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        四種檢測法在乙腈沉淀法去除血清蛋白中的比較

        2012-11-10 15:27:22胡洪華宋海星胡瀚丹
        中國醫(yī)藥導(dǎo)報 2012年23期
        關(guān)鍵詞:沉淀法乙腈蛋白質(zhì)

        胡洪華 蔣 婷 宋海星 胡瀚丹

        1.成都醫(yī)學(xué)院檢驗醫(yī)學(xué)院,四川成都 610083;2.成都醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)系,四川成都 610083

        四種檢測法在乙腈沉淀法去除血清蛋白中的比較

        胡洪華1蔣 婷1宋海星2▲胡瀚丹1

        1.成都醫(yī)學(xué)院檢驗醫(yī)學(xué)院,四川成都 610083;2.成都醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)系,四川成都 610083

        目的比較四種方法在乙腈沉淀法去除血清蛋白中的檢測效果,建立一種能快速檢測去蛋白率的方法。 方法用乙腈沉淀法去除血清蛋白,分別應(yīng)用四種不同的檢測分析方法,方法Ⅰ通過真空凍干;方法Ⅱ通過真空干燥;方法Ⅲ通過設(shè)立對照調(diào)零;方法Ⅳ通過揮干乙腈,分析血清蛋白的去除率。 結(jié)果 方法Ⅰ和方法Ⅱ耗時長、設(shè)備要求高;方法Ⅲ耗時最短、方法簡便;方法Ⅳ耗時較短、但容易產(chǎn)生實驗誤差,方法Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ的蛋白去除率結(jié)果比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),與方法Ⅳ比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。 結(jié)論 方法Ⅲ為最佳的分析測定分析方法,可用于快速方便了解乙腈的去蛋白率。

        乙腈沉淀法;血清蛋白;去蛋白率

        研究表明血清中有20多種高豐度蛋白質(zhì),占血清總蛋白的80%以上,而對疾病診斷有密切關(guān)系的蛋白含量甚微[1]。在檢測過程中血清高豐度蛋白質(zhì)不僅會掩蓋許多重要低豐度蛋白質(zhì),還會相對減小低豐度蛋白質(zhì)的上樣量,使得低豐度蛋白質(zhì)的難分離純化[2]。在進行蛋白組研究中,對血清樣本進行預(yù)處理,去除血清中的高分子量、高豐度蛋白質(zhì),排除它們對低豐度蛋白質(zhì)的掩蓋作用,促進低豐度蛋白質(zhì)的檢出很有必要。目前常用的去蛋白技術(shù)有蛋白質(zhì)沉淀法、親和技術(shù)、色譜技術(shù)等[3]。蛋白質(zhì)沉淀法是一種快速蛋白質(zhì)去除方法,乙腈沉淀法能去除血清中高豐度蛋白,是一種簡便、經(jīng)濟、有效的前期處理方法[4]??焖贆z測出乙腈的去蛋白率在研究中顯得十分必要,本研究旨在探索一種新的快速的檢測方法檢測其去蛋白率。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        血清標(biāo)本來源于GIBCO公司生產(chǎn)的小牛血清;乙腈(ACN)為美國sigma公司生產(chǎn);吸光度檢測儀為ND-1000分光光度計;Block Heaters GL-50為海門市其林貝爾儀器有限公司生產(chǎn);高速冷凍離心機為Eppendorf公司產(chǎn)品;真空冷凍凍干系統(tǒng)為美國Themo公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        從-80℃取出血清于4℃條件下解凍,解凍后,用超純水稀釋成5倍和25倍共3個待測血清樣本。每個樣品進行4次平行試驗,每個待測濃度按四種分析方法進行分析檢測,分別計算每種分析方法的去蛋白率。見表1。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法

        實驗數(shù)據(jù)采用SPSS 13.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)處理。計量資料數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間分析比較采用配對樣本t檢驗,去蛋白率的比較采用χ2檢驗。P<0.05表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 大體觀察結(jié)果

        去除蛋白后的上清液較去除蛋白前比較顏色明顯變淡,干燥后的樣本有黃色固體物附著于管壁,用超純水溶解于1.5 mL的EP管中,溶液澄清透明,如水樣。其顏色深淺與蛋白濃度成正相關(guān)。

        2.2 四種方法提取成功結(jié)果及耗時比較分析

        四種方法對三種不同濃度的樣本進行去蛋白的處理,每個樣本進行四次獨立實驗,分別檢測其去蛋白率。分析四種方法的實驗成功率和耗時,四種方法的成功率均為100%,四種方法的耗時差異明顯,方法Ⅲ通過建立實驗對照組,通過調(diào)零,方便、快捷、耗時短(表 2)。

        表1 檢測方法

        表2 四種方法提取的實驗結(jié)果

        2.3 紫外分光光度法檢測蛋白濃度

        四種方法對三種不同濃度的樣本進行去蛋白處理,通過紫外分光光度法檢測樣品去蛋白前后的蛋白濃度,并通過4次復(fù)實驗分析去蛋白前后的蛋白濃度(表3)。

        表3 紫外分光光度法檢測分析個樣本的蛋白濃度(±s,ng/μL)

        表3 紫外分光光度法檢測分析個樣本的蛋白濃度(±s,ng/μL)

        編號 樣品濃度 去蛋白前蛋白濃度 去蛋白后蛋白濃度方法Ⅰ方法Ⅱ方法Ⅲ方法Ⅳ高中低高中低高中低高中低45.27±0.48 9.14±0.16 1.81±0.01 45.27±0.48 9.14±0.16 1.81±0.01 45.27±0.48 9.14±0.16 1.81±0.01 45.27±0.48 9.14±0.16 1.81±0.01 0.97±0.04 0.28±0.05 0.13±0.03 0.91±0.07 0.30±0.02 0.18±0.09 0.37±0.07 0.17±0.11 0.01±0.01 3.36±0.06 1.38±0.07 0.52±0.06

        2.4 去蛋白率的分析

        方法Ⅰ、Ⅱ和方法Ⅳ相比,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),與方法Ⅲ比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表3。

        2.5 標(biāo)本蛋白濃度對去蛋白率影響的分析

        標(biāo)本蛋白濃度對去蛋白率的影響應(yīng)用標(biāo)本蛋白濃度的單因素方差分析表明,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)??梢姌?biāo)本蛋白濃度因素對去蛋白率無影響。

        3 討論

        質(zhì)譜鑒定蛋白技術(shù)已經(jīng)比較成熟,樣品有一定的純度和濃度是得到比較準(zhǔn)確的結(jié)果的前提條件,而高豐度蛋白的存在必然嚴(yán)重干擾小分子蛋白質(zhì)的分離檢測和鑒定[5]。理想的蛋白質(zhì)去除技術(shù)應(yīng)該是具有選擇性的,即能100%地去除不需要研究的高豐度蛋白質(zhì),同時又對擬研究的小分子蛋白質(zhì)的含量或活性不產(chǎn)生影響[6-7]。乙腈去蛋白質(zhì)法是一種快速的去除雜質(zhì)蛋白質(zhì)的方法,在研究中即時知道乙腈的去蛋白效果是每位研究者急切關(guān)注的問題。

        綜合以上四種檢測乙腈去除高豐度蛋白質(zhì)的方法,可以看出方法Ⅰ是種參考方法,通過低溫凍干的方式將含低豐度蛋白質(zhì)的溶液凍干,再用超純水復(fù)溶檢測計算乙腈的去蛋白率。方法Ⅱ是一種常用方法,但其耗時較長。方法Ⅳ通過揮干的方式去掉溶劑,在實驗過程中對設(shè)備的要求較高且容易產(chǎn)生實驗誤差。本研究提示方法Ⅳ與其他方法相比,蛋白檢測率差異明顯,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。通過比較,結(jié)果提示在實驗中通過建立對照組,在紫外法檢測蛋白濃度時使用對照調(diào)零去除乙腈對的干擾,可快速檢測出乙腈的去蛋白效果。

        [1]Steel LF,Trotter MG,Nakajma PB,et al.Efficient and specific removal of album in from human serum samples[J].Mol Cell Proteomics,2003,2(4):262-270.

        [2]Adkins JN,Varnum SM,Auberry KJ,et al.Toward a human blood serum proteome analysis by multid in ensional separation coupled with mass spectrometry[J].Mol Cell Proteomics,2002,1(12):947-955.

        [3]覃健,張志勇,何敏,等.兩種去除血清高豐度蛋白方法的比較[J].預(yù)防醫(yī)學(xué)情報雜志,2010,26(4):322-324.

        [4]覃健,胡天橋,張志勇,等.乙腈沉淀法去除人血清中高豐度蛋白的探索性研究[J].中國衛(wèi)生檢驗雜志,2010,20(5):963-964.

        [5]Diamandis EP.Mass spectrometry as a diagnostic and a can cerbiomarker discovery tool opportunities and potential limitations [J].Mol Cell Proteomics,2004,3(4):367-378.

        [6]Ramstrm M,Hagman C,Jennifer K,et al.Depletion of high-abundant proteins in body fluids prior to liquid chromatography fourier transformion cyclotron resonance mass spectrometry[J].J Proteome Res,2005,4(2):410-416.

        [7]Zolotarjova N,Martosella J,Nicol G,et al.Differences among techniques forhigh-abundantproteindepletion[J].Proteomics,2005,5(13):3304-3313.

        Comparison of four method for removing serum protein by acetonitrile precipitation

        HU Honghua1JIANG Ting1SONG Haixing2▲HU Handan1
        1.School of Laboratory Medicine,Chengdu Medical College,Sichuan Province,Chengdu 610083,China;2.Department of Biomedical Sciences,Chengdu Medical College,Sichuan Province,Chengdu 610083,China

        Objective To compare the test effect of serum protein removal rate by acetonitrile precipitation with four different methods,the aim is to establish a rapid test method to detect the serum protein removal rate.Methods The serum proteins were removed by acetonitrile precipitation experiments,and applied for four different detection methods,vacuum freeze-drying(methodⅠ),vacuum drying(methodⅡ),controlled through the establishment of zero(method Ⅲ),dryness acetonitrile(methodⅣ)were detected the serum protein removal rate in respect.Results MethodⅠand methodⅡwere time-consuming and higher equipment requirements,while methodⅢwas time-saving and simple,although methodⅣwas time-saving,it was prone to experimental error,methodⅠ,Ⅱ andⅢ proteins removal results revealed no significant difference (P>0.05)compared with methodⅣ,which had statistically significant difference (P<0.05).Conclusion MethodⅢis the best analysis of measurement and analysis method,and can be used to understand the removal quickly and easily.

        Acetonitrile precipitation;Serum proteins;Protein removal rate

        R446.1

        A

        1673-7210(2012)08(b)-0085-02

        成都醫(yī)學(xué)院創(chuàng)新性實驗項目(CX2010013)?!?/p>

        2012-03-28 本文編輯:谷俊英)

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