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        結(jié)縷草屬植物部分外部性狀的遺傳分析

        2012-08-20 04:06:40郭海林陳宣薛丹丹劉建秀
        草業(yè)學(xué)報(bào) 2012年5期
        關(guān)鍵詞:植物模型

        郭海林,陳宣,薛丹丹,劉建秀

        (江蘇省中國(guó)科學(xué)院植物研究所 南京中山植物園,江蘇 南京210014)

        結(jié)縷草屬(Zoysia)植物是禾本科畫眉草亞科的多年生草本植物,是優(yōu)良的暖季型草坪草??蓮V泛應(yīng)用于觀賞草坪、運(yùn)動(dòng)草坪、休憩草坪以及庭院草坪等各種草坪的建設(shè)中[1-4]。

        對(duì)結(jié)縷草屬植物的深入研究有利于培育出優(yōu)良的結(jié)縷草屬植物新品種。研究表明,結(jié)縷草屬植物大約有11種和一些變種與變型[1],結(jié)縷草屬植物的開花習(xí)性為雌蕊先熟雄蕊后熟,是一種典型的常異花授粉植物[5],結(jié)縷草屬植物的染色體倍性為2n=4X=40[6,7]。結(jié)縷草屬植物不同種、同一種的不同種質(zhì)資源間在外部性狀[8,9]、抗性(抗寒、旱、鹽、病等)等方面[10-16]均存在著豐富的遺傳變異,這些研究均為結(jié)縷草屬植物新品種選育奠定了良好的基礎(chǔ)。其中外部性狀的表現(xiàn)與研究直接關(guān)系到草坪草坪用質(zhì)量的好壞與改良。而外部性狀的遺傳機(jī)制對(duì)其遺傳改良和選擇適當(dāng)?shù)挠N方法均具有重要的指導(dǎo)意義,若這些性狀是由1~2個(gè)主基因控制則可采用單交重組或簡(jiǎn)單回交轉(zhuǎn)育的方法;若這些性狀由多個(gè)微效基因控制,則因?yàn)樯婕暗幕蚨?、單個(gè)基因效應(yīng)小、增效基因集中到一個(gè)個(gè)體的概率低、從表型鑒別基因型的難度大等特點(diǎn),則要采用聚合回交(或雙回交)及輪回選擇累積增效基因的方法[17]。

        蓋鈞鎰等[17]提出了植物數(shù)量性狀的主基因-多基因遺傳理論,認(rèn)為多數(shù)性狀由主基因加多基因共同控制是數(shù)量性狀遺傳的基本模型,而純主基因或純多基因的遺傳模型只是特例,并建立了植物數(shù)量性狀主基因+多基因混合遺傳模型分析方法[16-18],該模型自開發(fā)以來,已在小麥(Triticum aestivum)[19,20]、水稻(Oryza sativa)[21]、大豆(Glycine max)[22]、油菜(Brassica campestris)[23]、草坪[24]等多種植物的遺傳分析中得到了廣泛的應(yīng)用,在這些植物的遺傳機(jī)制研究方面發(fā)揮了重要作用。受上述思想的啟迪,本研究試圖應(yīng)用主基因+多基因混合遺傳模型分析方法對(duì)2份結(jié)縷草屬種源的正反交F1分離群體的8個(gè)與坪用價(jià)值相關(guān)的營(yíng)養(yǎng)性狀進(jìn)行遺傳分析,以明確結(jié)縷草屬植物營(yíng)養(yǎng)性狀的遺傳特性,為結(jié)縷草屬植物品種改良、相關(guān)性狀的分子標(biāo)記、定位以及標(biāo)記輔助育種等方面提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        供試材料為結(jié)縷草(Zoysiajaponica)‘J36’和中華結(jié)縷草(Zoysiasinica)Z039相互雜交的168個(gè)正交后代和99個(gè)反交后代,這些后代已通過SRAP分子標(biāo)記技術(shù)鑒定為真雜種。親本‘J36’為從美國(guó)引進(jìn)的結(jié)縷草品種,Z039為從安徽寧國(guó)采集的種源材料,兩親本在外部形態(tài)上存在較大的差異,兩親本來源及外部性狀的觀測(cè)值見表1。兩親本均種植于江蘇省中科院植物研究所的苗圃地內(nèi),287個(gè)雜交后代的獲得及其培養(yǎng)情況如下:2006年4月上旬通過控制授粉法對(duì)外部性狀存在顯著差異的2份親本材料J36和Z039進(jìn)行相互雜交,結(jié)果成功地獲得了184個(gè)正交后代和103個(gè)反交后代,并于2006年7月上旬將雜交后代種子用30%的NaOH處理80min后首先在培養(yǎng)皿培養(yǎng),待第1片葉長(zhǎng)到1.5~2.0cm時(shí)將其移入穴盤,其中穴盤的每一穴位只移入1株。2007年4月將后代從穴盤移入口徑為22cm的塑料盆中,每盆1株。對(duì)雜交后代進(jìn)行常規(guī)管理,2007年7-9月,對(duì)雜交后代通過SRAP分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行雜種真實(shí)性鑒定,結(jié)果有168個(gè)正交后代和99個(gè)反交后代被鑒定為真雜種,這些真雜種用于對(duì)本研究的結(jié)縷草屬植物外部性狀的遺傳分析。

        表1 親本來源及其外部性狀觀測(cè)值Table 1 Sources and the characteristics of morphological characters of parents

        1.2 外部性狀觀測(cè)

        外部性狀的觀測(cè)于2008年7-8月份進(jìn)行,觀測(cè)指標(biāo)包括密度、草層高度、葉長(zhǎng)與葉寬、葉片長(zhǎng)寬比、匍匐莖長(zhǎng)度和直徑和匍匐莖長(zhǎng)度與直徑比。觀測(cè)方法如下:

        密度:具體指草層中直立枝的密度。觀測(cè)采用9級(jí)制打分法,其中1為密度最低、6為可以接受,9為密度最高,為3個(gè)觀測(cè)值的平均值。

        草層高度:指結(jié)縷草生長(zhǎng)的自然高度,采用三點(diǎn)法測(cè)量。葉長(zhǎng)與葉寬:指成熟葉片的葉長(zhǎng)和葉寬,重復(fù)10次。節(jié)間長(zhǎng)度與直徑:指第3節(jié)的長(zhǎng)度和直徑,重復(fù)10次。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        結(jié)縷草屬植物為常異交植物,親本材料存在高度的異質(zhì)性,F(xiàn)1世代就產(chǎn)生性狀分離現(xiàn)象,類似于純合親本雜交的F2群體。本研究的遺傳數(shù)據(jù)分析應(yīng)用植物數(shù)量性狀主基因+多基因混合遺傳模型,采用單個(gè)分離世代F2群體的數(shù)量性狀分離分析方法[16-18]對(duì)正交J36×Z039及反交Z039×J36的F1群體的外部性狀進(jìn)行分析,由模型的似然函數(shù)值計(jì)算出AIC(Akaike’s information criterion)值,AIC值最小的模型為相對(duì)最佳模型,通過比較無主基因、1對(duì)主基因(A)和2對(duì)主基因(B)共11種遺傳模型的AIC值,并進(jìn)行遺傳模型的適合性測(cè)驗(yàn),包括均勻性檢驗(yàn)(U12,U22和 U32),Smirnov檢驗(yàn)(nW2)和Kolmogorov檢驗(yàn)(Dn),綜合考慮極大似然函數(shù)、AIC值以及適合性檢驗(yàn)的結(jié)果,最終確定最優(yōu)模型。在此基礎(chǔ)上,估計(jì)最優(yōu)模型的遺傳參數(shù),包括加性遺傳效應(yīng)(d)和主基因遺傳率(h2mg),并通過Excel軟件的數(shù)據(jù)分析功能,計(jì)算平均值、變異范圍、變異系數(shù)、偏度系數(shù)、峰度系數(shù)和方差等指標(biāo)。植物數(shù)量性狀主基因+多基因遺傳體系的分析統(tǒng)計(jì)軟件由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家大豆改良中心提供。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 F1群體的營(yíng)養(yǎng)性狀遺傳變異

        對(duì)J36×Z039的168份雜交后代和反交Z039×J36的99份雜交后代的外部性狀觀測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)不同性狀正反交的變異范圍均較大(表2),所觀測(cè)的8個(gè)性狀中,在正交后代群體中變異系數(shù)由大到小為:密度(29.66%)>節(jié)間長(zhǎng)度/直徑(24.23%)>節(jié)間長(zhǎng)度 (21.06%)>葉長(zhǎng)(17.19%)>草層高度(17.03%)>節(jié)間直徑(17.0%)>葉長(zhǎng)/葉寬(16.98%)>葉寬(8.79%);反交后代群體中變異系數(shù)由大到小為:密度(26.44%)>節(jié)間長(zhǎng)度/直徑(22.72%)>節(jié)間長(zhǎng)度 (18.14%)>葉長(zhǎng)/葉寬(16.53%)>草層高度(16.39%)>節(jié)間直徑(15.77%)>葉長(zhǎng)(15.57%)>葉寬(8.31%),比較正反交后代的變異系數(shù)可以看出,在這8個(gè)性狀中,不同后代間密度的變異最大,其次為節(jié)間長(zhǎng)度/直徑和節(jié)間長(zhǎng)度,葉寬的變異最小,其他性狀的變異居中。從變異范圍來看,正反交雜交后代中每一個(gè)性狀的變異范圍均超出了雙親的變異范圍,表明控制這些性狀的增效和減效基因在雙親中呈分散分布,通過基因重組可產(chǎn)生正向和負(fù)向的超親后代。

        不同性狀正反交后代的平均值略有差異(表2)。為比較正反交后代間性狀表現(xiàn)的差異顯著性,對(duì)不同性狀的正反交后代觀測(cè)值間進(jìn)行了t-檢驗(yàn)。t-檢驗(yàn)結(jié)果表明(表2),所檢測(cè)的8個(gè)性狀中,只有密度和節(jié)間長(zhǎng)度正反交后代間的t統(tǒng)計(jì)值小于t雙尾臨界值1.96(α=0.05),正反交后代間沒有顯著差異,其余6個(gè)性狀草層高度、葉長(zhǎng)、葉寬、葉長(zhǎng)/葉寬、節(jié)間直徑和節(jié)間長(zhǎng)度/直徑的正反交后代的t統(tǒng)計(jì)值絕對(duì)值均大于t雙尾臨界值1.96(α=0.05),正反交后代間存在顯著差異,由此推測(cè)這6個(gè)性狀可能存在母體遺傳效應(yīng)。

        根據(jù)正反交F1群體8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀的觀測(cè)結(jié)果,對(duì)正反交的每個(gè)性狀分別作次數(shù)分布圖(圖1)。不同性狀均呈連續(xù)性分布,其中葉長(zhǎng)(反交)(圖1-C2)和葉寬(正交)(圖1-D1)近似正態(tài)分布,草層高度(反交)(圖1-B2)和葉長(zhǎng)(正交)(圖1-C1)近似于雙峰分布,其他性狀均呈偏態(tài)分布,符合主基因+多基因的遺傳特征。

        表2 J36×Z039正反交雜交后代營(yíng)養(yǎng)性狀的變異分析Table 2 The variation of vegetative characters of reciprocal progenies in J36×Z039

        圖1 J36×Z039正反交雜交后代群體8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀的次數(shù)分布圖Fig.1 Frequency distribution of 8vegetative characters of reciprocal F1populations of J36×Z039

        續(xù)圖1 J36×Z039正反交雜交后代群體8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀的次數(shù)分布圖Fig.1 (continued) Frequency distribution of 8vegetative characters of reciprocal F1populations of J36×Z039

        2.2 F1群體的營(yíng)養(yǎng)性狀主基因+多基因混合遺傳分析

        分別計(jì)算8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀的正反交F1群體在11種遺傳模型下的極大似然函數(shù)值和AIC值(表3),以AIC值較小的模型作為候選模型。結(jié)果表明,在被檢驗(yàn)的各種模型中,密度正反交都是B-1模型的AIC值最小,適合性檢驗(yàn)結(jié)果(表4)也表明,正反交F1群體中密度的分布與理論分布是一致的(P>0.05),因此,B-1模型,即“兩對(duì)主基因,加性-顯性-上位性模型”是J36×Z039正反交F1群體密度的最適遺傳模型,其中正交的加性效應(yīng)(da和db)分別為1.936 5和1.063 7,顯性效應(yīng)(ha和hb)分別為0.575 4和0.035 6,上位性效應(yīng)(i,jab,jba,l)分別為-0.651 1,-0.187 2,-0.266 6和0.193 6,主基因遺傳方差(σ2mg)為2.37,主基因遺傳率[h2mg(%)]為93.67%,反交的加性效應(yīng)為1.282 4和0.830 8,顯性效應(yīng)為0.842 8和0.490 7,上位性效應(yīng)為-0.829 1,-0.490 2,-0.398 2和-0.086 5,主基因遺傳方差為1.169 6,主基因遺傳率為63.22%(表5)。

        草層高度、葉片長(zhǎng)度、葉片寬度、葉長(zhǎng)/葉寬、節(jié)間長(zhǎng)度5個(gè)性狀正反交F1群體均表現(xiàn)為A-0模型的AIC值最?。ū?),適合性檢驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),前3個(gè)性狀與節(jié)間長(zhǎng)度反交群體的分布均與理論分布一致(P>0.05),葉長(zhǎng)/葉寬的正反交群體表現(xiàn)和節(jié)間長(zhǎng)度的正交群體表現(xiàn)分別有一個(gè)值與理論值存在顯著差異,而其他值均與理論分布一致,因此,認(rèn)為A-0模型,即無主基因模型是這5個(gè)性狀的最適遺傳模型,也就是說在正反交F1群體中,這5個(gè)性狀表現(xiàn)出由誤差或誤差+多基因所修飾的單一正態(tài)分布特征。

        表3 不同遺傳模型下的極大似然函數(shù)值和AIC值Table 3 Maximum likelihood value(MLV)and Akaike’s information criterion(AIC)under different genetic model

        續(xù)表3 Continued

        表4 入選模型的適合性檢驗(yàn)Table 4 Tests for goodness-of-fit of selected model

        節(jié)間直徑正交后代群體檢測(cè)結(jié)果為A-1和A-4模型的AIC值最小,最適模型為一對(duì)主基因控制的遺傳模型,反交是A-0模型的AIC值最小,即無主基因模型為最適遺傳模型;節(jié)間長(zhǎng)度的檢測(cè)結(jié)果為正交是A-0模型的AIC值最小,最適模型為無主基因模型,反交為A-1與A-4模型的AIC值最小,最適模型為一對(duì)主基因控制的模型。正反交的遺傳模型不一致,這可能與節(jié)間直徑受母體遺傳效應(yīng)影響的結(jié)果有關(guān)。

        表5 B-1模型下F2群體密度一階遺傳參數(shù)的計(jì)算Table 5 Estimates of genetic parameters under genetic model B1for density of zoysia F2populations

        3 結(jié)論與討論

        本研究將2份外部性狀存在差異的結(jié)縷草與中華結(jié)縷草種源材料進(jìn)行雜交,對(duì)獲得的正反交F1后代的8個(gè)與坪用價(jià)值相關(guān)的外部性狀的遺傳變異進(jìn)行了分析。從變異范圍來看,正反交雜交后代中每一個(gè)性狀的變異范圍均超出了雙親的變異范圍,表明控制這些性狀的增效和減效基因在雙親中呈分散分布,通過基因重組可產(chǎn)生正向和負(fù)向的超親后代。但從變異系數(shù)發(fā)現(xiàn),不同性狀通過雜交育種的手段可以改良的程度不同,綜合分析正反交后代不同性狀變異系數(shù)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,在這8個(gè)性狀中,不同后代間密度的變異系數(shù)最大,其次為節(jié)間長(zhǎng)度/直徑和節(jié)間長(zhǎng)度,葉寬的變異最小,其他性狀的變異居中。變異系數(shù)反映了待改良群體的變異情況,變異越大,說明選擇潛力越大,因此,在本研究中,通過性狀的變異系數(shù)可以發(fā)現(xiàn),密度和節(jié)間長(zhǎng)度2個(gè)性狀比較容易通過雜交育種加以改良,而葉片寬度的變異系數(shù)很低,表明葉寬很難通過雜交育種加以改良。劉建秀等[9]對(duì)中華結(jié)縷草種質(zhì)資源的形態(tài)變異情況進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)節(jié)間直徑和葉寬在所觀測(cè)性狀中變異系數(shù)最小,分別為12.5%和14.4%,認(rèn)為通過系統(tǒng)選育的方法對(duì)中華結(jié)縷草的葉寬和節(jié)間直徑進(jìn)行改良,其效果明顯低于葉長(zhǎng)和草層高度等性狀。結(jié)合本研究的結(jié)果,認(rèn)為結(jié)縷草和中華結(jié)縷草的葉寬變異較小,很難通過系統(tǒng)選育的手段對(duì)其進(jìn)行改良。

        對(duì)于純合親本來說,母體遺傳效應(yīng)的研究一般通過正反交F1的表型值與雙親進(jìn)行比較來確定,而結(jié)縷草屬植物的雜交F1代即發(fā)生分離,無法通過單個(gè)的F1數(shù)據(jù)來與親本進(jìn)行比較,因此,本研究通過t測(cè)驗(yàn)的方法,根據(jù)正反交后代群體間的差異顯著性來推測(cè)不同性狀是否有母體遺傳效應(yīng),結(jié)果發(fā)現(xiàn),8個(gè)性狀中有6個(gè)性狀正反交后代間有顯著差異,初步推測(cè)這些性狀可能存在母體遺傳效應(yīng),這個(gè)結(jié)論還有待于在以后的研究中進(jìn)一步加以驗(yàn)證。

        本研究應(yīng)用蓋鈞鎰等[17]提出的主基因+多基因混合遺傳模型對(duì)結(jié)縷草與中華結(jié)縷草雜交的F1群體的8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀進(jìn)行了遺傳分析,通過比較AIC值確定了每個(gè)性狀的最佳遺傳模型,為這些性狀遺傳機(jī)制的進(jìn)一步研究和遺傳改良奠定了基礎(chǔ)。遺傳模型的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),所研究的8個(gè)性狀中只有密度為2對(duì)主基因的加性-顯性-上位性遺傳模型,而其他性狀幾乎全部為無主基因模型,節(jié)間直徑的正交后代和節(jié)間長(zhǎng)度/直徑的反交后代表現(xiàn)為1對(duì)主基因的遺傳模型,但是這2個(gè)性狀對(duì)應(yīng)的反交后代和正交后代也表現(xiàn)為無主基因模型,這一方面可能是受母性遺傳的效應(yīng),同時(shí)也可能是受環(huán)境的影響,數(shù)量性狀基因數(shù)目有多有少,各對(duì)基因效應(yīng)的大小也不同,而且其表現(xiàn)受環(huán)境的影響,可能對(duì)某個(gè)性狀的特定群體來說控制這個(gè)性狀的基因在已有的環(huán)境條件下主基因效應(yīng)明顯,而在另外一個(gè)群體中在相應(yīng)的環(huán)境條件下效應(yīng)較弱,表現(xiàn)為微效基因,關(guān)于A-0模型的遺傳機(jī)制,須通過同質(zhì)群體提供誤差方差以鑒別其有無遺傳變異存在。

        結(jié)縷草屬植物為常異交植物,親本異質(zhì)性很高,因此在F1代即發(fā)生分離現(xiàn)象。本研究借助于純合親本雜交的F2群體的主基因+多基因混合遺傳模型對(duì)結(jié)縷草屬植物的8個(gè)營(yíng)養(yǎng)性狀進(jìn)行了遺傳分析,初步明確了正反交雜交后代的遺傳模型,而實(shí)際上利用單個(gè)分離世代的分離分析方法是分兩步驟進(jìn)行的,首先鑒定主基因是否存在,然后再根據(jù)同質(zhì)群體P1、P2和F1提供試驗(yàn)誤差方差的無偏估計(jì)后鑒定是否有多基因的修飾。因模型的限制,本研究在只有單個(gè)親本和F1群體的表型值的情況下,只對(duì)主基因的存在情況和主基因遺傳效應(yīng)與遺傳率進(jìn)行了檢驗(yàn),關(guān)于多基因的存在和效應(yīng)都無法鑒別。

        目前,關(guān)于農(nóng)作物等自交植物,遺傳背景高度純合,容易得到自交群體的植物中,遺傳學(xué)方面的研究已比較深入,針對(duì)不同的研究需要建立了很多生物學(xué)研究體系,而對(duì)于草坪草和大多數(shù)林木植物等常異交植物,因遺傳背景高度雜合、遺傳負(fù)荷大,給遺傳學(xué)的研究帶來了很大的困難,目前在遺傳分析、遺傳圖譜構(gòu)建等遺傳學(xué)方面沒有一套合適的生物學(xué)研究體系可以利用,因此要對(duì)上述植物的遺傳機(jī)制進(jìn)行更全面的分析,還有待于建立更完善的分析方法。

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