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        1株苯并[a]芘高效降解菌的分離鑒定

        2012-07-19 07:56:50弓玉紅郭凱凱
        山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年5期
        關(guān)鍵詞:單胞菌生化測(cè)序

        弓玉紅,郝 林,郭凱凱

        (山西農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,山西太谷030801)

        苯并[a]芘(BaP)是一種含5個(gè)環(huán)的稠環(huán)芳烴,它是由1個(gè)苯環(huán)和1個(gè)芘分子結(jié)合而成的多環(huán)芳烴類化合物[1]。其分子式為C20H12,分子量為252。在室溫下,其為黃色或淡黃色晶體,熔點(diǎn)179℃,沸點(diǎn)496℃,相對(duì)密度為1.35,易溶于丙酮、二甲基甲酰胺、甲醇、二氯甲烷乙醇、苯、甲苯、二甲苯、氯仿、乙醚等有機(jī)溶劑,極不易溶于水,這也是其在環(huán)境中難以被降解的原因之一[2]。苯并[a]芘大多是石油、煤炭等化石燃料以及木材、天然氣、汽油、重油、有機(jī)高分子化合物、紙張、作物秸稈、煙草等含碳?xì)浠衔锏奈镔|(zhì)經(jīng)過不完全燃燒而生成。苯并[a]芘則是一種強(qiáng)致癌物[3],其不僅存在于石油產(chǎn)品中,而且也存在于食品、大氣和煤焦油中[4],也容易殘留在土壤中。許多國家都進(jìn)行過土壤中BaP含量調(diào)查,殘留濃度取決于污染源的性質(zhì)與距離[5],公路兩旁的土壤中BaP含量為2.0 mg/kg,在煉油廠附近土壤中為200 mg/kg;被煤焦油、瀝青污染的土壤中,其含量高達(dá)650 mg/kg。農(nóng)作物中的BaP殘留濃度取決于生產(chǎn)地附近是否有工業(yè)區(qū)或交通要道[6]。許多國家的動(dòng)物試驗(yàn)證明,苯并[a]芘具有致癌、致畸、致突變的特點(diǎn)。苯并[a]芘遇明火、高熱可燃,受高熱分解會(huì)釋放出有毒的氣體,即一氧化碳、二氧化碳、成分未知的黑色煙霧。

        本研究在山西太谷縣焦化廠周邊耕地中采集被苯并[a]芘污染的土壤樣品,分離篩選到1株苯并[a]芘降解能力較強(qiáng)的細(xì)菌,經(jīng)初步鑒定,屬于假單胞菌屬,為土壤苯并[a]芘污染的生物修復(fù)提供依據(jù),以及為降解土壤苯并[a]芘污染微生物多樣性提供參考。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        土樣采自山西省太谷縣焦化廠周邊耕地耕層土壤。富集用培養(yǎng)基[7]1 L:(NH4)2SO40.5 g,NaNO30.5 g,CaCl20.02 g,KH2PO41.0 g,NaH2PO41.0 g,MgSO40.2 g,苯并[a]芘 5 mg(溶解于丙酮后加入),加水至1 L,pH值為7.5。2216E培養(yǎng)基1 L:蛋白胨5 g,酵母浸膏1 g,磷酸高鐵 0.01 g,pH值為7.6~7.8。

        1.2 苯并[a]芘降解菌分離方法

        稱取10 g土樣加入到含有適量玻璃珠的100 mL無菌水中,振蕩3 h[8-9]。靜置30 min后,移取5 mL上清液到45 mL含有苯并[a]芘質(zhì)量濃度為5 mg/L的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,25℃,150 r/min搖床避光培養(yǎng)。每隔7 d移取10 mL菌液至滅菌的90 mL無機(jī)鹽-苯并[a]芘液體培養(yǎng)基中進(jìn)行富集培養(yǎng);連續(xù)富集培養(yǎng)28 d后,移取混合菌液稀釋,涂布于2216E固體平板培養(yǎng)基上分離、純化,觀察單菌落形態(tài),并采用試管斜面保存菌株[10],觀察菌株并進(jìn)行形態(tài)特征和生理生化特征鑒定。

        1.3 降解菌的鑒定

        1.3.1 分離菌株生理生化特征的檢測(cè) 生理生化特征檢測(cè)參照文獻(xiàn)[11]進(jìn)行。

        1.3.2 16 S rDNA測(cè)序的PCR擴(kuò)增及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建 菌株總DNA的提?。翰捎肅TAB法提取細(xì)菌的DNA于TE緩沖液中,-20℃保存?zhèn)溆谩CR反應(yīng):采用細(xì)菌的16 SrRNA通用引物,以提取的總DNA為模板,對(duì)該菌株的16 S rRNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系為:模板DNA 1 μL,10×PCR buffer 5 μL,dNTPs(2.5 mmol/L)4 μL,上游引物和下游引物(20 μmol/L)各 1 μL,加無菌水至50μL。反應(yīng)程序:95℃5min;94℃1min,53℃1 min,72℃ 1.5 min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。然后對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化,純化產(chǎn)物送上海生工公司測(cè)序。所得測(cè)序結(jié)果在NCBI中進(jìn)行序列搜索比對(duì)后,選擇親緣關(guān)系較近的幾種菌株作為參比菌株,用MEGA軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.3.3 苯并[a]芘含量的測(cè)定 在無機(jī)鹽液體培養(yǎng)基中加入丙酮-苯并[a]芘母液,使苯并[a]芘的質(zhì)量濃度達(dá)到5 mg/L。振蕩培養(yǎng)10 d,同時(shí)設(shè)不接菌對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次。苯并[a]芘含量采用萃取-紫外分光光度法[11]測(cè)定。培養(yǎng)后向試管中加入環(huán)己烷重復(fù)萃取2次,合并萃取液在50mL容量瓶,定容,用紫外分光光度計(jì)在296 nm波長(zhǎng)處測(cè)定其吸光度[1],在標(biāo)準(zhǔn)曲線上對(duì)應(yīng)查出樣品中剩余的苯并[a]芘含量。

        1.3.4 苯并[a]芘降解率的計(jì)算 利用標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣品中剩余苯并芘的含量,然后利用公式c=(a-b)/a×100%計(jì)算降解率。

        其中,c為降解率;a為空白樣品中苯并[a]芘的含量;b為處理后剩余苯并[a]芘的含量。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 苯并[a]芘降解菌的篩選與鑒定

        以苯并[a]芘為唯一碳源篩選出1株高效降解菌,該菌株命名為A12,為球狀,革蘭氏染色呈陰性,極生鞭毛。根據(jù)文獻(xiàn)[10],對(duì)A12生理生化測(cè)定結(jié)果如表1,表2所示。其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系如圖1所示。

        表1 菌株形態(tài)鑒定結(jié)果

        表2 菌株生理生化鑒定結(jié)果

        菌株A12的16 S rRNA經(jīng)測(cè)序后(NCBI序列號(hào)為AM184213.1),通過序列搜索和序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)菌株A12與Comamonas sp.DUT_AHX(DQ409079)的同源性最高,同源率為99.93%,Comamonas sp.DUT_AHX是1株睪丸酮叢毛單胞菌,對(duì)硝基苯有降解作用。與Pseudo-monas testosteroni屬的其他菌株(M11224和AB127967)同源率均高于99%以上,而這些菌株對(duì)芳香族化合物均有降解作用?;谏鲜鲂螒B(tài)鑒定、生理生化鑒定和16 S rRNA序列分析結(jié)果,初步確定A12菌株為睪丸酮叢毛單胞菌(Comamonas testosteroni)。

        2.2 苯并[a]芘降解率

        苯并[a]芘降解標(biāo)準(zhǔn)曲線如圖2所示。從圖2可以看出,苯并[a]芘質(zhì)量濃度在1.0~3.0 mg/L的范圍內(nèi)呈良好線性關(guān)系。對(duì)樣品的吸光度值進(jìn)行測(cè)定,得出其吸光度值為0.069,對(duì)照為0.135。用標(biāo)準(zhǔn)曲線y=0.424 8x-0.101 6計(jì)算得出,空白樣品中苯并[a]芘的含量(a)為0.557,處理后剩余苯并[a]芘的含量(b)為0.402。利用公式c=(a-b)/a×100%計(jì)算降解率(c)為28%。綜合得出,菌株A12在苯并[a]芘質(zhì)量濃度為5 mg/L、轉(zhuǎn)速為150 r/min、溫度為28℃的條件下,振蕩培養(yǎng)12 d,苯并[a]芘的降解率為28%。

        3 結(jié)論

        以苯并[a]芘為唯一碳源從焦化廠周邊耕地耕層土壤中篩選出1株降解菌A12,經(jīng)鑒定為睪丸酮叢毛單胞菌(Comamonas testosteroni);菌株A12在苯并[a]芘質(zhì)量濃度5 mg/L、轉(zhuǎn)速150 r/min、溫度28℃的條件下,振蕩培養(yǎng)12 d時(shí),苯并[a]芘的降解率為28%。

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