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        貴州3個民族亞甲基四氫葉酸還原酶基因的遺傳多態(tài)性*

        2013-03-04 05:12:06單可人官志忠
        重慶醫(yī)學(xué) 2013年28期

        張 婷,謝 淵,李 毅,單可人,官志忠

        (貴陽醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)重點實驗室 550004)

        亞甲基四氫葉酸還原酶(methy lenete trahydr of olate reductase,MTHFR)蛋白普遍存在于人、動物及原核生物中,其生化功能是催化5.1 0-亞甲基四氫葉酸到5-甲基四氫葉酸的還原反應(yīng)。MTHFR酶活性的改變會導(dǎo)致5-甲基四氫葉酸的生成障礙,從而導(dǎo)致同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)復(fù)甲基化障礙,使得血漿Hcy濃度升高[1-2],從而導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。目前研究較為廣泛的是該酶基因的677C/T和1298A/C多態(tài)位點,已有研究表明其在不同國家、同一國家不同地區(qū)、不同民族或種族中的分布有顯著差異性[3-5]。布依族、侗族、苗族是貴州省人口較多的少數(shù)民族,本研究所選標本采自封閉的自然群體。通過了解貴州布依族、侗族及苗族人群中MTHFR基因677C/T和1298A/C的遺傳多態(tài)性,獲取相關(guān)群體遺傳數(shù)據(jù)。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 根據(jù)知情同意的原則,隨機選取貴州世居布依族、侗族、苗族隔離自然人群,樣本總量597例,其中布依族201例,男100例,平均(46.5±14.1)歲,女101例,平均(47.9±14.0)歲;侗族198例,男106例,平均(46.5±18.2)歲,女92例,平均(45.8±17.2)歲;苗族198例,男112例,平均(48.3±12.9)歲,女86例,平均(45.0±10.3)歲。研究對象彼此間無直接血緣關(guān)系,采集受試對象外周靜脈血血樣,EDTA-K2抗凝后,-20℃保存。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取 采用常規(guī)酚-氯仿抽提法從全血中提取DNA,并將樣品DNA標化為20ng/μL作為模板,-20℃存放備用。

        1.2.2 TaqMan-MGB探針基因分型 采用ABI公司的Taq-Man?SNP Genotyping Assays對 MTHFR 677C/T,1298A/C)進行基因分型。反應(yīng)體系10L,包含5LTaqMan?Universal PCR Master Mix,0.25LTaqMan Genotyping Assay,1 μL DNA(20ng/μL),加雙蒸水至10μL。反應(yīng)條件為60℃30s;95℃10min;92℃15s,60℃60s,共40個循環(huán);60℃30 s。所擴增的目的基因片段由于SNPs位點的堿基不同,標記呈不同的熒光,利用熒光發(fā)光特點,通過Applied Biosystems StepOneTM基因分析儀檢測,StepOneTM軟件分析基因分型結(jié)果。

        表1 貴州3個民族MTHFR 677C/T,1298A/C基因型及等位基因頻率分布[n(%)]

        1.2.3 測序 用ABI 310型全自動DNA測序儀對兩基因型進行測序驗證。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS17.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,應(yīng)用HaploView 4.1軟件進行SNPs的Hardy-Weinberg平衡、LD水平和單倍型結(jié)構(gòu)分析,兩位點LD水平以D′=1為判斷標準。計數(shù)資料采用率表示,對基因型及等位基因頻率進行χ2檢驗,檢驗水準α=0.05,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 基因分型結(jié)果 貴州布依族、侗族、苗族人群 MTHFR 677C/T(rs 1801133),1298A/C(rs 1801133)基因型、等位基因頻率分布見表1。在受檢人群中MTHFR 677C/T和1298A/C位點在3個民族之間基因型(χ2=14.98,P=0.005)和等位基因頻率(χ2=14.68,P=0.001)差異有統(tǒng)計學(xué)意義,其中布依族與苗族間基因型(χ2=13.22,P=0.001)和布依族與侗族、苗族等位基因頻率(χ2=7.34,P=0.007;χ2=12.84,P=0.000)差異有統(tǒng)計學(xué)意義,而布依族與侗族間基因型(χ2=7.60,P=0.022),侗族與苗族間基因型、等位基因頻率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);1298A/C位點在3個民族之間基因型(χ2=0.672,P=0.955)和等位基因頻率(χ2=0.336,P=0.845)差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

        2.2 貴州3個民族 MTHFR 677C/T,1298A/C位點組合情況 677CC/1298AA雙野生型頻率以布依族最低,分別為布依族21.9%,侗族33.3%,苗族35.4%;677CT/1298CC組合僅存在于侗族;3個民族中均未見677TT/1298CC雙純和突變及677TT/1298AC組合。見表2。

        表2 677C/T與1298A/C各基因型在3個民族中的分布[n(%)]

        2.3 MTHFR基因677C/T與1298A/C兩位點連鎖情況及單倍型分析結(jié)果 將3個民族樣本MTHFR基因677C/T和1298A/C兩位點構(gòu)建單倍型,發(fā)現(xiàn)主要以3種組合的存在,其分別是:677C-1298A(54.3%)、677C-1298C(27.4%)及677T-1298A(18.0%)。677C/T和1298A/C連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn),布依族和苗族兩位點間存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D′=1)。見表3。

        表3 677C/T與1298A/C在3個民族中單倍型分布頻率(%)

        3 討 論

        MTHFR基因定位于染色體1p36.3[6],該基因最常見的SNP位點是677C/T及1298A/C。據(jù)報道他們的突變將導(dǎo)致酶的耐熱性和活性減低[7-8],血漿Hcy水平升高,成為心血管病和神經(jīng)管缺損的獨立風(fēng)險因素。現(xiàn)有資料表明,MTHFR 677C/T的等位基因和基因型分布具有較強的地域和人種特征,突變型T等位基因頻率由低到高依次為非洲人(<10%)、歐洲白人(25.1%~46.0%)、中東人(17.4%~25.7%)、中國漢族人(21.0%~44.8%,由南向北呈增加趨勢)和墨西哥人(57.0%)?;蛐头植荚诟鞯貐^(qū)或民族均以CC和CT為主[9-11]。本次研究發(fā)現(xiàn)僅有侗族677T等位基因頻率與上述結(jié)論相一致,而侗族和苗族突變頻率相對較低。1298A/C多態(tài)性也同樣存在種族和民族差異性。C等位基因的頻率亞洲為17%~38%,西歐為27%~36%。非洲和北美約30%,中國北方漢族為20%[11-13]。本次研究結(jié)果顯示1298C等位基因頻率與報道相符。

        上述兩位點組合情況研究發(fā)現(xiàn)(表2),677CT/1298CC組合僅存在于侗族;677CC/1298AA雙野生型頻率以布依族最低;3個民族中均未見677TT/1298CC雙純和突變及677TT/1298AC組合,這與已報道文獻一致[14];單倍型主要以677C-1298A(54.3%)出現(xiàn);同時侗族未見已報道的兩位點連鎖不平衡現(xiàn)象[15-16]。

        綜上所述,MTHFR基因677C/T和1298A/C位點在不同民族的分布存在明顯差異。分子生物學(xué)與遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),個體對疾病的易感性不僅與環(huán)境有關(guān)更與不同等位基因?qū)е碌谋磉_改變有關(guān)。而MTHFR與多種疾病的發(fā)生相關(guān),因此對人群MTHFR基因多態(tài)性的研究有助于進一步弄清人群中突變等位基因頻率,對基因多態(tài)與疾病的關(guān)系做更明確探討提供理論依據(jù),本研究為此提供有意義的數(shù)據(jù)積累。

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