朱曉芳,王曉冰,陳培榮,嘉 婷,朱小春
(溫州醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院風(fēng)濕免疫科,浙江 溫州 325000)
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)是一種病因未明的累及多系統(tǒng)的慢性反復(fù)性自身免疫疾病。SLE病人與動物模型中干擾素γ(interferon-gamma,IFN-γ)的表達增加是導(dǎo)致疾病發(fā)展的重要機制之一[1-2]。三氧化二砷(arsenic trioxide,ATO)是中藥砒霜的主要成分,已成功應(yīng)用于急性早幼粒細胞白血病及一些實體腫瘤的臨床治療[3]。國外研究[4]及我們的前期研究[5-6]均證實ATO是一種治療SLE很有前景的藥物,但其具體機制尚待進一步研究。本文通過運用染色質(zhì)免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)方法研究ATO對狼瘡鼠IFN-γ基因表達的調(diào)控,為ATO治療SLE的作用機制提供重要的實驗依據(jù)。
1.1 主要試劑和器材 ATO、植物血凝素P(phytohemagglutinin-P,PHA-P)和37%的甲醛(252549)購自Sigma;抗RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymeraseⅡ,RNAP II)抗體、ChIP試劑盒(#17-371)購自Millipore;乙?;M蛋白H4(acH4)抗體(ab15823)和乙?;M蛋白H3(acH3)抗體(ab10812)購自Abcam;重組人白細胞介素-2(interleukin-2,IL-2)購自上海華新生物高技術(shù)有限公司;RPMI-1640和胎牛血清(FCS)購自Gibco;小鼠淋巴細胞分離液(北京索萊寶);Trizol購自 Invitrogen;RT-PCR試劑盒、SYBR Green real-time PCR試劑盒購自Toyobo;小鼠IFN-γ ELISA試劑盒購自深圳晶美生物工程有限公司;超聲波細胞破碎儀JY92-Ⅱ購自寧波新芝;熒光定量PCR儀采用ABI的StepOne Plus Real-Time PCR System。實驗中所用引物由Invitrogen合成。
1.2 動物 20周齡 MRL/lpr狼瘡鼠15只,體重36~38 g;20周齡 C57BL/6J小鼠 28只,體重20~22 g,購自中國科學(xué)院上海實驗動物中心,飼養(yǎng)在溫州醫(yī)學(xué)院動物實驗中心SPF級動物房。
2.1 細胞培養(yǎng)與實驗分組 頸椎脫臼法處死小鼠后,無菌條件下取脾臟,用200目篩網(wǎng)輕輕研磨脾臟過濾成單細胞懸液,采用密度梯度離心法自脾臟單細胞懸液中分離小鼠淋巴細胞,用10%FCS-RPMI-1640重懸,調(diào)整細胞濃度為2×109/L,37℃、5%CO2孵箱培養(yǎng)1~2 h后觀察細胞生長情況,排除細菌生長,臺盼藍染色法測定細胞存活率>98%。加入PHA-P(終濃度20 mg/L)和IL-2(終濃度106IU/L),孵箱繼續(xù)培養(yǎng)48 h后隨機分為2組:(1)PBS組:為空白對照組;(2)ATO 組:1.0 μmol/L ATO 作為實驗組,共同培養(yǎng)24 h。
2.2 ELISA法測定各組培養(yǎng)上清液IFN-γ的濃度 收集細胞懸液于Eppendorf管,離心后吸取細胞上清液置于-80℃冰箱保存待測。嚴格按試劑說明書操作,顯色后在全自動酶標儀上450 nm波長處讀取A值,通過繪制標準曲線求出指標含量。
2.3 實時熒光定量PCR法檢測各組細胞IFN-γ mRNA的表達 用Trizol法抽提RNA,測RNA濃度后取2 μg的RNA,采用日本東洋紡(Toyobo)的 RT-PCR試劑盒,依照說明書進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。以β-actin為內(nèi)參照,采用實時熒光定量PCR進行IFN-γ和β-actin產(chǎn)物擴增及結(jié)果分析。IFN-γ引物序列:上游為5'-ggaaccctctcccttcaatgt-3';下游為5'-ctccacaatagccttcagtgc-3'。β-actin引物序列:上游為5'-gagaccttcaacaccccagc-3';下游為 5'-atgtcacgcacgatttccc-3'。反應(yīng)體系:SYBR-Green Master Mix 10 μL,Plus 2 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1.5 μL,DNA 模板 2 μL,加滅菌雙蒸水補至總體積20 μL。PCR循環(huán)條件設(shè)置:94℃變性10 min后,94℃ 20 s,60℃ 1 min,擴增50個循環(huán),反應(yīng)完成后再于95℃ 15 s,60℃ 1 min,95℃ 15 s繪制熔解曲線。根據(jù)Livak和Schmittgen設(shè)計的閾值法測定目的基因的相對表達水平,目的基因量 =2-ΔΔCt,將 C57BL/6J小鼠PBS組(C57 PBS)作為樣本校正,其表達水平設(shè)置為1,ΔΔCt = [Ct目的基因(其它實驗組)-Ct內(nèi)參照(其它實驗組)]-[Ct目的基因(C57 PBS)- Ct內(nèi)參照(C57 PBS)]。
2.4 ChIP 主要步驟:(1)蛋白-DNA交聯(lián)和裂解細胞:取10 mL細胞懸液(約2×107個細胞),加入37%甲醛使之終濃度為1%,37℃孵育10 min。加入甘氨酸終止交聯(lián)反應(yīng),洗滌2次。離心去上清后加入1 mL含蛋白酶抑制劑的SDS裂解液重懸細胞沉淀,冰上孵育10 min。(2)超聲斷裂染色質(zhì):按優(yōu)化好的條件(200 W,每次超聲15 s,間隔30 s,共10次)斷裂細胞裂解液中的染色質(zhì),使DNA的長度主要分布在200~1000 bp,4℃離心保留上清。(3)免疫共沉淀:超聲處理后的溶液中加入含蛋白酶體抑制劑的ChIP稀釋緩沖液,用蛋白G-瓊脂糖小珠進行預(yù)清除,離心后吸取1%上清留作input溶液,將剩余的上清分裝,每管1.0 mL,分別加入特異性抗體(抗 RNAPⅡ抗體每管 5.0 μg,抗 acH3 抗體每管 3 μg,抗 acH4 抗體每管 2.5 μg)及陰性對照抗體(正常小鼠IgG每管1.0μg),4℃搖床上孵育過夜。第2 d溶液中加入蛋白G-瓊脂糖小珠吸附免疫沉淀復(fù)合物,離心去上清,依次用低鹽、高鹽、氯化鋰和TE緩沖液清洗蛋白G-瓊脂糖小珠。(4)洗脫免疫沉淀復(fù)合物:配制新鮮洗脫液用于洗脫免疫沉淀復(fù)合物,同時在裝有Input溶液的管中加入相同體積的洗脫緩沖液。(5)蛋白-DNA復(fù)合物解交聯(lián):加入5 mol/L NaCl使之終濃度為0.02 mol/L,65℃水浴孵育過夜。(6)用DNA純化柱回收DNA。
2.5 半定量PCR分析ChIP產(chǎn)物 半定量PCR分析ChIP產(chǎn)物,用于擴增IFN-γ基因啟動子的引物如下:上游引物為5'-tcagctgatcctttggaccc-3',下游引物為5'-ctcagagctaggcgcagg-3'。反應(yīng)體系:10×PCR buffer 2 μL、2 mmol/L dNTP 2 μL、25 mmol/L MgSO40.8 μL、上下游引物(10 μmol/L)各 1 μL、KOD Plus 0.4 μL、DNA 模板 2 μL,加滅菌雙蒸水補至總體積 20 μL。PCR循環(huán)條件設(shè)置:94℃變性3 min后,94℃ 20 s,59℃ 30 s,72℃ 30 s,擴增32個循環(huán),然后行72℃ 2 min。最后將PCR產(chǎn)物行2%瓊脂糖凝膠電泳。
2.6 實時熒光定量PCR分析ChIP產(chǎn)物 實時熒光定量PCR分析ChIP產(chǎn)物,用于擴增的IFN-γ基因啟動子引物如下:上游為 5'-tttcagagaatcccacaagaatg-3',下游為5'-tcgggattacgtattttcacaag-3'。采用ABI公司的StepOne Plus Real-Time PCR System對CHIP產(chǎn)物分析,反應(yīng)體系:SYBR-green master mix 10 μL、Plus 2 μL、上下游引物(10μmol/L)各 1 μL、DNA模板 2 μL,加滅菌雙蒸水補至總體積20 μL。PCR循環(huán)條件設(shè)置:94℃變性10 min后,94℃20 s,60℃ 1 min,擴增50個循環(huán),反應(yīng)完成后再于95℃ 15 s,60℃ 1 min,95℃ 15 s繪制熔解曲線,分析方法參考文獻[7]和ChampionChIP qPCR Primers說明書介紹的方法,用ΔΔCt值進行相對定量,各實驗組均以C57BL/6J小鼠PBS組(C57 PBS)為對照組,其表達水平設(shè)置為1,計算其它實驗組較對照組C57 PBS組的倍數(shù)改變。
以SPSS 17.0統(tǒng)計學(xué)軟件進行分析。數(shù)據(jù)以均數(shù)±標準()表示,進行方差齊性檢驗,根據(jù)樣本的性質(zhì)采用單因素方差分析、Dunnet's T3檢驗。以P<0.05為有統(tǒng)計學(xué)意義。
(1)MRL/lpr狼瘡鼠PBS組IFN-γ的分泌高于C57BL/6J小鼠PBS組(P<0.01);(2)在 MRL/lpr狼瘡鼠中,與PBS組相比,ATO組IFN-γ的分泌下降(P<0.01);(3)在 C57BL/6J小鼠中,PBS組和ATO組之間IFN-γ的濃度無差異,見表1。
表1 MRL/lpr小鼠和C57BL/6J小鼠細胞上清液中IFN-γ的濃度Table 1.The expression of IFN - γ in the supernatants of the cells from MRL/lpr mice and C57BL/6J mice(ng/L..n=6)
表1 MRL/lpr小鼠和C57BL/6J小鼠細胞上清液中IFN-γ的濃度Table 1.The expression of IFN - γ in the supernatants of the cells from MRL/lpr mice and C57BL/6J mice(ng/L..n=6)
**P <0.01 vs MPL/lpr PBS group.
PBS 273.005 ±18.824 168.462 ±11.779**ATO 191.731 ±16.522** 160.914 ±14.526**
按優(yōu)化好的條件(200 W,每次超聲15 s,間隔30 s,共10次)斷裂細胞裂解液中的染色質(zhì),切割后的DNA片段主要分布在200~1000 bp,基本符合ChIP的要求,見圖1。
Figure 1.The segments of crosslinked DNA cut by ultrasound were mainly 200 ~1000 base pairs in size.圖1 超聲波切割染色質(zhì)DNA瓊脂糖凝膠電泳圖
半定量PCR分析各組細胞IFN-γ啟動子區(qū)acH3、acH4及啟動子區(qū)結(jié)合RNAPⅡ的水平。超聲打斷之后,以各組input DNA為模板,以IFN-γ為引物,通過調(diào)整模板量,重復(fù)驗證以最后在各組的input DNA擴增出相同條帶時的模板量作為最后抗體處理過的DNA樣本做PCR所需的模板量,并且將PCR產(chǎn)物稀釋2倍,瓊脂糖凝膠電泳顯示。與正常C57BL/6J小鼠相比,MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ啟動子區(qū)acH3和acH4的水平升高,更多的RNAPⅡ被富集到IFN-γ啟動子區(qū)域;ATO能降低MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ基因啟動子區(qū)域acH3和acH4的水平,減弱RNAPⅡ與IFN-γ啟動子區(qū)域的結(jié)合,而對正常C57BL/6J小鼠無明顯影響,見圖2。
Figure 2.Identification of ChIP by semiquantitative PCR and agarose gel electrophoresis.圖2 半定量PCR驗證ChIP的瓊脂糖凝膠電泳圖
(1)MRL/lpr狼瘡鼠PBS組IFN-γ mRNA的表達高于C57BL/6J小鼠PBS組(P<0.05),并且IFN-γ啟動子區(qū)acH3、acH4的水平及啟動子區(qū)域富集RNAPⅡ水平高于 C57BL/6J小鼠 PBS組(均 P<0.01);(2)在 MRL/lpr狼瘡鼠中,與 PBS組相比,ATO組IFN-γ mRNA的表達下降(P<0.05),IFN-γ基因啟動子區(qū)域acH3、acH4的水平及啟動子區(qū)域富集RNAPⅡ水平也下降(均P<0.01);(3)在C57BL/6J小鼠中,PBS組和ATO組之間以上指標均無差異,見圖3。
Figure 3.All samples were divided and analyzed by quantitative real-time PCR -based ChIP to measure the degree of histones H3(A)and H4(B)acetylation at IFN-γ promoter regions and the combination of RNA polymeraseⅡto IFN -γ promoter(C).Quantitative real-time PCR was also used to measure the levels of IFN-γ mRNA(D)..n=3.*P<0.05,**P<0.01 vs each other.圖3 實時熒光定量PCR分析ChIP結(jié)果及IFN-γ mRNA的表達
SLE是一種常見的自身免疫性疾病,其病因和發(fā)病機制尚未完全闡明。處于活動期的SLE病人全血細胞中IFN-γ的分泌量明顯高于正常人,并且分泌水平與SLEDAI(SLE活動性指標)呈不同程度的正相關(guān)[1]。Hasegawa等[2]認為循環(huán)和組織 IFN - γ的表達增加是導(dǎo)致SLE疾病發(fā)展和腎臟損害的重要機制。越來越多的研究表明下調(diào)IFN-γ水平可作為治療 SLE 的新靶點[8-9]。Bobe 等[4]提出:ATO 能下調(diào) MRL/lpr狼瘡鼠血清 IFN-γ的水平,減少MRL/lpr小鼠皮膚損害和腎小球免疫復(fù)合物的沉積,極大地延長生存時間。這與我們的前期體內(nèi)研究[5-6]相一致。
我們的前期研究發(fā)現(xiàn)1.0 μmol/L ATO體外作用MRL/lpr狼瘡鼠24 h是最佳作用時間和作用濃度。本研究發(fā)現(xiàn),L/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ的分泌水平及其mRNA的表達高于正常C57BL/6J小鼠;ATO能下調(diào)MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ的分泌水平及其 mRNA的表達,而對正常C57BL/6J小鼠無明顯影響。ATO通過何種機制下調(diào)MRL/lpr狼瘡鼠IFN-γ mRNA的表達,從而降低IFN-γ的分泌水平是本研究的重點。
組蛋白乙?;揎検腔蜣D(zhuǎn)錄調(diào)控的重要機制。當組蛋白乙?;缴邥r,染色質(zhì)處于活化或開放狀態(tài),此時核小體之間的致密度很低,允許了轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的進入,從而導(dǎo)致基因的轉(zhuǎn)錄,反之,則阻止了基因的轉(zhuǎn)錄[10-11]。Long 等[12]發(fā)現(xiàn)組蛋白的高乙?;菍?dǎo)致IFN-γ基因轉(zhuǎn)錄表達量增加的主要機制,而組蛋白的乙酰化水平下降時,IFN-γ基因轉(zhuǎn)錄表達量也下調(diào)。ChIP是一種能真實反映細胞內(nèi)DNA結(jié)合蛋白與基因組DNA相互作用的實驗技術(shù),目前常用于研究組蛋白修飾,轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)調(diào)控復(fù)合物與 DNA的相互作用[13]。本研究運用ChIP技術(shù)發(fā)現(xiàn)MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細IFN-γ啟動子區(qū)acH3、acH4的水平較正常C57BL/6J小鼠升高,ATO能降低MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ基因啟動子區(qū)域acH3和acH4的水平,而對正常C57BL/6J小鼠無明顯影響。我們由此推測,MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞高表達IFN-γ mRNA可能與其基因啟動子區(qū)域acH3、acH4的水平升高有關(guān),而ATO可能通過下調(diào)IFN-γ啟動子區(qū)域acH3、acH4的水平,阻礙了轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的進入,從而阻止IFN-γ基因的轉(zhuǎn)錄,減少IFN-γ mRNA的表達。
RNAPⅡ與相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子組成mRNA的轉(zhuǎn)錄復(fù)合體在基因的轉(zhuǎn)錄中起著重要的作用[14]。在ChIP應(yīng)用抗RNAPⅡ抗體,了解RNAPⅡ與基因啟動子區(qū)結(jié)合情況,能較好地反映mRNA的轉(zhuǎn)錄情況:轉(zhuǎn)錄激活時RNAPⅡ與基因啟動子區(qū)域的結(jié)合水平升高,反之,二者結(jié)合水平下降[15]。本研究發(fā)現(xiàn)與正常C57BL/6J小鼠相比,更多的RNAPⅡ被富集到MRL/lpr狼瘡鼠脾臟淋巴細胞IFN-γ的啟動子區(qū)域,ATO能減弱MRL/lpr狼瘡鼠RNAPⅡ與IFN-γ啟動子區(qū)域的結(jié)合,而對正常C57BL/6J小鼠無明顯影響。因此,ATO可能通過減弱MRL/lpr狼瘡鼠RNAPⅡ與IFN-γ啟動子區(qū)域的結(jié)合而阻止IFN-γ基因的轉(zhuǎn)錄。
綜上所述,通過MRL/lpr狼瘡鼠這個模型我們可以推測ATO可能通過下調(diào)MRL/lpr狼瘡鼠IFN-γ基因啟動子區(qū)域acH3和acH4的水平,減弱RNAPⅡ依賴的轉(zhuǎn)錄,從而降低IFN-γ mRNA的表達,下調(diào)IFN-γ的分泌水平。但ATO對轉(zhuǎn)錄因子如STAT4、T-bet以及組蛋白的其它修飾仍待進一步研究。
[1]Lit LC,Wong CK,Tam LS,et al.Raised plasma concentration and ex vivo production of inflammatory chemokines in patients with systemic lupus erythematosus[J].Ann Rheum Dis,2006,65(2):209 -215.
[2]Hasegawa K,Hayashi T,Maeda K.Promotion of lupus in NZB×NZWF1mice by plasmids encoding interferon(IFN)-γ but not by those encoding interleukin(IL)-4[J].Comp Pathol,2002,127(1):1 -6.
[3]任瑋瑋,李 弘,張 洹.三氧化二砷對肝癌細胞生長抑制作用差異性探討[J].中國病理生理雜志,2004,20(7):1179 -1182.
[4]Bobé P,Bonardelle D,Benihoud K,et al.Arsenic tri oxide:a promising novel therapeutic agent for lymphoproliferative and autoimmune syndromes in MRL/lpr mice[J].Blood,2006,108(13):3967 -3975.
[5]王曉冰,陳培榮,張 挺,等.三氧化二砷對MRL/lpr狼瘡鼠IFN-γ、IL-4表達和Th1/Th2平衡的影響[J].細胞生物學(xué)雜志,2008,30(4):509 -514.
[6]Xia XR,Xu H,Zhu XC.Effects of arsenic trioxide on survival rate and autoimmune responses of lupus mice[J].Chin J Pharmacol Toxicol,2007,21(6):482 -486.
[7]Pace BS,Qian XH,Sangerman J,et al.p38 MAP kinase activation mediates γ-globin gene induction in erythroid progenitors[J].Exp Hematol,2003,31(11):1089 -1096.
[8]Lawson BR,Prud'homme GJ,Chang Y,et al.Treatment of murine lupus with cDNA encoding IFN - γR/Fc[J].J Clin Invest,2000,106(2):207 -215.
[9]Shirota H,Gursel M,Klinman DM.Suppressive oligodeoxynucleotides inhibit Th1 differentiation by blocking IFN- γ and IL -12 - mediated signaling[J].J Immunol,2004,173(8):5002 -5007.
[10]Backs J,Olson EN.Control of cardiac growth by histone acetylation/deacetylation[J].Circ Res,2006,98(1):15-24.
[11]Urnov FD,Wolffe AP.Chromatin remodeling and transcriptional activation:the cast(in order of appearance)[J].Oncogene,2001,20(24):2991 -3006.
[12]Long M,Slaiby AM,Wu S,et al.Histone acetylation at the Ifng promoter in tolerized CD4 cells is associated with increased IFN-γ expression during subsequent immunization to the same antigen[J].J Immunol,2007,179(9):5669-5677.
[13]李敏俐,王 薇,陸祖宏.ChIP技術(shù)及其在基因組水平上分析DNA與蛋白質(zhì)相互作用[J].遺傳,2010,32(3):219-228.
[14]Sims RJ3rd,Belotserkovskaya R,Reinberg D.Elongation by RNA polymerase II:the short and long of it[J].Genes Dev,2004,18(20):2437 -2468.
[15]Sandoval J,Rodríguez JL,Tur G,et al.RNAPol- ChIP:a novel application of chromatin immunoprecipitation to the analysis of real-time gene transcription[J].Nucleic Acids Res,2004,32(11):e88.