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        禽流感H5、H7、H9亞型多重實時熒光RT-PCR檢測方法的建立

        2013-01-24 22:10:15
        中國畜牧獸醫(yī)文摘 2013年1期
        關(guān)鍵詞:禽流感亞型特異性

        (寧夏回族自治區(qū)動物疾病預(yù)防控制中心,寧夏 750011)

        禽流感病毒呈世界性分布,絕大多數(shù)禽流感病毒呈隱性感染,不表現(xiàn)臨床癥狀。只有少數(shù)禽流感病毒具有迅速傳播和高致病性的特征。禽流感病毒H5、H7、H9亞型的致病性強,危害極大,現(xiàn)有的熒光PCR檢測方法每次只能檢測禽流感病毒單個亞型,費時費力,檢測成本較高。更重要的是對于一批家禽及其產(chǎn)品,現(xiàn)有的單亞型檢測并不能完全適應(yīng)實際需要,迫切需要開發(fā)多種亞型禽流感病毒的快速檢測方法。

        1 實驗材料與方法

        1.1 病毒和雞胚

        1.1.1 禽流感病毒H5、H7和H9亞型標準抗原。

        1.1.2 禽流感病毒H5、H7和H9亞型分離毒株,均由深圳出入境檢驗檢疫局實驗室于2004年禽流感暴發(fā)流行期間均購自哈爾濱獸醫(yī)研究所。進行了相關(guān)的分離保存操作,其他的病毒都由深圳出入境檢驗檢疫局的實驗室保存。

        1.2 一步法

        RT-PCR試劑盒購自寶生物工程(大連)有限公司,設(shè)備與試劑 ABI7900HT熒光定量PCR儀,核酸蛋白分析儀。病毒RNA抽提試劑盒購自Qiagen公司。

        1.3 探針和引物的合成與設(shè)計

        1.4 抽提禽流感病毒RNA

        1.5 禽流感H5、H7、H9雙重實時熒光RT-PCR的建立

        1.6 實時熒光RT-PCR的敏感性試驗

        1.7 實時熒光RT-PCR的特異性試驗

        1.8 三重實時熒光RT-PCR的干擾性試驗

        1.9 禽流感病毒三重實時熒光RT-PCR與HA、HI

        1.10 禽流感病毒三重實時熒光RT-PCR的田間試驗

        2 實驗結(jié)果

        2.1 三重實時熒光RT-PCR敏感性試驗

        在三重實時熒光RT-PCR的反應(yīng)體系中,將測定的體外轉(zhuǎn)錄的H5亞型的RNA只加入不同稀釋度的H5模板,作10倍連續(xù)稀釋。試驗證實,三重實時熒光RT-PCR方法對H7和H9的敏感性分別約為1 000拷貝和500個拷貝。

        同樣,進行H5亞型的三重實時熒光敏感性檢測,結(jié)果證實其檢測的敏感性約為1 000個模板拷貝。

        2.2 三重實時熒光RT-PCR的特異性試驗

        通過對多種感染雞的病毒或細菌的檢測,只加入在反應(yīng)體系中,H5型特異性實時擴增圖(H7和H9型特異性擴增圖略)。結(jié)果證實,該方法特異性強,與其他檢測對象無交叉反應(yīng)。禽流感病毒一個亞型的病毒RNA作為模板,同時,加入針對H5、H7、H9亞型的引物、探針進行實時熒光RT-PCR檢測,結(jié)果只得到相應(yīng)亞型的特異性熒光曲線,證實所設(shè)計的引物探針具有型特異性。

        2.3 三重實時熒光RT-PCR的干擾性試驗

        將H5、H7、H9亞型不同的模板濃度進行組合,發(fā)現(xiàn)當2個亞型模板濃度較高,而另一個亞型模板濃度較低,所建立的方法依然可以同時檢測到各個亞型。三個亞型之間的其他濃度組合結(jié)果同上類似。

        2.4 三重實時熒光RT-PCR對比試驗

        取89份經(jīng)病毒雞胚運用禽流感病毒H5、H7、H9亞型三重實時熒光RT-PCR進行盲檢,進行分開檢測的模式進一步產(chǎn)生樣品的研究,得出的結(jié)論就是48份為禽流感病毒H9陽性,13份禽流感病毒H5陽性,2份為禽流感病毒H5和H9混合感染,26份為陰性。經(jīng)過相關(guān)的比較,能夠得到結(jié)論就是兩者有著明顯的相似程度,幾乎沒有差別。

        2.5 三重實時熒光RT-PCR田間試驗

        采集的4 000多份喉腔棉拭子、泄殖腔棉拭子及臨床采樣的樣品進行檢測,陽性樣品中,H9亞型的禽流感為12份,均為水禽樣品;H5亞型的禽流感為5份,利用禽流感H5、H7、H9亞型三重實時熒光RT-PCR對臨床結(jié)果檢測到喉腔棉拭子陽性3份、泄殖腔棉拭子陽性12份、疑似病料4份。另有4份為H5和H9亞型的混合感染。檢測的結(jié)果也是幾乎沒有任何差別,所以相關(guān)的方法需要進一步確立才能夠投入使用。

        3 討論

        3.1 單重與多重檢測的比較

        PCR技術(shù)作為一種高度靈敏、快速簡便的方法現(xiàn)已經(jīng)應(yīng)用于很多病毒的檢測,效率較高,是對傳統(tǒng)檢測模式的突破,已經(jīng)廣泛應(yīng)用。但單重PCR在成本和檢測時間上存在劣勢,需要更加高端的技術(shù)出臺,需要進一步降低成本。多重PCR用于病毒、細菌、真菌的高通量快速檢測和其他方面的檢測已經(jīng)成為研究熱點,用于多種微生物的檢測及轉(zhuǎn)基因的檢測等。

        3.2 建立組合

        通過分別進行禽流感H5、H7、H9亞型單重實時熒光RT-PCR檢測,確定所設(shè)計的引物和探針擴增效率高,有著比較高的靈活性,能夠滿足篩選的需要,可又進一步實現(xiàn)相關(guān)的內(nèi)容整合。

        3.3 三重實時熒光RT-PCR的干擾性

        我們選取的各個病毒的模板量均為單重單檢時效果較好的模板濃度,在建立多重實時熒光RT-PCR方法時,即3個亞型的模板濃度相對差別不大。但是如果有臨床的干擾情況,那么就會出現(xiàn)一定的差距,進一步對現(xiàn)實產(chǎn)生了矛盾,將禽流感H5、H7、H9的模板濃度進行調(diào)整、組合,進一步討論針對模版的濃度整合問題是否有著某種干擾。

        4 小結(jié)

        必須根據(jù)儀器的檢測通道進行多重實時PCR檢測時,來選擇熒光標記基團,才能達到避免干擾、并且實現(xiàn)檢測的效率性質(zhì)提高。

        [1] 朱文斯,賴平安,黃茜華,等.熒光RT-PCR快速檢測禽流感病毒H5亞型的研究[J].中國醫(yī)藥導刊,2003,5(1):27-30.

        [2] 曹梅,田夫林,莊文忠.禽流感病毒血凝素分子生物學研究進展[J].動物醫(yī)學進展,2004,25(2):35-37,61 .

        [3] 黃金海,王英珍,丁伯良,等.間接ELISA檢測禽流感抗體方法的建立[J].動物醫(yī)學進展,2004,25(4):111-113.

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