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        實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)兒童肺結(jié)核糞便中Mtb-DNA的效果評(píng)價(jià)

        2012-11-16 10:17:04黃慧謙吳馳陳建波楊燕侯志平李小勇
        中國(guó)防癆雜志 2012年5期
        關(guān)鍵詞:涂片結(jié)核病肺結(jié)核

        黃慧謙 吳馳 陳建波 楊燕 侯志平 李小勇

        2003年WHO估計(jì),每年全球有1~2億人死于結(jié)核病,其中有30萬15歲以下兒童死于肺結(jié)核。盡管兒童結(jié)核病疫情嚴(yán)峻,但長(zhǎng)期以來,人們往往對(duì)成人結(jié)核病給予更多的關(guān)注,對(duì)于兒童結(jié)核病卻容易忽視。由于兒童患者痰標(biāo)本獲得困難,阻礙了小兒結(jié)核病的診斷。為了獲得臨床細(xì)菌學(xué)檢查標(biāo)本往往需要采用侵入性檢查方法,如采用纖維支氣管鏡(簡(jiǎn)稱“纖支鏡”)誘導(dǎo)痰或用胃鏡吸取胃內(nèi)容物查找抗酸桿菌,這些方法不僅給患兒帶來痛苦,而且也增加了醫(yī)院感染的風(fēng)險(xiǎn),并且敏感度不高。

        本研究收集臨床診斷肺結(jié)核的住院兒童的糞便標(biāo)本,同時(shí)采用熒光探針加聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)相結(jié)合的檢測(cè)方法,初步建立起了應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光PCR(FQ-PCR)技術(shù)快速檢測(cè)肺結(jié)核患兒糞便標(biāo)本的流程,并對(duì)其臨床效果進(jìn)行初步評(píng)估。

        材料和方法

        一、標(biāo)本來源與分組

        實(shí)驗(yàn)組:收集本院2010年1月至2011年8月間臨床診斷為肺結(jié)核并排除腸結(jié)核病、年齡小于16歲的住院患兒糞便標(biāo)本76例作為實(shí)驗(yàn)組,實(shí)驗(yàn)組中41例患兒可取得痰標(biāo)本進(jìn)行培養(yǎng)及抗酸桿菌涂片細(xì)菌學(xué)檢查,進(jìn)一步分為15例痰菌陽(yáng)性肺結(jié)核患兒、26例痰菌陰性肺結(jié)核患兒與35例無痰肺結(jié)核患兒3組。住院患者診斷標(biāo)準(zhǔn)符合下列條件之一:痰或纖支鏡刷片查抗酸菌涂片陽(yáng)性;或Mtb培養(yǎng)陽(yáng)性;或其他治療無效,影像學(xué)檢查符合肺結(jié)核病診斷[1]。并正規(guī)抗結(jié)核治療有效,無腸道結(jié)核癥狀與體征,符合肺結(jié)核病演變過程。患兒年齡最小1個(gè)月,最大16歲,平均年齡(9.91±5.56)歲。其中男性50例,女性26例,男∶女=1.92∶1。其中臨床診斷為肺結(jié)核住院患兒68例,肺結(jié)核合并胸膜炎或胸腔積液4例,結(jié)核性腦膜炎3例,頸部淋巴結(jié)核1例。

        對(duì)照組:取同時(shí)期我院兒科住院的20例其他呼吸系統(tǒng)疾病患兒的糞便標(biāo)本作為對(duì)照組檢測(cè)FQ-PCR,其中男性12例,女性8例,男女比例為1.5∶1,年齡最小4個(gè)月,最大14歲,平均年齡(8.47±4.03)歲,臨床診斷上呼吸道感染患兒4例,肺炎6例,皰疹性咽峽炎10例。

        二、方法

        1.糞便標(biāo)本預(yù)處理:新鮮糞便標(biāo)本收集在無菌塑料杯中,取回實(shí)驗(yàn)室后置入(4℃)冰箱保存,時(shí)間不超過48h。取500mg糞便標(biāo)本加入裝有2ml無菌PBS緩沖液(0.05mol/L,pH 7.4)的試管中充分振蕩搖勻后,3200×g離心5min,收集上清液,重復(fù)上述PBS洗滌離心步驟1次,最終收集上清液1ml置于1.5ml的eppendorf管中。然后上清液16 400×g離心10min,棄上清后,沉淀加入1ml生理鹽水中重懸混勻,等分為2份后,16 400×g離心10min,棄上清,保留沉淀,一份標(biāo)本置于-30℃冰箱中待抽提DNA,另一份標(biāo)本行涂片檢查。所有標(biāo)本在1h內(nèi)預(yù)處理完畢。

        2.試劑盒抽提DNA:糞便標(biāo)本預(yù)處理后采用進(jìn)口試劑盒(QIAGEN公司QIAamp DNA mini kit)快速提取DNA,痰標(biāo)本采用中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司提供的Mtb核酸擴(kuò)增(PCR)熒光檢測(cè)試劑盒提取DNA,具體操作步驟按照說明書進(jìn)行。

        3.FQ-PCR檢測(cè) Mtb:Mtb核酸擴(kuò)增(PCR)熒光檢測(cè)試劑盒由中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司提供。具體操作步驟按照說明書操作。樣本熒光擴(kuò)增曲線根據(jù)說明書進(jìn)行結(jié)果判斷分析。

        4.Mtb培養(yǎng)和涂片檢查:痰Mtb培養(yǎng)參照《結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程》[2],采用法國(guó)梅里埃公司BACTEC MGIT 960快速培養(yǎng)系統(tǒng),陰性標(biāo)本培養(yǎng)42d,培養(yǎng)陽(yáng)性標(biāo)本需涂片檢查確認(rèn)。痰、糞便涂片檢查采用金胺O染色,暗視野熒光顯微鏡下檢測(cè),具體操作參照《結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程》[2]進(jìn)行。

        三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        使用SPSS 11.0統(tǒng)計(jì)軟件及Excel進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,兩種方法檢驗(yàn)結(jié)果的比較采用四格表資料分析,計(jì)數(shù)資料的比較采用卡方檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        一、糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)的敏感度和特異度

        實(shí)驗(yàn)組76例患兒糞便標(biāo)本中檢出Mtb-DNA陽(yáng)性18例,敏感度為23.68%;對(duì)照組20例其他呼吸系統(tǒng)疾病患兒的糞便標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),F(xiàn)Q-PCR結(jié)果均為陰性,特異度為100.00%。

        二、糞便標(biāo)本FQ-PCR與金胺O染色檢測(cè)結(jié)果的比較

        76例患兒糞便標(biāo)本中,F(xiàn)Q-PCR檢測(cè),Mtb陽(yáng)性18例,陽(yáng)性率23.68%(18/76);76例患兒糞便標(biāo)本同時(shí)采用金胺O染色涂片檢測(cè),Mtb陽(yáng)性5例,陽(yáng)性率僅為6.58%(5/76)。兩者均為陽(yáng)性者5例,兩者均為陰性者58例,涂片陰性、FQ-PCR陽(yáng)性標(biāo)本13例,涂片陽(yáng)性而FQ-PCR陰性標(biāo)本0例(表1)。FQ-PCR檢測(cè)陽(yáng)性率明顯高于涂片檢測(cè),兩種方法采用四格表資料的Fisher確切概率法計(jì)算(累積概率P=0.00046,P<0.05),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        表1 兩種實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法對(duì)糞便標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果的比較(例)

        三、痰細(xì)菌學(xué)檢測(cè)陽(yáng)性、痰細(xì)菌學(xué)檢測(cè)陰性與無痰肺結(jié)核患兒的糞便標(biāo)本FQ-PCR結(jié)果的比較

        41例患兒同時(shí)進(jìn)行了至少1次以上的痰標(biāo)本的涂片和(或)培養(yǎng)檢測(cè)(其中痰菌陽(yáng)性患兒15例、痰菌陰性患兒26例),收集患兒糞便標(biāo)本進(jìn)行FQ-PCR檢測(cè);另有35例患兒未收集到痰標(biāo)本,因此只進(jìn)行了糞便標(biāo)本的FQ-PCR檢測(cè)。如表2所示,痰菌陽(yáng)性肺結(jié)核患兒組糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性10例,陽(yáng)性率66.67%(10/15);痰菌陰性肺結(jié)核患兒組糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性1例,陽(yáng)性率3.85%(1/26);無痰肺結(jié)核患兒組糞便標(biāo)本PCR檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性7例,陽(yáng)性率20.00%(7/35)。兩兩比較,痰菌陽(yáng)性患兒與痰菌陰性患兒(χ2=16.06,P<0.05)、無痰肺結(jié)核患兒 (χ2=10.19,P<0.05)FQ-PCR陽(yáng)性率,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;痰菌陰性患兒與無痰肺結(jié)核患兒FQ-PCR陽(yáng)性率比較,差異也有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.23,P<0.05)。

        表2 痰菌陽(yáng)性、痰菌陰性肺結(jié)核患兒與無痰肺結(jié)核患兒糞便FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果(例)

        四、糞便標(biāo)本與痰標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果的比較

        41例兒童肺結(jié)核患兒同時(shí)收集到了糞便和痰標(biāo)本。取同一患兒的糞便和痰標(biāo)本進(jìn)行FQ-PCR檢測(cè),其結(jié)果如表3所示,糞便標(biāo)本PCR檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性11例,陽(yáng)性率26.83%(11/41);痰標(biāo)本 PCR檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性18例,陽(yáng)性率43.90%(18/41);兩者均為陽(yáng)性有11例,兩者均為陰性有22例,痰標(biāo)本陰性、糞便PCR陽(yáng)性標(biāo)本1例,痰標(biāo)本陽(yáng)性而糞便PCR陰性標(biāo)本8例。兩種方法采用四格表資料χ2檢驗(yàn)的校正公式進(jìn)行比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=12.93,P<0.05)。

        表3 同一患者的兩種標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果比較(例)

        討 論

        全球結(jié)核病疫情發(fā)展迅猛,兒童結(jié)核病發(fā)病率也在增加。長(zhǎng)期以來,兒童結(jié)核病的診斷與治療容易被忽視,兒童結(jié)核病的誤診率極高。國(guó)內(nèi)有文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì),超過40%的兒童結(jié)核病患者誤診時(shí)間大于30d,誤診時(shí)間大于90d的患者也不鮮見[3]。兒童結(jié)核病診斷較困難最重要的原因之一是,結(jié)核病患兒的臨床標(biāo)本留取困難,細(xì)菌學(xué)檢查的方法陳舊且陽(yáng)性率低。2000年我國(guó)痰涂片與培養(yǎng)陽(yáng)性兒童患者不足6萬例,同期據(jù)估算全國(guó)有活動(dòng)性肺結(jié)核病兒童患者45萬例,即大部分結(jié)核病患兒為Mtb細(xì)菌學(xué)檢查陰性[4]。

        兒童和嬰兒無法主動(dòng)咯出痰標(biāo)本,本研究實(shí)驗(yàn)組76例兒童肺結(jié)核患者中,只有41例患兒最終收集到了痰標(biāo)本進(jìn)行涂片和(或)培養(yǎng)檢測(cè)。兒童肺結(jié)核患者的痰大部分吞入消化道中,據(jù)此,國(guó)內(nèi)外有報(bào)道通過插胃管吸取胃液標(biāo)本查分枝桿菌,診斷的陽(yáng)性率可達(dá)20%~40%[5-6]。雖然抽取兒童胃液進(jìn)行細(xì)菌學(xué)或PCR檢查,可提高M(jìn)tb檢出率,但該方法屬于侵入性操作,既增加了患兒的痛苦又對(duì)臨床實(shí)施的各方面要求較高,目前在我國(guó)難以作為兒童肺結(jié)核常規(guī)診斷方法,尤其是不適合用于臨床疑似肺結(jié)核患兒的初步篩查。2008年,Wolf等[7]對(duì)236名懷疑肺結(jié)核的患兒進(jìn)行了大量的侵入性檢查,包括支氣管灌洗和插胃管等,收集到超過2000份臨床標(biāo)本進(jìn)行Mtb培養(yǎng),最終只有16名患兒培養(yǎng)結(jié)果為陽(yáng)性,初篩陽(yáng)性率極低。

        2003年,Montenegro等[8]研究發(fā)現(xiàn)肺結(jié)核患者糞便標(biāo)本中可檢測(cè)到Mtb-DNA,說明Mtb核酸經(jīng)過腸道轉(zhuǎn)運(yùn)后仍可保持完整。本研究采用試劑盒快速提取糞便樣本中總DNA和FQ-PCR擴(kuò)增Mtb種屬特異性IS6110核酸片段的方法,最終實(shí)驗(yàn)結(jié)果敏感度達(dá)到23.68%,特異度為100.00%。本研究中,76例糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)陽(yáng)性18例,陽(yáng)性率23.68%,金胺O染色涂片檢測(cè)陽(yáng)性標(biāo)本5例,陽(yáng)性率僅為6.58%。糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)陽(yáng)性率明顯高于涂片檢測(cè),該實(shí)驗(yàn)結(jié)果與2009年El Khéchine等[9]的相關(guān)報(bào)道是一致的。一方面說明了糞便標(biāo)本采用FQ-PCR進(jìn)行檢測(cè)受干擾小,結(jié)果靈敏度較高;另一方面,由于Mtb涂片檢查陽(yáng)性率低于熒光PCR的檢測(cè)[10],同時(shí)也由于糞便中雜質(zhì)較多,導(dǎo)致背景干擾較大,進(jìn)一步降低了糞便涂片檢查的陽(yáng)性率,表明糞便標(biāo)本涂片不適用于臨床查Mtb。

        本研究對(duì)痰細(xì)菌學(xué)檢測(cè)陽(yáng)性、痰細(xì)菌學(xué)檢測(cè)陰性與無痰肺結(jié)核患兒的糞便標(biāo)本的FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行了比較,還對(duì)同一患兒的糞便標(biāo)本FQPCR檢測(cè)結(jié)果與痰標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行了比較。經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析可知,痰菌陽(yáng)性肺結(jié)核患兒糞便標(biāo)本FQ-PCR陽(yáng)性率(66.67%)明顯高于痰菌陰性組(3.85%)和無痰患兒組(20.00%);同一患者的痰標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)陽(yáng)性率(43.90%)也顯著高于糞便標(biāo)本PCR檢測(cè)陽(yáng)性率(26.83%),因此,糞便標(biāo)本PCR檢出率高于糞便涂片但低于痰涂片和(或)培養(yǎng)以及痰PCR,比較敏感。但是,76例結(jié)核病患兒中有35例(46.05%)只收集到糞便標(biāo)本,經(jīng)FQPCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn)了陽(yáng)性7例。因此,雖然痰涂片加培養(yǎng)或者痰PCR檢測(cè)優(yōu)于糞便標(biāo)本PCR檢測(cè),但糞便標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)結(jié)果對(duì)兒童結(jié)核病患者痰標(biāo)本的細(xì)菌學(xué)和分子生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果是一個(gè)有益的補(bǔ)充。

        本研究采用試劑盒提取糞便標(biāo)本中DNA,快速高效,減少了糞便中PCR抑制劑對(duì)結(jié)果的干擾;采用FQ-PCR擴(kuò)增技術(shù),比普通PCR擴(kuò)增加電泳檢查又可大大提高檢測(cè)的靈敏度。糞便檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性的患兒,不但可避免多次侵入性檢查;而且,整個(gè)操作流程只需5~6h,速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于Mtb培養(yǎng)所需的幾個(gè)星期。同時(shí),保留檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性的糞便標(biāo)本DNA,還可進(jìn)一步用于利福平、異煙肼等抗結(jié)核藥物的耐藥突變位點(diǎn)的檢測(cè)。這些研究的證據(jù)都表明,糞便標(biāo)本熒光實(shí)時(shí)PCR可以協(xié)助診斷小兒肺結(jié)核病。

        總之,糞便熒光實(shí)時(shí)PCR是一種特異度高、中度敏感、非侵入性且相對(duì)安全快速的診斷方法,作為可疑兒童肺結(jié)核患者的一項(xiàng)初篩測(cè)試,可減少兒童結(jié)核病誤診的發(fā)生。隨著DNA提取和PCR擴(kuò)增技術(shù)的不斷改進(jìn),其檢測(cè)陽(yáng)性率還可進(jìn)一步提高。由于結(jié)果的高特異度,早期糞便熒光實(shí)時(shí)PCR檢測(cè)還能幫助臨床醫(yī)生迅速找出肺結(jié)核患兒,并開始進(jìn)行早期治療。

        [1]金彪,朱銘.兒童胸部影像學(xué)診斷.第9講 兒童肺結(jié)核的影像診斷.中國(guó)實(shí)用兒科雜志,2004,19(9):574-575.

        [2]中國(guó)防癆協(xié)會(huì)基礎(chǔ)專業(yè)委員會(huì).結(jié)核病診斷實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)程.北京:中國(guó)教育文化出版社,2006.

        [3]紀(jì)洪新,邱建清,周峰.兒童結(jié)核病延誤診斷原因分析.臨床肺科雜志,2005,10(2):238.

        [4]中華人民共和國(guó)衛(wèi)生部.2000年第四次全國(guó)肺結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查.北京:人民衛(wèi)生出版社,2003:1-52.

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        [6]肖愛清,侯雙翼,王文,等.聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)檢測(cè)兒童肺結(jié)核效果初探.中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué),2003,3(2):140-141.

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        [10]吳馳,張紅梅,詹能勇,等.熒光定量PCR技術(shù)在肺結(jié)核診斷中的臨床應(yīng)用研究.中國(guó)防癆雜志,2010,32(10):647-650.

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