摘要:提取6個癌基因(BAK1、ccnd1、ADAMTS1、ADAM17、ADAMTS8、AGER)的堿基序列,借助MATLAB軟件編寫程序代碼,檢索6個癌基因堿基序列的4種單一堿基(A、T、C、G)的概率和64種三堿基組(AAA、AAT、AAC、……、GGG)的概率;對6個癌基因堿基序列的各種分布進(jìn)行相空間聚類。結(jié)果表明,所在染色體不同、所在細(xì)胞不同、序列長度不同的6個癌基因堿基序列的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)與其生物學(xué)功能之間存在著明確的相空間關(guān)聯(lián)。對生物學(xué)功能未知的基因和生物學(xué)功能已知的基因進(jìn)行堿基序列結(jié)構(gòu)特點(diǎn)分析和相空間聚類,可以由聚類結(jié)果預(yù)測功能未知基因是否具有與功能已知基因相似的生物學(xué)功能,這為尋找具有某種生物學(xué)功能的基因和預(yù)測基因是否具有某種生物學(xué)功能提供了一個有效途徑。
關(guān)鍵詞:癌基因;堿基序列;相空間聚類;生物學(xué)功能;相空間關(guān)聯(lián)
中圖分類號:Q523+.8 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2012)13-2861-03