jié)構(gòu)組分等分析。

        統(tǒng)計(jì)分析全部用軟件SPSS 19.0完成。

        2 結(jié)果

        2.1土壤理化性質(zhì) 隨著封育時(shí)間的延長(zhǎng),土壤pH和容重呈下降趨勢(shì);而有機(jī)碳、全氮、全磷、速效磷和速效鉀均表現(xiàn)出先增加后降低然后再增加趨勢(shì)(表1)。

        表1 不同封育時(shí)間土壤理化性質(zhì)Table 1 Soil Physico-chemical properties at different times

        2.2測(cè)序序列統(tǒng)計(jì) 利用454高通量測(cè)序,14個(gè)樣品共獲得97 684條序列,總堿基數(shù)為41 083 452 bp,序列平均長(zhǎng)度420 bp。有效序列數(shù)量及長(zhǎng)度分布見(jiàn)表2。經(jīng)優(yōu)化丟棄長(zhǎng)度小于200 bp、模糊堿基數(shù)大于0、序列平均質(zhì)量低于25的序列后,14個(gè)樣品獲得84 492條序列,總堿基數(shù)36 880 126 bp,平均序列長(zhǎng)度436 bp。有效序列和優(yōu)化序列長(zhǎng)度分布圖見(jiàn)圖1a和b。

        表2 有效序列數(shù)量及長(zhǎng)度分布Table 2 The number and Length distribution of valid sequences

        2.3多樣性指數(shù) 多樣性指數(shù)分析中用于指數(shù)評(píng)估的OTU相似水平常選擇0.03(97%)、0.05(95%)和0.10(90%)。多樣性指數(shù)主要包括豐富度指數(shù)Ace和Chao、多樣性指數(shù)Shannon和Simpson、測(cè)序深度指數(shù)Coverage。用Mothur軟件計(jì)算的6個(gè)樣品(不同封育時(shí)期)微生物群落多樣性指數(shù)見(jiàn)表3。在0.03和0.05相似度水平下,各基因稀釋曲線均未趨向平滑,在0.01水平下,稀釋曲線達(dá)到明顯的平坦階段(數(shù)據(jù)未列出)。但從Coverage來(lái)看,該指數(shù)基本上都超過(guò)了90%,說(shuō)明測(cè)序結(jié)果反映了所測(cè)樣品中微生物的真實(shí)情況。在0.03相似度水平下,從多樣性指數(shù)Shannon可以看出,各群落多樣性大小順序?yàn)? a>5 a>22 a>15 a>30 a>9 a。不同封育時(shí)間相關(guān)性分析表明,土壤pH、容重和速效鉀與多樣性指數(shù)Shannon在0.03、0.05和0.01水平下均無(wú)顯著相關(guān)性,而有機(jī)碳、全氮、全磷、速效磷與多樣性指數(shù)Shannon在0.05水平下均呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.01)。

        2.4真菌、動(dòng)物和植物區(qū)系分布 OTU分類(lèi)學(xué)結(jié)果表明,土壤中真菌群落主要由子囊菌門(mén)(Ascomycota)、壺菌門(mén)(Chytridiomycota)、擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)、綠藻門(mén)(Chlorophyta)、球囊菌門(mén)(Glomeromycota)和變形菌門(mén)(Proteobacteria)組成。從綱水平來(lái)看(圖2),散囊菌綱(Eurotiomycetes)、座囊菌綱(Dothideomycetes)、糞殼菌綱(Sordariomycetes)、盤(pán)菌綱(Pezizomycetes)、錘舌菌綱(Leotiomycetes)、元盤(pán)菌綱(Orbiliomycetes)、傘菌綱(Agaricomycetes)和變性菌綱(Alphaproteobacteria)是組成真菌群落的主要真菌綱。不同封育時(shí)期草地土壤中真菌優(yōu)勢(shì)群落在不同分類(lèi)學(xué)水平下差異較大(表4)。

        圖1 有效序列和優(yōu)化序列分布圖Fig.1 Length distribution of valid sequences and trimmed sequences

        表3 不同封育年限草地土壤微生物群落多樣性指數(shù)Table 3 Diversity index of microbial community of grasslands with different enclosing years

        土壤中動(dòng)物群落區(qū)系主要包括脊椎動(dòng)物門(mén)(Craniata)、節(jié)足動(dòng)物門(mén)(Arthropoda)、線蟲(chóng)門(mén)(Nematoda)和環(huán)節(jié)動(dòng)物門(mén)(Annelida)。在綱水平上(圖2),主要包括脊椎動(dòng)物(Craniata)、有孔蟲(chóng)界(Rhizaria)、刺嘴綱(Enoplea)、色矛綱(Chromadorea)、絲足蟲(chóng)類(lèi)(Cercozoa)、變形蟲(chóng)(Lobosa)、環(huán)節(jié)動(dòng)物(Annelida)和六足類(lèi)(Hexapoda)。不同封育時(shí)期草地土壤中不同分類(lèi)學(xué)水平下優(yōu)勢(shì)動(dòng)物區(qū)系見(jiàn)表5。

        圖2 不同封育年限真核生物群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖Fig.2 Barplot of eukaryon community of grasslands with different enclosing year

        表4 不同封育年限不同分類(lèi)學(xué)水平草地土壤中優(yōu)勢(shì)真菌群落Table 4 The dominant fungi community of soil for different taxonomic level at different times

        土壤中的主要植物信息包括陸生植物(Embryophyta)和單子葉植物綱(百合綱)(Liliopsida)(圖2)。從物種比對(duì)結(jié)果來(lái)看,這些植物種主要包括寸苔草(Carexduriuscula)、苔蘚植物(Bryophyta)、蛇床子(Cnidiummonnieri)、蘚生馬先蒿(Pedicularismuscicola)、野甘草屬(Scoparia)、人參屬植物喜馬拉雅人參(Panaxpseudoginsengsubsp.himalaicus)和紫花地丁(Violaphilippica)。

        表5 不同封育年限不同分類(lèi)學(xué)水平草地土壤中優(yōu)勢(shì)動(dòng)物群落Table 5 The dominant soil animal communities of grasslands with different enclosing years at different taxonomic level

        3 討論

        以分子技術(shù)為基礎(chǔ)的現(xiàn)代生物學(xué)研究方法,如PCR-RFLP、PCR-RAPD、PCR-SSCP、熒光原位雜交技術(shù)(FISH)、基因芯片(Microarry)、磷脂脂肪酸圖譜分析(Phospholipid Fatty Acid,PLFA)和PCR-DGGE/TGGE等極大地推動(dòng)了土壤生物學(xué)研究的深度和廣度。其中運(yùn)用比較廣泛并被普遍認(rèn)可的是PCR-DGGE/TGGE法,而DGGE/TGGE的局限性在于,檢測(cè)的DNA片段長(zhǎng)度范圍以200~900 bp為佳,超出此范圍的片段難以檢測(cè)[5],PCR擴(kuò)增所需G/C堿基對(duì)含量至少達(dá)40%,通常只能檢測(cè)到環(huán)境中優(yōu)勢(shì)菌群的存在,只有占整個(gè)群落細(xì)菌數(shù)量約1%或以上的類(lèi)群才能夠通過(guò)DGGE檢測(cè)到[6]。454焦磷酸測(cè)序技術(shù)的最大優(yōu)點(diǎn)是與上述以DNA為基礎(chǔ)的傳統(tǒng)方法相比,可以獲得大量土壤中的生物學(xué)系統(tǒng)分類(lèi)信息;另外, 454技術(shù)具有快速和費(fèi)用低廉的特點(diǎn),與傳統(tǒng)的Sanger技術(shù)相比,費(fèi)用可以節(jié)約20~30倍,同時(shí)省去了對(duì)環(huán)境樣品進(jìn)行克隆的步驟[16]。研究表明,引物3NDf和V4_euk_R2可以檢測(cè)到環(huán)境中大多數(shù)的真核生物(真菌、微型藻類(lèi)、原生動(dòng)物、后生動(dòng)物等)[9,15],因此,本研究選擇了這兩條引物對(duì)真核生物18S rRNA V4區(qū)進(jìn)行分析。對(duì)優(yōu)化序列進(jìn)行分類(lèi)學(xué)分析時(shí)有大量的norank序列,特別是封育30 a草地超過(guò)90%的序列屬于norank序列,即在與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中已知序列進(jìn)行比對(duì)時(shí),無(wú)法獲得該序列的分類(lèi)學(xué)信息,因此,我們推斷這些序列可能是一些新發(fā)現(xiàn)的土壤微生物類(lèi)群。如OBrien等[17]在對(duì)混交落葉林中土壤與凋落物微生物研究結(jié)果分析后發(fā)現(xiàn)有12%的序列無(wú)法獲得具體物種信息。

        生物學(xué)分類(lèi)結(jié)果表明,不同封育時(shí)期草地真核生物組成結(jié)構(gòu)和比例不同(圖2、表4),沒(méi)有明顯的線性關(guān)系。隨著封育時(shí)間的延長(zhǎng),土壤有機(jī)碳、全氮、全磷和速效磷與多樣性指數(shù)Shannon均呈顯著負(fù)相關(guān)。已有研究表明,植物通過(guò)影響土壤理化性質(zhì)等進(jìn)一步影響土壤微生物多樣性[18]。隨著封育時(shí)間的延長(zhǎng),草地植被物種組成、蓋度和地上生物量等顯著增加,因而產(chǎn)生的大量枯落物對(duì)提高土壤養(yǎng)分和增加土壤微生物多樣性發(fā)揮著重要作用;而土壤微生物是土壤有機(jī)碳、全氮和全磷等轉(zhuǎn)化和循環(huán)的主要推動(dòng)力。因此,我們可以推斷,土壤養(yǎng)分和生物多樣性隨著封育時(shí)間的延長(zhǎng)并不是一個(gè)線性相關(guān)的同步過(guò)程,應(yīng)該有一個(gè)時(shí)間閾值,如果從土壤恢復(fù)水平來(lái)考慮,在這個(gè)閾值點(diǎn)就可以對(duì)封育草地進(jìn)行合理的利用。

        真菌主要存在于土壤表層10 cm處,在30 cm以下很難找到。藻類(lèi)一般生活在土壤表面或者上表層數(shù)毫米處,這些藻類(lèi)有可能會(huì)成為其他微生物的營(yíng)養(yǎng)源被吞噬。大部分原生動(dòng)物因?yàn)樾枰獫舛认鄬?duì)較高的O2,一般只存在于表層15 cm處,這些原生動(dòng)物是土壤細(xì)菌和藻類(lèi)的捕食者。因此,本研究中主要采集0-20 cm表層土壤進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,草地真菌主要由子囊菌門(mén)、壺菌門(mén)、擔(dān)子菌門(mén)、綠藻門(mén)、球囊菌門(mén)和變形菌門(mén)組成,這與前人[2]對(duì)地中海草地真菌群落的研究結(jié)果基本一致,但在科、屬、種分類(lèi)水平上具有各自的優(yōu)勢(shì)菌。

        OTU分類(lèi)結(jié)果表明,優(yōu)化序列中有超過(guò)60%的序列分類(lèi)結(jié)果屬于動(dòng)物區(qū)系,其中脊椎動(dòng)物占到了54%。從不同分類(lèi)學(xué)水平可以發(fā)現(xiàn)(表5),動(dòng)物區(qū)系以脊椎動(dòng)物中的鼠兔科居多,這一結(jié)果可為草原動(dòng)物區(qū)系調(diào)查提供新的研究思路。從圖2可以看出,脊椎動(dòng)物和有孔蟲(chóng)界在綱水平上也占了很大比例,從不同分類(lèi)學(xué)水平結(jié)果來(lái)看,土壤中多細(xì)胞后生動(dòng)物(尖線蟲(chóng))和單細(xì)胞原生動(dòng)物(鞭毛蟲(chóng))居多。一般后生動(dòng)物參與枯枝落葉的破碎和分解過(guò)程,使得這些植物殘?bào)w有利于微生物的進(jìn)一步分解,其中線蟲(chóng)一般又靠取食微生物和其他動(dòng)物生存。原生動(dòng)物在土壤中發(fā)揮著參與土壤植物殘?bào)w分解和調(diào)節(jié)細(xì)菌數(shù)量的作用,其中鞭毛蟲(chóng)以取食細(xì)菌作為食物源。這些動(dòng)物、植物和微生物在土壤中各自發(fā)揮著重要的作用,構(gòu)成了土壤中一條完整的生物鏈。

        為避免土壤樣品中有植物或者枯落物殘留影響測(cè)序結(jié)果,在土壤取樣過(guò)程中,將表面枯落物和植物去除并過(guò)篩。從分類(lèi)結(jié)果中發(fā)現(xiàn)有植物基因組信息,主要是陸生植物和單子葉植物綱,表明土壤中存在大量這些植物的根系分解物,這些植物殘?bào)w分解物可能是土壤養(yǎng)分和微生物的主要養(yǎng)分庫(kù)來(lái)源。其中,藻類(lèi)植物中綠藻門(mén)(Chlorophyta)的鏈形植物(Streptophyta)占了很大比例,同時(shí)發(fā)現(xiàn)了屬于真核微生物中藻類(lèi)殼衣藻科的Cephalomonasgranulata。藻類(lèi)為單細(xì)胞或多細(xì)胞的真核原生生物,是土壤生物群落的重要組成部分,為土壤有機(jī)質(zhì)的最先制造者。通過(guò)與云霧山植物區(qū)系調(diào)查結(jié)果比較,發(fā)現(xiàn)有新的植物種,如蛇床子、蘚生馬先蒿和人參屬植物喜馬拉雅人參。這一發(fā)現(xiàn)為研究該地區(qū)原始植被提供了新的思路,例如有些植物種由于草原退化可能已經(jīng)消失,通過(guò)這一方法可以還原該地區(qū)原來(lái)植物種的分布情況,這可能會(huì)對(duì)了解黃土高原原始植被組成提供新的信息。

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