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        CD3/CD28共刺激調(diào)節(jié)T細(xì)胞多重信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的基因mRNA表達(dá)①

        2012-09-12 10:54:44周俐斐陳峰陽李曉譽(yù)徐世芳葉益萍浙江省腫瘤醫(yī)院杭州310022
        中國免疫學(xué)雜志 2012年5期
        關(guān)鍵詞:基因芯片信號轉(zhuǎn)導(dǎo)活化

        周俐斐 陳峰陽 李曉譽(yù) 徐世芳 葉益萍 (浙江省腫瘤醫(yī)院,杭州310022)

        T細(xì)胞經(jīng)特異抗原刺激激活,涉及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因的活化和轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞因子分泌、細(xì)胞分裂和增殖分化等過程。T細(xì)胞活化需要兩種信號,一種是TCR/CD3與抗原提呈細(xì)胞(Antigen presenting cells,APCs)表面特異的MHCⅡ抗原肽復(fù)合物結(jié)合產(chǎn)生的特異性抗原刺激信號;另一種是非特異性協(xié)同刺激信號,如 CD154/CD40、CD28/B7、CD2/CD58、LFA-1(CD18)/ICAM-1(CD54)等,其中CD28/B7是最為重要的協(xié)同刺激分子,增加IL-2的產(chǎn)生,加速T細(xì)胞增殖,阻止細(xì)胞進(jìn)入無能狀態(tài)或死亡[1]。T細(xì)胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程復(fù)雜多樣,雖然對 Ca2+、PKC、Ras、MAP/ERK、NFAT、NF-κB 等轉(zhuǎn)導(dǎo)通路有了較好的認(rèn)識,但其活化的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚未完全清楚[2]。

        本實(shí)驗(yàn)中,我們在體外用CD3/CD28共刺激小鼠T細(xì)胞活化,提取RNA后,采用“信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路發(fā)現(xiàn)者”PCR芯片(Signal Transduction PathwayFinder PCR Array),觀察了18個不同信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路相關(guān)的84個關(guān)鍵基因的mRNA改變情況,對T細(xì)胞活化的基因調(diào)控過程進(jìn)行了探討。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)動物 SPF級雌性BALB/c小鼠,6周齡,18~22克,購于中國科學(xué)院上海實(shí)驗(yàn)動物中心,合格證號:SCXK(滬)2007-0005。實(shí)驗(yàn)動物購得后飼養(yǎng)一周再進(jìn)行免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)。

        1.2 主要試劑和儀器 RPMI1640培養(yǎng)基購自賽默飛世爾生物化學(xué)制品(北京)有限公司,臨用前加入100 U/ml青霉素、100 μg/ml鏈霉素和10%胎牛血清配制成完全培養(yǎng)液;胎牛血清(無菌、無支原體、無嗜菌體)購自杭州四季青生物工程有限公司;紅細(xì)胞裂解液購自碧云天生物技術(shù)研究所;T細(xì)胞純化尼龍毛柱購自日本和光純藥工業(yè)株式會社;功能級純化抗小鼠CD3e和CD28抗體購自美國eBioscience公司;小鼠IL-2 ELISA檢測試劑盒購自武漢博士德生物工程有限公司;Trizol購自美國Invitrogen公司;RNeasy?MinEluteTM純化試劑盒購自美國Qiagen公司;小鼠Signal Transduction PathwayFinder PCR Array(PAMM-014)購自美國Superarray公司;Bio-Rad 680型酶標(biāo)儀為美國Bio-Rad公司;NanoDrop?ND-1000全波長紫外/可見光掃描分光光度計為美國Thermo公司;ABI PRISM?7900熒光定量PCR儀為美國Applied Biosystems公司。

        1.3 小鼠T淋巴細(xì)胞的分離 按文獻(xiàn)[3]方法無菌取小鼠脾臟,制成單細(xì)胞懸液;以紅細(xì)胞裂解液裂解紅細(xì)胞,洗滌后以完全培養(yǎng)液混懸,調(diào)整濃度為1×108個/ml。以反向吸附法用尼龍毛柱純化T細(xì)胞[4],收集細(xì)胞后以臺盼藍(lán)排斥法計數(shù)和計算存活率,以FITC-抗-CD3標(biāo)記后流式細(xì)胞儀測定T細(xì)胞的純度。細(xì)胞存活率>95%;T細(xì)胞純度>85%。

        1.4 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖 于CD3e抗體包被的96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,加入T細(xì)胞(2×106個/ml)和CD28抗體。37℃、5%CO2培養(yǎng)24和48小時后,分別以MTT法測定T細(xì)胞增殖程度,結(jié)果以570 nm測定的吸光度A表示。

        1.5 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞IL-2的分泌 于CD3e(5 μg/ml)抗體包被的96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,加入T細(xì)胞(2×106個/ml)和 CD28(1 μg/ml)抗體。37℃,5%CO2培養(yǎng)6、12、24 和48 小時后,分別收集細(xì)胞培養(yǎng)上清,以ELISA法按IL-2檢測試劑盒說明測定IL-2的含量。

        1.6 CD3/CD28對T細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中基因mRNA表達(dá)的影響

        1.6.1 細(xì)胞收集 于CD3e(5 μg/ml)抗體包被的24孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,加入T細(xì)胞(2×106個/ml)和CD28(1 μg/ml)抗體。37℃,5%CO2培養(yǎng) 4 小時后,收集細(xì)胞。

        1.6.2 RNA 提取和純化 Trizol提取 RNA,以DNaseⅠ消化RNA樣品,去除其中可能含有的基因組DNA。經(jīng)RNeasy?MinEluteTM純化試劑盒純化后的RNA,分別以變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外吸收測定法觀察28S、18S核糖體RNA的條帶和測定A260/A280,檢測RNA質(zhì)量,計算RNA濃度。

        1.6.3 cDNA 合成 取 RNA 1.5 μg,加 oligo(dT)18(500 ng/μl)1 μl,10 mmol/L dNTP Mix 1 μl,加水補(bǔ)充至總體積13 μl,65℃水浴5分鐘后,冰上放置至少1分鐘。短暫離心后,在離心管中依次加入5×First-Strand Buffer 4 μl,0.1 mol/L DTT 1 μl,RNase Inhibitor 1 μl和 SuperScriptⅢ RT 1 μl,混合均勻。50℃溫育60分鐘,70℃ 溫育15分鐘使酶失活。加91 μl滅菌水混勻,置冰浴待用。

        1.6.4 PCR反應(yīng) 96孔板中的小鼠 Signal Transduction PathwayFinder PCR Array含有89個相關(guān)基因(包括 GUSB、HPRT1、HSP90AB1、GAPDH 和 β-Actin 5 個管家基因)。取 102 μl cDNA 加 550 μl 2×SuperArray PCR master mix和 448 μl雙蒸水混合,取10 μl置各孔中。將PCR Array置于實(shí)時定量PCR儀進(jìn)行PCR反應(yīng),設(shè)置程序?yàn)?聚合酶激活/變性(95℃)10分鐘,擴(kuò)增40個循環(huán)(95℃,15秒;60℃,1分鐘),收集熒光。

        1.6.5 采用 ΔΔCt方法分析數(shù)據(jù) 按公式:ΔCt(group 1)=average Ct-average of HK genes'Ct for group 1 array,計算每個處理組中的每個通路相關(guān)基因的ΔCt;按公式:ΔΔCt=ΔCt(組2)-ΔCt(組1),計算2 個 PCR Array(或兩組)中每個基因的 ΔΔCt;通過2-ΔΔCt計算組2 與組1對應(yīng)基因的表達(dá)差異。

        2 結(jié)果

        2.1 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖和活化 CD28共刺激能明顯加強(qiáng)CD3誘導(dǎo)的T細(xì)胞增殖,CD3e 5 μg/ml和CD28 1 μg/ml的濃度已能有效地誘導(dǎo)T細(xì)胞在48小時內(nèi)持續(xù)增殖(圖1),激活T細(xì)胞,使IL-2的分泌量在24小時內(nèi)迅速上升(圖2)。因此選擇該抗體濃度用于后續(xù)研究。

        圖1 不同濃度的CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖(n=4)Fig.1 T cells proliferation induced by CD3/CD28 crosslinking with different concentrations(n=4)

        2.2 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的基因mRNA變化 89個基因中,4個基因(Birc1a、Fgf4、Mmp7和Ptgs2)在CD3/CD28誘導(dǎo)的T細(xì)胞和未經(jīng)誘導(dǎo)的T細(xì)胞中都沒有表達(dá)(循環(huán)數(shù)>35);1個基因(Bmp2)在CD3/CD28誘導(dǎo)的T細(xì)胞中沒有表達(dá);1個基因(Ccl2)在未經(jīng)誘導(dǎo)的T細(xì)胞中沒有表達(dá)。因?yàn)闊嵝菘说鞍自赥細(xì)胞激活后會發(fā)生改變[5],因此HSP90AB1未作為管家基因計算。倍數(shù)(Fold change)相差2倍認(rèn)為表達(dá)有差異[6]。結(jié)果如表1和圖3所示,CD3/CD28共調(diào)節(jié)了43個基因,占檢測基因的51%,其中上調(diào)24個,下調(diào)19個,涵蓋檢測的所有18條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。

        圖2 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞IL-2分泌(n=3)Fig.2 CD3/CD28 cross-linking induced IL-2 production in T cells(n=3)

        圖3 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路基因mRNA變化的散點(diǎn)分布圖Fig.3 Scatter plots for modulated genes in CD3 and CD28 cross-linking induced T cells

        表1 CD3/CD28誘導(dǎo)T細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的基因mRNA變化Tab.1 Signal transduction genes mRNA found to be upregulated or downregulated in CD3 and CD28 cross-linking stimulated T cells based on PCR array

        (續(xù)表1)

        (續(xù)表1)

        3 討論

        T細(xì)胞在細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)中處于最為關(guān)鍵的位置,其激活受多重信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程的嚴(yán)格調(diào)控。共刺激信號先激活Lck、Fyn等 Src家族酪氨酸激酶(Src-related PTKs),接著PTKs誘導(dǎo)跨膜蛋白或銜接蛋白LAT、TRIM、SLP76酪氨酸磷酸化,啟動下游一系列信號傳遞。Ca2+、PKC、PI-3K/AKT、Ras、MAP/ERK、NFAT、NF-κB等通路被認(rèn)為是 T細(xì)胞主要的轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)[2]。結(jié)果顯示(表1),T細(xì)胞經(jīng)CD3/CD28共刺激后,鈣與蛋白激酶C信號通路(Calcium and protein kinase C pathway)87.5%的基因發(fā)生改變;含Ras/MEK/Erk的促有絲分裂通路(Mitogenic pathway)及PI-3K/AKT通路均有50%的基因發(fā)生改變;NFAT和NF-κB通路均有66.7%的基因發(fā)生改變。除此之外,其他如 Wnt、Hedgehog、Jak-Stat、Phospholipase C、CREB等信號通路也有較多的基因都發(fā)生了改變。另外,如Fos、Ccnd1、Cdkn1a等基因參與多個信號通路的傳遞。以上結(jié)果表明,相互聯(lián)系的復(fù)雜的多重信號通路參與了T細(xì)胞的激活過程。

        運(yùn)用cDNA全基因芯片,Teague等[7]報道了小鼠T細(xì)胞體內(nèi)經(jīng)超抗原刺激8和48小時后的基因變化情況;Diehn等[8]研究了人外周血T細(xì)胞體外激活過程中基因1小時至48小時的動態(tài)變化;Shu等[5]也對小鼠T細(xì)胞經(jīng)體外刺激18和48小時的基因變化做了觀察。但這些研究都未對信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中基因的變化情況作專門的描述。另外,全基因芯片包含許多與研究對象無關(guān)的基因,其提供的數(shù)據(jù)會對分析與研究對象有關(guān)的基因產(chǎn)生干擾,提供無用(Inconsequential)或錯誤(Detrimental)的信息,而功能分類基因芯片(Real-time PCR芯片)可以剔除基因芯片上對研究對象無意義的基因,同時準(zhǔn)確檢測上百個基因的mRNA水平[9,10]。本文首次采用功能分類基因芯片——“信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路發(fā)現(xiàn)者”PCR芯片研究了T細(xì)胞激活信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的基因變化情況,該結(jié)果有助于進(jìn)一步認(rèn)識T細(xì)胞的激活過程,控制和預(yù)防T細(xì)胞相關(guān)的免疫性疾病。

        致謝:感謝上??党缮锕こ逃邢薰驹赑CR array檢測中提供技術(shù)支持!

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