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        肺癌中EML4-ALK融合基因的存在狀態(tài)及生物學(xué)功能

        2012-09-11 02:53:42楊統(tǒng)綜述劉紅雨陳軍審校
        中國(guó)肺癌雜志 2012年2期
        關(guān)鍵詞:變種外顯子腺癌

        楊統(tǒng) 綜述 劉紅雨 陳軍 審校

        肺癌是當(dāng)前世界上最常見的惡性腫瘤,主要包括小細(xì)胞肺癌(small cell lung cancer, SCLC)和非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)兩類,而NSCLC約占肺癌總數(shù)的80%。盡管外科手術(shù)技術(shù)不斷提高,化療新藥不斷上市并進(jìn)入臨床應(yīng)用,但肺癌患者的預(yù)后仍然很差,原因是大多數(shù)NSCLC患者確診時(shí)已處于晚期,失去了手術(shù)治療的機(jī)會(huì)。同時(shí)部分臨床診斷為早期的肺癌患者,手術(shù)后發(fā)生復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移。長(zhǎng)期以來(lái),化療在晚期NSCLC的治療中占據(jù)主要地位,1995年進(jìn)行的meta分析顯示,以鉑類為基礎(chǔ)的化療相對(duì)于支持治療可以提高患者存活率[1]。20世紀(jì)90年代,第三代化療藥物有了較大進(jìn)展,多西紫杉醇、紫杉醇、長(zhǎng)春瑞濱、吉西他濱等藥物應(yīng)用于肺癌患者。然而,以鉑類為基礎(chǔ)的化療方案在晚期(IIIb或IV)NSCLC患者中,緩解率(response rate,RR)為30%-40%,中位生存期僅為8個(gè)月-10個(gè)月[2]。如何更好而有效地改善NSCLC患者的生存率和生存時(shí)間,提高治療效果,成為臨床和科研工作者的一個(gè)研究方向和目標(biāo)。

        近年來(lái),隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,產(chǎn)生了一些針對(duì)細(xì)胞特定分子的分子靶向治療藥物,這些藥物針對(duì)性強(qiáng),能特異性地殺傷腫瘤細(xì)胞。其中,針對(duì)表皮生長(zhǎng)因子受體酪氨酸激酶抑制劑(epidermal growth factor receptor-tyrosine kinases inhibitors, EGFR-TKI)的分子靶向治療受到了極大的關(guān)注。目前,有兩種EGFR-TKI(厄洛替尼和吉非替尼)成功在中國(guó)上市,其藥物特點(diǎn)是口服、高效、高特異性,病人耐受性好,無(wú)骨髓抑制和神經(jīng)毒性,能明顯延長(zhǎng)敏感患者生存期[3],改善患者生活質(zhì)量。但是,相關(guān)的臨床研究[4,5]結(jié)果顯示吉非替尼對(duì)東方人NSCLC的有效率為25%-35%,對(duì)西方人的有效率僅為8%-15%,臨床研究表明腺癌、女性、非吸煙、亞裔的NSCLC患者獲益明顯。

        2010年,日本學(xué)者[6]研究了具有EGFR 19外顯子缺失突變和21外顯子L858點(diǎn)突變的病例,比較單純使用吉非替尼組與單純使用順鉑加紫杉醇組的生存時(shí)間后發(fā)現(xiàn),在具有突變的患者中,使用吉非替尼者的生存時(shí)間較單純使用化療藥長(zhǎng)(9.2個(gè)月 vs 6.3個(gè)月),而在不具有EGFR外顯子突變的非吸煙腺癌患者中,單純使用吉非替尼者的生存時(shí)間也較單純使用鉑類化療藥物的時(shí)間延長(zhǎng)。因此,在亞洲的非吸煙腺癌患者中,使用EGFR-TKI靶向藥物吉非替尼的療效優(yōu)于傳統(tǒng)的化療,這無(wú)疑是肺癌治療史上的一個(gè)巨大的進(jìn)步。

        然而,2007年,日本學(xué)者在腺癌患者中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)亞群,這部分患者具有人類棘皮動(dòng)物微管相關(guān)蛋白樣4(echinoderm microtubule-associated- protein-like 4, EML4)和人類間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)重排形成的融合基因,即EML4-ALK融合基因,對(duì)EGFRTKI治療和傳統(tǒng)的化療不敏感,而可能對(duì)ALK抑制劑敏感[7]。后來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),具有EML4-ALK重排的患者有其獨(dú)特的臨床病理生理特征,提示其治療有別于一般的腺癌,本文就EML4-ALK融合基因的發(fā)現(xiàn)及研究現(xiàn)狀作一綜述。

        圖1 EML4-ALK融合基因形成示意圖Fig 1 Schematic representation of fusion junctions and flanking sequences of the EML4-ALK fusion gene. Fusion of the N-terminal portion of EML4 (comprising the basic region, the HELP domain and part of the WD-repeat region) to the intracellular region of ALK(containing the tyrosine kinase domain).

        1 EML4-ALK融合基因的發(fā)現(xiàn)

        2007年日本學(xué)者Soda等[7]在一名62歲男性吸煙肺腺癌患者手術(shù)標(biāo)本中擴(kuò)增出一個(gè)由3,926個(gè)堿基組成的cDNA片段,編碼一個(gè)由1,059個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),該蛋白的氨基端(殘基1-496)是EML4編碼蛋白的一部分,而羧基端(殘基497-1,059)則由ALK編碼蛋白的一部分構(gòu)成,提示這個(gè)cDNA片段由是EML4和ALK的融合形成。此病例的EGFR和KRAS基因均為野生型。如圖1所示,該融合基因定位于2號(hào)染色體的短臂上(2p21和2p23),其5'端為EML4的片段,3'端為ALK的片段,由倒置后的EML4基因片段與殘余的ALK片段連接。該融合基因擁有EML4基因中的basic區(qū)域、疏水的棘皮動(dòng)物微管相關(guān)蛋白區(qū)(hydrophobic echinoderm microtubule-associated protein-like protein, HELP)以及部分WD重復(fù)區(qū)(后兩部分在部分亞型中缺失)和ALK基因中的Kinase功能區(qū);此外在75個(gè)病例中發(fā)現(xiàn)了另外5例也具有EML4-ALK融合基因,因此,提示具有EML4-ALK融合基因的患者可能為NSCLC的一個(gè)特殊群體。

        目前,已至少發(fā)現(xiàn)了14種EML4-ALK的變異體。這些變異體均有功能,均為EML4的不同外顯子與ALK的20外顯子相融合。變種1(V1),為EML4的第13外顯子與ALK的第20外顯子相連;變種2(V2),為EML4的第20外顯子與ALK的第20外顯子相連[7];變種3(V3),有兩個(gè)亞變種(V3a/b),V3a為EML4的第6外顯子與ALK的第20外顯子相連,而V3b為EML4的第6外顯子加上一個(gè)33 bp的小片段再與ALK的第20外顯子相連[8];變種4(V4),為EML4的第14外顯子加上一個(gè)11 bp的小片段再與前面缺失49 bp的ALK的第20外顯子相連;變種5(V5),有兩個(gè)亞變種(V5a/b),V5a為EML4的第2外顯子與ALK的第20外顯子相連,而V3b為EML4的第2外顯子加上一個(gè)117 bp的小片段再與ALK的第20外顯子相連[9];變種6(V6),為EML4的第13外顯子加上一個(gè)49 bp的小片段再與ALK的第20外顯子相連;變種7(V7),為EML4的第14外顯子與前面缺失12 bp的ALK的第20外顯子相連;變種8(“V4”),為EML4的第15外顯子缺失了后面19 bp再與前面缺失20 bp的ALK的第20外顯子相連;變種9(“V5”),為EML4的第18外顯子與ALK的第20外顯子相連[10]。

        2 EML4-ALK融合基因陽(yáng)性患者的病理生理學(xué)特征

        幾乎所有研究均顯示EML4-ALK融合基因主要存在于NSCLC中,其出現(xiàn)頻率為5%-10%。研究顯示EML4-ALK融合基因陽(yáng)性患者多為不吸煙或少吸煙的腺癌患者,多伴隨印戒細(xì)胞樣改變,與EGFR突變相比,EML4-ALK融合基因多出現(xiàn)于男性,較EGFR突變者年輕,在亞洲人群中出現(xiàn)的比例較大;與EGFR突變和KRAS突變多不會(huì)同時(shí)出現(xiàn),即具有EML4-ALK融合基因的患者多為EGFR和KRAS野生型,而EGFR和/或KRAS突變的患者多不具有EML4-ALK融合基因[11,12]。EGFR-ALK患者對(duì)EGFRTKI治療不敏感,表現(xiàn)為對(duì)TKI治療的原發(fā)性耐藥;比較EML4-ALK陽(yáng)性組與陰性組后發(fā)現(xiàn)兩組患者對(duì)鉑類藥物的治療效果無(wú)明顯差異,總的生存時(shí)間也無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異[13]。

        3 EML4-ALK融合基因可能的生物學(xué)功能

        EML4-ALK融合基因的發(fā)現(xiàn)者Soda等將攜帶EML4-ALK基因的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染小鼠胚胎成纖維細(xì)胞3T3,而使后者獲得了致瘤性,接種于裸鼠皮下后成瘤。而在攜帶EML4-ALK的所有轉(zhuǎn)基因小鼠的肺組織中,自發(fā)性形成數(shù)百個(gè)腺癌病灶。這種轉(zhuǎn)基因的小鼠在口服ALK激酶的抑制劑后,腫瘤均趨于消失;而在靜脈注射轉(zhuǎn)染EML4-ALK的3T3細(xì)胞后,小鼠均由于呼吸衰竭而死亡,而使用ALK激酶抑制劑后,能明顯延長(zhǎng)這些小鼠的生存時(shí)間。使用特異的siRNA沉默EML4-ALK融合基因后,能抑制相關(guān)腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)[14]。這些均提示EML4-ALK基因在肺癌的形成過(guò)程中起著重要的作用。

        研究者研究了EML4-ALK融合基因的各個(gè)功能區(qū),其中,EML4基因片段中的basic區(qū)及ALK基因的kinase區(qū)在各個(gè)亞型中均包含。后者為ALK基因的膜內(nèi)催化區(qū)域,其激活后通過(guò)相關(guān)信號(hào)通路與細(xì)胞增殖、存活、遷移密切相關(guān)。EML4基因片段扮演著能使該融合基因產(chǎn)物蛋白二聚化的功能,因?yàn)锳LK基因的膜內(nèi)催化區(qū)域能在形成二聚體時(shí)激活,其異常激活導(dǎo)致細(xì)胞的癌變。Soda等[7]構(gòu)建缺失EML4 Basic區(qū)、HELP區(qū)、WD區(qū)質(zhì)粒的3T3細(xì)胞,接種裸鼠后發(fā)現(xiàn)缺失EML4 Basic區(qū)完全不能成瘤,而缺失HELP區(qū)和WD區(qū)均能成瘤,但瘤體較小,提示各功能區(qū)在肺癌的轉(zhuǎn)化過(guò)程中均發(fā)揮作用,但Basic區(qū)的作用可能最為重要。

        對(duì)于EML4-ALK融合基因信號(hào)通路的研究,與其它ALK基因重排的融合基因一樣,都是對(duì)ALK基因信號(hào)通路的研究,都是通過(guò)激活A(yù)LK基因的膜內(nèi)催化區(qū)域達(dá)到細(xì)胞癌變的效果。目前研究發(fā)現(xiàn)其與STAT3、AKT/PI3K及RAS/ERK三條信號(hào)通路有關(guān)系。轉(zhuǎn)錄因子C/EBPβ(CCAAT/enhancer binding protein beta)具有提高細(xì)胞增殖和生存的能力。ALK基因通過(guò)STAT3信號(hào)通路提高C/EBPβ的mRNA及蛋白水平,還通過(guò)ERK1/2磷酸化C/EBPβ的第235位蘇氨酸激活C/EBPβ蛋白[15]。研究[16]發(fā)現(xiàn)ALK也可以通過(guò)SHH/GLI1信號(hào)通路發(fā)揮作用,且可激活A(yù)KT/PI3K信號(hào)通路穩(wěn)定GLI1蛋白。

        4 EML4-ALK融合基因的檢測(cè)方法

        自從該融合基因發(fā)現(xiàn)以來(lái),為尋找更簡(jiǎn)便和更準(zhǔn)確的方法,研究人員做了各方面大量的研究。目前最常用的方法是反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)。RT-PCR是一種很靈敏的技術(shù),可以檢測(cè)很低拷貝數(shù)的RNA。RT-PCR廣泛應(yīng)用于遺傳病的診斷,并且可以用于定量監(jiān)測(cè)某種RNA的含量。利用手術(shù)切除標(biāo)本或其他標(biāo)本,提取總RNA后進(jìn)行RT-PCR,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳以確定是否含有EML4-ALK融合基因。通過(guò)對(duì)各種不同亞型進(jìn)行專門引物的設(shè)計(jì),可以分辨出各種不同亞型的EML4-ALK融合基因。

        熒光原位雜交技術(shù)(fluorescent in situ hybridization,FISH)也是常用的方法。 FISH是利用熒光標(biāo)記的特異核酸探針與細(xì)胞內(nèi)相應(yīng)的靶DNA分子或RNA分子雜交,通過(guò)在熒光顯微鏡或共聚焦激光掃描儀下觀察熒光信號(hào),來(lái)確定與特異探針雜交后被染色的細(xì)胞或細(xì)胞器的形態(tài)和分布,或者是結(jié)合了熒光探針的DNA區(qū)域或RNA分子在染色體或其它細(xì)胞器中的定位。通過(guò)對(duì)EML4基因及ALK基因進(jìn)行熒光標(biāo)記,在熒光顯微鏡下查看這兩種基因的位置關(guān)系判斷是否有染色體易位,以確定是否有EML4-ALK融合基因[17]。

        Western blot的方法也是檢測(cè)EML4-ALK融合基因的方法之一。Western blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)過(guò)PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素膜NC膜)上,固相載體以非共價(jià)鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對(duì)應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過(guò)底物顯色或放射自顯影以檢測(cè)電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。Western blot主要用來(lái)確定EML4-ALK融合基因是否表達(dá)及表達(dá)情況。

        除了以上幾種常用的方法外,還有其它各種常規(guī)或新的方法。Zhang等[18]使用了一種RACE-coupled PCR的方法,也很好地檢測(cè)出了EML4-ALK融合基因陽(yáng)性的樣本。Takeuchi等[19]發(fā)現(xiàn)了一種新的檢測(cè)ALK相關(guān)融合基因的免疫組化方法-iAEP(antibody-enhanced polymer)。該法將ALK蛋白的不同區(qū)域分別做出相應(yīng)的特異性抗體,然后用這些抗體特異檢測(cè)標(biāo)本中ALK蛋白不同區(qū)域的表達(dá)情況。若5'端的區(qū)域與3'端的區(qū)域表達(dá)差異較大,則說(shuō)明有ALK融合基因。表1列出了文獻(xiàn)[7,9,11,13,14,18-25]報(bào)道的檢測(cè)EML4-ALK的方法及陽(yáng)性率。

        表1 文獻(xiàn)所用檢測(cè)EML4-ALK的方法及陽(yáng)性率Tab 1 EML4-ALK fusion gene previously reported by the literatures in lung cancer

        5 展望

        目前在NSCLC中EML4-ALK融合基因的亞型已經(jīng)有14種。Lin等[14]發(fā)現(xiàn)一種EML4的21外顯子與ALK的20外顯子融合而成的新亞型,但僅在大腸癌中出現(xiàn),并未在肺癌中檢測(cè)到,或許更敏感的檢測(cè)方法或更大樣本量的檢測(cè)能發(fā)現(xiàn)更多新的亞型。

        現(xiàn)在對(duì)EML4-ALK融合基因在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路方面的研究還剛開始,相信這部分的研究將是以后的重點(diǎn)。如果信號(hào)通路明確的話,可以設(shè)計(jì)相應(yīng)的藥物,這將對(duì)治療有極大的幫助。實(shí)驗(yàn)中通過(guò)對(duì)EML4-ALK融合基因陽(yáng)性的細(xì)胞系及EML4-ALK融合基因陽(yáng)性的小鼠進(jìn)行一些嘗試性的治療,觀察細(xì)胞系的生長(zhǎng)情況及小鼠腫瘤的生長(zhǎng)情況,發(fā)現(xiàn)其對(duì)吉非替尼耐藥,對(duì)鉑類藥物低反應(yīng),但ALK抑制劑對(duì)其有效,能明顯抑制腫瘤的生長(zhǎng)[13,26]。

        由于目前在臨床上相關(guān)特征并無(wú)超大樣本的統(tǒng)計(jì)資料,對(duì)一些特征還是比較難以把握,并且一些更常規(guī)高效的檢測(cè)方法有待研究,EML4-ALK融合基因檢測(cè)真正應(yīng)用于臨床還有一定的距離。

        綜上所述,EML4-ALK融合基因存在于NSCLC中,很有可能成為在EGFR突變與KRAS突變之外的另一個(gè)重要的分子靶點(diǎn),進(jìn)一步研究可能會(huì)展現(xiàn)出與NSCLC的發(fā)生、發(fā)展、治療及評(píng)估等方面相關(guān)的新領(lǐng)域。

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