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        內生固氮菌HAUM10對水稻的侵染定殖規(guī)律及促生效應

        2012-04-29 15:44:00陶艷會林會趙斌
        湖北農業(yè)科學 2012年6期
        關鍵詞:定殖侵染水稻

        陶艷會 林會 趙斌

        摘要:試驗以從表面滅菌的稗草中分離到的一株內生固氮菌HAUM10為對象,研究發(fā)現(xiàn)該菌具有較強的產(chǎn)固氮酶和吲哚乙酸能力。乙炔還原法測定其所產(chǎn)固氮酶的活性為0.824 μmol C2H4/(mL·h),液相色譜法測定其產(chǎn)吲哚乙酸量為15.44 μg/mL。將HAUM10用gfp基因標記后接種水稻,觀察其在水稻中的侵染定殖規(guī)律,發(fā)現(xiàn)在接種后第7天,gfp標記的HAUM10主要定殖于根內通氣組織和韌皮部細胞,少量定殖在葉鞘中。盆栽試驗表明,HAUM10促進水稻葉綠素合成,有利于光合作用,在水稻生長后期促進氮、磷元素由葉向穗轉移。

        關鍵詞:內生固氮菌;水稻;侵染;定殖;促生

        中圖分類號:S154.38+1文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2012)06-1257-06

        Infection and Colonization of Endophytic Diazotroph HAUM10 on Rice Seedlings

        and Its Plant Growth-Promoting Role

        TAO Yan-hui,LIN Hui,ZHAO Bin

        (State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070, China)

        Abstract: An endophytic diazotroph HAUM10 was originally isolated from surface-sterilized Echinochloa crusgalli and it presented appreciable levels of nitrogenase activity and IAA production capability. The nitrogenase activity(ARA) was about 0.824 μmol C2H4/(mL·h). The liquid chromatography method was performed to determine the IAA production of HAUM10 which was detected as up to 15.44 μg/mL. Infection and colonization of the rice seedlings by gfp-tagged HAUM10 were examined. HAUM10-gfp was mainly colonized within the root aerenchyma and phloem at the 7th day after inoculation; While a few was observed in the leaf sheath. Pot experiment showed that the strain of HAUM10 increased the chlorophyll content to promote the photosynthesis of rice and transported the nitrogen and phosphorus from leaf to spike in the late growth of rice.

        Key words: endophytic diazotroph; rice; infection; colonization; growth promotion

        水稻生長過程除了需要大量的水外,氮源是其最重要的生長因子。中國是世界上稻米的主要生產(chǎn)國和消費國之一,目前化肥是實現(xiàn)單位面積高產(chǎn)的重要因素之一,但中國占世界約7%的耕地面積中施用的氮肥高達全球氮肥總用量的35%以上[1]。氮肥進入灌溉稻田后,通過氨的揮發(fā)、硝化-反硝化作用、表面流失等多途徑損失,最終導致氮肥利用率降低。大量氮素損失導致一系列環(huán)境問題:地下水污染和江河湖泊的富營養(yǎng)化;飲用水中硝酸鹽濃度高于10 mg/L將導致嬰兒高鐵血紅蛋白癥和成人胃癌;N2O和NO的排放可能導致全球氣候變暖[2]。生物固氮不僅可以為植物提供氮源緩解施用化肥帶來的一系列危害,而且具有環(huán)保、高效、節(jié)能、高效等優(yōu)點,因此研究利用生物固氮的方式為水稻提供氮源具有極其重要的意義。

        植物內生菌是指在其生活史的一定階段或全部階段生活于健康植物的各種組織和器官內部的微生物,被感染的宿主植物不表現(xiàn)出外在癥狀,可通過組織學方法或從嚴格表面消毒的植物組織中分離或從植物組織內直接擴增出微生物DNA的方法來證明其內生性[3]。內生菌對宿主植物的促生效應包括固氮、解磷、分泌植物激素、促進礦質元素吸收、生物防治等[4]。植物內生固氮菌(Endophytic diazotroph)是一類能定殖在健康植物體內,與宿主植物進行聯(lián)合固氮的微生物。由于內生固氮菌在農作物體內不僅具有固氮活性,而且可能分泌植物激素等多種生物活性物質促進作物生長,因此,利用內生固氮菌對植物的促生效應,有可能開辟一條不同于根瘤菌與豆科作物互作促生的途徑??紤]到與水稻生長環(huán)境相似、常與水稻發(fā)生營養(yǎng)競爭關系的稗草中可能存在某些有促生作用的內生固氮菌,故將稗草作為內生固氮菌分離的材料,研究了其中一株內生固氮菌在水稻中的侵染定殖規(guī)律及對水稻的促生效應。

        1材料與方法

        1.1材料

        內生固氮菌來源:HAUM10由華中農業(yè)大學微生物學國家重點實驗室自華中農業(yè)大學實驗基地的稻田溝渠稗草中分離得到。HAUM10單個菌體短桿狀,不形成芽孢,具有運動性,革蘭氏陰性。在營養(yǎng)瓊脂平板上生長,單個菌落平滑,菌落淡黃色,半透明,中間凸起,粘著于培養(yǎng)基上;在無氮阿須貝氏培養(yǎng)基平板上,菌落透明黏稠,邊緣不規(guī)則向周圍擴展生長。根據(jù)HAUM10的生理生化性質和16 S rDNA序列比對結果,鑒定HAUM10是一株泛菌(Pantoea sp.)。

        含gfp基因的供體菌:大腸桿菌(Escheichi coli)ccll8λ/pFAJ1820,卡那霉素抗性[5]。由比利時魯汶大學J. Vanderleyden教授饋贈。

        三親本雜交輔助菌:E. coli(pPK2073,Spe R)。

        1.2方法

        1.2.1擴增固氮酶nifH基因,測定固氮酶活性首先用堿變性法[6]抽提HAUM10總DNA,并稀釋100倍后作為模板。固氮酶nifH基因擴增引物和反應程序參考Ueda等[7]的方法。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后用DNA純化試劑盒回收,回收產(chǎn)物連接到pMD18-T載體上,轉化入DH5α,挑陽性克隆測序。

        乙炔還原法測純培養(yǎng)的內生固氮菌所產(chǎn)固氮酶活性[6]。將改良的Do氏培養(yǎng)基[8]3 mL分裝于PA瓶中滅菌后制成斜面,取等量內生固氮菌接種于Do氏培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)48 h后將PA瓶上的硅膠蓋換成不透氣的橡膠塞。用注射器平衡瓶內外壓力后,抽出10%體積的空氣,注入等體積的乙炔,繼續(xù)在28 ℃下培養(yǎng)24 h。氣相色譜儀測定乙烯生成量。

        1.2.2產(chǎn)吲哚乙酸試驗CCM培養(yǎng)基[9]:葡萄糖5 g,甘露糖5 g,蘋果酸5 g,NH4Cl 1 g,去離子水1 000 mL,pH 5.8,加色氨酸0.2 g/L。接種菌體于CCM培養(yǎng)基中,生長1周;10 000 g離心15 min,收集上清液;HCl調節(jié)上清液pH為2.8;用等體積的乙酸乙酯抽提3遍;提取物40 ℃水浴旋轉蒸發(fā)真空濃縮至近干,然后加1 mL無水乙醇懸??;HPLC檢測:采用C18色譜柱,V甲醇∶V醋酸∶V水=30∶1∶70為流動相,流速1.2 mL/min,λIAA=280 nm[10]。

        1.2.3gfp基因標記HAUM10及接合子的鑒定以抗生素利福平作為三親本雜交試驗受體菌的篩選標記,馴化HAUM10,得到抗100 μg/mL Rif的HAUM10。

        三親本雜交方法參考趙斌等[6]的方法。為了得到穩(wěn)定表達的gfp接合子,將三抗平板上得到的接合子菌體在無抗性的液體LB培養(yǎng)基中傳20代,然后將菌液稀釋107倍涂三抗(Rif 100 μg/mL,Spe 50 μg/mL,Km 30 μg/mL)LB平板,即可得到較為穩(wěn)定的gfp接合子。

        鑒定轉化子:在熒光顯微鏡下觀察菌體是否發(fā)出綠色熒光,是否在三抗阿須貝氏培養(yǎng)基上生長;PCR擴增菌體gfp基因:挑轉化子于三抗LB培養(yǎng)基生長至對數(shù)期后,取菌液30 μL,10 000 r/min離心1 min,倒掉上清液加入50 μL無菌去離子水并搖動均勻,100 ℃、5 min后置冰上5min,10 000 r/min離心5 min,?。?μL上清液作為模板。gfp引物的設計:從GenBank中搜索到gfp基因的序列,根據(jù)gfp基因全長設計引物。Gfpf為5′-AAGGAGGATATACA

        TATGGCTAGC-3′,Gfpr為5′-CCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTC-3′。反應體系(20 μL):10×PCR buffer 2 μL;dNTP(dATP、dCTP、dTTP和dGTP濃度均為2 mmol/L)2 μL;正反向引物(50 μg/mL)各0.8 μL;模板DNA(10 ng/mL)1 μL;Taq聚合酶(5 U/μL)0.2 μL;加水至20 μL。反應程序:94 ℃,預變性5 min;94 ℃變性1 min,57 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,30個循環(huán);72 ℃繼續(xù)延伸10 min。

        1.2.4HAUM10在水稻中的侵染定植路徑水稻(中花11)種子表面滅菌處理參考文獻[10]的方法。將滅菌后的水稻種子鋪于1%瓊脂固體培養(yǎng)基中萌發(fā)5 d,選擇健壯的幼苗剪少許根后移入20 mL裝有水稻無氮營養(yǎng)液配置的半固體培養(yǎng)基(瓊脂濃度3.25 g/L)的玻璃試管(口徑2.5 cm,長19 cm)中。接入無菌水懸浮的HAUM10-gfp。管底作避光處理后,置智能光照培養(yǎng)箱(光照27 ℃,16 h/d;黑暗25 ℃,8 h/d)培養(yǎng)。

        于接種后3、5、7 d分別取水稻幼苗,無菌水洗去表面附著菌體。在連續(xù)變倍體式顯微鏡下用不銹鋼刀片切取水稻組織制作切片。激光掃描共聚焦顯微鏡λ488nm激發(fā)光下觀察水稻各部位內生固氮菌存在狀態(tài)。

        1.2.5HAUM10纖維素酶和果膠酶試驗纖維素酶試驗采用趙斌等[6]的纖維素水解試驗方法一。配制果膠培養(yǎng)基[6],0.1 MPa滅菌5 min倒平板,每個平板點種4株菌株,28 ℃倒置培養(yǎng)2~4 d。

        1.2.6盆栽試驗觀察HAUM10對水稻生長的影響盆栽試驗設不接種(CK)和接種HAUM10兩種處理,各4個重復,每個重復1盆(盆口徑20.5 cm,高19.0 cm,土深14.0 cm)。水稻種子表面滅菌后,置于添加無菌水的平皿中,28 ℃萌發(fā)5 d后,倒掉無菌水,加入無菌水懸浮的菌液浸苗過夜。每盆25棵苗,等距種植。水稻生長過程澆自來水和無氮Fahraeus營養(yǎng)液。待水稻生長至分蘗期和灌漿期再各接種一次內生固氮菌劑。移栽后分別在第7、14、21、30、45天取樣,將植株完全拔出后自來水沖洗干凈。觀察內生固氮菌在水稻不同部位的消長動態(tài),不同時期測HAUM10在水稻體內的固氮酶活性[10]。移栽后第45天取水稻苗測葉片的葉綠素含量[11]。第45天和種子收獲期取樣消化[12]后以凱氏定氮法和鉬銻抗比色法分別測水稻氮和磷含量。

        2結果與分析

        2.1HAUM10固氮酶基因nifH及固氮酶活性

        nifH基因是蛋白酶多肽的3個功能基因nifHDK之一,擴增片段大小為390 bp(圖1)。測序結果在NCBI數(shù)據(jù)庫中經(jīng)BLAST比對,與成團泛菌(Pantoea agglomerans)的nifH序列覆蓋率為75%,同一性為96%。乙炔還原法測定HAUM10的固氮酶活性為0.824 μmol C2H4/(mL·h)。

        2.2產(chǎn)吲哚乙酸試驗結果分析

        高效液相色譜法測定吲哚乙酸標準品的出峰時間是11.020 min(圖2a),確定HAUM10發(fā)酵液出峰時間為11.173 min的峰圖是其所產(chǎn)吲哚乙酸的峰圖(圖2b),可得HAUM10產(chǎn)吲哚乙酸量為15.44 μg/mL。

        2.3gfp標記菌株的鑒定

        HAUM10與供體菌、輔助菌接合后,在選擇性三抗培養(yǎng)基上產(chǎn)生了一些接合子,而單獨的供體菌、輔助菌、受體菌在這樣的選擇性培養(yǎng)基上均不能生長。將其接種于無氮三抗培養(yǎng)基上,接合子可生長,單獨的供體菌、輔助菌、受體菌不生長。用無選擇壓力的液體LB培養(yǎng)基傳20代后,在三抗LB培養(yǎng)基上篩選穩(wěn)定的接合子,此時在ZEISS熒光顯微鏡藍色激發(fā)光下明顯看到每個單菌落發(fā)出明亮的熒光。挑?。纾妫鸱€(wěn)定表達的接合子單菌落液體培養(yǎng)后取菌液,PCR擴增gfp片段,瓊脂糖凝膠電泳結果見圖3。從圖3可以看出,經(jīng)PCR擴增后,HAUM10-gfp和陽性對照E. coli ccll8λ/pFAJ1820都產(chǎn)生了分子量相同的惟一一條電泳帶(片段大小約790 bp),而野生型的HAUM10未產(chǎn)生任何條帶。

        2.4HAUM10-gfp在水稻中的侵染定殖

        試驗發(fā)現(xiàn),水稻苗接菌后,在水稻根周圍1~3 mm內可見云霧狀細菌群圍繞,說明HAUM10主要通過根部侵染進入稻體,而在未接菌的水稻根的周圍沒有此現(xiàn)象。激光掃描共聚焦顯微鏡觀察未接菌對照的水稻根,橫切面內沒有綠色熒光標記的菌體侵染定殖(圖4a)。接種后第3天,用普通熒光顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)水稻根毛區(qū)聚集大量內生固氮菌,附著于根表面(圖4b)。第5天,激光掃描共聚焦顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)水稻表皮細胞和皮層細胞有少量gfp標記的HAUM10。第7天,根內HAUM10-gfp數(shù)量增多,內生固氮菌主要分布于皮層細胞和韌皮部細胞,當薄壁細胞萎縮徑向壁相互重疊形成通氣腔后,在通氣組織中可看到HAUM10-gfp(圖4c);在葉鞘橫切面和縱切面也可見較多的HAUM10-gfp,主要存在于韌皮部細胞和薄壁組織中(圖4d和圖4e)。試驗發(fā)現(xiàn),在維管束中有極少量gfp基因標記的菌體。

        2.5HAUM10所產(chǎn)纖維素酶和果膠酶的活性

        接種兩周后觀察HAUM10分解纖維素的試驗結果,發(fā)現(xiàn)接種HAUM10的濾紙條比未接菌對照濾紙條變薄。根據(jù)纖維素分解菌具有將纖維濾紙分解使其失去原有物理性狀的性質,說明它可以產(chǎn)生纖維素酶分解纖維素。HAUM10在果膠培養(yǎng)基上培養(yǎng)后,在菌體生長區(qū)域培養(yǎng)基顏色由黃色變?yōu)樗{色(培養(yǎng)基中添加了酸堿指示劑),且菌落周圍的培養(yǎng)基出現(xiàn)下凹(圖5)。根據(jù)果膠可以使液體培養(yǎng)基胨化,果膠被分解,胨狀培養(yǎng)基被液化,培養(yǎng)基表面會出現(xiàn)下凹的原理,說明HAUM10在生長過程中能夠分泌果膠酶。

        2.6盆栽試驗結果分析

        通過盆栽試驗,觀察HAUM10在水稻不同部位的消長動態(tài),在接種后第7天水稻根、莖、葉內都已經(jīng)有HAUM10侵染定殖。接種后第7天時,水稻鮮根、莖、葉菌體數(shù)量分別為108、106、103 CFU/g;第14天,水稻鮮根、莖、葉菌體數(shù)量分別是107、106、103 CFU/g;第21天,水稻鮮根、莖、葉菌體數(shù)量分別是105、104、102 CFU/g,第30天,水稻鮮根、莖、葉菌體數(shù)量分別是103、102、10 CFU/g。HAUM10在水稻體內遷移路徑是從根到莖再到葉,菌量表現(xiàn)為根>莖>葉。第7天測得HAUM10在水稻鮮根的固氮酶活性為5.674 μmol C2H4/(g·h),第14天為4.837 μmol C2H4/(g·h),第21天為0.91 μmol C2H4/(g·h),第30天為0.301 μmol C2H4/(g·h),第45天為0.132 μmol C2H4/(g·h)。接種HAUM10第45天后水稻鮮葉葉綠素a含量和總葉綠素含量分別為2.868和4.143 mg/g,分別比對照增長51.9%和19.15%;地上部分、地下部分全氮含量分別為117.60、52.34 g/kg,分別比對照增長29.39%、48.86%,全磷含量分別為19.18、10.31 g/kg,分別比對照增長30.12%、12.43%;收獲期水稻葉片接種HAUM10的全氮、全磷含量分別為129.60、8.50 g/kg,分別比對照下降26.82%、15.17%(表1)。

        3討論

        內生細菌通過黏附作用吸附在植物細胞的表面,這對細菌侵染定殖有很好的促進作用。試驗中發(fā)現(xiàn)水稻根毛區(qū)聚集較多的HAUM10,附著于根上。大多數(shù)內生菌都具有分解纖維素和果膠的能力,有助于其穿透植物細胞壁,進入植物體內部[13]。同樣,對HAUM10進行的研究發(fā)現(xiàn)其果膠分解能力比較強。運動性試驗說明HAUM10可能具有鞭毛,這有利于其發(fā)揮主動運動性,向有利于其生存的環(huán)境移動,同時可以開辟更廣闊的生存空間。顯微切片發(fā)現(xiàn)HAUM10主要定殖于根和葉鞘的皮層細胞和韌皮部細胞,可能這些部位細胞有利于其生存。Gyaneshwar等[14]利用免疫金標記技術研究發(fā)現(xiàn),固氮型內生菌粘質沙雷氏菌(Serratia marcescens)可以定殖于水稻根、莖、葉中,在細胞間隙、衰老根的皮層細胞、通氣組織和木質部導管中有大量該菌定殖。Jha等[15]利用gusA標記克雷伯氏產(chǎn)酸菌(Klebsiella oxytoca)GR-3,通過組織染色發(fā)現(xiàn)新生側根處極有可能是該菌侵染進入水稻根內的主要部位。

        高效液相色譜法分析HAUM10產(chǎn)吲哚乙酸的情況,由色譜圖可知HAUM10能分泌吲哚乙酸,而且還有其他許多未知物質產(chǎn)生,某些物質的分泌量比吲哚乙酸多。這些未知物質可能是其他植物激素,對宿主植物有促生作用或有助于植物進行無機鹽運輸、營養(yǎng)分配等。HAUM10可分泌生長激素,可能在植物體內也通過分泌植物激素的方式對宿主起促生作用。IAA可促進水稻根的伸長,增加根系與土壤接觸面積,從而有利于吸收環(huán)境中的營養(yǎng)物質,如礦質元素和水,最終增加植物的生物量[15]。Mattos等[16]用Burkholderia kururiensis接種水稻,認為B. kururiensis可產(chǎn)生吲哚乙酸,使植株側根和根毛增多。

        盆栽試驗是在水稻種子萌發(fā)5 d后接種HAUM10,是因為在萌發(fā)時接種有助于該菌充分與水稻根接觸,達到促根目的,使根系強大,為培育壯秧打下堅實基礎;另外,有助于該菌占領根系,排除盆栽外環(huán)境中其他雜菌的干擾[17]。對收獲期水稻葉中氮、磷含量分析發(fā)現(xiàn),接種HAUM10的水稻葉中氮、磷含量均比未接菌水稻葉中氮、磷含量低,分析可能是HAUM10在水稻生長后期對營養(yǎng)物質由葉運輸至穗發(fā)揮了一定的作用。沈德龍等[18]利用14C同位素標記技術研究了水稻內生成團泛菌YS19在水稻子粒乳熟初期和乳熟后期對光合產(chǎn)物在源、庫中的分配和影響,發(fā)現(xiàn)水稻內生成團泛菌可以調控光合產(chǎn)物在旗葉(源)、穗(庫)中的分配,在水稻子粒乳熟初期,噴施YS19菌液有助于旗葉光合產(chǎn)物向穗的運輸,而向根、葉鞘運輸?shù)墓夂袭a(chǎn)物很少,在乳熟后期則有抑制作用,原因是與YS19菌株產(chǎn)生的激素有關。

        綜上所述,可以判斷從稗草中分離的HAUM10可以侵染定植于水稻中,這是其促生性質被廣泛利用的基礎。HAUM10對水稻的促生效應包括固氮、產(chǎn)生生長激素、有助于水稻葉綠素合成促進光合作用以及水稻生長后期氮、磷元素由葉向穗轉移。

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