趙衛(wèi)衛(wèi),彭 攸,李曉嬌,盧曉佳,王玉平,劉萃萃,王璐璐,馮 景
(南方醫(yī)科大學(xué)附屬奉賢醫(yī)院檢驗(yàn)科,上海201400)
EZH2基因是人們新近認(rèn)識(shí)的一種人類基因,定位于染色體7q35,是一種轉(zhuǎn)錄阻遏因子,可抑制抑癌基因的活性,具有促進(jìn)多種腫瘤的轉(zhuǎn)移特征[1-2]。大量研究表明,乳腺癌發(fā)生、發(fā)展與EZH2基因密切相關(guān)[3-6]。進(jìn)一步研究表明,miRNAs對(duì) EZH2的表達(dá)有重要的調(diào)控作用[7-8]。miRNA是一種不編碼蛋白的單鏈小分子RNA,其通過完全或不完全地與靶mRNA的3'UTR互補(bǔ)結(jié)合,引起靶基因的翻譯抑制或切割降解,從而調(diào)控基因的表達(dá)[9]。本研究嘗試將 EZH2基因3'UTR序列定向克隆到慢病毒篩選載體上,構(gòu)建攜帶EZH2基因3'UTR的慢病毒篩選載體,在包裝質(zhì)粒的輔助作用下包裝成慢病毒顆粒,并轉(zhuǎn)染乳腺癌細(xì)胞株MCF-7,獲得穩(wěn)定表達(dá)EZH2 3'UTR的細(xì)胞株,為后續(xù)的篩選miRNAs奠定基礎(chǔ)。
293T細(xì)胞株、乳腺癌細(xì)胞株MCF-7(上海中科院提供);pMD19-T載體(TaKaRa公司);CTX靶點(diǎn)篩選系統(tǒng)慢病毒表達(dá)載體及包裝質(zhì)粒(SBI公司);Taq DNA聚合酶、4×dNTP(Promega公司);DNA連接酶、限制性內(nèi)切酶BamHI和EcoR I(TaKaRa公司);RNA提取試劑盒、質(zhì)粒小量提取試劑盒、膠回收試劑盒(QIAGEN公司);Lipofecter脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑(碧云天公司);Marker-DL2000、低熔點(diǎn)瓊脂糖(上海生物工程公司)。
1.EZH2 3'UTR重組篩選載體的構(gòu)建 查詢PubMed數(shù)據(jù)庫(www.PubMed.com)查找人EZH2 mRNA序列,根據(jù)EZH2 3'UTR序列信息設(shè)計(jì)引物。引物序列 上游P5:5'-CT(保護(hù)堿基)GGATCC(劃線部分為BamHI酶切位點(diǎn))CATCTGCTACCTCCTCC-3',下游P3:5'-CA(保護(hù)堿基)GAATTC(劃線部分為 EcoRI酶切位點(diǎn))GATTCAACAAGGACAAGTT-3'。抽提乳腺癌組織總RNA,進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,55℃復(fù)性 30 s,72℃延伸30 s,共35個(gè)循環(huán)。對(duì)CTX-Lentivirus空質(zhì)粒和pMD19T-EZH2 3'UTR重組質(zhì)粒分別用BamHⅠ、EcoRⅠ雙酶切,酶切產(chǎn)物在T4DNA連接酶作用下與16℃連接1h。轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌,次日挑取菌落進(jìn)行PCR,對(duì)于陽性菌落進(jìn)行抽取質(zhì)粒,以BamHⅠ、EcoRⅠ雙酶切進(jìn)行重組質(zhì)粒鑒定后送于上海生工生物工程公司進(jìn)行測(cè)序。
2.病毒顆粒的包裝和生產(chǎn) 將對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的293T細(xì)胞進(jìn)行胰酶消化后,接種到6孔板中。用脂質(zhì)體法將病毒包裝 pPACKH1-GAG、pPACKH1-REV、pVSV-G三質(zhì)?;旌衔?500 ng/μL)7.5μL 和 CTX-EZH2'UTR 慢病毒質(zhì)粒(609 ng/μL)1.2μL共轉(zhuǎn)染 293T 細(xì)胞,混勻后放回到5%CO2培養(yǎng)箱中。6h后,移去細(xì)胞上清,更換為5mL的DMEM完全培養(yǎng)基。收集轉(zhuǎn)染72 h后的293T細(xì)胞上清,用Real-Time PCR對(duì)病毒進(jìn)行滴度測(cè)定。CMV上游引物P5:5'-ACGTATTGTCATC-GCTATTACCAT-3',CMV下游引物 P3:5'-TGGAAATCCCCGTGAGTCAAA-3',CMV 探針:5'CGCTATCCACGCCCATTGATGTACTGCC-3'。以CMV上下游引物,以 tubulin為內(nèi)參進(jìn)行定量PCR,檢測(cè)病毒滴度。
3.重組慢病毒感染MCF-7細(xì)胞陽性細(xì)胞株的篩選 將細(xì)胞接種于6孔板中,擇合適的感染復(fù)數(shù)(MOI)值,加入適量的病毒,同時(shí)加入終濃度為10 μg/mL的 polybrene增強(qiáng)病毒感染。感染24h后換成無病毒和polybrene的完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。在感染前進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),摸索最佳篩選藥物濃度。感染72 h后收集細(xì)胞,將其置于含嘌呤霉素的完全培養(yǎng)基中篩選,并進(jìn)行克隆和擴(kuò)增。
4.PCR鑒定重組體在MCF-7細(xì)胞中的整合收集經(jīng)嘌呤霉素篩選的陽性細(xì)胞,提取基因組DNA。根據(jù)慢病毒載體上CMV啟動(dòng)子的序列設(shè)計(jì)引物,陽性細(xì)胞的基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR反應(yīng)。反應(yīng)體系:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,60℃復(fù)性30 s,72℃延伸30 s,共33個(gè)循環(huán)。通過PCR鑒定EZH2 3'UTR與MCF-7細(xì)胞基因組整合量。
5.Western blotting檢測(cè)慢病毒感染乳腺細(xì)胞株MCF-7后EZH2蛋白表達(dá) 以未感染EZH2 3'UTR的MCF-7乳腺癌細(xì)胞為對(duì)照組,細(xì)胞培養(yǎng)后,分別收獲實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組細(xì)胞,加入組織細(xì)胞裂解液提取蛋白,配制10%的十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)凝膠,上樣量為20 μL,進(jìn)行電泳。恒壓80V至分離膠處后100V至電泳結(jié)束。200mA,1 h將蛋白電轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯膜(PVDF)膜,轉(zhuǎn)膜結(jié)束后EZH2用含5%脫脂奶粉的TBST室溫封閉1 h,4℃封閉過夜。EZH2一抗工作濃度為1∶300,4℃過夜,actin一抗工作濃度為1∶200,室溫3h。TBST洗膜10 min×3次;加入二抗,工作濃度為1∶300,室溫反應(yīng)2 h 30 min,TBST洗膜10 min×3次。加入化學(xué)發(fā)光底物,暗室壓片,曝光后顯影、定影。
經(jīng)PCR擴(kuò)增后,用1.5%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行產(chǎn)物鑒定,目的片段大小為275bp,與預(yù)期擴(kuò)增的基因片段大小一致,見圖1。
圖1 目的片段EZH2 3'UTR凝膠電泳結(jié)果
目的片段EZH2 3'UTR與克隆載體pMD19-T通過連接酶連接后,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后,次日隨機(jī)挑取6個(gè)菌落進(jìn)行PCR鑒定,可見除1個(gè)克隆未出現(xiàn)目的條帶外,其余5個(gè)均出現(xiàn)目的條帶,大小為275bp,與預(yù)期片段大小相符,見圖2。BamHⅠ、EcoRⅠ雙切酶克隆載體pMD19-T—EZH2 3'UTR后,在電泳下可見275bp處有目的條帶,與預(yù)期片段大小相符,見圖3。
圖2 pMD19-I-EZH2 3'UTR菌落PCR擴(kuò)增結(jié)果
圖3 pMD19-T-EZH2 3'UTR雙酶切鑒定
從AMP+的LB平板上隨機(jī)挑克隆,進(jìn)行菌落PCR鑒定,對(duì)于陽性重組子用BamHⅠ、EcoRⅠ進(jìn)行雙酶切鑒定,在約10.2Kb處可見線性慢病毒質(zhì)粒和275bp的目的條帶,見圖4,測(cè)序結(jié)果顯示目的片段已經(jīng)克隆到慢病毒載體中。
圖4 CTX-Lentivirus-EZH2 3'UTR雙酶切鑒定
對(duì)病毒進(jìn)行裂解后用裂解的病毒上清作為模板,以CMV的上下游P3、P5為引物,進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR,做復(fù)管得到CMV1和CMV2的值為1.6×107拷貝/mL和2.1×107拷貝/mL,通過病毒滴度計(jì)算公式得到:病毒滴度為4.3×109拷貝/mL。
經(jīng)梯度摸索篩選穩(wěn)定整合MCF-7細(xì)胞的最佳濃度為0.2μg/mL。經(jīng)Real-Time PCR檢測(cè),實(shí)驗(yàn)組病毒整合入細(xì)胞基因組的值與對(duì)照組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。表明重組EZH2 3'UTR慢病毒載體在MCF-7細(xì)胞中很好地與細(xì)胞基因組整合,見圖5。
圖5 MCF-7細(xì)胞中重組慢病毒載體的整合量鑒定
Western blotting檢測(cè)顯示,在EZH2慢病毒感染實(shí)驗(yàn)組中,EZH2蛋白呈高表達(dá),而沒有感染EZH2 3'UTR的MCF-7乳腺癌細(xì)胞對(duì)照組,則少量表達(dá)EZH2蛋白,見圖6。
圖6 轉(zhuǎn)染慢病毒后EZH2蛋白的表達(dá)
近年研究發(fā)現(xiàn)表觀遺傳調(diào)控因子PcG蛋白(polycomb group proteins)在乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過程中起重要作用[10],其核心成分EZH2蛋白廣泛受到人們關(guān)注。EZH2通過催化組蛋白H3氨基末端的第27位賴氨酸(H3K27)發(fā)生三甲基化[11],促進(jìn)或維持染色體的轉(zhuǎn)錄抑制狀態(tài),從而沉默癌組織中的抑癌基因的表達(dá)[12]。Raaphorst等[13]研究發(fā)現(xiàn),在浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌EZH2表達(dá)明顯增加,表明EZH2是腫瘤發(fā)生發(fā)展的早期階段的分子事件,直接參與了乳腺癌的演變過程。EZH2高表達(dá)機(jī)制尚不清楚,但大量研究表明miRNAs對(duì)EZH2的表達(dá)有重要的調(diào)控作用[7-8]。miRNAs可通過與EZH2基因的3'端非翻譯區(qū)形成堿基配對(duì)抑制其表達(dá)。構(gòu)建3'非翻譯區(qū)慢病毒篩選載體為深入了解EZH2與miRNAs相互的關(guān)系顯得非常必要。
慢病毒載體是以人類免疫缺陷病毒-1(HIV-1)來源的一種病毒載體[14-15],與腺病毒相比,其具有可感染分裂細(xì)胞及非分裂細(xì)胞,轉(zhuǎn)移片段容量較大,目的基因表達(dá)時(shí)間長(zhǎng)、不易誘發(fā)宿主免疫反應(yīng)等優(yōu)點(diǎn)[15-16]。本實(shí)驗(yàn)所選擇的是長(zhǎng)末端重復(fù)序列(LTR)缺失的慢病毒載體,經(jīng)該載體包裝產(chǎn)生的病毒顆粒屬于假型病毒,即病毒感染目的細(xì)胞后不會(huì)再感染其他細(xì)胞,也不會(huì)利用宿主細(xì)胞產(chǎn)生新的病毒顆粒[17]。利用成功構(gòu)建的EZH2基因3'非翻譯區(qū)慢病毒篩選載體,將目的片段EZH2基因3'非翻譯區(qū)整合到MCF-7的基因組中,經(jīng)Real-Time PCR檢測(cè)證實(shí),目的片段在乳腺癌MCF-7中穩(wěn)定整合。同時(shí)Western blotting檢測(cè)顯示,在EZH2慢病毒感染實(shí)驗(yàn)組中,EZH2蛋白呈高表達(dá),而沒有感染EZH2 3'UTR的空MCF-7細(xì)胞對(duì)照組,則低量表達(dá)EZH2蛋白,且該結(jié)果與Kleer等[18]的研究結(jié)果基本一致。
本研究成功構(gòu)建人EZH2基因3'非翻譯區(qū)慢病毒篩選載體,并感染乳腺癌細(xì)胞MCF-7,使其在乳腺細(xì)胞中穩(wěn)定整合,為miRNAs篩選提供理想的病毒載體,同時(shí)該慢病毒載體帶有熒光報(bào)告系統(tǒng),通過熒光報(bào)告基因分析,可以很好實(shí)現(xiàn)miRNAs與EZH2基因的3'端非翻譯區(qū)的功能驗(yàn)證。
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