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        MicroRNA在抗病毒免疫中的作用研究進展

        2012-04-13 06:19:20王強泰安市岱岳區(qū)山口鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站271038
        山東畜牧獸醫(yī) 2012年12期

        王強 (泰安市岱岳區(qū)山口鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站 271038)

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        MicroRNA在抗病毒免疫中的作用研究進展

        王強 (泰安市岱岳區(qū)山口鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站 271038)

        MicroRNAs是一類2l-23核苷酸小非編碼RNA,其通過與靶基因的3’非翻譯區(qū)間結(jié)合抑制靶基因表達,或者使靶基因轉(zhuǎn)錄本降解。研究表明,miRNA可能參與脊椎動物固有免疫應(yīng)答的多個環(huán)節(jié),在病原微生物感染時,它們不僅成為重要的固有免疫受體活化后的信號調(diào)節(jié)分子,而且能夠直接干擾病毒復(fù)制而發(fā)揮抗病毒效應(yīng)。病原微生物,特別是病毒還可以通過自己編碼miRNA或者改變宿主細胞miRNA表達譜直接或間接地干擾很多宿主免疫相關(guān)基因的表達,實現(xiàn)逃逸機體免疫清除的目的。因此,miRNA水平的相互作用可能是病原微生物與其宿主展開免疫“博弈”的重要戰(zhàn)場。

        MicroRNA(miRNA)是近幾年繼siRNA之后非編碼RNA研究的又一熱點。它通過與靶mRNA的特異性結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平上對基因表達進行調(diào)控。到目前為止,絕大多數(shù)研究結(jié)果都顯示,miRNA能夠通過特異性的堿基配對抑制靶mRNA翻譯或誘導(dǎo)剪切,從而在轉(zhuǎn)錄后水平上對基因的表達進行負調(diào)控,促進靶mRNA的快速脫腺苷酸化而使其易于降解,也是miRNA抑制基因表達的機制之一。自從Pfeffer等[1]于2004年從EBV感染的細胞中發(fā)現(xiàn)了首個由病毒基因組編碼的miRNA。到目前為止,通過克隆鑒定和生物信息學(xué)手段預(yù)測到可能存在的病毒miRNA已有上百種,其中很多已經(jīng)完成了序列鑒定和功能分析。

        1 miRNA的生物合成

        miRNA的生物合成需要復(fù)雜的蛋白酶系統(tǒng),在RNA聚合酶Ⅱ的作用下合成miRNA初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物pri-miRNA,然后在RNaseⅢ核酸酶Drosha及輔助因子Pasha的作用下形成具有發(fā)卡狀結(jié)構(gòu)的70個左右堿基的pre-miRNA,pre-miRNA經(jīng)Ran GTP依賴途徑和Expotin-5復(fù)合物輸送到細胞質(zhì)后,由胞質(zhì)核酸酶Dicer剪切為約22個核苷酸左右的miRNA,引導(dǎo)進入RISC(RNA-induced silencing complex)中成熟的miRNAs被保留,互補結(jié)合于靶基因mRNA,抑制其翻譯或降解靶基因調(diào)控基因表達。靶tuRNA不完全互補的miRNA通常結(jié)合在mRNA的3’端非翻譯區(qū),抑制翻譯的延伸或降解核糖體合成的新生肽鏈從而抑制蛋白質(zhì)翻譯;如與靶位點完全互補通常結(jié)合在mRNA的編碼區(qū),引起靶mRNA的降解,一個miRNA可有多個靶基因,多個miRNA也可共同調(diào)節(jié)一個靶基因,形成調(diào)控網(wǎng)絡(luò),精細調(diào)控功能基因的表達。miRNA是調(diào)節(jié)細胞功能的關(guān)鍵因子,自身的表達和功能被嚴格地調(diào)控,受感染、炎癥或細胞刺激的影響才能發(fā)揮作用。

        2 . 病毒編碼的miRNA與免疫逃逸

        早在2004年,研究人員就發(fā)現(xiàn)KSHV(kaposi sarcoma associated herpesvirus)編碼的11種miRNA在靜止期的KSHV感染細胞中表達上調(diào),并預(yù)測它們與宿主的若干基因mRNA有結(jié)合能力,估計它們可能會通過調(diào)節(jié)某些重要宿主細胞基因的表達使感染狀態(tài)得以長期維持[2]。進一步研究發(fā)現(xiàn)它們能夠靶向下調(diào)宿主的一種抗腫瘤因子THBS1(thrombospondin 1)從而促進疾病的發(fā)生[3]。類似的情況還見于SV40(sarcoma virus 40)等病毒的感染過程,早期基因轉(zhuǎn)錄區(qū)指導(dǎo)合成的T抗原是細胞轉(zhuǎn)化啟動所必需的蛋白質(zhì),參與轉(zhuǎn)化細胞表型的維持,在SV40誘發(fā)腫瘤的過程中具有重要作用。

        Sullivan等[4]發(fā)現(xiàn),SV40編碼的一組miRNA在其基因組轉(zhuǎn)錄后期顯著積累,進一步研究表明它們能夠與T抗原mRNA的3'-UTR互補結(jié)合抑制其翻譯,引起其合成下調(diào),從而削弱了SV40感染細胞的特異性表型,降低CTL對被感染細胞的識別和殺傷,有利于病毒的持續(xù)性感染。Stern-Ginossar等[5]探索了HCMV(human cytomegalovirus)編碼的11種miRNA在宿主基因組中的靶點,發(fā)現(xiàn)hcmv-miR-UL112能夠與人類MHCⅡ類鏈相關(guān)分子B(MHC classⅡ-related chain B molecules,MICB) mRNA 的3'-UTR互補結(jié)合,特異性下調(diào)被感染細胞膜表面MICB的表達,進而降低由其受體NKG2D介導(dǎo)的NK細胞對HCMV感染細胞的識別和殺傷,幫助被感染細胞逃逸免疫清除。這項成果進一步證實了病毒可以通過編碼miRNA直接靶向宿主免疫防御基因,削弱宿主免疫防御功能。

        3 病毒miRNA與細胞凋亡

        病毒抗凋亡策略不僅有利于病毒的大量復(fù)制,而且有助于病毒逃避CTL和自然殺傷(NK)細胞對病毒感染細胞的殺傷。病毒編碼抗凋亡蛋白已為大家所熟知,近年研究表明,病毒還能編碼miRNA來抑制病毒感染細胞過早凋亡。單純皰疹病毒1型(herpes simplex virus-1,HSV-1)潛伏相關(guān)轉(zhuǎn)錄物(latency-associated transcript,LAT)基因編碼的miRNA,提供了病毒感染細胞對凋亡的抗性[6]。轉(zhuǎn)染LAT基因片段的成神經(jīng)瘤細胞增加了細胞凋亡的抗性,并且LAT miRNA在瞬時轉(zhuǎn)染LAT基因片段或者感染HSV-1野毒株的細胞中積累。而缺失372 nt核酸片段(含有成熟LAT miRNA)的突變毒株,既不能抑制感染細胞免于凋亡,也不能產(chǎn)生miRNA。分析發(fā)現(xiàn),miR-LAT可通過下調(diào)與轉(zhuǎn)化生長因子(transforming growth factor,TGF)通路相連的TGF 1 和SMAD3(mothers against decapentaplegic homologue3)表達而實施抗凋亡效應(yīng)。Stern Ginossar等[7]研究表明,人巨細胞病毒miRNA miR-UL112的可能靶標是NK細胞激活受體NKG2D的脅迫誘導(dǎo)配體——主要組織相容性復(fù)合體I 相關(guān)B鏈(major histocompatibility complex class I related chain B,MICB)基因,他們進一步證明,miR-UL112確實能降低內(nèi)源MICB的生成,干擾與NKG2D結(jié)合,從而降低NK細胞殺傷作用。

        4 宿主細胞編碼miRNA的抗病毒作用

        2005年Lecellier等[8]報道轉(zhuǎn)染腺病毒E1A基因的人腎上皮細胞系293T表達一種miRNA-miR-32,可以廣泛抑制PFV-1(primary foamy virus 1)蛋白的表達,降低病毒基因組在胞內(nèi)的積累。熒光素酶報告基因檢測表明,轉(zhuǎn)染miR-32的反義寡鎖核酸片段能夠重新提高胞內(nèi)PFV-1的載荷。這一結(jié)果證明,動物細胞能夠通過編碼miRNA直接抑制病毒的感染。值得注意的是PFV-1也具有一種反制手段,可以通過編碼Ras蛋白來抑制miR-32介導(dǎo)的對PFV-1積累的阻斷作用。Otsuka等[9]則在研究Dicer-1缺陷鼠對VSV(vesicular stomatitis virus)高度易感的機制時發(fā)現(xiàn),宿主細胞編碼產(chǎn)生的miR-24和miR-93兩種miRNA能夠靶向VSV的L蛋白和P蛋白,從而抑制VSV的復(fù)制,Dicer的缺陷將導(dǎo)致miRNA合成障礙而使機體易于受到VSV的感染。

        Hariharan等[10]利用生物信息學(xué)的手段預(yù)測出T細胞表達的miR-29a等5種miRNA可能分別靶向調(diào)節(jié)玉型人免疫缺陷病毒編碼的nef、vpr等基因,而這些基因在HIV-1的吸附感染、衣殼合成、顆粒裝配及對宿主細胞周期的調(diào)控等方面發(fā)揮著十分重要的作用。而Triboulet等[11]發(fā)現(xiàn)宿主細胞編碼的miR-17-5p和miR-20a能夠靶向下調(diào)組蛋白乙?;窹CAF的表達,由于PCAF是HIV-1基因組復(fù)制中重要的協(xié)同因子,因而這兩種miRNA能夠發(fā)揮降低細胞內(nèi)的病毒載荷的作用。最近的一項研究則證實[12],宿主CD4+T細胞編碼的一組miRNA能夠直接抑制靜止期初始CD4+T細胞中HIV-1的復(fù)制。分析發(fā)現(xiàn),它們在靜止期初始CD4+T細胞中的表達水平明顯高于活化期,并與HIV-1基因組RNA3憶端的若干區(qū)域有結(jié)合能力,轉(zhuǎn)染這些miRNA的序列特異性反義寡核苷酸,則會解除它們在模擬感染和分離自HIV感染者血液的靜止期初始CD4+T細胞中對HIV復(fù)制的抑制,由于HIV在靜止期CD4+T細胞中的潛伏被認為是HAART無法根除HIV病毒的主要原因,因此這一成果無疑為治療HIV感染指出了新的方向。

        5 編碼的miRNA促進病毒復(fù)制

        2005年,Jopling等發(fā)現(xiàn)宿主細胞編碼的miRNA并不都是對病毒感染發(fā)揮抑制作用,HCV(hepatitis C virus)能夠?qū)⑷烁渭毎禺愋愿弑磉_的miRNA-miR-122,募集到其基因組RNA的5'-NCR(non-coding region),促進自身基因組的復(fù)制。Pedersen等最近報道,miR-122可以成為干擾素抗HCV感染的新靶點,他們用IFN-β分別處理人肝癌細胞系Huh7和人原代肝細胞,發(fā)現(xiàn)miR-122的表達明顯下調(diào),HCV基因組的復(fù)制受到抑制,結(jié)果控制了感染的進一步發(fā)生。應(yīng)用miR-122特異性反義寡核苷酸則能夠減弱這種抗病毒作用,這表明了由宿主編碼的miRNA不僅能夠?qū)Σ《綬NA進行干擾,還有可能被病毒利用為自己服務(wù),這一現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)為進一步理解宿主基因組編碼的miRNA與病毒之間的關(guān)系,探索免疫應(yīng)答過程中更多未知分子機制及它們的免疫學(xué)意義展示了新的視角。

        6 展望

        對病毒miRNA的研究從2004年至今,屬于較新的領(lǐng)域,很多遇到的miRNA有待實驗驗證,并需要尋找與確認它們的功能。為獲得病毒生存優(yōu)勢,病毒miRNA可以在免疫系統(tǒng)活化不同階段干擾免疫系統(tǒng);同時由于miRNA可以通過直接接觸的方式實現(xiàn)免疫細胞之間的相互傳遞,所以病毒的miRNA可能會采取這種方式更大限度操控免疫系統(tǒng),進一步探索病毒miRNA在病毒感染早期對自身與宿主的調(diào)控將為研發(fā)有效防控手段提供理論基礎(chǔ)。

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        (2012–09–22)

        S813.3

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        1007-1733(2012)12-0088-03

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