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        Mimics三維重建模型在人體解剖學(xué)學(xué)習(xí)中的應(yīng)用

        2012-12-13 08:34:56卉,吳
        關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)模型

        王 卉,吳 濤

        南方醫(yī)科大學(xué):1珠江醫(yī)院;2微創(chuàng)外科解剖學(xué)研究所,廣州 510515

        人體解剖學(xué)學(xué)習(xí)的最終目的是了解正常活體情況下各器官結(jié)構(gòu)的空間位置和形態(tài)。所以,在學(xué)習(xí)過程中必須完成知識從平面到立體、從靜態(tài)到動態(tài)的轉(zhuǎn)變。目前,普遍采用的是教科書、解剖圖譜、實(shí)驗(yàn)室觀察人體標(biāo)本相結(jié)合的學(xué)習(xí)方法,強(qiáng)調(diào)教科書與圖譜的結(jié)合。學(xué)習(xí)過程中需要通過二維平面圖像發(fā)揮空間想象力構(gòu)建人體三維立體結(jié)構(gòu),從而加強(qiáng)對人體結(jié)構(gòu)解剖概念及空間形態(tài)的記憶,這對剛剛接觸醫(yī)學(xué)知識的醫(yī)學(xué)生來說,其難度可想而知。Mimics圖像三維重建軟件,可以將二維斷層序列圖像轉(zhuǎn)變?yōu)檎宫F(xiàn)人體器官三維結(jié)構(gòu)與形態(tài)的立體模型。使用這種模型可以使學(xué)生在虛擬三維空間對人體中感興趣的對象放大、旋轉(zhuǎn)和平移,近距離地觀察了解人體內(nèi)部復(fù)雜的空間關(guān)系,極大地拓展了“教與學(xué)”的方法和思路,對傳統(tǒng)人體解剖學(xué)教學(xué)手段和學(xué)習(xí)方法產(chǎn)生了深刻的影響。

        1 三維重建軟件Mimics

        1.1 概述

        目前應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像三維重建的軟件很多,Mimics交互式醫(yī)學(xué)圖像控制系統(tǒng)就是其中之一。Mimics是一套高度整合而且易用的3D圖像生成及編輯處理軟件,它能輸入各種掃描的數(shù)據(jù)(CT、MRI)建立3D模型進(jìn)行編輯,然后輸出通用的CAD(計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì))、FEA(有限元分析)、RP(快速成型)格式文件,可以在PC機(jī)上進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換處理。它由RPSlice、STL+、Simn-Lation、MedCAD和FEA五個(gè)模塊組成[1]。其中:①RP Slice模塊為快速成型切片模塊。通過切片文件提供了Mimics和其他快速成型系統(tǒng)之間的接口,并能自動生成快速成型系統(tǒng)模型所需的支撐結(jié)構(gòu)。RP Slice模塊能夠利用彩色立體激光快速樣板制造技術(shù)將腫瘤、牙根、腺體、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在RP模型中高品質(zhì)地顯示出來,患者的信息也可以用彩色標(biāo)簽顯示;②Simn-Lation模塊,可以實(shí)現(xiàn)手術(shù)過程的模擬。通過人體測量分析模板對細(xì)部的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,完成對骨切開手術(shù)及植入手術(shù)的模擬,也可以用于示教解釋手術(shù)植入的過程;③MedCAD模塊是醫(yī)學(xué)圖像和CAD之間的橋梁。通過雙向交互模式進(jìn)行溝通實(shí)現(xiàn)掃描數(shù)據(jù)與CAD數(shù)據(jù)的相互互換。目前CT、MRI等斷層掃描技術(shù)在診斷方面應(yīng)用相當(dāng)廣泛,但是,二維斷層圖像只是表達(dá)某一截面的解剖信息,很難建立起三維空間的立體結(jié)構(gòu)。在放射治療應(yīng)用中,僅由二維斷層圖像上某些解剖部位進(jìn)行簡單的坐標(biāo)疊加,不能給出準(zhǔn)確的三維影像,容易造成病變(靶區(qū))定位的失真與畸變[2]。如果通過Mimics將這些斷層掃描圖片進(jìn)行三維重建,將二維斷層圖像序列轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂兄庇^立體效果的圖像,展現(xiàn)人體器官的三維結(jié)構(gòu)與形態(tài),可提供若干用傳統(tǒng)手段無法獲得的解剖結(jié)構(gòu)信息,為提高醫(yī)療診斷和治療規(guī)劃的準(zhǔn)確性與科學(xué)性打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        1.2 Mimics三維重建的方法

        1.2.1 圖片導(dǎo)入 針對目前標(biāo)準(zhǔn)的DICOM文件格式,Mimics提供了自動的導(dǎo)入功能,用戶只需要在導(dǎo)入向?qū)У闹敢戮涂梢詫?dǎo)入整個(gè)目錄下的文件或是部分文件。同時(shí),還可以通過半自動的方式導(dǎo)入BMP和TIFF文件,手動的方式導(dǎo)入其他的文件。如:收集雙排螺旋頸胸部的影像CT數(shù)據(jù),掃描范圍為第1胸椎至第12胸椎,斷層掃描層厚為 l mm,共262層,每一斷面包含512×512個(gè)像素,作為胸廓三維重建的斷層掃描圖片,將圖片依順序排列(編號為0-261),放入指定文件夾中備用[3]。

        1.2.2 組織的提取及三維重建 導(dǎo)入原始的斷層圖片后,Mimics會自動計(jì)算生成冠狀面圖和矢狀面圖。Mimics用三個(gè)視圖來顯示這三個(gè)位置的圖片,并且這三個(gè)視圖是相互關(guān)聯(lián)的(圖1A)。右上圖是原始的掃描圖像,左上角和下角是由原始橫斷面圖像計(jì)算生成的冠狀面和矢狀面圖像,冠狀面圖像中橫線指示橫斷面圖像的位置,豎線指示矢狀面位置,在矢狀面圖像中,豎線指示冠狀面圖像的位置。斷層圖片中,不同組織的灰度值不同,故此可以通過閾值來提取相應(yīng)的組織(圖1B)。通過準(zhǔn)確的閾值設(shè)置提取組織,并通過看圖,可檢查所提取的組織是否合適。Mimics會將提取的像素存放在一個(gè)蒙罩(Mask)里,同時(shí),Mimics提供一系列的工具編輯修改蒙罩,從而提取所需的組織。編輯好的蒙罩可以用來生成3D模型,這樣就實(shí)現(xiàn)了2D斷層掃描圖片到三維實(shí)體的轉(zhuǎn)換(圖1C)。

        圖1 A為Mimics用戶界面;B為設(shè)定恰當(dāng)閾值提取組織;C為重建的三維模型

        如:將前一步收集到的262張雙排螺旋頸胸部的影像CT數(shù)據(jù)圖片(圖2A),輸入到Mimics軟件,對圖像進(jìn)行三維重建。軟件可再現(xiàn)頸胸部水平面、矢狀面及冠狀面的影像。利用軟件自帶的閾值設(shè)定選擇擬重建部分,軟件中以不同顏色顯示各種擬重建結(jié)構(gòu),利用圖像編輯功能對圖像邊界進(jìn)行“添加”或“擦除”操作,這樣可使重建圖像更準(zhǔn)確。建立脊柱、胸骨和肋骨的骨性胸廓3D模型,并在軟件的有限元分析(FEA)模塊中對模型進(jìn)行表面網(wǎng)格劃分。利用軟件自帶的“CT圖像灰度一組織力學(xué)材料性質(zhì)”關(guān)系公式,對三維胸廓體網(wǎng)格模型的各單元進(jìn)行材質(zhì)分配,材料和組織考慮為各向同性的線彈性材料,至此得出完整的人體胸廓有限元網(wǎng)格模型(圖2B)。通過三維重建軟件Mimics中閾值設(shè)定、圖像編輯、區(qū)域增長、布爾運(yùn)算及三維計(jì)算等功能對CT斷層數(shù)據(jù)進(jìn)行圖像分割、重建,既可清楚、直觀地再現(xiàn)胸廓整體的三維結(jié)構(gòu),也可單獨(dú)顯示肺、頸椎、胸椎、肋骨、胸骨等結(jié)構(gòu)的三維形態(tài)[4](圖2C)。

        2 Mimics在解剖學(xué)學(xué)習(xí)中的應(yīng)用

        圖2 A為人體胸廓螺旋CT掃描斷層影像;B為重建的人體3D模型;C為肺組織胸廓三維模型

        三維重建軟件Mimics支持多種格式的數(shù)據(jù)(如CT、MRI等影像學(xué)數(shù)據(jù)),重建圖像清晰,將其應(yīng)用于解剖學(xué)教學(xué)、學(xué)習(xí)中可獲得良好的效果。不足之處主要是:Mimics是單機(jī)注冊版,且價(jià)格較高(整套Mimics系統(tǒng)報(bào)價(jià)約20萬人民幣),限制了它的普及應(yīng)用[5]。我們在膝關(guān)節(jié)的學(xué)習(xí)過程中,通過摸索,將Mimics與虛擬現(xiàn)實(shí)造型語言(VRML)編輯軟件Vrmlpad相結(jié)合,選擇正確的文件輸出格式,建立基于Web的醫(yī)學(xué)三維重建模型瀏覽網(wǎng)頁,可以拓展教學(xué)內(nèi)容,優(yōu)化教學(xué)過程,有效提高優(yōu)質(zhì)資源的共享范圍。

        2.1 膝關(guān)節(jié)重建三維模型輸出格式的選擇

        圖3 膝關(guān)節(jié)三維解剖圖譜網(wǎng)頁

        將膝關(guān)節(jié)的斷層影像數(shù)據(jù)導(dǎo)入Mimics,通過Mimics自帶的圖像重建功能,建立膝關(guān)節(jié)各個(gè)部分的三維模型,構(gòu)建模型如圖3所示。在Mimics輸出選項(xiàng)中選擇輸出格式為.wrl。.wrl是基于網(wǎng)絡(luò)的虛擬現(xiàn)實(shí)文件格式,可以用Vrmlpad打開這種文件,將Mimics三維重建模型轉(zhuǎn)換為VRML模型,在IE瀏覽器中安裝Cortona3d插件后,IE即可具有瀏覽VRML三維模型的功能。

        2.2 三維電子圖譜網(wǎng)頁的建立

        膝關(guān)節(jié)三維解剖圖譜利用Dreamweaver進(jìn)行開發(fā),內(nèi)嵌VRML模型瀏覽器。為更好地用于解剖學(xué)教學(xué),該網(wǎng)頁還包括了文字及不同方位的二維圖像。

        2.3 應(yīng)用效果

        在個(gè)人計(jì)算機(jī)上安裝相應(yīng)的VRML插件,打開三維解剖圖譜的網(wǎng)頁后,即可瀏覽到膝關(guān)節(jié)的三維模型及二維圖像。學(xué)習(xí)過程中三維模型的直觀性得到充分體現(xiàn),對照三維模型學(xué)習(xí)如同手持人體標(biāo)本一樣,結(jié)構(gòu)清楚,易于理解,學(xué)生們普遍反映三維重建模型方位感強(qiáng),解剖結(jié)構(gòu)顯示清楚,對于理解膝關(guān)節(jié)前、后交叉韌帶的位置關(guān)系、半月板形態(tài)等都有很好的效果,同時(shí)還可以對照二維解剖學(xué)圖譜及相關(guān)知識點(diǎn),減小了解剖學(xué)的學(xué)習(xí)難度,提高了學(xué)習(xí)效率[6]。

        3 幾種醫(yī)學(xué)三維重建方法比較

        3.1 使用斷層切片、CT和MRI數(shù)據(jù)通過Mimics軟件進(jìn)行重建

        Mimics三維圖像重建軟件可以依據(jù)CT或MRI斷層掃描數(shù)據(jù),在普通計(jì)算機(jī)上進(jìn)行三維重建。不僅可開展骨結(jié)構(gòu)的三維重建,而且可顯示皮膚等軟組織結(jié)構(gòu),在安裝了適當(dāng)?shù)南嚓P(guān)軟件后,重建的三維模型可以在普通的個(gè)人計(jì)算機(jī)上使用,從而大大方便了教學(xué)。對教師而言,首先可以很方便地進(jìn)行解剖理論課的教學(xué),各解剖結(jié)構(gòu)的位置一目了然,不用再辛苦而且枯燥地描述各解剖結(jié)構(gòu)的空間位置,學(xué)生理解及記憶能力也將明顯提高。對學(xué)生而言,首先可以在個(gè)人電腦中近距離觀察人體結(jié)構(gòu)的三維形態(tài)和空間毗鄰關(guān)系,不再需要辛苦地冥想各結(jié)構(gòu)的立體位置。其次,基于Web的醫(yī)學(xué)三維人體模型網(wǎng)頁,相當(dāng)于虛擬人體解剖學(xué)標(biāo)本室,學(xué)生們可以隨時(shí)登錄服務(wù)器下載各種人體三維模型,自主地進(jìn)行解剖學(xué)學(xué)習(xí),滿足個(gè)性化學(xué)習(xí)的需求。因而,Mimics三維圖像重建軟件適合在學(xué)習(xí)過程中廣泛應(yīng)用。

        3.2 用三維激光掃描儀進(jìn)行重建

        激光三維掃描儀,適合骨形態(tài)的三維重建,其原理為:采用逐行掃描方式,通過偏轉(zhuǎn)掃描激光頭,線狀激光束平行掃描骨結(jié)構(gòu)表面,以一定掃描范圍和間距測量并記錄表面點(diǎn)空間位置,測量點(diǎn)數(shù)據(jù)形成點(diǎn)云以文件形式保存,掃描點(diǎn)云圖形成物體的表面輪廓,通過相應(yīng)的圖像拼接軟件完成骨外形的三維重建。該方法重建的三維模型有很大的局限性,它只能對骨的外形進(jìn)行重建,無法對內(nèi)部的骨小梁進(jìn)行重建,也無法重建變形較大的軟組織。由于掃描過程需要進(jìn)行多次、分區(qū)域掃描,每次掃描局部表面,掃描完成后再進(jìn)行點(diǎn)云拼接處理。即根據(jù)兩幅鄰近點(diǎn)云圖中含有的公共表面部分進(jìn)行圖像自動匹配處理[7]。利用三維激光掃描技術(shù)獲取的空間點(diǎn)云數(shù)據(jù),可快速建立結(jié)構(gòu)復(fù)雜、不規(guī)則場景的三維可視化模型,既省時(shí)又省力,這種能力是現(xiàn)行的三維建模軟件所不可比擬的,現(xiàn)行此種建模方式主要適用于工程建模。

        3.3 多層螺旋CT三維重建

        臨床影像中心的多層螺旋CT可對患者CT和MRI數(shù)據(jù)直接進(jìn)行圖像重建而獲得三維圖像。SGI工作站是其超高速三維重建的基礎(chǔ),形成的3D圖像可以任意方向旋轉(zhuǎn)和觀察。利用Remove Object軟件可快速去除非感興趣區(qū),在膽道CT造影、結(jié)腸CT造影、胃CT造影、股骨頭游離、中耳半規(guī)管等特殊的三維重建中有獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢。多層螺旋CT三維重建需要大型、昂貴的數(shù)字設(shè)備支持,因此只能在影像中心的工作站中完成和使用,適用于臨床診斷治療。

        三維模型的應(yīng)用作為眾多多媒體技術(shù)的一種,有著不可替代的作用和優(yōu)勢。在三維可視化狀態(tài)下研究人體結(jié)構(gòu)及其內(nèi)在的解剖位置、參數(shù),可克服諸多傳統(tǒng)人體解剖學(xué)教學(xué)過程中的不足,使教學(xué)過程形象生動,教學(xué)內(nèi)容易于理解,有利于醫(yī)學(xué)生對人體解剖結(jié)構(gòu)知識的理解和把握。

        [1]付淼,李莉,何葉松.Mimics與醫(yī)學(xué)圖像三維重建[J].中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志,2010,20(10):3030-3031

        [2]洪鋒,梅炯,李明祿.醫(yī)學(xué)圖像三維重建技術(shù)綜述[J].中國圖像圖形學(xué)報(bào),2003,8(A):784-789

        [3]李鑒軼,趙衛(wèi)東,張美超,等.醫(yī)學(xué)影像資料三維重建及在解剖學(xué)教學(xué)中的應(yīng)用[J].解剖學(xué)研究,2007,29(2):154-155

        [4]胡輝瑩,何忠杰,呂麗萍,等.應(yīng)用Mimics軟件輔助重建人體胸廓三維有限元模型的研究[J].解放軍醫(yī)學(xué)雜志,2008,33(3):273-274

        [5]方馳華,李曉鋒.醫(yī)學(xué)三維可視化仿真系統(tǒng)研究進(jìn)展[J].中國數(shù)字醫(yī)學(xué)雜志,2009,4(7):25-27

        [6]李鑒軼,張少華,焦培峰,等.膝關(guān)節(jié)三維解剖電子圖譜的制作及在解剖學(xué)教學(xué)中的應(yīng)用[J].解剖學(xué)雜志,2011,34(1):138-139

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