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        雜合抗菌肽MgJ 基因真核表達(dá)載體的構(gòu)建

        2013-04-23 11:53:30
        中國釀造 2013年8期

        尹 佳

        (吉林化工學(xué)院環(huán)境與生物工程學(xué)院,吉林 吉林 132022)

        抗菌肽(antimicrobial peptides)是具有抗菌活性的一類肽的總稱。通常由13~50個氨基酸組成,為陽離子型多肽[1]。兩性α-螺旋結(jié)構(gòu)和兩性β-折疊結(jié)構(gòu)是抗菌肽最顯著的結(jié)構(gòu)特征。抗菌肽對細(xì)菌具有很強(qiáng)的殺傷作用,不宜在原核系統(tǒng)中直接表達(dá),一般采用融合表達(dá)或在酵母中表達(dá)[2-3]。

        本研究通過對抗菌肽Magainin-Ⅱ和JaponicinⅡ兩個基因(簡稱M和J)的一級結(jié)構(gòu)和二級結(jié)構(gòu)的分析,用一段編碼ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將M基因和J基因相連,以利于M和J基因各自的空間折疊。選用巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)偏愛的密碼子,通過重疊區(qū)基因擴(kuò)增法(SOE法)[4]人工合成MgJ基因,然后將其連接至在巴斯德畢赤酵母中高效表達(dá)的表達(dá)載體pPICZα A上。其設(shè)計(jì)目的是獲得比MagaininⅡ和JaponicinⅡ生物活性更高的抗菌肽,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、質(zhì)粒pPICZα A 均由本實(shí)驗(yàn)室保存,內(nèi)切酶、dNTP、T4連接酶、DNA marker、PCR 擴(kuò)增試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒購自TaKaRa寶生物工程有限公司。引物由聯(lián)星生物合成,其他試劑均為國產(chǎn)分析純試劑。

        1.2 方法

        1.2.1 基因的合成

        引物設(shè)計(jì):根據(jù)GenBank中的基因序列,在M基因和J基因中間用鉸鏈ser-ser-gly-se r-gly-ser連接,按照畢赤酵母偏愛密碼子表[5]設(shè)計(jì)合成8個引物,其中Up1含有EcoRⅠ酶切位點(diǎn),Down2含有XbaⅠ酶切位點(diǎn)。各引物序列見表1。

        表1 合成MgJ基因的引物序列Table 1 MgJ primers sequencs

        各引物與模板之間的互補(bǔ)關(guān)系見圖1。

        圖1 各引物與模板之間的互補(bǔ)關(guān)系示意圖Fig.1 Complementation of primers

        MgJ基因的合成:M1+M2(J1+J2):94℃、5min;94℃、30s,60℃、30s,72℃、30s,每一個循環(huán)增加0.2℃,共35個循環(huán);72℃、10min。經(jīng)電泳檢測后割膠回收DNA片段,并命名為M基因。相同條件下J1和J2合成J基因。

        Up1-M-Down1(Up2-J-Down2):94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s、56℃退火30 s、72℃延伸30s;每一個循環(huán)增加0.1℃,共30個循環(huán);72℃延伸10min。

        全長片段:Up1-M-Down1、Up2-J-Down2互為引物,94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s、56℃退 火30s、72℃延伸30s;每一個循環(huán)增加0.1℃,共30個循環(huán);72℃延伸10min。

        以上各PCR體系均為100mL。

        1.2.2 目的基因的鑒定目的基因經(jīng)PCR擴(kuò)增后,取5μLPCR產(chǎn)物與DNA marker 2.0%瓊脂糖凝膠電泳。

        1.2.3 表達(dá)載體的構(gòu)建目的基因表達(dá)載體的構(gòu)建策略見圖2。

        圖2 重組質(zhì)粒pPICZαA-MgJ構(gòu)建策略Fig.2 Construction of recombinant pPICZα A-MgJ

        1.2.4 酶切和連接

        目的基因全片段和pPICZα A均用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,膠回收后,16℃連接過夜。

        1.2.5 感受態(tài)細(xì)胞DH5α的制備和轉(zhuǎn)化

        按常規(guī)方法操作[6-8]。

        1.2.6 陽性克隆的篩選

        Zeocin篩選法[9]。

        1.2.7 重組質(zhì)粒的鑒定及DNA序列分析

        挑取重組菌培養(yǎng),提取質(zhì)粒[10],用EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切初步鑒定重組子。DNA序列分析由上海生工生物工程公司完成。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 MgJ基因的合成

        各引物片斷拼接采用重疊PCR擴(kuò)增出完整的基因。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,大小與預(yù)計(jì)的163bp相符。結(jié)果見圖3、圖4。

        圖3 目的基因的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.3 Agarose gel electrophoresis of genes

        圖4 MgJ的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.4 Agarose gel electrophoresis ofMgJ

        2.2 陽性克隆的篩選結(jié)果

        目的基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物回收后與pPICZα A載體連接轉(zhuǎn)化至EcoDH5α中,由于EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切線性化的pPICZα A不可能自身環(huán)化[11-12],因此Zeocin 抗性菌落應(yīng)含有所需要的重組質(zhì)粒pPICZα A-MgJ。

        2.3 重組質(zhì)粒的鑒定及測序

        將獲得的重組質(zhì)粒pPICZα A-MgJ用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,在相應(yīng)位置出現(xiàn)條帶,表明pPICZα A-MgJ構(gòu)建成功,結(jié)果見圖5。測序表明,基因序列與預(yù)期相符。

        圖5 pPICZα A-MgJ雙酶切的瓊脂糖凝膠電泳Fig.5 Agarose gel electrophoresis of pPICZα A-MgJ digestion

        3 結(jié)論

        抗菌肽必須具備兩親結(jié)構(gòu)和正電荷,較多的正電荷與穩(wěn)定的兩性α-螺旋結(jié)合,有助于提高殺菌活性。因此,可利用這一原則來設(shè)計(jì)新型的雜合抗菌肽[13]。本研究在MagaininⅡ和JaponicinⅡ之間用一段ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將2個基因相連,以利于增強(qiáng)兩段序列的連接,而且還可防止連接的過程中兩條序列單獨(dú)表達(dá)互補(bǔ)配對形成二聚體。為了獲得抗菌肽MgJ的全長基因片段,本研究采用了重疊區(qū)擴(kuò)增基因拼接法,用互有一段互補(bǔ)序列的8個引物,通過PCR擴(kuò)增得到了具有EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切位點(diǎn)的全長基因。

        本研究以pPICZα A作為表達(dá)載體。因?yàn)閜PICZα A即可以在原核細(xì)胞中表達(dá),也可在真核細(xì)胞中表達(dá),同時其表達(dá)盒的N端帶有引導(dǎo)分泌的α交配因子(α-MF)信號序列,表達(dá)產(chǎn)物可以分泌到細(xì)胞外的培養(yǎng)基中[14-15]。由于酵母本身分泌到培養(yǎng)基中的蛋白很少,因此表達(dá)上清中的雜質(zhì)蛋白含量很低,為進(jìn)一步純化表達(dá)蛋白提供了極大的方便。

        研究結(jié)果表明,成功地構(gòu)建了抗菌肽MgJ基因穿梭表達(dá)載體pPICZα A-MgJ,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。

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