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        黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因在大腸桿菌中的表達(dá)及產(chǎn)物酶學(xué)性質(zhì)研究

        2012-08-02 08:33:10劉明啟戴賢君白蘭芳

        劉明啟,戴賢君,白蘭芳

        (中國計(jì)量學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院,浙江 杭州 310018)

        果膠由酯化程度不同的半乳糖醛酸以α-1,4糖苷鍵聚合而成的,并含有木糖、海藻糖、半乳糖等側(cè)鏈的一類雜多糖.果膠酶(pectinase)是指能夠降解果膠一系列酶的總稱,主要包括聚半乳糖醛酸 酶(PG)、果膠裂解酶(PL)、果膠酯酶(PE)[1,2].果膠酶是世界四大工業(yè)用酶制劑之一,廣泛應(yīng)用于食品工業(yè)、生物制漿、紡織工業(yè)和飼料工業(yè).內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶(endo-polygalacturonase,EC.3.2.1.15)作用于果膠主鏈內(nèi)部的2個(gè)非酯化半乳糖醛酸間的α-1,4糖苷鍵,是果膠最關(guān)鍵的水解酶之一,也是果膠酶中最早被人們所認(rèn)識(shí)和應(yīng)用最廣泛的一類.質(zhì)量最好的果膠來自于柑橘水果類,2010年浙江省柑橘的種植面積為169.3萬畝,柑橘產(chǎn)量為192萬噸,多年居全國第一位,果膠資源非常豐富,具有以果膠為原料生產(chǎn)高附加值產(chǎn)品的優(yōu)勢.

        果膠經(jīng)內(nèi)切聚半乳糖醛酸特異性降解所得產(chǎn)物為聚合度不等的果膠低聚糖(POS,DP:2-10)和低分子果膠(MCP,DP:20-50).POS是公認(rèn)的功能性添加劑,具有特異性增殖雙歧桿菌和乳酸菌、有效用量最小、熱量低、穩(wěn)定性好、感觀性好等特性[3-7].低分子果膠(MCP)具有重要的生理功能,主要表現(xiàn)為抗腫瘤作用,增強(qiáng)免疫功能,改善肥胖和降低血脂水平,輔助排毒[8-10].低分子果膠和果膠低聚糖雖然廣泛存在柑橘膠質(zhì)中,但含量很低,采用直接提取方法生產(chǎn)成本高,難以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模的商品化生產(chǎn);然而固定化內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶結(jié)合酶反應(yīng)器為大規(guī)模制備POS和MCP提供了可能性.

        果膠酶在實(shí)際應(yīng)用過程存在諸多不足之處,如:由野生菌種分泌到胞外的蛋白種類多,增加了果膠酶分離純化的難度,故目前商品化野生型果膠酶純度較低;果膠酶活性偏低,導(dǎo)致催化水解效率偏低;現(xiàn)在市場上銷售的果膠酶多為內(nèi)切酶、裂解酶及果膠酯酶的混合物,缺少專一適用于制備POS、MCP的商品化內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶[11,12].黑曲霉(Aspergillus niger JL-15)為本實(shí)驗(yàn)室前期篩選的酶高產(chǎn)菌株,它主要產(chǎn)果膠酶、木聚糖酶、淀粉酶和葡聚糖酶[13].本研究采用 RT-PCR方法,克隆到黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA),并在大腸桿菌中獲得分泌表達(dá),有助于獲得適用于制備POS、MCP的重組內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶.

        1 材料和方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        黑曲霉JL-15(Aspergillus niger JL-15)菌株由本實(shí)驗(yàn)室分離,其孢子于-20℃保存.Escherichia coli Rosetta-gami B(DE3)、pET-32a(+)購于Novagen;pUCm-T vector System、總 RNA提取試劑盒、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、PCR試劑盒和DNA Marker購于上海生工生物技術(shù)有限公司;質(zhì)粒抽提試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒和割膠回收純化試劑盒購于Axygen;T4DNA連接酶和限制性內(nèi)切酶購自TaKaRa;酵母膏、蛋白胨購于Oxoid;其余常規(guī)試劑均為進(jìn)口或國產(chǎn)分析純.

        1.2 黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA)的RT-PCR

        根據(jù)GenBank中已登錄的真菌內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,引物序列為:P1,5′-TCAG^AATTCATGCCTTCTGCCAAGCCTTTGT-3′,P2,5′-CAT GC^GGCCGCTTACT-GATCGCAAGAAGCAC-3′,并在上下游引物中分別引入EcoRI和NotI限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn).

        將A.niger JL-15接種于YPD液體培養(yǎng)基中,30℃,150r/min培養(yǎng)48h,收集菌絲于滅菌后的濾紙上,吸干,再將菌絲置于滅菌后的研缽中,經(jīng)液氮冷凍,碾磨;然后采用Trizol法提取黑曲霉總RNA[14],參照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒操作說明合成cDNA.以cDNA為模板,P1和P2為引物進(jìn)行目的基因的PCR擴(kuò)增.PCR反應(yīng)條件如下:94℃,4min;94 ℃,50s;62.6 ℃,50s;72 ℃,2min,循環(huán)34次;72 ℃,10min.PCR 產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖電泳分析,并割膠回收目的條帶,回收產(chǎn)物與pUCm-T vector連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pUCm-T-pgaA,測定核苷酸序列.

        1.3 黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA)在大腸桿菌中的表達(dá)

        重組質(zhì)粒pUCm-T-pgaA 經(jīng)EcoRI和NotI雙酶切,電泳,割膠回收的目的片段,定向插入酶切后的表達(dá)載體pET-32a(+)中,并轉(zhuǎn)化E.coli Rosetta-gami B(DE3),轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布于含100mg/L氨芐青霉素的LB平板上,37℃培養(yǎng)12h,挑取單菌落,提取質(zhì)粒進(jìn)行PCR鑒定和雙酶切鑒定.將陽性克隆子接種于LB液體培養(yǎng)基中(100mg/L氨芐青霉素),37℃、150r/min培養(yǎng)至A600=0.8左右,加IPTG(終濃度1mmol/L)30℃誘導(dǎo)培養(yǎng)8h,離心,取上清液測定果膠酶活性.

        1.4 重組黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A(rePGA)活性測定和SDS-PAGE

        聚半乳糖醛酸酶活性測定采用DNS法[15],果膠酶活力單位(U)定義為:在最適反應(yīng)條件下,以每1min生成1μmol還原糖(以D 半乳糖醛酸計(jì))所需的酶量為一個(gè)酶活力單位.蛋白質(zhì)濃度的測定采用Bradford法,牛血清白蛋白(BSA)為標(biāo)準(zhǔn)蛋白[16].選用不同底物濃度測定果膠酶活性,采用雙倒數(shù)作圖法求米氏常數(shù)(Km)和最大反應(yīng)速度(Vmax)[17].

        重組黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A(rePGA)的SDS-PAGE分析參照Laemmli報(bào)道的方法[18],濃縮膠和分離膠的質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為5%和15%.以pET-32a(+)轉(zhuǎn)化菌為對照,陽性表達(dá)子和對照菌株經(jīng)培養(yǎng),離心收集菌體,加5×SDSPAGE電泳上樣緩沖液,100℃煮沸10min,離心,取上清液,等量蛋白上樣.

        1.5 溫度對rePGA活性的影響及其熱穩(wěn)定性

        測定rePGA在30~90℃下的活性,以確定其最適溫度.rePGA在30~90℃下分別保溫4min,然后冰浴5min,在最適條件下測定酶活,以未經(jīng)熱處理的rePGA在最適條件下的酶活為對照,計(jì)算殘余酶活.

        1.6 pH對rePGA活性的影響及其穩(wěn)定性

        分別用pH 3.0~9.0的緩沖液配制果膠底物,測定果膠酶活性,確定rePGA最適pH.將rePGA酶液pH分別調(diào)為pH3.0~9.0,在25℃條件下保溫1h,然后在最適條件下測定酶活,計(jì)算rePGA的殘余酶活.

        1.7 金屬離子對rePGA活性的影響

        分別向rePGA酶液中添加CaCl2、MgSO4、CuSO4、ZnSO4、MnSO4、FeCl3、KCl和 AlCl3,各種金屬離子的終濃度均為5.0mmol/L,在25℃下處理1h,計(jì)算rePGA殘余酶活.

        1.8 水解過程中果膠溶液粘度和還原糖的變化

        以400mL 4.0%的果膠為底物,添加4.0mL的rePGA酶液(110U),在28℃條件下進(jìn)行酶解反應(yīng),采用Brookfield DV-I Prime測定反應(yīng)體系的粘度變化,選用S 02號(hào)轉(zhuǎn)子,100r/min轉(zhuǎn)速;每間隔5min取樣測定反應(yīng)體系的還原糖濃度.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA)的克隆及序列分析

        從黑曲霉菌絲體中提取其總RNA,逆轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果表明在1100bp大小附近存在特異條帶(圖1).測序結(jié)果表明,擴(kuò)增產(chǎn)物序列全長為1113bp,與黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA)理論長度一致,為一個(gè)完整的開放閱讀框(ORF),編碼370個(gè)氨基酸殘基(圖2),所編碼蛋白的理論相對分子質(zhì)量為38800Da,pgaA與Genbank已登錄的黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(CAB72125)的同源性為99%.

        圖1 黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA)PCR擴(kuò)增Figure 1 Electrophoresis of pgaAfromA.niger

        2.2 pgaA在大腸桿菌中的表達(dá)及SDS-PGAE分析

        重組表達(dá)質(zhì)粒pgaA-pET-32a(+)Vector經(jīng)EcoRI、NotI雙酶切后電泳,顯示切出與目的基因大小一致的DNA片段(圖3),表明克隆載體含有pgaA序列.pgaA-pET-32a(+)Vector轉(zhuǎn)化E.coli Rosetta-gami B(DE3),挑取重組子于LB中,37℃培養(yǎng)12h,然后添加IPTG誘導(dǎo),陽性子BL21pgaA7發(fā)酵上清液中的果膠酶活性最高,為637.0U/mg,分別高于黑曲霉深層發(fā)酵產(chǎn)果膠酶的活性和重組Burkholderia cepacia 果膠酶的活性[[19,20].

        SDS-PAGE 結(jié)果表明,與對照相比,BL21pgaA7在40000Da附近存在特異性條帶(圖4),計(jì)算出的相對分子質(zhì)量為40500Da,與理論值40000Da相近.酶促動(dòng)力學(xué)研究表明,rePGA的米氏常數(shù)(Km)和最大反應(yīng)速度(Vmax)分別為4.05mg/mL和39.37μmol/(mL·min)(圖5),與野生型黑曲霉JL-15果膠酶的Km和Vmax相似.

        圖2 黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因序列及編碼的氨基酸序列Figure 2 Nucleotide sequences of pgaAand the deduced amino acid sequences

        圖3 重組表達(dá)質(zhì)粒pgaA-pET-32a(+)Vector雙酶切鑒定Figure 3 Digestion of pgaA-pET-32a(+)Vector

        圖4 重組大腸桿菌BL21pgaA7表達(dá)產(chǎn)物SDS-PAGE分析Figure 4 SDS-PAGE of BL21pgaA7

        2.3 溫度對rePGA活性的影響及其熱穩(wěn)定性

        圖5 rePGA的酶促動(dòng)力學(xué)Figure 5 Michaelis-Menten kinetics of rePGA

        在不同溫度下,重組黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶(rePGA)的活性變化較大,在60℃時(shí),酶活性達(dá)到最大值(圖6),在70℃~80℃范圍內(nèi),酶活性迅速降低.熱穩(wěn)定性研究表明,rePGA在低于50℃條件下較穩(wěn)定,50℃處理5min,其殘余酶活為64.37%.在高于65℃條件下,重組酶活性穩(wěn)定性迅速下降,80℃處理5min后,其殘余酶活僅為14.18%(圖6).

        圖6 溫度對rePGA活性的影響及其熱穩(wěn)定性Figure 6 Optimum temperature and thermostability of rePGA

        2.4 pH對rePGA活性的影響及其穩(wěn)定性

        在不同pH條件下,rePGA活性發(fā)生明顯變化,在pH 5.0時(shí)酶活性達(dá)到最大值(圖7),rePGA在酸性條件下活性較高,為嗜酸性酶.pH穩(wěn)定性研究表明,重組酶在pH 5.0~9.0范圍內(nèi)較穩(wěn)定,25℃處理30min,其殘余酶活均在70%以上(圖7).

        圖7 pH對rePGA活性的影響及其pH穩(wěn)定性Figure 7 Optimum pH and pH stability of rePGA

        2.5 金屬離子對rePGA活性的影響

        8種常見金屬離子對重組酶活性的影響各異(圖8).Ca2+對rePGA酶活具有顯著促進(jìn)作用,經(jīng)過1h處理,果膠酶活性是對照組的為137.95%.Fe3+、Mg2+、Mn2+、Al3+對rePGA的活性具有明顯抑制作用,處理后的殘余酶活分別是對照組的14.36%、0.89%、58.1%、70.2%,其它2種金屬離子對rePGA活性無顯著影響.Ca2+對米曲霉JL-14果膠酶活性無顯著影響[21],但對枯草芽孢桿菌JL-13果膠酶活性有顯著的促進(jìn)作用[22].Mn2+對米曲霉JL-14果膠酶和Mucor rouxii果膠酶活性均有顯著促進(jìn)作用[23].

        圖8 金屬離子對rePGA活性的影響Figure 8 Effect of metal ions on rePGA activity

        2.6 水解過程中果膠溶液粘度和還原糖的變化

        rePGA能快速降低果膠溶液的粘度并使反應(yīng)體系的還原糖濃度升高(圖9).反應(yīng)前期的粘度降低幅度顯著高于反應(yīng)后期,而還原糖濃度的變化則是反應(yīng)前期小于反應(yīng)后期,該結(jié)果與rePGA的內(nèi)切作用模式相符,經(jīng)過30min水解rePGA使果膠溶液的粘度降低了72%,還原糖的質(zhì)量濃度增加到11.2mg/mL.米曲霉果膠酶經(jīng)過30min水解作用使橘皮果膠溶液的粘度降低了80%[18],粘度降低的幅度高于rePGA的作用效果.

        圖9 水解過程中底物粘度與還原糖質(zhì)量濃度的變化Figure 9 Change in viscosity and concentration of reducing sugars during hydrolysis of pectin by rePGA

        3 結(jié) 語

        目前商品化果膠酶生產(chǎn)菌株多為野生真菌菌株或突變選育菌株,實(shí)驗(yàn)室前期分離到多株果膠酶高產(chǎn)菌株,并對其發(fā)酵條件和酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究,但野生型菌株分泌的雜蛋白較多,增加了果膠酶分離純化的難度.構(gòu)建高產(chǎn)果膠酶基因工程菌,可以使繁瑣的酶蛋白分離純化變得簡單快捷,也有助于獲得專一性的內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶.本研究采用RT-PCR的方法克隆到黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A基因(pgaA),該基因ORF全長1113bp,編碼370個(gè)氨基酸殘基;pgaA定向插入表達(dá)載體pET-32a(+)中,在E.coli獲得分泌表達(dá),重組黑曲霉內(nèi)切聚半乳糖醛酸酶A(rePGA)最高活性為637.0U/mg,相對分子質(zhì)量約為40500Da,Km和Vmax分別為4.05mg/mL 和39.37μmol/(mL·min).rePGA 的最適溫度為60℃,最適pH為pH 5.0.rePGA能快速降低果膠溶液的粘度,符合其內(nèi)切作用模式特點(diǎn),表明其初步具備適用于制備POS和MCP的特性.

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