摘要:以槭樹品種“冷俊”為試材,利用RT-PCR技術(shù),根據(jù)GenBank中登錄的相關(guān)物種查爾酮異構(gòu)酶基因(CHI)的保守序列設(shè)計簡并引物,提取其秋季變色期葉片中的總RNA并擴增出CHI基因的cDNA片段。測序結(jié)果表明,該片段長553 bp,編碼183個氨基酸。序列分析表明,該片段與龍眼、橄欖、山茶、沙梨等的同源性在81%~90%以上,證明已成功克隆到槭樹變色期葉片CHI基因的cDNA片段,在GenBank中登錄號為KC121346。
關(guān)鍵詞:槭樹;CHI基因;克隆;序列分析
中圖分類號:Q785文獻標(biāo)識號:A文章編號:1001-4942(2013)04-0012-04
1材料與方法
11材料
試驗于2011年11月在山東省果樹研究所觀賞園藝室進行,以槭樹品種“冷俊”的秋季變色葉片為試材。于11月份采集葉片,迅速放入液氮中冷凍,帶回實驗室放入-80℃冰箱中備用。
12試劑
PCR kit、cDNA kit購自大連寶生物工程公司,PCR引物合成及測序工作則由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進行。
13方法
131葉片總RNA提取參考招雪晴等[10]的方法,采用改良CTAB法提取槭樹葉片總RNA。瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整性,采用Nanodrop紫外分光光度計測量OD值。
反應(yīng)條件:98℃變性30 s,然后按98℃ 10 s、57℃ 25 s、72℃ 30 s進行35輪循環(huán)反應(yīng),最后72℃延伸6 min,4℃保存。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR結(jié)果。PCR產(chǎn)物送上海生工測序。
134序列分析通過BLASTN 進行同源性比對分析。用DNAMAN 60軟件分析DNA 序列并進行多序列比對,翻譯出氨基酸序列后在BLASTP中搜索相似性高的蛋白質(zhì)序列。
2結(jié)果與分析
21槭樹葉片總RNA的制備
利用改良的CTAB法提取槭樹葉片的RNA,測量其OD值,結(jié)果為201,表明蛋白污染少。用1%的瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,28S、18S條帶較清晰,無降解,說明所提取的RNA純度和完整性較好,無DNA污染,符合cDNA合成的要求。
22槭樹葉片CHI基因片段的克隆與測序
利用設(shè)計好的簡并引物,以槭樹葉片cDNA為模板進行PCR擴增,得到了與預(yù)計片段大小一致的片段(圖1),測序后的cDNA片段為553 bp,編碼183個氨基酸(圖2)。
3結(jié)論與討論
Druka 等[11]曾報道CHI cDNA序列的同源性一般為 42%~65%, 不同物種或同一物種不同類型的CHI也有較大的差異,給同源克隆CHI帶來一定的困難。本試驗表明,用于擴增的引物設(shè)計是同源克隆成功的重要因素,不合適的引物無擴增條帶或產(chǎn)生彌散,而保守性好、GC含量高的引物克隆結(jié)果較好。故選擇保守區(qū)間GC含量高的區(qū)域有利于同源克隆試驗的成功。
目前研究結(jié)果表明,CHI是影響植物顏色形成的重要酶之一,會直接影響植物顏色表達。目前對CHI基因的研究主要在序列分析、基因克隆及轉(zhuǎn)基因表達調(diào)控等方面。對CHIA和CHIB啟動子DNA序列研究表明,啟動子中有高度保守的序列37 bp[12]。菜豆和矮牽牛的氨基酸組成與從豌豆胚軸上克隆的CHI基因氨基酸序列顯示較高的同源性[13]。現(xiàn)已在多種植物中克隆到CHI基因,并開始在轉(zhuǎn)基因植物中應(yīng)用。Muir等[1]曾將矮牽牛CHI基因轉(zhuǎn)入番茄并獲得了轉(zhuǎn)基因番茄,結(jié)果顯示番茄果皮中黃酮類含量增加了78倍,果肉中黃烷醇增加了21倍。將CHS和CHI基因?qū)氚珷颗?,轉(zhuǎn)基因植株花的顏色發(fā)生了改變,花器官也發(fā)生了變異[14]。洋蔥中CHI基因突變引起CHI酶活性的喪失,導(dǎo)致洋蔥變?yōu)榻鹕玔15]。對CHI基因的研究,前人大部分以蔬菜、水果、花卉等物種為試材,但對木本園林植物CHI基因的研究較少,本試驗利用同源克隆的方法,首次以槭樹為試材克隆出CHI基因cDNA片段,為下一步克隆槭樹CHI基因cDNA全長奠定基礎(chǔ),該基因在槭樹秋季變色過程中起何種調(diào)節(jié)作用,還有待于進一步研究。
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